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空间转录组学在衰老研究中的应用与未来: 1; 作者孙宇哲郑惠文聂超《中国医学前沿杂志（电子版）》 CSCD 北大核心 2024年第8期14-22,共9页; 空间转录组学技术通过在基因表达分析中添加空间位置信息,为生物学研究,尤其在探索细胞老化和器官功能衰退方面提供了新的视角。本文综述了空间转录组学在脑衰老、皮肤衰老以及其他器官系统中的应用,并探讨了这些技术在揭示衰老机制中... 展开更多; 关键词空间转录组学衰老机制器官衰老新算法生物年龄; 在线阅读下载PDF 职称材料

空间转录组学技术及其应用的研究进展被引量：1: 2; 作者林辰张心雅 +1 位作者马伟燕柯荣秦《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期506-516,共11页; 空间转录组简单地说就是一个完整的组织样本中不同位置的全部转录组数据信息.目前的空间转录组学技术主要包括两大类:基于原位捕获并测序和基于成像的空间转录组学技术.这些技术已被广泛应用于神经生物学、发育生物学、肿瘤生物学等领域... 展开更多; 关键词空间转录组学基因表达分析原位检测单细胞分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

整合组织学图像信息增强空间转录组细胞聚类的分辨率: 3; 作者王睿戚继《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期39-46,共8页; 【目的】增加空间转录组基因表达的空间分辨率以提升遗传发育与疾病研究中的细胞谱系和类型变化的精度,提供更精细的分子表型信息。【方法】通过图像分割实现空间转录组点阵的细胞空间分布模拟,使用线性插值方法重构超分辨率基因空间表... 展开更多; 关键词空间转录组学细胞分割空间域识别细胞聚类; 在线阅读下载PDF 职称材料

空间转录物组学技术进展及其在神经科学领域中的应用被引量：1: 4; 作者项铮苏存锦潘杰《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1486-1492,共7页; 空间转录物组学是在单细胞RNA测序技术基础上实现细胞空间位置信息测定的组学技术。该技术克服了单细胞转录物组学在单细胞分离建库过程中丢失细胞在组织中空间信息的问题,可同时提供研究对象的转录物组数据信息和在组织中的空间位置信... 展开更多; 关键词空间转录物组学单细胞测序神经科学; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名空间转录组学在衰老研究中的应用与未来: 1; 作者孙宇哲郑惠文聂超; 机构深圳华大生命科学研究院北京华大生命科学研究院深圳市神经基因组重点实验室深圳华大生命科学研究院杭州华大生命科学研究院; 出处《中国医学前沿杂志（电子版）》 CSCD 北大核心 2024年第8期14-22,共9页; 基金国家重点研发计划(2023YFC3603300)。; 文摘空间转录组学技术通过在基因表达分析中添加空间位置信息,为生物学研究,尤其在探索细胞老化和器官功能衰退方面提供了新的视角。本文综述了空间转录组学在脑衰老、皮肤衰老以及其他器官系统中的应用,并探讨了这些技术在揭示衰老机制中的重要作用。研究中使用的新型算法和统计方法,提高了我们对空间数据中隐藏的生物学信息的解析能力。这些发现不仅深化了对衰老过程的理解,还为开发新的治疗策略提供了潜在的靶点。未来,空间转录组学有望在揭示衰老的分子机制、细胞微环境以及开发针对年龄相关疾病的治疗方法中发挥更加关键的作用。; 关键词空间转录组学衰老机制器官衰老新算法生物年龄; Keywords Spatial transcriptomics Aging mechanisms Organ aging Novel algorithms Biological age; 分类号 R394 [医药卫生—医学遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名空间转录组学技术及其应用的研究进展被引量：1: 2; 作者林辰张心雅马伟燕柯荣秦; 机构华侨大学医学院; 出处《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期506-516,共11页; 基金国家自然科学基金(31770927)。; 文摘空间转录组简单地说就是一个完整的组织样本中不同位置的全部转录组数据信息.目前的空间转录组学技术主要包括两大类:基于原位捕获并测序和基于成像的空间转录组学技术.这些技术已被广泛应用于神经生物学、发育生物学、肿瘤生物学等领域.本文总结并比较了不同空间转录组学技术的特点,列举了空间转录组学技术在不同领域中的应用,最后讨论了其所面临的挑战和机遇.; 关键词空间转录组学基因表达分析原位检测单细胞分析; Keywords spatial transcriptomics gene expression analysis in situ detection single cell analysis; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名整合组织学图像信息增强空间转录组细胞聚类的分辨率: 3; 作者王睿戚继; 机构复旦大学生命科学学院; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期39-46,共8页; 基金国家自然科学基金项目(32070247)。; 文摘【目的】增加空间转录组基因表达的空间分辨率以提升遗传发育与疾病研究中的细胞谱系和类型变化的精度,提供更精细的分子表型信息。【方法】通过图像分割实现空间转录组点阵的细胞空间分布模拟,使用线性插值方法重构超分辨率基因空间表达,并利用图聚类方法揭示组织中细胞分布的空间偏好性。【结果】将新方法SpaGMM在小鼠后脑10X Visium数据集上进行检验,可以精确识别小鼠脑神经空间结构域。通过与几种空间转录组聚类的常用方法进行比较,结果显示SpaGMM的聚类结果更加符合组织学区域的注释,这些区域具有大量标记基因的空间表达支持。SpaGMM还可以从小鼠小脑区域中区分出浦肯野细胞(Purkinje cell)和伯格曼胶质细胞(Bergmann glial cell)所对应的组织区域,发现不同细胞层中存在互补的基因表达模式。【结论】SpaGMM可以通过提高点阵的空间分辨率揭示组织结构域的精细结构。; 关键词空间转录组学细胞分割空间域识别细胞聚类; Keywords spatial transcriptomics cell segmentation spatial domain recognition cell clustering; 分类号 TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术] Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名空间转录物组学技术进展及其在神经科学领域中的应用被引量：1: 4; 作者项铮苏存锦潘杰; 机构苏州大学附属第二医院药剂科; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1486-1492,共7页; 基金国家自然科学基金项目(No.82102486) 苏州市科技计划项目(No.SYS2020145,No.SYSD2020185) +1 种基金江苏省研究型医院学会基金项目(No.JY202032)资助。; 文摘空间转录物组学是在单细胞RNA测序技术基础上实现细胞空间位置信息测定的组学技术。该技术克服了单细胞转录物组学在单细胞分离建库过程中丢失细胞在组织中空间信息的问题,可同时提供研究对象的转录物组数据信息和在组织中的空间位置信息。空间转录物组学技术对研究细胞谱系的发生过程、细胞间的调控机制和相互作用等具有重要作用,是组学技术研究的重要发展方向和热点。近年来,空间转录物组学技术发展迅速,新的检测方法不断产生,检测灵敏度、分辨率和检测通量等技术指标不断提升。本文根据获取空间信息的原理不同,将较为常用的空间转录物组学技术进行了分类,总结了各类方法的检测原理、代表性技术手段及其相应的技术指标。随后,从脑细胞类型区分与细胞层图谱构建、神经系统相关疾病特征分析与标志物研究两个方面举例论述了空间转录物组学技术在神经科学中的应用。最后,对空间转录物组学技术目前存在的问题进行了总结,并对其未来的发展方向进行了展望。; 关键词空间转录物组学单细胞测序神经科学; Keywords spatial transcriptomics single cell sequencing neuroscience; 分类号 Q522 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	空间转录组学在衰老研究中的应用与未来	孙宇哲郑惠文聂超	《中国医学前沿杂志（电子版）》 CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	空间转录组学技术及其应用的研究进展	林辰张心雅马伟燕柯荣秦	《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	整合组织学图像信息增强空间转录组细胞聚类的分辨率	王睿戚继	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	空间转录物组学技术进展及其在神经科学领域中的应用	项铮苏存锦潘杰	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料