近日,由中国水产科学研究院东海水产研究所海水蟹类基因组与育种团队马洪雨博士(第一作者)、马凌波研究员和夏连军研究员(共同通讯作者)共同完成的“锈斑蟳线粒体全基因组测序、系统演化和种群遗传学研究”的学术论文“First mitoc...近日,由中国水产科学研究院东海水产研究所海水蟹类基因组与育种团队马洪雨博士(第一作者)、马凌波研究员和夏连军研究员(共同通讯作者)共同完成的“锈斑蟳线粒体全基因组测序、系统演化和种群遗传学研究”的学术论文“First mitochondrial genome for the red crab (Charybdis feriata) with implication of phylogenomics and population genetics”在国际知名期刊Namre子刊Scientific Repots(2015,5:11524)上公开发表,该刊在2014年度的影响因子达到5.578。展开更多
限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段...限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。展开更多
文摘近日,由中国水产科学研究院东海水产研究所海水蟹类基因组与育种团队马洪雨博士(第一作者)、马凌波研究员和夏连军研究员(共同通讯作者)共同完成的“锈斑蟳线粒体全基因组测序、系统演化和种群遗传学研究”的学术论文“First mitochondrial genome for the red crab (Charybdis feriata) with implication of phylogenomics and population genetics”在国际知名期刊Namre子刊Scientific Repots(2015,5:11524)上公开发表,该刊在2014年度的影响因子达到5.578。
文摘限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。