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基于稳定性同位素核酸探针技术的红壤微生物底物利用策略研究被引量：7: 1; 作者王辛辛刘岩 +3 位作者张威周旭辉何红波张旭东《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期274-284,共11页; 外源活性碳底物输入强烈影响土壤微生物的生长,但是在系统发育分类水平上,细菌和真菌对活性底物的动态响应及利用特征和微生物群落组成的关系仍不清楚。以红壤为研究对象,采用;C标记葡萄糖为底物进行模拟培养并定期取样,利用稳定性同位... 展开更多; 关键词底物利用策略 C-葡萄糖时间动态营养策略稳定同位素核酸探针技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

稳定性同位素探针技术在土壤功能微生物原位鉴定的应用被引量：6: 2; 作者蔺中孙礼勇 +3 位作者陈昊孙迎韬白婧李永涛《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-6,共6页; 新近发展起来的稳定性同位素探针技术(SIP)与分子生物学方法结合,能够定向发掘复杂环境中参与特定生态过程的微生物资源,是土壤功能微生物原位鉴定的有效手段,具有广阔的应用前景。其原理是环境样品中的功能微生物代谢同化同位素标记的... 展开更多; 关键词土壤稳定性同位素探针技术原位鉴定功能微生物; 在线阅读下载PDF 职称材料

青枯病导病型和抑病型植烟土壤氮循环微生物群落差异分析被引量：1: 3; 作者刘艳霞李想 +6 位作者李寒蒋天平芶剑渝张恒朱经伟高维常姚云静《贵州农业科学》 CAS 2024年第11期52-63,共12页; 【目的】探明导病型和抑病型植烟土壤氮循环微生物群落演替规律,为研究连作障碍发生的微生物机制奠定基础。【方法】通过“限微模拟宇宙系统”,采用稳定同位素核酸探针(DNA-SIP)技术标记氮来源,利用宏基因组高通量测序技术开展导病抑病... 展开更多; 关键词烟草导病抑病土壤烟草青枯病根系分泌物氮素循环微生物稳定性同位素核酸探针技术微生物群落; 在线阅读下载PDF 职称材料

水稻土好氧甲烷氧化菌对大气CO_(2)浓度升高的适应规律: 4; 作者曹伟伟严陈 +3 位作者钟文辉朱春梧朱建国贾仲君《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1055-1065,共11页; CH4是仅次于CO_(2)的第二大温室气体,而稻田是CH4的主要排放源,未来大气CO_(2)浓度升高情景下(elevatedCO_(2),eCO_(2)),水稻土好氧甲烷氧化过程及其功能微生物群落适应规律尚不清楚。依托中国FACE(FreeAir CO_(2) Enrichment)水稻田试... 展开更多; 关键词大气CO_(2)浓度升高水稻土甲烷氧化菌稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP) 高通量测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤^(15)N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法被引量：2: 5; 作者苟永刚余玲玲 +1 位作者许霞王建武《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期140-147,共8页; 为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)中超高速离心后15N-DNA富集位置的指示功能基因,利用实时荧光定量PCR技术(qPCR),检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布,通过对氮素循... 展开更多; 关键词甘蔗//大豆间作稳定性同位素核酸探针荧光定量PCR 功能基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于稳定性同位素核酸探针技术的红壤微生物底物利用策略研究被引量：7: 1; 作者王辛辛刘岩张威周旭辉何红波张旭东; 机构中国科学院沈阳应用生态研究所全球变化与生态预测研究中心中国科学院大学上海污染控制与生态安全研究院沈阳农田生态系统国家野外科学观测研究站; 出处《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期274-284,共11页; 基金国家自然科学基金重点项目(41630862) 国家重点研发计划项目(2017YFD0200100) 中国科学院战略先导专项(XDB15040200)共同资助。; 文摘外源活性碳底物输入强烈影响土壤微生物的生长,但是在系统发育分类水平上,细菌和真菌对活性底物的动态响应及利用特征和微生物群落组成的关系仍不清楚。以红壤为研究对象,采用;C标记葡萄糖为底物进行模拟培养并定期取样,利用稳定性同位素核酸探针(DNA-based stable isotope probing,DNA-SIP)和高通量测序技术分析活性的真菌和细菌类群,并探讨不同微生物利用葡萄糖来源碳的动态特征。研究发现,微生物群落对葡萄糖的利用符合从细菌向真菌演替的r/K选择策略。在细菌群落中,隶属于富营养菌的变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)对活性底物的利用能力显著高于寡营养菌的酸杆菌门(Acidobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi)。和细菌的底物利用策略不同,真菌子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)在整个培养期间均可以利用葡萄糖和土壤原有组分。因此,葡萄糖的连续加入并未改变不同营养类型细菌的底物利用策略,而真菌对底物的利用具有广谱性特征,活性底物可诱导真菌对土壤原有组分的利用。; 关键词底物利用策略 C-葡萄糖时间动态营养策略稳定同位素核酸探针技术; Keywords Microbial substrate utilization strategy 13C-glucose Temporal variation Trophic pattern DNA-based stable isotope probing; 分类号 S154.36 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名稳定性同位素探针技术在土壤功能微生物原位鉴定的应用被引量：6: 2; 作者蔺中孙礼勇陈昊孙迎韬白婧李永涛; 机构华南农业大学资源环境学院; 出处《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-6,共6页; 基金国家自然科学基金(40871152 41171210); 文摘新近发展起来的稳定性同位素探针技术(SIP)与分子生物学方法结合,能够定向发掘复杂环境中参与特定生态过程的微生物资源,是土壤功能微生物原位鉴定的有效手段,具有广阔的应用前景。其原理是环境样品中的功能微生物代谢同化同位素标记的底物,通过对其生物标志物(即DNA、RNA、PLFA等)进行提取、分离、鉴定和比对分析,以此获取介导土壤物质转化和循环过程的功能微生物的直接信息。本文在分别介绍SIP技术在土壤功能微生物原位鉴定过程中的各种前处理方法、生物标志物选择及后续鉴定方法的基础上,综述了SIP技术在研究驱动土壤有机污染物生物降解、碳氮循环等过程的功能微生物原位鉴定的应用进展,展望了SIP技术在土壤微生物基因组学方面的应用前景。; 关键词土壤稳定性同位素探针技术原位鉴定功能微生物; Keywords soil stable isotope probing in-situ identification functional microorganism; 分类号 S154.3 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名青枯病导病型和抑病型植烟土壤氮循环微生物群落差异分析被引量：1: 3; 作者刘艳霞李想李寒蒋天平芶剑渝张恒朱经伟高维常姚云静; 机构贵州省烟草科学研究院中国烟草总公司贵州省公司贵州大学贵州省烟草公司遵义市公司; 出处《贵州农业科学》 CAS 2024年第11期52-63,共12页; 基金中国烟草总公司重点研发项目“土壤残留除草剂和化感物质的微生物消减关键技术研究”(110202202015),“烟草生防菌精准鉴定、重要性状解析及资源库建设”(110202201019) 中国烟草总公司贵州省公司科技项目“根际增氧技术促进有机肥养分转化的研究与应用”(201905),“基于烟叶特色香气品质彰显的土壤微生物调控技术研究与应用”(2021XM18),“烤烟根系趋化菌群重建抵御青枯菌机制及应用研究”(2022XM03) 福建中烟项目“福建中烟基地单元高品质上部烟叶开发技术集成研究与应用”(闽烟工合作[2021]9号)。; 文摘【目的】探明导病型和抑病型植烟土壤氮循环微生物群落演替规律,为研究连作障碍发生的微生物机制奠定基础。【方法】通过“限微模拟宇宙系统”,采用稳定同位素核酸探针(DNA-SIP)技术标记氮来源,利用宏基因组高通量测序技术开展导病抑病植烟根际土壤氮循环微生物特征分析,并建立特征微生物与烟叶品质、产质量、青枯病发病状况等表观数据的相关性。【结果】导病抑病土壤中参与氮素循环的微生物种类具有差异,导病与抑病土壤中受根系分泌物调控的特有微生物分别为受土壤本身影响微生物数量的63.9%和1.29倍;在根系分泌物介导下,导病土壤中与氮循环相关的物种群落主要为变形菌门(Proteobacteria),主要上调与细胞运动和转运有关的基因;抑病土壤中主要为放线菌门(Actinobacteria),主要上调与物质转运与代谢有关的基因。导病与抑病土氮循环微生物具有显著差异的物种为硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和木纹杆菌门(Lgnavibacteriae);抑病土壤中与质量指标间存在极显著相关关系的微生物属比导病土壤少21.7%,但抑病土壤微生物与烟叶品质关键指标茄酮间关联性是交叉互作的,显著相关比例较导病土提升19.3百分点。【结论】根系分泌物主要影响导病土壤与氮素循环相关的微生物,土壤本身的性状主要影响抑病土壤氮素循环相关微生物,即导病土壤微生物易受作物的影响发生病害;抑病土壤通过调控土壤微生物对烟叶质量的影响,保持烟叶质量的稳定状态。; 关键词烟草导病抑病土壤烟草青枯病根系分泌物氮素循环微生物稳定性同位素核酸探针技术微生物群落; Keywords tobacco disease-conducive and suppressive soil tobacco bacterial wilt root exudates nitrogen cycling related microorganisms stable isotope nucleic acid probe technology(DNA-SIP) microbial community; 分类号 S154.3 [农业科学—土壤学] S141 [农业科学—肥料学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名水稻土好氧甲烷氧化菌对大气CO_(2)浓度升高的适应规律: 4; 作者曹伟伟严陈钟文辉朱春梧朱建国贾仲君; 机构土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所) 中国科学院大学南京师范大学地理科学学院; 出处《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1055-1065,共11页; 基金国家自然科学基金项目(92251305)资助。; 文摘 CH4是仅次于CO_(2)的第二大温室气体,而稻田是CH4的主要排放源,未来大气CO_(2)浓度升高情景下(elevatedCO_(2),eCO_(2)),水稻土好氧甲烷氧化过程及其功能微生物群落适应规律尚不清楚。依托中国FACE(FreeAir CO_(2) Enrichment)水稻田试验平台,通过13C-CH4示踪的室内微宇宙培养实验,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)和高通量测序技术,研究未来大气CO_(2)浓度升高对水稻土甲烷氧化活性及其功能微生物的影响规律。结果表明:与常规大气CO_(2)浓度(ambient CO_(2),aCO_(2))相比,eCO_(2)条件下的甲烷氧化活性显著增加,从243 nmol·g^(-1) d.w.s·h^(-1)增加至302 nmol·g^(-1) d.w.s·h^(-1),增幅高达24.3%,甲烷氧化菌数量则增加了1.1倍~1.2倍。通过超高速离心获得活性甲烷氧化菌同化13CH4后合成的13C-DNA,高通量测序发现,未来大气CO_(2)升高情景下水稻土活性好氧甲烷氧化微生物群落极可能发生明显演替,与对照相比,类型I甲烷氧化菌甲基杆菌属Methylobacter的相对丰度增加16.2%~17.0%,而甲基八叠球菌属Methylosarcina的相对丰度下降4.7%~11.1%;同时刺激了食酸菌属Acidovorax和假单胞菌属Pseudomonas等非甲烷氧化菌的活性。综上所述:未来大气CO_(2)升高情景下,水稻土好氧甲烷氧化微生物群落结构发生分异,促进了甲烷氧化通量,而甲烷氧化的代谢产物可能引发土壤中微生物食物网的级联反应,是土壤碳储存和周转的重要功能微生物群。; 关键词大气CO_(2)浓度升高水稻土甲烷氧化菌稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP) 高通量测序; Keywords Elevated CO_(2) Paddy soil Methane-oxidizing bacteria DNA-based stable isotope probing High-throughput sequencing; 分类号 Q938 [生物学—微生物学] S154.36 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤^(15)N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法被引量：2: 5; 作者苟永刚余玲玲许霞王建武; 机构华南农业大学热带亚热带生态研究所农业农村部华南热带农业环境重点实验室华南农业大学资源环境学院生态学系; 出处《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期140-147,共8页; 基金国家自然科学基金项目(31600348)~~; 文摘为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)中超高速离心后15N-DNA富集位置的指示功能基因,利用实时荧光定量PCR技术(qPCR),检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布,通过对氮素循环功能基因相对丰度作图分析,nifH和amoA基因在甘蔗//大豆间作和大豆单作种植模式中15N标记组与对照组基因丰度峰发生偏移,chiA基因丰度峰仅在大豆单作种植模式下存在偏移,而nirS、nirK、nosZ等3个基因的丰度峰值在两种种植模式下均不发生偏移。结果表明nifH和amoA基因可作为指示基因,能够有效鉴定甘蔗//大豆间作系统中DNA-SIP技术15N-DNA位置。; 关键词甘蔗//大豆间作稳定性同位素核酸探针荧光定量PCR 功能基因; Keywords sugarcane-soybean intercropping stable isotope probing real-time PCR functional genes; 分类号 Q508 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于稳定性同位素核酸探针技术的红壤微生物底物利用策略研究	王辛辛刘岩张威周旭辉何红波张旭东	《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	7	在线阅读下载PDF 职称材料
2	稳定性同位素探针技术在土壤功能微生物原位鉴定的应用	蔺中孙礼勇陈昊孙迎韬白婧李永涛	《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	6	在线阅读下载PDF 职称材料
3	青枯病导病型和抑病型植烟土壤氮循环微生物群落差异分析	刘艳霞李想李寒蒋天平芶剑渝张恒朱经伟高维常姚云静	《贵州农业科学》 CAS	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	水稻土好氧甲烷氧化菌对大气CO_(2)浓度升高的适应规律	曹伟伟严陈钟文辉朱春梧朱建国贾仲君	《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤^(15)N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法	苟永刚余玲玲许霞王建武	《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	2	在线阅读下载PDF 职称材料