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基于离散增量的免疫分类器在模式生物基因中应用
1
作者
王炼红
章兢
段兰燕
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009年第4期1409-1411,1415,共4页
首先把线虫、酵母和拟南芥三种模式生物基因组中的内含子、外显子和基因间序列归为三类,滑动统计这些序列中64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,这样就得到了这些序列的64维特征值,并将这些数据分成训练样本集和测试样本集...
首先把线虫、酵母和拟南芥三种模式生物基因组中的内含子、外显子和基因间序列归为三类,滑动统计这些序列中64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,这样就得到了这些序列的64维特征值,并将这些数据分成训练样本集和测试样本集。根据免疫进化网络理论,用离散增量作为抗体—抗原间的亲和度函数,把训练集看成抗原,不断刺激免疫网络向识别抗原的方向进化,构造了一个基于离散增量的免疫分类器。通过测试表明,该分类器性能优良,分类预测准确率达到了85%以上。
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关键词
离散增量
免疫分类器
模式生物
基因序列
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职称材料
使用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白酶的类型
2
作者
王婷
《农业与技术》
2021年第8期46-48,共3页
蛋白酶的类型与其功能和催化机理关系密切,而且对药物的开发和研究有着至关重要的作用。本文从蛋白酶的一级序列出发,以氨基酸组分、氨基酸二肽组分和亲疏水三肽组分为参数,使用离散增量方法将3组参数降维,再把降维后的离散增量值以组...
蛋白酶的类型与其功能和催化机理关系密切,而且对药物的开发和研究有着至关重要的作用。本文从蛋白酶的一级序列出发,以氨基酸组分、氨基酸二肽组分和亲疏水三肽组分为参数,使用离散增量方法将3组参数降维,再把降维后的离散增量值以组合向量的形式输入支持向量机,对3051个蛋白酶的类型进行预测,获得了较好的预测效果。
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关键词
蛋白酶
氨基酸n肽组分
离散增量
支持向量机
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职称材料
离散量方法应用于蛋白质β发夹模体识别的研究
3
作者
姜雪
李石涛
《湖北农业科学》
北大核心
2013年第23期5898-5901,共4页
基于氨基酸一级序列,应用离散增量的方法识别ArchDB数据库中的6 100个β发夹模体和2 701个非β发夹模体。模体按照二级结构中无规卷曲的长进行分类得到"07232"、"07322"、"09432"、"09522"、&q...
基于氨基酸一级序列,应用离散增量的方法识别ArchDB数据库中的6 100个β发夹模体和2 701个非β发夹模体。模体按照二级结构中无规卷曲的长进行分类得到"07232"、"07322"、"09432"、"09522"、"13643"、"13733"、"13832"、"13922"型。以氨基酸和氨基酸紧邻关联为参量,利用10-fold交叉检验的方法进行检验,平均识别精度均达到75.0%和83.0%以上。以氨基酸亲疏水性和亲疏水紧邻关联为参量进行检验,平均识别精度有所降低。
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关键词
β发夹模体
离散增量
离散
量
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职称材料
基于广义信息距离的直接聚类算法
被引量:
6
4
作者
丁世飞
史忠植
+1 位作者
靳奉祥
夏士雄
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2007年第4期674-679,共6页
提出了基于广义信息距离的直接聚类算法.基于信息理论给出了离散量的基本概念,讨论并证明了离散量的一个基本不等式,进而给出了离散增量的概念.在分析距离测度的基础上,提出了广义信息距离(GID)、改进的广义信息距离(IGID),建立了基于GI...
提出了基于广义信息距离的直接聚类算法.基于信息理论给出了离散量的基本概念,讨论并证明了离散量的一个基本不等式,进而给出了离散增量的概念.在分析距离测度的基础上,提出了广义信息距离(GID)、改进的广义信息距离(IGID),建立了基于GID,IGID的直接聚类算法,并对土地肥力数据资料进行了聚类分析.结果表明,建立的算法与传统的聚类算法相比,算法原理简便、对数据本身的维数与分布要求不高,且具有较好的聚类效果.
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关键词
离散
量
离散增量
广义信息距离
直接聚类
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职称材料
一种新的信息系数及应用
被引量:
1
5
作者
陈超英
王黎明
邹武
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003年第4期503-505,共3页
给出了一种基于信息理论的广义距离系数.这一新的信息系数较离散增量信息系数有所改进,并可应用于聚类分析.
关键词
广义距离
离散增量
聚类分析
生物信息论
生物数学
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职称材料
基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
6
作者
姜雪
于巍
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第2期20-23,共4页
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和...
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。
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关键词
蛋白质
βαβ模体
离散增量
优化的参量
优化位点氨基酸
识别精度
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职称材料
中国人口发展预测研究
被引量:
12
7
作者
门可佩
官琳琳
尹逊震
《统计与决策》
CSSCI
北大核心
2007年第22期6-9,共4页
本文根据1949-2006年中国人口发展的实际,首次提出离散灰色增量模型和新初值灰色增量模型,并据此对未来中国人口进行预测研究。结果表明,到2007年底中国人口约达13.2133亿,到2010年将不超过13.405亿,2020年不超过13.913亿,2030年约为14...
本文根据1949-2006年中国人口发展的实际,首次提出离散灰色增量模型和新初值灰色增量模型,并据此对未来中国人口进行预测研究。结果表明,到2007年底中国人口约达13.2133亿,到2010年将不超过13.405亿,2020年不超过13.913亿,2030年约为14.27亿,2040年约为14.52亿,到2050年约为14.69亿。
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关键词
中国人口发展
离散
灰色
增量
模型
新初值灰色
增量
模型
人口预测
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职称材料
辅助控制点下快鸟影像定位求解及其精度分析
被引量:
2
8
作者
刘春
展昀
吴杭彬
《同济大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期983-988,共6页
结合上海地区城市快鸟(QuickBird)高分辨率卫星影像,简述高分辨率影像定位中的通用传感器模型,有理多项式系数模型(RPC).通过在影像上选取均匀分布的50个地面控制点,运用正则化最小二乘迭代法计算得出RPC.然后分2种情况对求解出的PRC改...
结合上海地区城市快鸟(QuickBird)高分辨率卫星影像,简述高分辨率影像定位中的通用传感器模型,有理多项式系数模型(RPC).通过在影像上选取均匀分布的50个地面控制点,运用正则化最小二乘迭代法计算得出RPC.然后分2种情况对求解出的PRC改正,即当同时具有原始地面控制点(GCP)和辅助GCP时,应用正则化批处理最小二乘迭代法(BILSR)来改正RPC系数,而当只有辅助GCP时,则使用增量离散卡尔曼滤波方法(IDKF)来改正RPC精度.最后利用40个检测点,设计多种方案的实验并进行分析,以此为基础对BILSR和IDKF法的可行性进行了对比分析,认为辅助控制点的选择应侧重其本身更高的精度而不是单纯从数量上考虑,此外得出城市高分辨率卫星影像几何处理的一些结论.
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关键词
卫星影像
有理多项式系数
正则化批处理最小二乘迭代
增量
离散
卡尔曼滤波
定位精度
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职称材料
早期油料火灾图像检测及识别技术研究
被引量:
2
9
作者
陈俊
杜扬
+1 位作者
王冬
吕航
《计算机工程与科学》
CSCD
北大核心
2010年第2期72-74,共3页
本文提出了一种早期油料火灾图像检测及识别算法。将火焰颜色、亮度及运动特征作为火灾检测与识别的判据,在火焰颜色模型和运动图像差分模型的基础上提出利用离散分形布朗随机增量场模型对早期油料火灾图像进行进一步的判定。模拟坑道...
本文提出了一种早期油料火灾图像检测及识别算法。将火焰颜色、亮度及运动特征作为火灾检测与识别的判据,在火焰颜色模型和运动图像差分模型的基础上提出利用离散分形布朗随机增量场模型对早期油料火灾图像进行进一步的判定。模拟坑道实验结果表明,该算法能够有效提高油料火灾检测与识别的准确率,降低误报、漏报率。
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关键词
油料火灾图像
火焰模型
差分模型
离散
分形布朗随机
增量
场模型
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职称材料
题名
基于离散增量的免疫分类器在模式生物基因中应用
1
作者
王炼红
章兢
段兰燕
机构
湖南大学电气与信息工程学院
中兴通讯股份有限公司
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009年第4期1409-1411,1415,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(60634020)
文摘
首先把线虫、酵母和拟南芥三种模式生物基因组中的内含子、外显子和基因间序列归为三类,滑动统计这些序列中64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,这样就得到了这些序列的64维特征值,并将这些数据分成训练样本集和测试样本集。根据免疫进化网络理论,用离散增量作为抗体—抗原间的亲和度函数,把训练集看成抗原,不断刺激免疫网络向识别抗原的方向进化,构造了一个基于离散增量的免疫分类器。通过测试表明,该分类器性能优良,分类预测准确率达到了85%以上。
关键词
离散增量
免疫分类器
模式生物
基因序列
Keywords
increment of diversity
immune classifier
model species
DNA sequences
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
使用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白酶的类型
2
作者
王婷
机构
长治职业技术学院
出处
《农业与技术》
2021年第8期46-48,共3页
文摘
蛋白酶的类型与其功能和催化机理关系密切,而且对药物的开发和研究有着至关重要的作用。本文从蛋白酶的一级序列出发,以氨基酸组分、氨基酸二肽组分和亲疏水三肽组分为参数,使用离散增量方法将3组参数降维,再把降维后的离散增量值以组合向量的形式输入支持向量机,对3051个蛋白酶的类型进行预测,获得了较好的预测效果。
关键词
蛋白酶
氨基酸n肽组分
离散增量
支持向量机
分类号
S-3 [农业科学]
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职称材料
题名
离散量方法应用于蛋白质β发夹模体识别的研究
3
作者
姜雪
李石涛
机构
沈阳工业大学基础部
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2013年第23期5898-5901,共4页
基金
辽宁省教育厅教学改革立项项目(2012411)
文摘
基于氨基酸一级序列,应用离散增量的方法识别ArchDB数据库中的6 100个β发夹模体和2 701个非β发夹模体。模体按照二级结构中无规卷曲的长进行分类得到"07232"、"07322"、"09432"、"09522"、"13643"、"13733"、"13832"、"13922"型。以氨基酸和氨基酸紧邻关联为参量,利用10-fold交叉检验的方法进行检验,平均识别精度均达到75.0%和83.0%以上。以氨基酸亲疏水性和亲疏水紧邻关联为参量进行检验,平均识别精度有所降低。
关键词
β发夹模体
离散增量
离散
量
Keywords
β-hairpin motif
increment of diversity
measure of diversity
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
基于广义信息距离的直接聚类算法
被引量:
6
4
作者
丁世飞
史忠植
靳奉祥
夏士雄
机构
中国矿业大学计算机科学与技术学院
中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室
山东科技大学地球信息科学与工程学院
出处
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2007年第4期674-679,共6页
基金
国家自然科学基金项目(60435010
90604017
+5 种基金
40574001
50674086)
国家"九七三"重点基础研究发展规划基金项目(2003CB317004)
国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2006AA01Z128)
高等学校博士学科点专项科研基金项目(20060290508)
北京市自然科学基金项目(4052025)
文摘
提出了基于广义信息距离的直接聚类算法.基于信息理论给出了离散量的基本概念,讨论并证明了离散量的一个基本不等式,进而给出了离散增量的概念.在分析距离测度的基础上,提出了广义信息距离(GID)、改进的广义信息距离(IGID),建立了基于GID,IGID的直接聚类算法,并对土地肥力数据资料进行了聚类分析.结果表明,建立的算法与传统的聚类算法相比,算法原理简便、对数据本身的维数与分布要求不高,且具有较好的聚类效果.
关键词
离散
量
离散增量
广义信息距离
直接聚类
Keywords
measure of diversity
inerernent of diversity
generalized information distance
direct clustering
分类号
TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
一种新的信息系数及应用
被引量:
1
5
作者
陈超英
王黎明
邹武
机构
福建农林大学计算机与信息学院
福建农林大学植物保护学院
福建农林大学图书馆
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003年第4期503-505,共3页
文摘
给出了一种基于信息理论的广义距离系数.这一新的信息系数较离散增量信息系数有所改进,并可应用于聚类分析.
关键词
广义距离
离散增量
聚类分析
生物信息论
生物数学
Keywords
information
generalized distance
increment of diversity
cluster analysis
分类号
Q-332 [生物学]
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职称材料
题名
基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
6
作者
姜雪
于巍
机构
沈阳工业大学辽阳校区基础部
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第2期20-23,共4页
基金
辽宁省教育厅教学改革立项(编号:2012411)
文摘
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。
关键词
蛋白质
βαβ模体
离散增量
优化的参量
优化位点氨基酸
识别精度
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
中国人口发展预测研究
被引量:
12
7
作者
门可佩
官琳琳
尹逊震
机构
南京信息工程大学数理学院
出处
《统计与决策》
CSSCI
北大核心
2007年第22期6-9,共4页
文摘
本文根据1949-2006年中国人口发展的实际,首次提出离散灰色增量模型和新初值灰色增量模型,并据此对未来中国人口进行预测研究。结果表明,到2007年底中国人口约达13.2133亿,到2010年将不超过13.405亿,2020年不超过13.913亿,2030年约为14.27亿,2040年约为14.52亿,到2050年约为14.69亿。
关键词
中国人口发展
离散
灰色
增量
模型
新初值灰色
增量
模型
人口预测
分类号
C924.24 [社会学—人口学]
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职称材料
题名
辅助控制点下快鸟影像定位求解及其精度分析
被引量:
2
8
作者
刘春
展昀
吴杭彬
机构
同济大学测量与国土信息工程系
同济大学现代工程测量国家测绘局重点实验室
出处
《同济大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期983-988,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(40501061)
国家"八六三"高技术研究发展计划资助项目(2007AA12Z178)
文摘
结合上海地区城市快鸟(QuickBird)高分辨率卫星影像,简述高分辨率影像定位中的通用传感器模型,有理多项式系数模型(RPC).通过在影像上选取均匀分布的50个地面控制点,运用正则化最小二乘迭代法计算得出RPC.然后分2种情况对求解出的PRC改正,即当同时具有原始地面控制点(GCP)和辅助GCP时,应用正则化批处理最小二乘迭代法(BILSR)来改正RPC系数,而当只有辅助GCP时,则使用增量离散卡尔曼滤波方法(IDKF)来改正RPC精度.最后利用40个检测点,设计多种方案的实验并进行分析,以此为基础对BILSR和IDKF法的可行性进行了对比分析,认为辅助控制点的选择应侧重其本身更高的精度而不是单纯从数量上考虑,此外得出城市高分辨率卫星影像几何处理的一些结论.
关键词
卫星影像
有理多项式系数
正则化批处理最小二乘迭代
增量
离散
卡尔曼滤波
定位精度
Keywords
satellite imagery
rational polynomial coefficients
batch iterative least-squares solution with regularization
incremental discrete kalman filtering
geo- positioning accuracy
分类号
P208 [天文地球—地图制图学与地理信息工程]
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职称材料
题名
早期油料火灾图像检测及识别技术研究
被引量:
2
9
作者
陈俊
杜扬
王冬
吕航
机构
解放军后勤工程学院军事供油工程系
中航油重庆分公司
出处
《计算机工程与科学》
CSCD
北大核心
2010年第2期72-74,共3页
文摘
本文提出了一种早期油料火灾图像检测及识别算法。将火焰颜色、亮度及运动特征作为火灾检测与识别的判据,在火焰颜色模型和运动图像差分模型的基础上提出利用离散分形布朗随机增量场模型对早期油料火灾图像进行进一步的判定。模拟坑道实验结果表明,该算法能够有效提高油料火灾检测与识别的准确率,降低误报、漏报率。
关键词
油料火灾图像
火焰模型
差分模型
离散
分形布朗随机
增量
场模型
Keywords
oil fire image
flame model
differential model
discrete fractal brownian incremental random field model (DFBIR)
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
X924.2 [环境科学与工程—安全科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于离散增量的免疫分类器在模式生物基因中应用
王炼红
章兢
段兰燕
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009
0
在线阅读
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职称材料
2
使用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白酶的类型
王婷
《农业与技术》
2021
0
在线阅读
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职称材料
3
离散量方法应用于蛋白质β发夹模体识别的研究
姜雪
李石涛
《湖北农业科学》
北大核心
2013
0
在线阅读
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职称材料
4
基于广义信息距离的直接聚类算法
丁世飞
史忠植
靳奉祥
夏士雄
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2007
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
一种新的信息系数及应用
陈超英
王黎明
邹武
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
6
基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
姜雪
于巍
《江苏农业科学》
北大核心
2015
0
在线阅读
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职称材料
7
中国人口发展预测研究
门可佩
官琳琳
尹逊震
《统计与决策》
CSSCI
北大核心
2007
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
8
辅助控制点下快鸟影像定位求解及其精度分析
刘春
展昀
吴杭彬
《同济大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
9
早期油料火灾图像检测及识别技术研究
陈俊
杜扬
王冬
吕航
《计算机工程与科学》
CSCD
北大核心
2010
2
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职称材料
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