液相芯片技术联合等位基因特异性引物延伸反应检测结核分枝杆菌耐多药突变 被引量：4

1

作者 李婧婵 姜春来 +1 位作者 于源华 宋海鹏 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2016年第3期165-168,共4页

目的建立一种耐多药结核分枝杆菌检测方法。方法设计并构建含有kat G315、rpo B526、rpo B531耐药基因突变位点的质粒;通过PCR扩增及纯化、等位基因特异性引物延伸反应（ASPE）、荧光微球杂交反应及液相芯片系统Luminex 200检测;并对该... 目的建立一种耐多药结核分枝杆菌检测方法。方法设计并构建含有kat G315、rpo B526、rpo B531耐药基因突变位点的质粒;通过PCR扩增及纯化、等位基因特异性引物延伸反应（ASPE）、荧光微球杂交反应及液相芯片系统Luminex 200检测;并对该方法反应条件进行探索及方法学评价。结果 ASPE反应中Tsp DNA聚合酶最适浓度为0.025 U/μL,杂交荧光微球浓度为每μL 100个,链霉亲和素藻红蛋白浓度及杂交时间分别为2μg/m L和20 min;所建立方法的检测灵敏度最低可达1ng/m L;当质粒浓度为1.5×105ng/m L时,批间和批内变异系数（CV）分别为6.48%～12.15%和0.35%～6.92%;当质粒浓度为2 ng/m L时,批间和批内变异系数（CV）分别为5.73%～10.77%和0.97%～8.91%;特异性引物探针与其他突变位点均无交叉反应。结论液相芯片技术联合等位基因特异性引物延伸反应检测耐多药结核分枝杆菌灵敏且具有成本低、高通量等特点,极具临床应用潜力。 展开更多

关键词 液相芯片技术 等位基因特异性引物延伸反应 结核分枝杆菌 耐多药性

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汾远2号远志的rDNA ITS等位基因特异性PCR鉴别研究 被引量：2

2

作者 李娟 王丹丹 +4 位作者 孔冉冉 田洪岭 张福生 秦雪梅 马存根 《山西医科大学学报》 CAS 2019年第8期1143-1148,共6页

目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(rDNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志... 目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(rDNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志样品rDNA ITS序列进行比对,找到汾远2号远志(Polygala tenuifolia,简称FY2)的等位基因差异位点,并利用NCBI网上已有的远志序列以及作者测序得到的卵叶远志(P.sibirica)序列和FY2序列比对,进行等位基因差异位点的验证。最后根据FY2的碱基差异位点,采用Primer 5.0软件设计特异性PCR引物,用于FY2的特异性PCR鉴别。结果测序所得的序列与NCBI中远志的相似度高达99.36%。找到了两个FY2的等位基因差异位点,第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C。设计了4对特异性PCR引物对FY2进行特异性PCR扩增,在约463 bp处出现单一的扩增条带,而其他远志及卵叶远志则无相应的扩增条带。结论等位基因特异性PCR能有效地从远志和卵叶远志药材中鉴别出汾远2号远志,具有准确、高效、灵敏、简便的特点。 展开更多

关键词 远志 汾远2号 ITS 等位基因特异性引物 分子鉴别

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二球悬铃木花粉变应原特应性体质与HLA-DRB1等位基因相关性分析 被引量：6

3

作者 齐名 魏花 +2 位作者 朱琴 王艾丽 熊华 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期401-403,共3页

目的建立对二球悬铃木花粉过敏的特应性体质者的HLA-DRB1等位基因的PCR-SSP检测方法,探讨江苏汉族人二球悬铃木花粉变应原特应性体质者与HLA-DRB1等位基因的相关性。方法用酚-氯仿法提取全血DNA,合成8对等位基因特异性引物,用PCR-SSP方... 目的建立对二球悬铃木花粉过敏的特应性体质者的HLA-DRB1等位基因的PCR-SSP检测方法,探讨江苏汉族人二球悬铃木花粉变应原特应性体质者与HLA-DRB1等位基因的相关性。方法用酚-氯仿法提取全血DNA,合成8对等位基因特异性引物,用PCR-SSP方法检测20例江苏汉族二球悬铃木花粉过敏体质者和36例健康人HLA-DRB1*0401,*0402,*0403,*0404,*0405,*0406,*0407,*0408等位基因。结果经优化实验条件,建立了HLA-DRB1的8个等位基因的PCR-SSP检测方法,获得了患者组和健康人组上述HLA-DRB1等位基因的分布资料。二球悬铃木花粉变应原特应性体质者DRB1*0405和*0406基因频率高于健康人对照组而DRB1*0402基因频率低于健康人对照组。其他5个等位基因频率二组间无显著性差异。结论HLA-DRB1*0406和*0405可能是对二球悬铃木花粉变应原过敏的I型变态反应特应性体质者的可疑候选易患等位基因,而DRB1*0402基因可能是与之相关的具有抵抗作用的等位基因。 展开更多

关键词 人类白细胞抗原 等位基因 二球悬铃木花粉 变应原 序列特异性引物聚合酶链反应

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HLA新等位基因HLA-A*11∶230序列分析及确认 被引量：3

4

作者 齐珺 王天菊 +2 位作者 王满妮 陈利萍 王小芳 《山西医科大学学报》 CAS 2016年第12期1080-1085,共6页

目的对人类白细胞抗原(HLA)-A*11新等位基因核苷酸序列分析及确认。方法采用多聚酶链反应-测序(PCR-SBT)在对2015年中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)入库数据进行HLA常规分型中,应用组序列特异性引物(GSSP)单链测序方法针对常规SBT检测... 目的对人类白细胞抗原(HLA)-A*11新等位基因核苷酸序列分析及确认。方法采用多聚酶链反应-测序(PCR-SBT)在对2015年中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)入库数据进行HLA常规分型中,应用组序列特异性引物(GSSP)单链测序方法针对常规SBT检测中A位点无匹配结果的2例无亲缘关系陕西汉族供者样本进一步进行确证实验,并运用聚合酶链式反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)进行对照实验。结果经确证实验发现2例无亲缘关系供者携带同一HLA-A新等位基因序列,与同源基因HLA-A*11∶01序列相比,均在第2外显子98位置发生A>G突变,该突变造成氨基酸序列9位由酪氨酸(TAC)变成半胱氨酸(TGC);而2例样本的PCR-SSO结果均显示为HLA-A的常见等位基因组合,未见异常反应格局。结论经WHO HLA因子命名委员会正式命名的新等位基因HLA-A*11:230的发现和鉴定表明,对于常规测序无匹配结果的样本应进一步深入分析,即使以常见等位基因组合为分型结果的SSO方法仍存在HLA新等位基因漏检的可能,需引起注意。 展开更多

关键词 人类白细胞抗原 测序 组序列特异性引物 新等位基因

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新疆地区维吾尔族寻常型银屑病与HLA-DRB1~＊ 07等位基因的关联研究 被引量：6

5

作者 蒋建华 多兰 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2012年第1期54-57,共4页

目的银屑病是慢性炎症性、增生性皮肤病,可分为Ⅰ型和Ⅱ型2种亚型,发病机制尚不清楚,与遗传、免疫、感染等因素有关。近年来,国内外对银屑病发病与人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)相关性的研究积累了一些资料。目前认为HLA... 目的银屑病是慢性炎症性、增生性皮肤病,可分为Ⅰ型和Ⅱ型2种亚型,发病机制尚不清楚,与遗传、免疫、感染等因素有关。近年来,国内外对银屑病发病与人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)相关性的研究积累了一些资料。目前认为HLA-DRB1*07是与寻常型银屑病最为密切相关的基因位点。尚未见有维吾尔族银屑病患者HLA-DRB1*07频率的研究报道。文中探讨新疆地区维吾尔族寻常型银屑病与HLA-DRB1*07等位基因的相关性。方法用聚合酶链反应-序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)对200例维吾尔族寻常型银屑病患者HLA-DRB1*07等位基因进行检测,并与200例健康人群进行对照,分析了携带该基因的银屑病患者与其家族史的相关性。结果寻常型银屑病患者组HLA-DRB1*07等位基因频率显著高于对照组。Ⅰ型寻常型银屑病HLA-DRB1*07等位基因频率显著高于对照组。有银屑病家族史患者与无银屑病家族史的患者HLA-DRB1*07等位基因频率无显著性差异。结论 HLA-DRB1*07等位基因可能是新疆维吾尔族寻常型银屑病患者的易感基因。 展开更多

关键词 寻常型银屑病 HLA-DRB1 等位基因 聚合酶链反应-序列特异性引物

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内蒙古呼和浩特和通辽地区人群肠道内双歧杆菌多样性分析

6

作者 杨淑莹 赵志鑫 +6 位作者 赵飞燕 沈馨 玉霞 赵佳 文芳 孙志宏 孟和毕力格 《食品研究与开发》 2025年第9期188-196,共9页

该研究探究内蒙古呼和浩特和通辽地区蒙古族人肠道中双歧杆菌(Bifidobacterium)的数量和生物多样性特点,并探讨地域对人体肠道内双歧杆菌数量和生物多样性的影响。以内蒙古呼和浩特地区和通辽地区各50名蒙古族成年志愿者为研究对象,借... 该研究探究内蒙古呼和浩特和通辽地区蒙古族人肠道中双歧杆菌(Bifidobacterium)的数量和生物多样性特点,并探讨地域对人体肠道内双歧杆菌数量和生物多样性的影响。以内蒙古呼和浩特地区和通辽地区各50名蒙古族成年志愿者为研究对象,借助双歧杆菌特异性引物,采用PacBio Sequel Ⅱ测序技术和微滴式数字聚合酶链式反应(droplet digital polymerase chain reaction,dd-PCR)技术解析志愿者肠道中双歧杆菌的数量和生物多样性特点。结果表明,呼和浩特地区志愿者肠道内双歧杆菌的平均生物量[(1.64×10^(8)±2.16)CFU/g]小于通辽地区[(2.04×10^(8)±3.72)CFU/g];在内蒙古志愿者肠道内共注释到11种双歧杆菌,两地区志愿者肠道中双歧杆菌多样性和结构无显著差异,但角双歧杆菌(B.angulatum)和长双歧杆菌(B.longum)等在呼和浩特市志愿者肠道中富集(P<0.05),齿双歧杆菌(B.dentium)、链状双歧杆菌(B.catenulatum)以及热嗜酸性双歧杆菌(B.thermacidophilum)等在通辽市志愿者中显著增加。Spearman分析结果发现,呼和浩特市志愿者肠道内双歧杆菌间互作网络更密集(P<0.05,|R|>0.3)。相比于多样性和结构,地域因素显著影响了肠道双歧杆菌的相对丰度和互作网络关系。 展开更多

关键词 双歧杆菌 特异性引物 微滴式数字聚合酶链式反应(dd-PCR) 三代测序技术 绝对定量

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北京油鸡和矮脚鸡心脏型、脂肪型脂肪酸结合蛋白基因多态性的研究 被引量：31

7

作者 叶满红 曹红鹤 +3 位作者 文杰 李宏滨 陈继兰 赵桂萍 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期422-426,共5页

根据不同物种间同一基因核苷酸序列的保守性及相似性,设计特异性引物,利用聚合酶链式反应技术(PCR),扩增鸡心脏型脂肪酸结合蛋白(H FABP)基因第二内含子序列;根据已经发表的鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A FABP)基因mRNA序列,设计特异性引物... 根据不同物种间同一基因核苷酸序列的保守性及相似性,设计特异性引物,利用聚合酶链式反应技术(PCR),扩增鸡心脏型脂肪酸结合蛋白(H FABP)基因第二内含子序列;根据已经发表的鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A FABP)基因mRNA序列,设计特异性引物,扩增鸡A FABP基因第三内含子序列。选用HhaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ、BamHⅠ、EcoRⅠ、PstⅠ、XmnⅠ和HindⅢ8种限制性内切酶对扩增产物分别进行单酶切,发现H FABP基因第二内含子HhaⅠPCR RFLP及A FABP基因第三内含子HinfⅠPCR RFLP。 展开更多

关键词 北京油鸡 矮脚鸡 心脏型 脂肪型 脂肪酸 蛋白基因 多态性 聚合酶链式反应 特异性引物 内切酶

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HLA-DRB1、DQB1基因多态性与流行性出血热的相关性 被引量：7

8

作者 冯继红 孙万邦 +3 位作者 罗军敏 李维宏 黄学贵 张忆雄 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第48期23-25,共3页

目的从基因水平探讨HLA-DRB1、DQB1等位基因多态性与流行性出血热的相关性,以阐述其免疫遗传学特征。方法应用序列特异性引物聚合酶链反应技术检测流行性出血热患者和正常对照组各50例的HLA-DRB1、DQB1等位基因。结果流行性出血热患者... 目的从基因水平探讨HLA-DRB1、DQB1等位基因多态性与流行性出血热的相关性,以阐述其免疫遗传学特征。方法应用序列特异性引物聚合酶链反应技术检测流行性出血热患者和正常对照组各50例的HLA-DRB1、DQB1等位基因。结果流行性出血热患者与正常对照组比较,HLA-DRB1*16等位基因分布频率明显增高(Pc=0.010 6),两组间其余HLA-DRB1-、DQB1等位基因分布频率差异无统计学意义(Pc>0.05)。结论HLA-DRB1*16等位基因与流行性出血热呈正相关,可能为流行性出血热易感基因之一。 展开更多

关键词 流行性出血热 序列特异性引物聚合酶链反应 人类白细胞抗原 相关性

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河南汉族人群血小板抗原HPA1-16bw基因多态性研究 被引量：7

9

作者 滑世轩 王书勤 +1 位作者 岑东 燕备战 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期545-547,共3页

目的研究河南地区汉族人群血小板抗原基因分布频率,建立地区性血小板抗原基因库,为血小板配合输注提供实验依据。方法用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)对160例无血缘关系的河南汉族体检健康者进行HPA1-16bw系统基因分型。结果 HPA... 目的研究河南地区汉族人群血小板抗原基因分布频率,建立地区性血小板抗原基因库,为血小板配合输注提供实验依据。方法用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)对160例无血缘关系的河南汉族体检健康者进行HPA1-16bw系统基因分型。结果 HPA1-6和HPA-15基因频率分别为1a 0.987 5,1b 0.012 5;2a 0.946 9,2b 0.053 1;3a 0.590 6,3b0.409 4;4a 0.996 9,4b 0.003 1;5a 0.990 6,5b 0.009 4;6a 0.981 2,6b 0.018 8;15a 0.540 6,15b 0.459 4。HPA7-14bw,16bw仅检测到a/a等位基因,基因频率均为1.000 0。经χ2检验各系统HPA符合Hardy-Weinberg平衡法则。HPA基因分布存在种族和地区差异。结论河南汉族人HPA-15和HPA-3基因型杂合率最高。HPA基因分型有助于输注血小板时降低免疫性血小板减少症的发生概率。 展开更多

关键词 人类血小板抗原 序列特异性引物聚合酶链反应 基因分型 基因频率

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RhD血型基因定型在新生儿溶血病产前诊断的应用 被引量：4

10

作者 田爱民 孙启俊 +1 位作者 Helen Davies YW Liew 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期194-195,209,共3页

目的检测血液RhD血型基因型并应用于新生儿溶血病(HDN)的产前诊断。方法采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR SSP)方法,根据PCR产物的强弱判定RhD基因型。结果36名个体血液样本中,10名为RhD-/RhD-纯合子,3名为RhD+/RhD-杂合子,23名为RhD... 目的检测血液RhD血型基因型并应用于新生儿溶血病(HDN)的产前诊断。方法采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR SSP)方法,根据PCR产物的强弱判定RhD基因型。结果36名个体血液样本中,10名为RhD-/RhD-纯合子,3名为RhD+/RhD-杂合子,23名为RhD+/RhD+纯合子。结论该方法可以准确检测出RhD血型基因型,并可用于RhD血型不合引起HDN的产前诊断。 展开更多

关键词 RHD血型 RhD基因型 聚合酶链反应-序列特异性引物 新生儿溶血病 产前诊断

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PCR-SSP检测HLA-B_(27)基因分型诊断强直性脊柱炎 被引量：1

11

作者 董魁 吴俊柱 沈云青 《山东医药》 CAS 北大核心 2004年第25期61-61,共1页

关键词 HLA-B27 基因分型 诊断 PCR-SSP技术 强直性脊柱炎 序列特异性引物 患者 寡核苷酸探针 聚合酶链反应

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广东汉族SLE患者HLA-DR、DQ、DP基因多态性研究 被引量：2

12

作者 禤国维 范瑞强 +2 位作者 吴元胜 陈红 查旭山 《岭南皮肤性病科杂志》 2003年第4期225-228,共4页

目的 :研究广东汉族SLE患者与HLA -DQ、DR、DP的相关性。方法 :采用聚合酶链反应一序列特异性引物 (PCR -SSP)技术 ,对 48例广东籍汉族SLE患者和 1 0 2例健康对照者静脉血样本HLA -DQ、DR、DP等位基因多态性进行研究。结果 :SLE患者DQA1... 目的 :研究广东汉族SLE患者与HLA -DQ、DR、DP的相关性。方法 :采用聚合酶链反应一序列特异性引物 (PCR -SSP)技术 ,对 48例广东籍汉族SLE患者和 1 0 2例健康对照者静脉血样本HLA -DQ、DR、DP等位基因多态性进行研究。结果 :SLE患者DQA1 0 1 0 1等位基因频率显著升高 (RR =8 1 2 ,P =0 0 0 4) ,DQA1 0 3 0 2的明显低于正常组 (RR =0 0 9,P =0 0 0 5 )。DQB1 0 3 0 1基因频率明显低于正常组 ,两者比较有显著性差异 (P <0 0 1 )。SLE患者DR3 (DRB1 0 3 0 1 -DRB1 0 3 0 2 )基因频率显著高于正常组 ( χ2 =1 4 2 4,P <0 0 1 ,RR =2 0 2 0 ) ;DRw5 2 (DRB3 0 1 0 1 -DRB3 0 3 0 1 )基因频率显著高于正常组 ( χ2 =2 0 3 46,P <0 0 1 ) ;DRW1 4:DRB1 1 40 2 ,DRB1 1 40 3基因频率也显著高于正常组 (P <0 0 5 ) ;DR4(DRB1 0 40 1 -DRB1 0 41 1 )基因频率明显低于正常组 (P <0 0 1 ) ,DR9(DRB1 0 90 1 ) ,DRw1 1(DRB1 1 1 0 1 -DRB1 1 1 0 4)基因频率也显著低于正常组 (P <0 0 1 ) ,DPA1 0 2 0 2等位基因频率显著高于正常组 ( χ2 =4 1 2 4,P <0 0 5 ,RR =3 5 4) ,SLE患者DPA1 0 2 0 1等位基因频率显著低于正常组 ( χ2 =4 5 95 ,P <0 0 5 ,RR =0 3 7)。结论 :提示HLA -DQA1 展开更多

关键词 广东汉族 SLE HLA-DR基因 DQ基因 DP基因 系统性红斑狼疮 聚合酶链反应-序列特异性引物技术

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PCR-SSP检测人胰腺癌细胞株PC-2K-ras基因点突变及其方式 被引量：3

13

作者 高亮 王永向 +2 位作者 纪宗正 陈熹 吴涛 《西安医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期227-228,269,共3页

目的　检测人胰腺癌细胞株PC 2K ras基因点突变及其突变方式 ,明确基因治疗靶点的碱基序列。方法　针对K ras基因第 1 2位密码子点突变方式 (CGT、CAT、GTT)设计顺序特异性引物 (SSP) ,对人胰腺癌细胞株PC 2进行聚合酶链反应 (PCR) ,扩... 目的　检测人胰腺癌细胞株PC 2K ras基因点突变及其突变方式 ,明确基因治疗靶点的碱基序列。方法　针对K ras基因第 1 2位密码子点突变方式 (CGT、CAT、GTT)设计顺序特异性引物 (SSP) ,对人胰腺癌细胞株PC 2进行聚合酶链反应 (PCR) ,扩增产物借助聚丙烯酰胺凝胶电泳判定该细胞株有无K ras基因点突变及其突变方式。结果　人胰腺癌细胞株PC 2存在K ras基因点突变 ,突变方式为CGT。结论　PCR SSP法简便快速 ,特异性高 。 展开更多

关键词 胰腺癌 胰腺肿瘤 K-RAS基因 点突变 聚合酶链反应 突变方式 顺序特异性引物

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115例献血者ABH分泌型与非分泌型分布及基因多态性分析 被引量：1

14

作者 朱岷 马洪亮 +1 位作者 赵蒲宇 兰炯采 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期550-552,共3页

目的探讨115例汉族献血者ABH分泌型与非分泌型血清学分布及基因多态性。方法用凝集抑制试验检测115例标本ABH血型物质,聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)对选取标本作ABH基因定型,直接测序技术对46例血清学检测为分泌型标本进行分... 目的探讨115例汉族献血者ABH分泌型与非分泌型血清学分布及基因多态性。方法用凝集抑制试验检测115例标本ABH血型物质,聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)对选取标本作ABH基因定型,直接测序技术对46例血清学检测为分泌型标本进行分析。结果 115例献血者中分泌型95例,非分泌型20例;分泌型献血者A物质效价均高于B物质效价和H物质效价(P<0.05);115例献血者中,无A385T基因突变的48例均为分泌型;A385T基因突变者中,杂合子基因385A/385T 39例,为分泌型,纯合子385T/385T基因28例,8例为分泌型,20例为非分泌型;1例分泌型标本出现178C/T新的突变位点。结论 ABH血型A物质效价高于B、H物质,115例汉族人群中存在不同于高加索人群及非洲人群的A385T基因突变。 展开更多

关键词 ABH分泌型 聚合酶链反应-序列特异性引物 基因多态性 (DNA)序列测定

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HLA-DQB1基因分型技术

15

作者 黄兵 张祖文 +3 位作者 兰炯采 张玉明 武大林 黄志光 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期29-31,共3页

报告了简便、快速的ＨＬＡ－ＤＱＢ１聚合酶链反应一序列特异性引物（ＰＣＲ－ＳＳＰ）基因分型技术。比较了基因分型与血清学分型技术的结果，其中３３份标本中６份血清型结果（１８．２％）与基因型不吻合。

关键词 人类白细胞抗原 聚合酶链反应 序列特异性引物

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DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与SLE的相关性

16

作者 张敏 齐名 +3 位作者 车敦发 管海宏 胡文星 邓德权 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期115-117,共3页

目的分析中国汉族人群SLE患者与健康对照人群中DNA修复基因X线修复交叉互补基因1(XRCC1)的单核苷酸多态性(SNP)分布,探讨其对SLE易感性的影响及与临床表现、实验室指标的关联程度。方法用等位基因特异性PCR(AS-PCR)检测39例中国汉族SLE... 目的分析中国汉族人群SLE患者与健康对照人群中DNA修复基因X线修复交叉互补基因1(XRCC1)的单核苷酸多态性(SNP)分布,探讨其对SLE易感性的影响及与临床表现、实验室指标的关联程度。方法用等位基因特异性PCR(AS-PCR)检测39例中国汉族SLE患者和40例中国汉族健康人的XRCC1基因多态位点Arg194Trp、Arg280His和Arg399G1n的SNP型别。结果 SLE组XRCC1多态位点Arg399G1n等位基因和基因型频率分布与健康人对照组比较具有显著性差异(P<0.05)。XRCC1多态位点Arg194Trp与SLE患者的血液系统损害及抗SS-A抗体的存在相关(P<0.05)。结论 XRCC1基因SNP与SLE发生及临床表现和自身抗体可能相关。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性 系统性红斑狼疮 X线修复交叉互补基因1 DNA修复 等位基因特异性聚合酶链反应

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PCR-SSP/PCR-SSO两种KIR基因分型方法的比较 被引量：2

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作者 李娟 慕力 +6 位作者 韩兴乔 张华 孙乐静 暨波 魏博 杨俊晔 韩俊领 《生物医学工程与临床》 CAS 2021年第2期225-231,共7页

目的杀伤细胞免疫蛋白样受体(KIR)基因在自然杀伤细胞活性调节、机体抗感染、移植免疫过程中发挥重要作用。在脐带血移植中,KIR基因分型的效率和准确关系到移植的成败。为了满足临床上对KIR基因分型的要求,对比分析聚合酶链反应-序列特... 目的杀伤细胞免疫蛋白样受体(KIR)基因在自然杀伤细胞活性调节、机体抗感染、移植免疫过程中发挥重要作用。在脐带血移植中,KIR基因分型的效率和准确关系到移植的成败。为了满足临床上对KIR基因分型的要求,对比分析聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)和聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)两种方法,试图建立一个高效便捷检测KIR基因分型的方法学体系。方法从2018年到2019年已外送到第三方检测实验室(北京博富瑞医学检验实验室有限公司)做过KIR基因分型检测的脐带血样本中随机取出12份,分别用PCR-SSP及PCR-SSO商品化试剂盒进行KIR基因分型检测,并通过凝胶电泳分析或MATCH IT!DNA软件分析,获取KIR基因分型结果。结果12例脐带血样本中,PCR-SSO方法学检测的结果与原PCR-SSO方法检测结果完全一致,PCR-SSP方法学检测的结果与原PCR-SSO方法检测结果9例相同,有2例因出现漏孔而无法判读,有1例出现了假阳性带。结论PCR-SSO方法学检测KIR基因效果优于PCR-SSP,但是PCR-SSO方法学也存在当微珠的荧光校准值接近于临界值时,结果出现错判的现象;为保证KIR基因分型的准确度,建议PCR-SSP方法出现漏孔或者PCR-SSO方法荧光校准值接近于临界值时两种方法相互验证。 展开更多

关键词 KIR基因 基因分型 聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP) 聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO) 荧光校准值 相互验证

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对HLA-B座位中低分辨中模棱两可基因分型的调查分析

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作者 鞠瑞青 《中国实用医药》 2014年第4期255-255,共1页

人类白细胞抗原（HLA）是目前所知的最具有多态性的遗传系统之一,它位于人类第6号染色体短臂上,总长度3600 kb,约占人类基因组总长度的1/3000。整个HLA复合体共有数十个基因座,可分为HLA-Ⅰ类、HLA-Ⅱ类、HLA-Ⅲ类基因。HLA-B基因座属于... 人类白细胞抗原（HLA）是目前所知的最具有多态性的遗传系统之一,它位于人类第6号染色体短臂上,总长度3600 kb,约占人类基因组总长度的1/3000。整个HLA复合体共有数十个基因座,可分为HLA-Ⅰ类、HLA-Ⅱ类、HLA-Ⅲ类基因。HLA-B基因座属于HLA-Ⅰ类基因,它是HLA编码系统中最复杂,多态性最多的区域,由于其高变区各个等位基因差异仅在几个碱基,且只有极少等位基因某个高变区具有独立的碱基序列,因而交叉反应众多,故B位点往往出现定型困难［1］。尽管现有特异性寡核苷酸探针技术已经达到了中等分辨水平,但对于HLA-B座位上有些模棱两可的基因型尚不能分辨识别。作者所在实验室采用特异性寡核苷酸探针（PCR-SSO）技术对13485例HLA-B座位进行中低分辨调查分析,并对筛选出的模棱两可等位基因通过采用聚合酶链反应-序列特异性引物扩增（PCR-SSP）技术进行进一步确认。 展开更多

关键词 HLA-B 聚合酶链反应-序列特异性引物扩增 特异性寡核苷酸探针 基因分型 调查 人类白细胞抗原 HLA-Ⅰ类 人类基因组

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广西道地药材肉桂及阴香的DNA分子鉴定研究 被引量：3

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作者 李立 吴桂凡 +3 位作者 罗轶 李丽莉 凌婕 马双成 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期191-196,203,共7页

建立一种能够准确鉴别肉桂及阴香的特异性聚合酶链式反应方法,以保障肉桂用药的安全性和有效性。通过对比分析肉桂及阴香的psbA-trnH序列差异找到特异性单核苷酸多态性位点,设计特异性引物,通过优化退火温度、循环次数,评估不同聚合酶... 建立一种能够准确鉴别肉桂及阴香的特异性聚合酶链式反应方法,以保障肉桂用药的安全性和有效性。通过对比分析肉桂及阴香的psbA-trnH序列差异找到特异性单核苷酸多态性位点,设计特异性引物,通过优化退火温度、循环次数,评估不同聚合酶种类和不同基因扩增仪等扩增条件对不同来源的肉桂及阴香进行特异性扩增,根据特异性扩增条带进行鉴别。结果表明退火温度为54℃,循环次数为35次时,肉桂经肉桂特异性引物扩增后在100~200 bp处出现特异性条带,阴香无条带;退火温度为56℃,循环次数为40次时,阴香经阴香引物扩增后在200~300 bp处出现特异性条带,肉桂无条带。该研究所建立的特异性PCR方法可以快速准确鉴别出肉桂及阴香,为控制肉桂的质量安全提供参考。 展开更多

关键词 肉桂 阴香 特异性聚合酶链式反应 特异性引物 质量安全

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马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种real-time PCR检测方法的建立与应用

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作者 吕厚姣 李欣媛 +3 位作者 白小佳 贾龙刚 耿伟涛 王艳萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第9期102-108,共7页

本研究建立了一种特异性实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法,根据模式菌株马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种ZW3的16S rDNA序列和全基因组序列设计筛选特异性引物,采用SYBR Green I荧光染料建立r... 本研究建立了一种特异性实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法,根据模式菌株马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种ZW3的16S rDNA序列和全基因组序列设计筛选特异性引物,采用SYBR Green I荧光染料建立real-time PCR方法,并对方法的特异性、灵敏度、重复性和混合体系等进行检测。结果表明,本研究所建立的方法特异性强、灵敏度高、重复性好,建立real-time PCR的标准曲线,其决定系数R2为0.965,具有良好的线性关系,且在马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种及混合体系中可以特异性检出。综上,本研究建立的real-time PCR法可以快速、准确地检测马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种,为马乳酒样乳杆菌的特异性定性定量检测提供了一种新的方法。 展开更多

关键词 马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种 实时聚合酶链式反应 特异性引物

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