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谷子NPR1基因特征及响应禾生指梗霉侵染的表达分析
被引量：
3
1
作者
刘旭
张诺
+2 位作者
徐林
孙卓楠
张宝俊
《山西农业科学》
2022年第9期1233-1239,共7页
病程相关基因1的非表达子(NPR1)是植物抗病信号传导的关键基因,在植物响应病原菌侵染过程中发挥重要作用。为分析谷子NPR1家族基因的特征及响应禾生指梗霉侵染的表达水平,根据已报道的拟南芥、水稻NPR1蛋白序列,利用BLASTP对xiaomi全基...
病程相关基因1的非表达子(NPR1)是植物抗病信号传导的关键基因,在植物响应病原菌侵染过程中发挥重要作用。为分析谷子NPR1家族基因的特征及响应禾生指梗霉侵染的表达水平,根据已报道的拟南芥、水稻NPR1蛋白序列,利用BLASTP对xiaomi全基因组进行鉴定,利用生物信息学方法进行理化性质分析、进化分析、基因结构分析,利用转录组数据分析谷子NPR1家族基因的组织表达特异性及响应禾生指梗霉胁迫下的表达特征。结果表明,共筛选到谷子NPR1家族基因4个,分别位于第5、8、9号染色体上,依次命名为SiNPR1~SiNPR4,编码475~629个氨基酸,其中,SiNPR1定位于细胞核中,SiNPR2、SiNPR4定位于叶绿体中,SiNPR3定位于质膜且为唯一的疏水蛋白。进化分析发现,谷子与拟南芥、水稻NPR1家族基因可分为3类,其中,SiNPR2和SiNPR4聚为一支,SiNPRs与OsNPRs亲缘关系更近。motif分析中共鉴定到8个motif基序,除SiNPR3仅含有5个保守基序外,其余成员均含8个保守基序,且排列顺序均为motif6、motif2、motif7、motif3、motif4、motif5、motif1、motif8;顺式作用元件分析发现,该家族成员主要含有水杨酸、茉莉酸甲酯、赤霉素等激素元件。组织特异性分析发现,仅SiNPR1在不同时期未成熟种子中特异高表达,其余基因均在不同时期叶片中高表达;转录组分析发现,SiNPR1在受禾生指梗霉侵染的谷子叶片和穗中均上调表达,表明SiNPR1可能在抵御禾生指梗霉侵染方面发挥重要作用。
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关键词
谷子
NPR1
禾生指梗霉
转录组
表达模式
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职称材料
我国谷子白发病研究进展
被引量：
12
2
作者
程富英
王鹤
+1 位作者
韩彦卿
韩渊怀
《山西农业科学》
2020年第2期263-267,共5页
谷子是我国北方重要的杂粮作物,具有抗旱耐瘠、生长期短、适应性强、粮草兼用、耐储藏等特点。2016年农业部发布新政策恢复杂粮生产,谷子种植面积逐渐增多,同时谷子白发病也逐渐上升为谷子生产中最具毁灭性的病害之一。目前,国内外关于...
谷子是我国北方重要的杂粮作物,具有抗旱耐瘠、生长期短、适应性强、粮草兼用、耐储藏等特点。2016年农业部发布新政策恢复杂粮生产,谷子种植面积逐渐增多,同时谷子白发病也逐渐上升为谷子生产中最具毁灭性的病害之一。目前,国内外关于谷子白发病的研究较少,白发病的发生规律及发病机制等方面的研究则更少。详细阐述了谷子白发病发病主要症状、发病原因以及病原菌的生物学特征,并介绍了防治谷子白发病行之有效的方法及今后的发展方向等,其可为今后谷子白发病防控策略及抗病育种提供有价值的借鉴。
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关键词
谷子白发病
禾生指梗霉
发病原因
防治方法
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职称材料
题名
谷子NPR1基因特征及响应禾生指梗霉侵染的表达分析
被引量：
3
1
作者
刘旭
张诺
徐林
孙卓楠
张宝俊
机构
山西农业大学植物保护学院
出处
《山西农业科学》
2022年第9期1233-1239,共7页
基金
山西省研究生创新项目(2021Y331)
山西省自然基金面上项目(20210302123415)。
文摘
病程相关基因1的非表达子(NPR1)是植物抗病信号传导的关键基因,在植物响应病原菌侵染过程中发挥重要作用。为分析谷子NPR1家族基因的特征及响应禾生指梗霉侵染的表达水平,根据已报道的拟南芥、水稻NPR1蛋白序列,利用BLASTP对xiaomi全基因组进行鉴定,利用生物信息学方法进行理化性质分析、进化分析、基因结构分析,利用转录组数据分析谷子NPR1家族基因的组织表达特异性及响应禾生指梗霉胁迫下的表达特征。结果表明,共筛选到谷子NPR1家族基因4个,分别位于第5、8、9号染色体上,依次命名为SiNPR1~SiNPR4,编码475~629个氨基酸,其中,SiNPR1定位于细胞核中,SiNPR2、SiNPR4定位于叶绿体中,SiNPR3定位于质膜且为唯一的疏水蛋白。进化分析发现,谷子与拟南芥、水稻NPR1家族基因可分为3类,其中,SiNPR2和SiNPR4聚为一支,SiNPRs与OsNPRs亲缘关系更近。motif分析中共鉴定到8个motif基序,除SiNPR3仅含有5个保守基序外,其余成员均含8个保守基序,且排列顺序均为motif6、motif2、motif7、motif3、motif4、motif5、motif1、motif8;顺式作用元件分析发现,该家族成员主要含有水杨酸、茉莉酸甲酯、赤霉素等激素元件。组织特异性分析发现,仅SiNPR1在不同时期未成熟种子中特异高表达,其余基因均在不同时期叶片中高表达;转录组分析发现,SiNPR1在受禾生指梗霉侵染的谷子叶片和穗中均上调表达,表明SiNPR1可能在抵御禾生指梗霉侵染方面发挥重要作用。
关键词
谷子
NPR1
禾生指梗霉
转录组
表达模式
Keywords
foxtail millet
NPR1
Sclerospora graminicola
transcriptome
expression pattern
分类号
S515 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
我国谷子白发病研究进展
被引量：
12
2
作者
程富英
王鹤
韩彦卿
韩渊怀
机构
山西农业大学农学院
山西农业大学农业生物工程研究所
出处
《山西农业科学》
2020年第2期263-267,共5页
基金
国家自然科学基金项目（31701440）
山西省青年科技研究基金项目（201701D221183）
+1 种基金
山西农业大学科技创新基金项目（2016YJ06）
山西省重点研发项目（201703D211008）
文摘
谷子是我国北方重要的杂粮作物,具有抗旱耐瘠、生长期短、适应性强、粮草兼用、耐储藏等特点。2016年农业部发布新政策恢复杂粮生产,谷子种植面积逐渐增多,同时谷子白发病也逐渐上升为谷子生产中最具毁灭性的病害之一。目前,国内外关于谷子白发病的研究较少,白发病的发生规律及发病机制等方面的研究则更少。详细阐述了谷子白发病发病主要症状、发病原因以及病原菌的生物学特征,并介绍了防治谷子白发病行之有效的方法及今后的发展方向等,其可为今后谷子白发病防控策略及抗病育种提供有价值的借鉴。
关键词
谷子白发病
禾生指梗霉
发病原因
防治方法
Keywords
foxtail millet downy mildew
Sclerospora graminicola(Sacc.)Schroet
cause of disease
control measures
分类号
S435.15 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
谷子NPR1基因特征及响应禾生指梗霉侵染的表达分析
刘旭
张诺
徐林
孙卓楠
张宝俊
《山西农业科学》
2022
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
我国谷子白发病研究进展
程富英
王鹤
韩彦卿
韩渊怀
《山西农业科学》
2020
12
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职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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