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加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法被引量：5: 1; 作者马玉韬车进 +1 位作者关欣滕建辅《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2013年第2期129-135,共7页; 改进Gabor小波变换(Modified Gabor wavelet transform,MGWT)蛋白质编码区预测算法给出的预测结果在当前所有的独立预测算法中准确率最高。本文提出了有限脉冲响应(Finite impulse response,FIR)加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测(Windo... 展开更多; 关键词蛋白质编码区预测窄通带滤波器 FIR滤波器窗函数法群延迟; 在线阅读下载PDF 职称材料

一种基于改进通用梳状滤波器的基因预测算法: 2; 作者贾艳玲马玉韬 +1 位作者刘思远唐晓芬《湖北农业科学》北大核心 2014年第19期4712-4715,共4页; 针对IIR滤波器在设计和使用中存在系统稳定性和群延迟造成输出滞后的问题,以通用梳状滤波器为例提出了适用于IIR NPBF的改进预测算法。在HMR195序列集上的预测结果表明,所提算法能有效提高编码区预测准确率。; 关键词窄通带滤波器蛋白质编码区预测无限脉冲响应滤波器群延迟; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于全相位滤波理论的基因预测被引量：2: 3; 作者马玉韬轩秀巍 +1 位作者车进滕建辅《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1149-1154,共6页; 基于全相位滤波理论,设计了一种新的FIR窄通带滤波器———APNPBF.它能精确控制通带增益,且不需反复进行参数调试.使用频率采样、Chebyshev窗和全相位窄通带滤波器分别作为蛋白质编码区预测算法的核心,在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上... 展开更多; 关键词全相位窄通带滤波器基因预测蛋白质编码区预测窗函数; 在线阅读下载PDF 职称材料

DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响被引量：7: 4; 作者马玉韬张成 +2 位作者杨泽林李琦杨婷《安徽农业科学》 CAS 2012年第6期3234-3238,共5页; [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射... 展开更多; 关键词预测准确率蛋白质编码区映射方法加窗窄通带滤波器; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析: 5; 作者刘平马玉韬 +2 位作者孙学宏张成杜勇《湖北农业科学》北大核心 2014年第6期1432-1435,共4页; 蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视。研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR(Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法... 展开更多; 关键词蛋白质编码区预测窄通带滤波器归一化的功率谱密度值信噪比近似相关系数; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法被引量：5: 1; 作者马玉韬车进关欣滕建辅; 机构天津大学电子信息工程学院宁夏大学物理电气信息学院; 出处《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2013年第2期129-135,共7页; 基金国家自然科学基金(61162020)资助项目宁夏自然科学基金(NZ1024)资助项目宁夏高校科学研究项目(2011263)资助项目; 文摘改进Gabor小波变换(Modified Gabor wavelet transform,MGWT)蛋白质编码区预测算法给出的预测结果在当前所有的独立预测算法中准确率最高。本文提出了有限脉冲响应(Finite impulse response,FIR)加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测(Windowed narrow pass-band filter,WNPBF)算法。算法的主要部分包括:以F56F11.4序列为例给出了WNPBF阶数选择的依据,并据此设计WNPBF;为消除滤波器群延迟对预测结果产生的不良影响,对信号用边界对称延拓法进行预处理并对窄带滤波器滤波输出信号进行截取;为改善预测结果,设计滑动平均滤波器平滑功率谱密度曲线。在ALLSEQ和HMR195两个DNA序列集上获得预测准确率分别接近或达到独立预测算法的最高水平。通过比较后发现,所提出的WNPBF算法较MGWT算法效率更高,使用该算法可以直观和客观地比较不同滤波器的预测结果。; 关键词蛋白质编码区预测窄通带滤波器 FIR滤波器窗函数法群延迟; Keywords protein coding region prediction narrow pass-band filter FIR filters windowfunction method group delay; 分类号 TN713 [电子电信—电路与系统] Q751 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种基于改进通用梳状滤波器的基因预测算法: 2; 作者贾艳玲马玉韬刘思远唐晓芬; 机构宁夏大学物理电气信息学院/宁夏信息感知与智能沙漠重点实验室宁夏大学发展规划与学科建设处宁夏大学数学计算机学院; 出处《湖北农业科学》北大核心 2014年第19期4712-4715,共4页; 基金宁夏自然科学基金项目"分数阶滤波器设计及其在基因预测中的应用研究"(NZ13028) 宁夏高等学校科学技术研究重点项目"基于滤波理论的基因预测研究"(NGY2013003) 宁夏大学科学研究基金项目"地震资料中非平稳随机噪声信号的消减方法研究"(ZR1237); 文摘针对IIR滤波器在设计和使用中存在系统稳定性和群延迟造成输出滞后的问题,以通用梳状滤波器为例提出了适用于IIR NPBF的改进预测算法。在HMR195序列集上的预测结果表明,所提算法能有效提高编码区预测准确率。; 关键词窄通带滤波器蛋白质编码区预测无限脉冲响应滤波器群延迟; Keywords narrow pass-band filter protein coding regions prediction infinite impulse response filter group delay; 分类号 Q751 [生物学—分子生物学] TN713 [电子电信—电路与系统]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于全相位滤波理论的基因预测被引量：2: 3; 作者马玉韬轩秀巍车进滕建辅; 机构天津大学电子信息工程学院宁夏大学物理电气信息学院天津理工大学电子信息工程学院; 出处《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1149-1154,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(61162020) 宁夏自然科学基金资助项目(NZ1024) 宁夏高校科学研究项目(2011263)资助课题; 文摘基于全相位滤波理论,设计了一种新的FIR窄通带滤波器———APNPBF.它能精确控制通带增益,且不需反复进行参数调试.使用频率采样、Chebyshev窗和全相位窄通带滤波器分别作为蛋白质编码区预测算法的核心,在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上获得的碱基层预测准确率AC表明,APNPBF效果优于现有方法.; 关键词全相位窄通带滤波器基因预测蛋白质编码区预测窗函数; Keywords all-phase narrow pass-band filter gene prediction protein coding regions prediction window function; 分类号 Q751 [生物学—分子生物学] TN713 [电子电信—电路与系统]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响被引量：7: 4; 作者马玉韬张成杨泽林李琦杨婷; 机构宁夏大学物理电气信息学院天津大学电子信息工程学院; 出处《安徽农业科学》 CAS 2012年第6期3234-3238,共5页; 基金宁夏自然科学基金(NZ1024) 宁夏高校科学研究项目(201027)资助; 文摘 [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-IoInteraction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。; 关键词预测准确率蛋白质编码区映射方法加窗窄通带滤波器; Keywords Prediction accuracy Protein coding regions Mapping method Windowed Narrow pass-band filter; 分类号 Q523 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析: 5; 作者刘平马玉韬孙学宏张成杜勇; 机构宁夏大学物理电气信息学院/宁夏沙漠信息智能感知重点实验室宁夏医科大学总医院小儿外科; 出处《湖北农业科学》北大核心 2014年第6期1432-1435,共4页; 基金国家自然科学基金项目(81260100) 宁夏自然科学基金项目(NZ13028) 宁夏高校科学研究重点项目(NGY2013003); 文摘蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视。研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR(Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较。结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观。; 关键词蛋白质编码区预测窄通带滤波器归一化的功率谱密度值信噪比近似相关系数; Keywords protein coding regions prediction narrow pass-band filter normalized value of power spectrum density ratio of signal to noise approximate correlation; 分类号 TP391.9 [自动化与计算机技术—计算机应用技术] TN713 [电子电信—电路与系统]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法	马玉韬车进关欣滕建辅	《数据采集与处理》 CSCD 北大核心	2013	5	在线阅读下载PDF 职称材料
2	一种基于改进通用梳状滤波器的基因预测算法	贾艳玲马玉韬刘思远唐晓芬	《湖北农业科学》北大核心	2014	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于全相位滤波理论的基因预测	马玉韬轩秀巍车进滕建辅	《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2013	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响	马玉韬张成杨泽林李琦杨婷	《安徽农业科学》 CAS	2012	7	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析	刘平马玉韬孙学宏张成杜勇	《湖北农业科学》北大核心	2014	0	在线阅读下载PDF 职称材料