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禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因多重PCR检测方法的建立被引量：1: 1; 作者何贤发冯方东 +4 位作者徐一凡高博施文文薛梦琦郭伟娜《动物医学进展》北大核心 2018年第4期13-18,共6页; 为建立多重PCR方法用于禽源多杀性巴氏杆菌中毒力基因的检测,对禽源多杀性巴氏杆菌分离株MD-1的9个毒力基因进行PCR扩增及敏感性测定,然后通过多个基因的组合得到5种多重PCR体系,并从中筛选合适的多重PCR体系,测定其特异性、敏感性和重... 展开更多; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因多重PCR 检测; 在线阅读下载PDF 职称材料

禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析被引量：5: 2; 作者孔令严罗青平 +2 位作者卢琴邵华斌李槿年《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期262-266,共5页; 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Avian Pasteurella multocida,Pm)敏感株与环丙沙星(Cip)耐药株的差异表达基因,本研究采用高通量转录组测序的RNA-seq技术对敏感株与Cip耐药株进行检测,参考Pm70株基因组(NC_002663.1)进行拼接与质量评估,测... 展开更多; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析耐药机制; 在线阅读下载PDF 职称材料

禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析被引量：2: 3; 作者孔令严汪最 +3 位作者邵华斌张腾飞卢琴罗青平《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2019年第1期30-36,共7页; 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(avian Pasteurella multocida,Pm)四环素(Tetracycline,Tet)敏感株与耐药株(MIC=32μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Tet敏感株与耐药株进行双向测序,通过GO、KEGG和ARDB数据库对表达差异... 展开更多; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析 ARDB注释; 在线阅读下载PDF 职称材料

体外诱导禽巴氏杆菌链霉素耐药株及耐药机制的初步分析被引量：2: 4; 作者汪最孔令严 +3 位作者邵华斌卢琴罗青平杨玉莹《湖北农业科学》 2018年第8期96-100,共5页; 为了研究多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)对链霉素(Streptomycin,Str)药物敏感性变化及其耐药机制,采用体外诱导法对禽源Pm亲本敏感株(C48-1)进行诱导后成功获得Str耐药株,并对Str耐药株的最小抑菌浓度(MIC)、生化特性、生长... 展开更多; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌体外诱导链霉素耐药基因位点突变耐药机制; 在线阅读下载PDF 职称材料

禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析被引量：1: 5; 作者汪最孔令严 +2 位作者邵华斌卢琴罗青平《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期288-293,共6页; 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Pm)链霉素(Str)敏感株与耐药株(MIC=1024μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Str敏感株与耐药株进行双向测序,筛选得到差异表达基因,通过GO、KEGG和ARDB数据库对差异表达基因进行分组和富集... 展开更多; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析 ARDB分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因多重PCR检测方法的建立被引量：1: 1; 作者何贤发冯方东徐一凡高博施文文薛梦琦郭伟娜; 机构安徽科技学院动物科学学院; 出处《动物医学进展》北大核心 2018年第4期13-18,共6页; 基金安徽省教育厅自然科学研究重点项目(KJ2016A822) 安徽科技学院自然科学研究项目(ZRC2016497) +1 种基金安徽省兽医学重点学科建设项目(AKZDXK2015A04); 文摘为建立多重PCR方法用于禽源多杀性巴氏杆菌中毒力基因的检测,对禽源多杀性巴氏杆菌分离株MD-1的9个毒力基因进行PCR扩增及敏感性测定,然后通过多个基因的组合得到5种多重PCR体系,并从中筛选合适的多重PCR体系,测定其特异性、敏感性和重复性。结果显示,分离株MD-1中的9个毒力基因均可扩增出目的片段,敏感性测定结果表明,有的基因可检测至1.81×10~4 copies/μL的核酸。筛选出的4种多重PCR体系1、3或4、5均可用于其中6个毒力基因(pfhA、nanB、ompH、oma87、sodA、sodC)的检测,并且特异性较强,均能够扩增禽源多杀性巴氏杆菌分离株HN-1和CZ-6,而大肠埃希菌和沙门菌分离株均无扩增条带。多重PCR体系1、3、4可检测多杀性巴氏杆菌核酸的敏感性为1.81×10~6 copies/μL,多重PCR体系5甚至可检测至1.81×10~5 copies/μL,同时这4种多重PCR体系与单个毒力基因PCR检测的敏感性均一致。说明建立的禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因的多重PCR检测方法对多杀性巴氏杆菌毒力基因的快速检测有参考价值。; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因多重PCR 检测; Keywords avian Pasteurella multocida virulence gene multiplex PCR detection; 分类号 S852.612 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析被引量：5: 2; 作者孔令严罗青平卢琴邵华斌李槿年; 机构安徽农业大学动物科技学院湖北省农业科学院畜牧兽医研究所; 出处《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期262-266,共5页; 基金公益性农业行业科研专项:家禽主要细菌病防控技术研究与示范(201303044) 现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-42-G11) 规模化养鸡场主要疫病防控关键技术研究(2015ABA039); 文摘为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Avian Pasteurella multocida,Pm)敏感株与环丙沙星(Cip)耐药株的差异表达基因,本研究采用高通量转录组测序的RNA-seq技术对敏感株与Cip耐药株进行检测,参考Pm70株基因组(NC_002663.1)进行拼接与质量评估,测序数据处理后获得表达差异基因,利用GO和KEGG数据库对表达差异基因进行注释与富集性分析,并利用荧光定量PCR对转录组测序中的差异表达基因进行验证。结果显示,所有样品测序数据参考Pm70全基因组匹配率均达到95.87%以上,对基因差异表达进行分析后鉴定得到19个差异表达基因,其中15个上调,4个下调。通过GO功能富集分析显示差异表达基因主要为转运运输功能,并对差异表达基因进行信号通路富集性分析,结果表明最具代表性的信号通路为"ABC转运蛋白"(ko02010)。推测禽源Pm中的ABC转运蛋白超家族可能在Cip耐药机制中具有重要作用。; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析耐药机制; Keywords avian Pasteurella multocida RNA sequencing GO analysis KEGG pathways analysis resistance mechanism; 分类号 S852.61 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析被引量：2: 3; 作者孔令严汪最邵华斌张腾飞卢琴罗青平; 机构湖北省农业科学院畜牧兽医研究所农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室; 出处《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2019年第1期30-36,共7页; 基金公益性农业行业科研专项家禽主要细菌病防控技术研究与示范(201303040) +1 种基金规模化养鸡场主要疫病防控关键技术研究(2015ABA039); 文摘为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(avian Pasteurella multocida,Pm)四环素(Tetracycline,Tet)敏感株与耐药株(MIC=32μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Tet敏感株与耐药株进行双向测序,通过GO、KEGG和ARDB数据库对表达差异基因进行注释和富集性分析。结果显示,共筛选出442个差异表达基因,其中包括103个上调基因和339个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数富集于核糖体结构成分、rRNA结合、跨膜运输和离子转运等生物过程;对差异表达基因进行信号通路富集性分析,大多数差异表达基因分布在ABC转运蛋白与核糖体代谢途径中;对差异表达基因进行耐药基因注释(ARDB),发现其中的耐药基因主要为核糖体保护蛋白和外排系统两类。本研究表明禽源Pm对四环素耐药的耐药机制可能与细胞膜上ABC转运蛋白的过量表达以及核糖体保护蛋白有关。; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析 ARDB注释; Keywords AvianPasteurella multocida RNA sequencing GO analysis KEGG pathways analysis ARDB analysis; 分类号 S852.612 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名体外诱导禽巴氏杆菌链霉素耐药株及耐药机制的初步分析被引量：2: 4; 作者汪最孔令严邵华斌卢琴罗青平杨玉莹; 机构长江大学动物科学学院湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室; 出处《湖北农业科学》 2018年第8期96-100,共5页; 基金国家重点研发计划项目(2016YFD0500803) 公益性农业行业科研专项(201303040) 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-41-G13); 文摘为了研究多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)对链霉素(Streptomycin,Str)药物敏感性变化及其耐药机制,采用体外诱导法对禽源Pm亲本敏感株(C48-1)进行诱导后成功获得Str耐药株,并对Str耐药株的最小抑菌浓度(MIC)、生化特性、生长曲线、耐药稳定性、耐药基因点突变以及耐药逆转性进行了研究。结果表明,与亲本株相比,Str耐药株生化特性与生长曲线无显著差异,MIC值由8μg/m L上升至1 024μg/m L;发现耐药基因Str A、Str B,且核糖体基因rps L编码的氨基酸发生了Lys43→Thr突变;耐药逆转性试验中羰基氰氯苯腙(CCCP)将Str耐药株MIC值降为16μg/m L。逐步递增药物浓度可以诱导禽源Pm对氨基糖苷类药物的耐药性,其耐药机理为磷酸转移酶类对氨基糖苷类抗生素结构的修饰作用,核糖体靶位点突变和外排泵的过量表达。; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌体外诱导链霉素耐药基因位点突变耐药机制; Keywords avian Pasteurella multocida in vitro induction sreptomycin drug resistance gene site nmtation resistance mechanism; 分类号 S852.615 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析被引量：1: 5; 作者汪最孔令严邵华斌卢琴罗青平; 机构湖北省农业科学院畜牧兽医研究所长江大学动物科学学院农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室; 出处《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期288-293,共6页; 基金公益性农业行业科研专项:家禽主要细菌病防控技术研究与示范(201303040) 现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-42-G11) 规模化养鸡场主要疫病防控关键技术研究(2015ABA039); 文摘为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Pm)链霉素(Str)敏感株与耐药株(MIC=1024μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Str敏感株与耐药株进行双向测序,筛选得到差异表达基因,通过GO、KEGG和ARDB数据库对差异表达基因进行分组和富集性分析,并利用荧光定量PCR对筛选出的差异表达基因进行验证。结果显示,共筛选获得625个差异表达基因,其中包括581个上调基因和44个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数发挥细胞膜转运功能;对差异表达基因进行信号通路富集性分析显示,大多数差异表达基因分布在ABC转运蛋白与双组分系统代谢途径中;采用ARDB对差异表达基因进行耐药基因分析,显示其中的耐药基因主要为氨基糖苷转移酶类和外排系统两类。本研究结果表明,禽源Pm对Str的耐药机制可能与细胞膜上多药外排泵的过量表达和氨基糖苷转移酶类灭活抗菌药物有关。同时,也为进一步研究禽源Pm对Str的耐药机制奠定了基础。; 关键词禽源多杀性巴氏杆菌转录组测序 GO功能分析 KEGG功能分析 ARDB分析; Keywords avian Pasteurella multocida RNA sequencing GO analysis KEGG pathways analysis ARDB analysis; 分类号 S852.61 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	禽源多杀性巴氏杆菌毒力基因多重PCR检测方法的建立	何贤发冯方东徐一凡高博施文文薛梦琦郭伟娜	《动物医学进展》北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析	孔令严罗青平卢琴邵华斌李槿年	《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2017	5	在线阅读下载PDF 职称材料
3	禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析	孔令严汪最邵华斌张腾飞卢琴罗青平	《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心	2019	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	体外诱导禽巴氏杆菌链霉素耐药株及耐药机制的初步分析	汪最孔令严邵华斌卢琴罗青平杨玉莹	《湖北农业科学》	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析	汪最孔令严邵华斌卢琴罗青平	《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料