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高通量测序在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中的应用 被引量：1
1
作者 李向 杨进 +2 位作者 黄爱军 周俊 易龙 《果树学报》 北大核心 2025年第3期651-661,共11页
中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高... 中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高通量、高效快速以及效益高的优势,逐渐成为了鉴定柑橘病毒的核心技术手段。HTS技术的应用不仅成功揭示了多种新病毒的存在,还深入挖掘了已知病毒的全基因组信息,提供了大量的基因序列数据,极大地推动了柑橘病毒在遗传变异、进化关系以及生态系统作用等方面的研究。展望未来,随着技术的发展和优化,HTS将在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中发挥更为重要的作用,为柑橘产业的可持续发展提供坚实的支撑。综述了HTS技术在柑橘病毒检测与鉴定,以及种群多样性分析方面的最新进展,并深入探讨了当前面临的挑战、未来的发展前景及其意义。 展开更多
关键词 柑橘 高通量测序技术 柑橘病毒 种群多样性分析
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对抗环境中基于种群多样性的鲁棒策略生成方法
2
作者 庄述鑫 陈永红 +3 位作者 郝一行 吴巍炜 徐学永 王万元 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2024年第6期1081-1091,共11页
在对抗博弈环境中,目标智能体希望生成具有高鲁棒性的博弈策略,使得目标智能体在面对不同对手策略时,始终具有较高的收益。现有的基于自我博弈的策略生成方法通常会过拟合到针对对手某个特定策略进行学习,所学习到的策略鲁棒性低且容易... 在对抗博弈环境中,目标智能体希望生成具有高鲁棒性的博弈策略,使得目标智能体在面对不同对手策略时,始终具有较高的收益。现有的基于自我博弈的策略生成方法通常会过拟合到针对对手某个特定策略进行学习,所学习到的策略鲁棒性低且容易受到其他对手策略的攻击。此外,现有的结合深度强化学习和博弈论方法迭代生成对手策略的方法在复杂且具有庞大决策空间的对抗场景下收敛效率低。鉴于此,提出一种基于种群多样性的鲁棒策略生成方法,其中对抗双方各自维护一个种群策略池,并且需要保证种群中的策略是具有多样性的,以此生成鲁棒的目标策略。为了保证种群多样性,将从策略的行为和质量2个视角度量策略的多样性,其中行为多样性是指不同策略状态-动作轨迹的差异性,质量多样性是指不同策略面对相同对手时最终获得的收益的差异性。最后,在典型的具有连续状态、连续动作的对抗环境中验证了所提出的基于种群多样性所生成的策略的鲁棒性。 展开更多
关键词 对抗环境 深度强化学习 种群多样性 Shapley value 行为表征
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遗传算法种群多样性的分析研究 被引量：77
3
作者 张晓缋 戴冠中 徐乃平 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 1998年第1期17-23,共7页
种群的多样性是遗传算法进化的前提条件．本文提出用种群方差和熵两个量来全面刻画遗传算法中种群的多样性，分析了选择、交换和变异三个主要算子对种群方差和嫡的影响，同时比较了编码机制对种群多样性的影响．得出了一些重要的结论．
关键词 遗传算法 交换操作 变异操作 种群多样性
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药用植物根际放线菌的种群多样性及生物活性初步研究 被引量：16
4
作者 袁丽杰 章广玲 +2 位作者 张玉琴 余利岩 张月琴 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期463-466,504,共5页
从我国云南及重庆地区采集62份药用植物根际土样,采用多种选择性分离培养基,4种预处理方法,分离得到959株根际放线菌。所得放线菌菌株经发酵和多种筛选模型检测,显示出多种生物活性,初筛总阳性率达31%。根据菌株形态特征并结合代谢产物... 从我国云南及重庆地区采集62份药用植物根际土样,采用多种选择性分离培养基,4种预处理方法,分离得到959株根际放线菌。所得放线菌菌株经发酵和多种筛选模型检测,显示出多种生物活性,初筛总阳性率达31%。根据菌株形态特征并结合代谢产物的生物活性,从中挑选出77株菌进行16SrRNA基因检测,发现其分属于17个不同的放线菌属,充分显示出药用植物根际放线菌的生物多样性。 展开更多
关键词 植物根际 放线菌 种群多样性 生物活性
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稻鸭共育模式下水稻根际土壤真菌和细菌种群多样性分析 被引量：30
5
作者 廖咏梅 黄元腾吉 +4 位作者 韩宁宁 凌展 邹承武 史鼎鼎 蒋代华 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期59-67,共9页
【目的】比较稻鸭共育模式与常规管理模式种植水稻的根际土壤微生物种群多样性,为利用土壤微生物多样性开展水稻生态栽培提供科学依据。【方法】采集常规管理模式水稻根际土壤样品(记为S2)和稻鸭共育模式水稻根际土壤样品(记为S3),采用... 【目的】比较稻鸭共育模式与常规管理模式种植水稻的根际土壤微生物种群多样性,为利用土壤微生物多样性开展水稻生态栽培提供科学依据。【方法】采集常规管理模式水稻根际土壤样品(记为S2)和稻鸭共育模式水稻根际土壤样品(记为S3),采用电位法测定土壤pH、重铬酸钾—外加热法测定土壤有机质含量;针对土壤样品真菌ITS1～ITS2区域和细菌16S rDNA扩增子V3～V4区域进行Illumina MiSeq 2×300 bp双末端测序,分析两种模式土壤真菌和细菌的种类及丰度差异。【结果】S3的p H为5.10,有机质含量为23.91 g/kg;S2的pH为5.34,有机质含量为19.84 g/kg。在真菌门水平上,两种管理模式的根际土壤优势门均为子囊菌门(Ascomycota),S3中子囊菌门的相对丰度为42.36%,S2为93.67%,两者相差2.21倍;在真菌属的水平上,S3的优势属为毛壳菌属(Chaetomium),相对丰度为2.63%,而S2的毛壳菌属相对丰度仅为0.26%,两者相差10.12倍;S3中居第2位的属是嗜热真菌属(Mycothermus),相对丰度为2.21%,而S2的嗜热真菌属相对丰度为0.05%,两者相差44.20倍;S2的优势属是黑盘孢属(Melanconiella),相对丰度为6.66%,而S3的黑盘孢属相对丰度为0.26%,两者相差25.62倍。两种管理模式下相对丰度居前2位的细菌门均为变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria),S3中变形菌门的相对丰度为40.90%,S2为29.45%,两者相差1.38倍;S3中酸杆菌门的相对丰度为18.90%,S2为27.84%,两者相差1.47倍;两种管理模式下相对丰度居前10的细菌属相同,其中7个属隶属变形菌门[其中3个属隶属于根瘤菌目(Rhizobiales)、3个属于隶属粘细菌目(Myxococcales)、1个属隶属于δ-变形菌纲未分目(unidentified Deltaproteobacteria)]、3个属隶属于酸杆菌门,10个属中仅有红微菌属(Rhodomicrobium)在两种管理模式土壤中相对丰度相差2.23倍(S3为1.18%,S2为0.53%),其他9个属相差均在1.00倍左右。【结论】与常规管理模式比较,稻鸭共育模式的水稻根际土壤pH略低,有机质稍高,真菌的种群结构丰富,而细菌的优势门和优势属无明显差异。 展开更多
关键词 稻鸭共育模式 水稻 根际土壤 真菌 细菌 种群多样性
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河西山地绿洲荒漠植物群落种群多样性研究Ⅰ生态地理及植物群落的基本特征 被引量：41
6
作者 王国宏 任继周 张自和 《草业学报》 CSCD 2001年第1期1-12,共12页
河西山地绿洲荒漠区包括祁连山北坡中段森林草原区、张掖荒漠绿洲区和东大山森林草原区等 3个地理地段 ,海拔在 1450～ 4 2 0 0 m之间。近 50年气候的变化趋势是 2 0世纪 6 0年代冬冷夏热春雨多 ;70年代冬暖夏冷 ,夏秋雨多 ;80年代至本... 河西山地绿洲荒漠区包括祁连山北坡中段森林草原区、张掖荒漠绿洲区和东大山森林草原区等 3个地理地段 ,海拔在 1450～ 4 2 0 0 m之间。近 50年气候的变化趋势是 2 0世纪 6 0年代冬冷夏热春雨多 ;70年代冬暖夏冷 ,夏秋雨多 ;80年代至本世纪末 ,年平均气温偏低 ,降水量增加。相应地 ,祁连山发育的现代冰川今后将出现稳定乃至前进现象。黑河流量动态变化与降水量的变化趋势一致。主要植被类型有红砂荒漠、山地荒漠草原、典型草原、寒温性针叶林、高山灌丛及高山流石滩植被等。祁连山北坡产高等植物 10 6 4种。植物区系从区系特征上可以分为两个区系小区 ,即祁连山北坡中段、东大山森林草原区和河西荒漠区。东大山与祁连山北坡中段属于同一个植物区系类型 ,是一个年轻衍生的温带植物区系 ,区系发生在晚第三纪至第四纪。河西荒漠区是一个古老的植物区系。维管植物生活型谱组成中 ,地面芽植物占优势 ,其次是高位芽植物、一年生植物、隐芽植物和地上芽植物 ,分别占 6 0 %、17.6 %、11%、6 .5%和 4 %。 展开更多
关键词 祁连山北坡 荒漠绿洲区 种群多样性 植物群落类型 河西走廓
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基于城市污水好氧颗粒污泥脱氮除磷系统种群多样性研究 被引量：8
7
作者 纪树兰 崔丹红 +2 位作者 周明璟 刘缨 秦振平 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1100-1108,共9页
采用16S rDNA克隆文库方法对城市污水脱氮除磷好氧颗粒污泥的细菌种群进行了多样性研究.从16SrDNA克隆文库中随机挑选110个克隆子测序并进行了BLAST比对.结果表明:好氧颗粒污泥序批式反应器(GSBR)系统中细菌群落具有高度多样性,包含14... 采用16S rDNA克隆文库方法对城市污水脱氮除磷好氧颗粒污泥的细菌种群进行了多样性研究.从16SrDNA克隆文库中随机挑选110个克隆子测序并进行了BLAST比对.结果表明:好氧颗粒污泥序批式反应器(GSBR)系统中细菌群落具有高度多样性,包含14个类群,优势细菌类群为Proteobacteria类群(变形菌类群),占85.18%;细菌类群优势顺序为β-Proteobacteria、α-Proteobacteria、γ-Proteobacteria、uncultured Bacteroidetes、Candidatedivision TM7、δ-proteobacterium、Firmicutes、Planctomycetacia、Actinobacteria、Sphingobacteria、Flavobacteria、Cytophagia、Uncultured bacterium和Uncultured anaerobic bacterium.初步分析了不同细菌类群在脱氮除磷系统中的作用,其中,Proteobacteria纲中部分为聚磷菌,Acidovorax sp.、Planctomycetacia、Cytophagia、Flavobacteria对氮的脱除均有一定作用. 展开更多
关键词 脱氮除磷 16S rDNA克隆文库 好氧颗粒污泥 种群多样性
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青藏铁路沿线土壤可培养微生物种群多样性分析 被引量：10
8
作者 刘振静 李潞滨 +3 位作者 庄彩云 周金星 杨凯 韩继刚 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第6期176-181,共6页
选择青藏铁路沿线不同海拔高度的10个地点采集土壤样品,采用3种不同的培养基分离培养其中的微生物;提取各土壤样品可培养微生物菌体基因组DNA,进行16S rDNA的PCR扩增,对可培养微生物种群多样性进行分析.结果表明,该地区可培养微生物的... 选择青藏铁路沿线不同海拔高度的10个地点采集土壤样品,采用3种不同的培养基分离培养其中的微生物;提取各土壤样品可培养微生物菌体基因组DNA,进行16S rDNA的PCR扩增,对可培养微生物种群多样性进行分析.结果表明,该地区可培养微生物的数量为1×106～8×106CFU/g.16SrDNA序列分析发现,分离培养的微生物主要包括厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和变形菌门γ亚群(Gammaproteobacteria)3个类群,分别占菌株总数的53.1%,29.6%和16.0%.其中,Bacillussp.为优势菌属,占菌株总数的29.6%;Bacillussimplex为优势种,占菌株总数的12.3%. 展开更多
关键词 青藏铁路 可培养微生物 种群多样性
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铝胁迫对酸性红壤中真菌种群多样性的影响 被引量：9
9
作者 贺根和 王小东 +1 位作者 刘强 吴吉春 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1736-1742,共7页
通过聚合酶链式反应-限制性片段长度多态（PCR-RFLP）技术构建了红壤真菌的内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer,ITS）rDNAs文库,比较分析了红壤地区典型森林土和农田土真菌群落结构对铝胁迫的响应,构建了6个土壤样品的真菌ITS r... 通过聚合酶链式反应-限制性片段长度多态（PCR-RFLP）技术构建了红壤真菌的内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer,ITS）rDNAs文库,比较分析了红壤地区典型森林土和农田土真菌群落结构对铝胁迫的响应,构建了6个土壤样品的真菌ITS rDNAs文库。从这6个克隆文库中随机挑取克隆进行了PCR-RFLP指纹图谱分析,共获得77个独特的真菌操作分类单元（OperationalTaxanomicalUints,OTUs）。对77个OTUs的代表性克隆测序并利用Blast工具进行分析（相似性95%～100%）。研究结果表明森林土壤和农田土壤样品中真菌类群79.2%（61）属于子囊菌门（Ascomycota）、担子菌门（Basidiomycota）和球囊菌门（Glomeromycota）,20.8%（16）属于未分类的簇（Unclassifiedfungi）,其中担子菌门真菌在两种土壤中具有明显优势。物种多样性指数（Simpson、Shannon和Chao1）分析表明,铝胁迫降低了土壤真菌种群的多样性,农田土壤中真菌的种群多样性明显高于森林土壤。而且随着铝胁迫浓度的增加,担子菌门真菌在两种土壤中丰度明显下降,子囊菌门真菌的丰度显著上升,在高铝处理浓度处理的土壤中演变为优势种群。 展开更多
关键词 铝胁迫 酸性红壤 真菌种群多样性 PCR-RFLP
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一种维持种群多样性的遗传算法变异算子的研究 被引量：10
10
作者 刘智明 周激流 +1 位作者 陈莉 陈玮 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2003年第5期902-904,共3页
本文针对二进制编码遗传算法中,由于传统变异算子随机地选取基因位置而对搜索全局最优的不利影响,分析了变异位置对种群多样性的影响.提出了一种新的维持种群多样性的变异算子,其变异概率和变异位置由种群基因位的多样度和个体适应度值... 本文针对二进制编码遗传算法中,由于传统变异算子随机地选取基因位置而对搜索全局最优的不利影响,分析了变异位置对种群多样性的影响.提出了一种新的维持种群多样性的变异算子,其变异概率和变异位置由种群基因位的多样度和个体适应度值自适应决定.经变异后优秀的个体得以保存,且在种群中每一基因坐上两种基因的比例控制在期望的范围内.本文最后用实验验证了该算子维持种群多样性的有效性. 展开更多
关键词 遗传算法 变异算子 种群多样性 二进制编码
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PSO模型种群多样性与学习参数的关系研究 被引量：13
11
作者 申元霞 王国胤 曾传华 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1238-1244,共7页
粒子群优化(Particle Swarm Optimization,PSO)算法在求解复杂多峰问题时,易陷入早期收敛.通过调整惯性权重和加速系数来控制种群多样性是缓解PSO早期收敛的一个重要手段,但是目前对惯性权重和加速系数的设置主要依赖于实验设计,缺乏必... 粒子群优化(Particle Swarm Optimization,PSO)算法在求解复杂多峰问题时,易陷入早期收敛.通过调整惯性权重和加速系数来控制种群多样性是缓解PSO早期收敛的一个重要手段,但是目前对惯性权重和加速系数的设置主要依赖于实验设计,缺乏必要的理论支撑.针对该问题,本文提出了一种以种群未来的多样性变化调整PSO算法参数的方法.该方法首先在种群当前状态已知的条件下计算种群下一时刻多样性的期望表达式,再采用多元函数极值理论的分析方法给出了惯性权重,加速系数与种群下一时刻多样性的数学关系,该结果为PSO学习参数控制种群多样性提供有力的数学理论依据. 展开更多
关键词 粒子群 早期收敛 种群多样性 惯性权重 加速系数
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我国热带作物多主棒孢种群多样性及致病力分化分析 被引量：7
12
作者 李博勋 冯艳丽 +4 位作者 刘先宝 蔡吉苗 陆翠梅 郑肖兰 黄贵修 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第12期2456-2465,共10页
多主棒孢(Corynespora cassiicola)是一种全球分布的重要植物病原真菌,寄主范围十分广泛。近年来,该病原菌侵染危害多种热带作物,并在局部地区大面积暴发流行,造成巨大的经济损失。本研究利用核糖体转录间隔区(Internal transcribed spa... 多主棒孢(Corynespora cassiicola)是一种全球分布的重要植物病原真菌,寄主范围十分广泛。近年来,该病原菌侵染危害多种热带作物,并在局部地区大面积暴发流行,造成巨大的经济损失。本研究利用核糖体转录间隔区(Internal transcribed spacer, ITS)、翻译延伸因子(translation elongation factor 1 alpha, EF-1α)、β微管蛋白(β-Tubulin,TUB),对来自橡胶树、木薯、番木瓜和瓜菜等多种热带作物的70株多主棒孢进行种群多样性分析。结果发现,利用最大似然法,在相似系数为0.97时可将供试菌株划分为两大遗传类群:类群Ⅰ为国内和一些国外橡胶树的多主棒孢;类群Ⅱ为其他寄主多主棒孢,遗传类群与寄主来源具有显著的相关性。致病力测定表明,多主棒孢种内致病力分化明显,类群Ⅰ的橡胶树多主棒孢仅能侵染橡胶树,不能侵染其他寄主,具有明显的寄主专化性,且不同地理来源的菌株致病力差异不显著。类群Ⅱ的多主棒孢在不同寄主间可以相互侵染,但菌株在致病力和发病症状上存在一定差异,表现出对其原寄主的高度致病力。多基因序列聚类分析与致病力分化分析结果具有较好的一致性,这为研究我国热带作物多主棒孢的种群结构、主要致病型以及为多主棒孢病害的发生、流行和防治提供了理论依据。 展开更多
关键词 热带作物 多主棒孢病菌 种群多样性 致病力分化
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天府花生内生细菌种群多样性研究 被引量：10
13
作者 方扬 张小平 +1 位作者 陈露遥 黄怀琼 《西南农业学报》 CSCD 2008年第2期353-358,共6页
通过对四川省重点推广的4个花生品种——天府11号、12号、13号和岳易各生育期、各部位内生细菌种群动态的系统研究,分离出内生细菌170株,其中放线菌15株;鉴定结果表明,天府系列花生内生细菌共16个属,其中芽孢杆菌属11个种,为花生内生细... 通过对四川省重点推广的4个花生品种——天府11号、12号、13号和岳易各生育期、各部位内生细菌种群动态的系统研究,分离出内生细菌170株,其中放线菌15株;鉴定结果表明,天府系列花生内生细菌共16个属,其中芽孢杆菌属11个种,为花生内生细菌的优势种群。对链霉菌属放线菌进行了抗菌性检测,其中13株对枯草芽孢杆菌有拮抗作用,淡紫灰类群菌株11-02和13-10的抑菌效果最为显著。 展开更多
关键词 天府花生 内生细菌 种群多样性
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保护地土壤生防木霉菌种群多样性研究 被引量：4
14
作者 贺字典 高增贵 +1 位作者 高玉峰 张洋 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第4期1350-1358,共9页
采用传统的形态学特征和分子方法(ITS、TEF序列和UP-PCR)研究了蔬菜保护地土壤中木霉菌种群多样性及其影响因素。结果表明:提交genbank 11个木霉种的序列,分别为长枝木霉(Trichoderma longibrachiatum)、拟康氏木霉(Trichoderma pseud-o... 采用传统的形态学特征和分子方法(ITS、TEF序列和UP-PCR)研究了蔬菜保护地土壤中木霉菌种群多样性及其影响因素。结果表明:提交genbank 11个木霉种的序列,分别为长枝木霉(Trichoderma longibrachiatum)、拟康氏木霉(Trichoderma pseud-okoningii)、黄绿木霉(Trichoderma aureoviride)、棘孢木霉(Trichoderma asperellum)、深绿木霉(Trichoderma atroviride)、哈茨木霉(Tri-choderma harzianum)、非钩木霉(Trichoderma inhamatum)、微孢木霉(Trichoderma minutisporum)、长孢木霉(Trichoderma longipile)和粘绿木霉(Trichoderma virens);木霉菌24个菌株经UP-PCR扩增,引物AS4、AS19、L45扩增出一条500 bp大小的木霉菌种的特征性谱带,其他谱带则为多态性谱带,多态性达93.5%;营养条件、杀菌剂及土壤因素对不同种木霉菌的影响不同,得到2株适应性较强的木霉菌株,有望成为生防菌株。 展开更多
关键词 木霉菌 种群多样性 ITS和TEF UP-PCR 影响因素
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混合种群多样性自适应遗传操作的HMM训练模型 被引量：4
15
作者 王相海 丛志环 +1 位作者 方玲玲 宋传鸣 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2014年第8期1833-1844,共12页
针对传统GA方法训练HMM模型所存在的对遗传控制参数具有较强的敏感性的问题:1)提出一种以混合遗传种群多样性为原则的BPD-AGA算法,该算法依据决定种群多样性的基因型和表现型来自适应地调整遗传参数,使整个遗传迭代过程能够在扩大遗传... 针对传统GA方法训练HMM模型所存在的对遗传控制参数具有较强的敏感性的问题:1)提出一种以混合遗传种群多样性为原则的BPD-AGA算法,该算法依据决定种群多样性的基因型和表现型来自适应地调整遗传参数,使整个遗传迭代过程能够在扩大遗传搜索空间的同时提高最优解的质量;2)提出了一种基于BPD-AGA的HMM训练模型,该模型一方面利用BPD-AGA的自适应选择操作,选择对混合种群多样性贡献最大的个体作为竞争优胜者;另一方面利用BPD-AGA的自适应交叉变异操作,在扩大算法搜索空间的同时保护对混合种群多样性贡献较大的个体,从而保证了HMM解个体的全局最优性;3)为了提高BPD-AGA训练的收敛速度,利用Baum-Welch算法从外部对BPD-AGA的收敛性进行了改善,提出了一个从外部和内部同时改善GA性能的BPD-AGA/Baum-Welch混合模型;4)给出了将所提出的模型和算法应用在交通视频车辆行驶状态判别中的实现过程.仿真实验验证了所提出模型和算法的有效性. 展开更多
关键词 混合遗传种群多样性 自适应遗传算法 HMM训练模型 车辆行驶状态 实时判别
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全局收敛的PSO算法的种群多样性特征 被引量：6
16
作者 李国 徐晨 吴延科 《计算机应用与软件》 CSCD 北大核心 2008年第5期237-240,259,共5页
PSO算法的早熟收敛与种群多样性有着密切的关系,传统观念认为,多样性丧失导致了算法的早熟收敛。为了避免早熟收敛现象的发生,很多学者提出了很多控制、保持或增大多样性的措施,但是并不是增大了多样性之后早熟收敛现象就会改善。那么,... PSO算法的早熟收敛与种群多样性有着密切的关系,传统观念认为,多样性丧失导致了算法的早熟收敛。为了避免早熟收敛现象的发生,很多学者提出了很多控制、保持或增大多样性的措施,但是并不是增大了多样性之后早熟收敛现象就会改善。那么,到底什么样的多样性才会有利于算法的持续收敛?通过对6个测试函数用3种算法做实验,深入探讨了PSO的收敛性与种群多样性的关系,描述了PSO算法理想的种群多样性曲线,对改进算法提出了指导性建议。主要观点是,一个好的算法应该是能够保持比较大的多样性曲线的震动频率和振幅,尤其是算法前期的震动频率和振幅,而不是保持比较大的多样性,因为比较大的多样性曲线的震动频率和振幅有利于算法寻找全局搜索和局部搜索的平衡点。 展开更多
关键词 PSO 进化算法 收敛 种群多样性
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商洛丹参内生真菌的种群多样性研究 被引量：6
17
作者 冀玉良 李堆淑 +1 位作者 朱广启 何军 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第15期8913-8915,8982,共4页
[目的]揭示商洛丹参内生真菌的种群多样性和分布特征。[方法]采用内生菌分离法从丹参根、茎、叶组织分离内生真菌,在显微镜下观察其形态并进行分类鉴定。[结果]从商洛丹参根、茎、叶组织中分离获得126株内生真菌,经形态学鉴定归属于5目7... [目的]揭示商洛丹参内生真菌的种群多样性和分布特征。[方法]采用内生菌分离法从丹参根、茎、叶组织分离内生真菌,在显微镜下观察其形态并进行分类鉴定。[结果]从商洛丹参根、茎、叶组织中分离获得126株内生真菌,经形态学鉴定归属于5目7科19属。其中根部最多,分离到64株12属;茎部次之,分离到50株12属;叶部最少,仅分离到12株5属;曲霉属(Aspergillus)和青霉属(Peni-cillium)既是整个植株的优势菌群,也是根部和茎部的优势菌群。[结论]商洛丹参内生真菌的数量种群具有较丰富的多样性,分布具有明显的组织专一性,研究内生真菌与寄主植物丹参之间的协同进化关系可为开发利用丹参资源提供理论依据。 展开更多
关键词 丹参 内生真菌 种群多样性
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一种惯性权重与种群多样性协同调整的二进制粒子群优化算法 被引量：11
18
作者 李浩君 张广 王万良 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2018年第3期529-533,共5页
针对二进制粒子群算法惯性权重和种群多样性不能随粒子群进化状态变化而动态协同调整,易造成后期收敛性较差陷入局部最优的缺点,提出一种惯性权重与种群多样性协同调整的二进制粒子群算法(CBPSO),首先使用混沌函数初始化种群,其次根据... 针对二进制粒子群算法惯性权重和种群多样性不能随粒子群进化状态变化而动态协同调整,易造成后期收敛性较差陷入局部最优的缺点,提出一种惯性权重与种群多样性协同调整的二进制粒子群算法(CBPSO),首先使用混沌函数初始化种群,其次根据每个粒子与最优粒子之间海明距离均值与当前迭代状态共同调整权重值,再次根据海明距离均值动态调整种群多样性,最后根据调整后的种群多样性在下次迭代中计算新的海明距离均值及对应的惯性权重值.通过对常用的基准函数进行不同维度下的仿真实验,实验结果证明:在相同迭代次数等条件下,该算法具有较强的动态搜索能力和种群多样性调整能力,比同类算法具有更好的准确率和鲁棒性. 展开更多
关键词 二进制粒子群 海明距离 惯性权重 种群多样性
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一种新型保持种群多样性的遗传算法 被引量：11
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作者 申元霞 张翠芳 《系统仿真学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1052-1053,1071,共3页
针对遗传算法的“早期收敛”或“遗传漂移”,本文提出了一种新型保持群体多样性的遗传算法。该算法利用种群的熵和个体基因座的多样度来测度进化中种群的多样性,并将遗传操作与种群多样性联系起来,建立了遗传操作与种群多样度之间的函... 针对遗传算法的“早期收敛”或“遗传漂移”,本文提出了一种新型保持群体多样性的遗传算法。该算法利用种群的熵和个体基因座的多样度来测度进化中种群的多样性,并将遗传操作与种群多样性联系起来,建立了遗传操作与种群多样度之间的函数关系式,使遗传算子中的主要参数能够随多样性函数和适应度函数的变化而自适应调整,从而提高了进化中种群的多样性和算法的搜索效率。仿真研究证明了该算法的优越性。 展开更多
关键词 遗传算法 熵 种群多样性 遗传操作
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不同地区药用植物两面针根际土壤真菌种群多样性差异分析 被引量：15
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作者 张淼 陈裕凤 +2 位作者 陈龙 黄飘玲 韦露玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期167-179,共13页
为了解不同地区两面针植物根际土壤真菌种群多样性差异,以6个不同地区两面针植物根际土壤为研究对象,对土壤真菌ITS1-2进行高通量测序,通过对比分析两面针植物根际土壤真菌的种群多样性差异,并结合冗余分析探讨了环境因素对真菌菌群的... 为了解不同地区两面针植物根际土壤真菌种群多样性差异,以6个不同地区两面针植物根际土壤为研究对象,对土壤真菌ITS1-2进行高通量测序,通过对比分析两面针植物根际土壤真菌的种群多样性差异,并结合冗余分析探讨了环境因素对真菌菌群的影响。研究表明,6个土壤样品真菌种群多样性丰富,但种群结构和物种丰富存在明显差异。子囊菌门(Ascomycota)、未分类菌门(unclassified)、担子菌门(Basidiomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和罗兹菌门(Rozellomycota)为共有菌门。各样品的优势菌群构成不尽相同,但子囊菌门(Ascomycota)的优势比较明显。真菌种群多样性由高到低的顺序为B3>A3>A2>B2>B1>A1。土壤酸碱度(PH)、有机质含量(ORM)、土壤粘粒(CP)、土壤砂粒(SP)、土壤粉(砂)粒(SSG)等环境因子均对样品的真菌菌群组成和物种丰度有影响,但对各样品的影响程度有差异。 展开更多
关键词 两面针 根际土壤真菌 高通量测序 种群多样性
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