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金沙江河谷地区岩羊种群遗传多样性分析 被引量:1
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作者 朱睦楠 周材权 《四川动物》 CSCD 北大核心 2014年第3期342-346,共5页
岩羊为国家Ⅱ级保护动物。目前,由于人类活动范围日益扩大,其栖息地遭到了不同程度的破坏,岩羊种群数量和分布范围呈明显下降趋势。为了及时制定科学的保护策略必须了解它们的种群遗传结构。本文以粪便为研究材料,对来自金沙江河谷地区... 岩羊为国家Ⅱ级保护动物。目前,由于人类活动范围日益扩大,其栖息地遭到了不同程度的破坏,岩羊种群数量和分布范围呈明显下降趋势。为了及时制定科学的保护策略必须了解它们的种群遗传结构。本文以粪便为研究材料,对来自金沙江河谷地区林线以上岩羊和林线以下矮个子岩羊共4个地理种群的169份有效样品进行线粒体CR全序列分析,共检测出210个变异位点,定义了4种单倍型,单倍型多样性为0.68,核苷酸多样性为0.0242,显示种群整体遗传多样性水平较低。基于最大简约法构建的系统发育树中,金沙江河谷地区的4个地理种群被划分到四川种群的2个亚分支中,但云南曲宗贡的部分岩羊和四川竹巴笼的矮个子岩羊单倍型存在共享现象。根据分子钟计算,林线上下岩羊分化时间在39~32万年前,在中更新世早中期(105~36万年前)气候影响下,导致岩羊在金沙江河谷高低海拔之间相互迁移。对于岩羊在历史上所表现出的潜在迁徙能力,我们建议将白马雪山自然保护区到竹巴笼自然保护区之间的金沙江河谷地区作为岩羊和矮个子岩羊的栖息地整体保护。 展开更多
关键词 岩羊 粪便 种群遗传多样性 金沙江河谷地区
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混合种群多样性自适应遗传操作的HMM训练模型 被引量:4
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作者 王相海 丛志环 +1 位作者 方玲玲 宋传鸣 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2014年第8期1833-1844,共12页
针对传统GA方法训练HMM模型所存在的对遗传控制参数具有较强的敏感性的问题:1)提出一种以混合遗传种群多样性为原则的BPD-AGA算法,该算法依据决定种群多样性的基因型和表现型来自适应地调整遗传参数,使整个遗传迭代过程能够在扩大遗传... 针对传统GA方法训练HMM模型所存在的对遗传控制参数具有较强的敏感性的问题:1)提出一种以混合遗传种群多样性为原则的BPD-AGA算法,该算法依据决定种群多样性的基因型和表现型来自适应地调整遗传参数,使整个遗传迭代过程能够在扩大遗传搜索空间的同时提高最优解的质量;2)提出了一种基于BPD-AGA的HMM训练模型,该模型一方面利用BPD-AGA的自适应选择操作,选择对混合种群多样性贡献最大的个体作为竞争优胜者;另一方面利用BPD-AGA的自适应交叉变异操作,在扩大算法搜索空间的同时保护对混合种群多样性贡献较大的个体,从而保证了HMM解个体的全局最优性;3)为了提高BPD-AGA训练的收敛速度,利用Baum-Welch算法从外部对BPD-AGA的收敛性进行了改善,提出了一个从外部和内部同时改善GA性能的BPD-AGA/Baum-Welch混合模型;4)给出了将所提出的模型和算法应用在交通视频车辆行驶状态判别中的实现过程.仿真实验验证了所提出模型和算法的有效性. 展开更多
关键词 混合遗传种群多样性 自适应遗传算法 HMM训练模型 车辆行驶状态 实时判别
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基于线粒体COI基因分析广州市15个白纹伊蚊种群的遗传多样性 被引量:7
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作者 郑梓豪 吴珊珊 +2 位作者 魏勇 钟代斌 郑学礼 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期985-994,共10页
目的探讨广州市白纹伊蚊不同地理种群的遗传多样性、遗传分化和系统发育关系。方法本实验于2020年9月至2020年11月期间,采集广州市11个行政区的共计15个白纹伊蚊种群。单只蚊虫提取基因组DNA,通过PCR法扩增COI基因序列并测序,获得的序列... 目的探讨广州市白纹伊蚊不同地理种群的遗传多样性、遗传分化和系统发育关系。方法本实验于2020年9月至2020年11月期间,采集广州市11个行政区的共计15个白纹伊蚊种群。单只蚊虫提取基因组DNA,通过PCR法扩增COI基因序列并测序,获得的序列在GenBank上经过BLAST比对。BioEdit 7.2软件观察序列峰图。MEGA X软件对齐序列,分析碱基组成,构建系统发育树(NJ法)。DNAsp 6.12软件分析位点多态性,单倍型及其多样性,进行错配分布分析。Arlequin 3.5软件进行分子变异分析、进行中性检验。DAMBE 7.2软件分析序列的系统发育信号。PopART 1.7软件构建单倍型网络图(Median joining法)。结果广州市15个白纹伊蚊种群共获得642条序列,其长度为603 bp。A碱基加T碱基平均含量是67.5%,符合线粒体DNA的AT偏向性。单倍型分析共检出45种单倍型,其中单倍型1为优势单倍型。中性检验表明广州市部分种群不符合中性理论,但大部分种群都经历过种群扩张,而错配分布却表明仅有少部分种群经历过种群扩张。Mantel检验表明15个白纹伊蚊种群不存在地理隔离现象。种群遗传分化显示各种群间交流较频繁,且种群间的遗传分化很低,差异更多来自于个体间。结论广州市的白纹伊蚊种群间基因交流较频繁,遗传分化小,遗传多样性偏低。这可能使不同地理种群的白纹伊蚊具有相似的媒介能力。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ 种群遗传多样性
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北京松山国家级自然保护区野猪种群遗传结构初步分析
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作者 唐小澄 杨婧 +4 位作者 董艳民 张洪亮 沈延京 王小萌 鲍伟东 《兽类学报》 北大核心 2025年第3期345-355,共11页
随着北京市自然生态环境逐渐改善,野猪(Sus scrofa)的种群数量不断增长,造成局部危害,对野猪种群遗传结构进行监测有助于制定种群长期防控管理措施。本研究使用非损伤采样和微卫星分子标记技术,对北京松山国家级自然保护区野猪种群的性... 随着北京市自然生态环境逐渐改善,野猪(Sus scrofa)的种群数量不断增长,造成局部危害,对野猪种群遗传结构进行监测有助于制定种群长期防控管理措施。本研究使用非损伤采样和微卫星分子标记技术,对北京松山国家级自然保护区野猪种群的性别结构、遗传多样性和遗传距离进行分析,了解种群未来发展趋势。结果表明,88份疑似野猪粪便样品鉴定出42只个体,其中35只雌性、7只雄性,雌雄性比为5∶1。种群遗传多态信息含量(PIC)在0.55~0.81之间,平均为0.71,具有适中的遗传多样性。基于微卫星位点间的遗传距离构建进化树,42只个体呈现3个分支,聚类分析结果也显示出该种群个体按照3个遗传支系进行聚类的现象。总体上,松山地区的野猪群体在遗传结构方面存在一定程度的分离,但并未到达明显分化的程度,仍属于一个种群。对近交系数的分析显示,松山野猪种群总体呈现中度近交状态,将对种群发展产生一定抑制作用。本研究为了解北京地区野猪种群的遗传结构提供了基础资料,对于分析该地区野猪的种群密度变化和预测种群发展趋势有重要参考价值。 展开更多
关键词 野猪 非损伤性取样 微卫星分子标记 种群遗传多样性 保护区管理
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小种群的遗传变异和近交衰退 被引量:27
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作者 王峥峰 彭少麟 任海 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第1期101-107,共7页
小种群一般拥有较小的遗传变异。当前人为干扰和破坏造成了生物种群个体数量减少,导致种群遗传多样性丧失,引起近交衰退,影响到种群后代适应性。产生近交衰退的原因是近交增加了有害等位基因纯合几率,导致个体适应能力下降。近交衰退受... 小种群一般拥有较小的遗传变异。当前人为干扰和破坏造成了生物种群个体数量减少,导致种群遗传多样性丧失,引起近交衰退,影响到种群后代适应性。产生近交衰退的原因是近交增加了有害等位基因纯合几率,导致个体适应能力下降。近交衰退受交配系统、世系效应、环境胁迫等的影响。在物种保护和恢复过程中,要防止近交衰退。 展开更多
关键词 近交衰退 遗传变异 种群 种群遗传多样性 个体数量 生物种群 人为干扰 等位基因 适应能力 交配系统 环境胁迫 恢复过程 物种保护 适应性
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野生与笼养绿孔雀种群的随机扩增多态DNA研究 被引量:10
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作者 常弘 柯亚永 +2 位作者 苏应娟 张国萍 朱世杰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期271-274,共4页
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对野生 14只和笼养 18只绿孔雀 (Pavomuticus)个体进行了种群遗传多样性分析。用 2 3个随机引物 ,野生与笼养绿孔雀分别获得 16 1和 16 6个扩增片段 ,计算发现野生与笼养绿孔雀的种群内平均相对遗传距离... 利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对野生 14只和笼养 18只绿孔雀 (Pavomuticus)个体进行了种群遗传多样性分析。用 2 3个随机引物 ,野生与笼养绿孔雀分别获得 16 1和 16 6个扩增片段 ,计算发现野生与笼养绿孔雀的种群内平均相对遗传距离分别是 0 .0 5 5 5和 0 .135 5 ,两种群间的为 0 .16 35 ;两种群的Shannon多样性指数平均分别是 0 .434 8和 1.0 16 3,有显著性差异。以上分析都显示野生绿孔雀的遗传多样性很低。用UPGMA法聚类显示两个种群都是分别来源于两个家系 ,可据此进行繁育管理。 展开更多
关键词 笼养绿孔雀 随机扩增多态DNA 野生绿孔雀 基因组DNA 种群遗传多样性
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城市商业中心区机械式立体车库规划模型与算法 被引量:3
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作者 陈莉 王同洲 +2 位作者 宋结焱 王娜 段刚 《交通运输系统工程与信息》 EI CSCD 北大核心 2014年第2期168-175,212,共9页
由于机械式立体车库具有占地少容量大的特点,非常适合在城市商业中心区大规模推广.针对立体车库的选址、建设规模及收费标准的制定,以规划期内利润最大为目标,以资金预算、可利用土地面积、车库利用率、出行需求及收费限制等为约束,建... 由于机械式立体车库具有占地少容量大的特点,非常适合在城市商业中心区大规模推广.针对立体车库的选址、建设规模及收费标准的制定,以规划期内利润最大为目标,以资金预算、可利用土地面积、车库利用率、出行需求及收费限制等为约束,建立了停车场规划综合优化模型.为克服简单遗传算法易陷入早熟的缺陷,设计了基于种群多样性控制的遗传算法,在寻优过程中始终保持一定数量的不可行解,与可行解进行遗传运算,并在计算一定次数后重新产生一些个体代替那些较差的个体,用以提高种群多样性.最后通过实例验证了模型和算法的有效性. 展开更多
关键词 城市交通 优化 非线性混合整数规划 机械式立体车库规划 种群多样性控制遗传算法
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利用基因库保护中华蜜蜂种质资源
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作者 何旭 田自珍 《中国蜂业》 2016年第10期37-37,39,共2页
利用基因库保存中蜂生物遗传物质具有特别的意义:低温保存遗传材料是野生生物保护战略的有机组成部分。当野生种群的遗传多样性由于自然的选择、遗传演变而部分丧失时,基因库仍为保护种群遗传多样性;野生生物基因资源库为改良蜜蜂品... 利用基因库保存中蜂生物遗传物质具有特别的意义:低温保存遗传材料是野生生物保护战略的有机组成部分。当野生种群的遗传多样性由于自然的选择、遗传演变而部分丧失时,基因库仍为保护种群遗传多样性;野生生物基因资源库为改良蜜蜂品质和种间杂交提供了野生种源;野生生物基因库资源为地理隔离种群之间交流基因提供了途径。 展开更多
关键词 野生生物保护 生物基因库 种质资源 中华蜜蜂 利用 种群遗传多样性 遗传材料 低温保存
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