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山乌桕叶片DNA提取及ISSR-PCR反应体系优化
被引量：
10
1
作者
黄旭萍
黄一航
+3 位作者
黄敏
王建超
陈孝丑
陈发兴
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2021年第2期164-171,共8页
为研究南方优良乡土彩叶树种山乌桕的遗传多样性,并为山乌桕种质培育研究提供技术参考。以山乌桕叶片为试验材料,对山乌桕ISSR-PCR反应体系进行优化,比较试剂盒法、改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和十二烷基硫酸钠(SDS)法对山乌桕叶...
为研究南方优良乡土彩叶树种山乌桕的遗传多样性,并为山乌桕种质培育研究提供技术参考。以山乌桕叶片为试验材料,对山乌桕ISSR-PCR反应体系进行优化,比较试剂盒法、改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和十二烷基硫酸钠(SDS)法对山乌桕叶片DNA的提取效果,并利用单因素试验和L 25(53)正交试验对DNA模板用量、引物浓度、2×Taq Master Mix添加量、退火温度和循环次数进行优化。结果表明,试剂盒法和改良CTAB法均可获得较高浓度和质量的DNA,都是提取山乌桕叶片DNA的良好方法;山乌桕叶片ISSR-PCR反应体系中,DNA模板用量对扩增效果影响最大,2×Taq Master Mix添加量的影响最小;山乌桕叶片ISSR-PCR的最优反应体系为:总体积20μL,其中含20 ng DNA模板1.5μL、2×Taq Master Mix 8.0μL、引物浓度0.8μmol·L^(-1)。山乌桕叶片ISSR-PCR的反应程序为:94℃预变性5 min、94℃变性30 s、51.9℃退火45 s、72℃延伸90 s、40个循环,72℃延伸10 min、4℃保存。
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关键词
山乌桕
DNA提取
简单重复序列区间-聚合酶链式扩增反应
体系优化
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职称材料
应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析
被引量：
6
2
作者
程华
李琳玲
+4 位作者
张心玲
方佳
郑永生
姜德志
程水源
《湖北农业科学》
北大核心
2011年第20期4292-4297,共6页
中国的菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)品种数量众多,形态变异丰富,适应性强,分布广泛,遗传背景非常复杂,这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术,对福白菊(C.morifolium cv.Fubai...
中国的菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)品种数量众多,形态变异丰富,适应性强,分布广泛,遗传背景非常复杂,这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术,对福白菊(C.morifolium cv.Fubaiju)、杭白菊(C.morifolium cv.Hangbaiju)等10个菊花品种进行了分类鉴定及亲缘关系研究,结果显示,在简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(Inter-simple sequence repeat-Polymerase chain reaction,ISSR-PCR)分子标记反应体系及引物的筛选方面,选择了条带数量多和清晰度高的菊花反应体系,应用野生福白菊对39条ISSR引物进行了筛选,淘汰了扩增效果差、带型不易辨认的引物,最终确定12条引物用于菊花品种的鉴定。ISSR-PCR聚类分析结果表明,12条ISSR引物扩增出了185条清晰的、重复性好的ISSR条带,其中多态性条带有176条,多态性比率高达95.1%。应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,在相似系数0.55处可将10个菊花品种大致分为3类,结果福白菊与其他杭菊品种在遗传上有较大的差异。
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关键词
菊花
简单
序列
重复
区间
扩
增
-
聚合
酶
链
式
反应
分子标记
遗传多样性
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职称材料
上皮性卵巢肿瘤端粒酶活性及其各亚单位基因表达的研究
被引量：
2
3
作者
刘敏
纪新强
+1 位作者
罗兵
刘付敏
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期461-465,共5页
目的:探讨端粒酶及其亚单位(hTERT、TP1、hTR)在卵巢癌发生和发展中的作用,研究端粒酶活性与各亚单位表达的相关性。方法:应用逆转录-聚合酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)技术检测66例卵巢上皮性肿瘤及1...
目的:探讨端粒酶及其亚单位(hTERT、TP1、hTR)在卵巢癌发生和发展中的作用,研究端粒酶活性与各亚单位表达的相关性。方法:应用逆转录-聚合酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)技术检测66例卵巢上皮性肿瘤及10例正常卵巢组织端粒酶不同亚单位基因的表达情况,应用端粒重复序列扩增技术(telomeraserepeatamplificationprotocol,TRAP)检测其中45例卵巢上皮性肿瘤及9例正常卵巢组织端粒酶活性。结果:1)恶性、交界性卵巢肿瘤组织中端粒酶阳性检出率分别为83.33%(25/30)、71.43%(5/7),两组间无显著性差异(P>0.05),而良性上皮性卵巢肿瘤及正常卵巢上皮中未检测到端粒酶活性,与前两组之间均有显著差异(P<0.001);2)RT-PCR定性检测发现hTR和TP1mRNA在检测的各组组织中均有表达,而hTERTmRNA主要在上皮性卵巢癌和交界性卵巢肿瘤中表达,二者间hTERTmRNA表达的差别无统计学意义(P>0.05),而与良性及正常组织hTERT表达有显著差异(P<0.001);3)端粒酶活性与hTERT亚单位表达明显相关(P<0.001),而与hTR和TP1亚单位表达无明显相关性(P>0.05)。结论:端粒酶与卵巢癌发生发展过程密切相关;hTERT表达与端粒酶活性密切相关,并可能参与端粒酶的活性调节,hTERT的表达有望成为上皮性卵巢癌的诊断指标。
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关键词
上皮性卵巢肿瘤
端粒
酶
端粒
酶
亚单位
逆转录
-
聚合
酶
链
反应
RT—PCR
端粒
重复
序列
扩
增
技术
TRAP
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职称材料
题名
山乌桕叶片DNA提取及ISSR-PCR反应体系优化
被引量：
10
1
作者
黄旭萍
黄一航
黄敏
王建超
陈孝丑
陈发兴
机构
福建农林大学园艺学院
福建省农业科学院果树研究所
福州植物园
出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2021年第2期164-171,共8页
基金
福建省林业科技项目(闽林科便函〔2020〕9号)。
文摘
为研究南方优良乡土彩叶树种山乌桕的遗传多样性,并为山乌桕种质培育研究提供技术参考。以山乌桕叶片为试验材料,对山乌桕ISSR-PCR反应体系进行优化,比较试剂盒法、改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和十二烷基硫酸钠(SDS)法对山乌桕叶片DNA的提取效果,并利用单因素试验和L 25(53)正交试验对DNA模板用量、引物浓度、2×Taq Master Mix添加量、退火温度和循环次数进行优化。结果表明,试剂盒法和改良CTAB法均可获得较高浓度和质量的DNA,都是提取山乌桕叶片DNA的良好方法;山乌桕叶片ISSR-PCR反应体系中,DNA模板用量对扩增效果影响最大,2×Taq Master Mix添加量的影响最小;山乌桕叶片ISSR-PCR的最优反应体系为:总体积20μL,其中含20 ng DNA模板1.5μL、2×Taq Master Mix 8.0μL、引物浓度0.8μmol·L^(-1)。山乌桕叶片ISSR-PCR的反应程序为:94℃预变性5 min、94℃变性30 s、51.9℃退火45 s、72℃延伸90 s、40个循环,72℃延伸10 min、4℃保存。
关键词
山乌桕
DNA提取
简单重复序列区间-聚合酶链式扩增反应
体系优化
Keywords
Sapium discolor
DNA extraction
inter
-
simple sequence repeat
-
polymerase chain reaction(ISSR
-
PCR)
system optimization
分类号
S687.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析
被引量：
6
2
作者
程华
李琳玲
张心玲
方佳
郑永生
姜德志
程水源
机构
经济林木种质改良与资源综合利用湖北省重点实验室
黄冈师范学院化学与生命科学学院
麻城市福白菊产业协会
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2011年第20期4292-4297,共6页
基金
湖北省自然科学基金项目(2010CDZ026)
湖北省教育厅优秀中青年科技创新团队项目(T200702)
文摘
中国的菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)品种数量众多,形态变异丰富,适应性强,分布广泛,遗传背景非常复杂,这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术,对福白菊(C.morifolium cv.Fubaiju)、杭白菊(C.morifolium cv.Hangbaiju)等10个菊花品种进行了分类鉴定及亲缘关系研究,结果显示,在简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(Inter-simple sequence repeat-Polymerase chain reaction,ISSR-PCR)分子标记反应体系及引物的筛选方面,选择了条带数量多和清晰度高的菊花反应体系,应用野生福白菊对39条ISSR引物进行了筛选,淘汰了扩增效果差、带型不易辨认的引物,最终确定12条引物用于菊花品种的鉴定。ISSR-PCR聚类分析结果表明,12条ISSR引物扩增出了185条清晰的、重复性好的ISSR条带,其中多态性条带有176条,多态性比率高达95.1%。应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,在相似系数0.55处可将10个菊花品种大致分为3类,结果福白菊与其他杭菊品种在遗传上有较大的差异。
关键词
菊花
简单
序列
重复
区间
扩
增
-
聚合
酶
链
式
反应
分子标记
遗传多样性
Keywords
Chrysanthemum morifolium Ramat.
Inter
-
simple sequence repeat
-
Polymerase chain reaction （ISSR
-
PCR）
molecular marcer
genetic diversity
分类号
S682.11 [农业科学—观赏园艺]
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
上皮性卵巢肿瘤端粒酶活性及其各亚单位基因表达的研究
被引量：
2
3
作者
刘敏
纪新强
罗兵
刘付敏
机构
山东大学齐鲁医院妇产科
青岛大学医学院附属医院妇产科
青岛大学医学院微生物学教研室
泰山医学院附属医院妇产科
出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期461-465,共5页
基金
国家留学回国基金资助犤教外国留(1999)363号犦
文摘
目的:探讨端粒酶及其亚单位(hTERT、TP1、hTR)在卵巢癌发生和发展中的作用,研究端粒酶活性与各亚单位表达的相关性。方法:应用逆转录-聚合酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)技术检测66例卵巢上皮性肿瘤及10例正常卵巢组织端粒酶不同亚单位基因的表达情况,应用端粒重复序列扩增技术(telomeraserepeatamplificationprotocol,TRAP)检测其中45例卵巢上皮性肿瘤及9例正常卵巢组织端粒酶活性。结果:1)恶性、交界性卵巢肿瘤组织中端粒酶阳性检出率分别为83.33%(25/30)、71.43%(5/7),两组间无显著性差异(P>0.05),而良性上皮性卵巢肿瘤及正常卵巢上皮中未检测到端粒酶活性,与前两组之间均有显著差异(P<0.001);2)RT-PCR定性检测发现hTR和TP1mRNA在检测的各组组织中均有表达,而hTERTmRNA主要在上皮性卵巢癌和交界性卵巢肿瘤中表达,二者间hTERTmRNA表达的差别无统计学意义(P>0.05),而与良性及正常组织hTERT表达有显著差异(P<0.001);3)端粒酶活性与hTERT亚单位表达明显相关(P<0.001),而与hTR和TP1亚单位表达无明显相关性(P>0.05)。结论:端粒酶与卵巢癌发生发展过程密切相关;hTERT表达与端粒酶活性密切相关,并可能参与端粒酶的活性调节,hTERT的表达有望成为上皮性卵巢癌的诊断指标。
关键词
上皮性卵巢肿瘤
端粒
酶
端粒
酶
亚单位
逆转录
-
聚合
酶
链
反应
RT—PCR
端粒
重复
序列
扩
增
技术
TRAP
Keywords
Epithelial ovarian tumor Telomerase Telomerase subunits Telomerase repeat amplification protocol(TRAP)Reverse transcription
-
polymerase chain reaction(RT
-
PCR)
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山乌桕叶片DNA提取及ISSR-PCR反应体系优化
黄旭萍
黄一航
黄敏
王建超
陈孝丑
陈发兴
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2021
10
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职称材料
2
应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析
程华
李琳玲
张心玲
方佳
郑永生
姜德志
程水源
《湖北农业科学》
北大核心
2011
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
上皮性卵巢肿瘤端粒酶活性及其各亚单位基因表达的研究
刘敏
纪新强
罗兵
刘付敏
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
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职称材料
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