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纳米孔靶向测序技术对福尔马林固定石蜡包埋组织中肉芽肿性疾病的诊断价值
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作者 孙晓柯 魏金星 +4 位作者 张春艳 梁瑞霞 史慧敏 阮祥林 段鸿飞 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第5期582-588,共7页
目的:评估纳米孔靶向测序技术(nanopore-targeted sequencing,NTS)对福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixation and paraffin embedding,FFPE)组织中肉芽肿性疾病的检测能力。方法:参照入组标准收集2023年1—6月河南省胸科医院收治的因... 目的:评估纳米孔靶向测序技术(nanopore-targeted sequencing,NTS)对福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixation and paraffin embedding,FFPE)组织中肉芽肿性疾病的检测能力。方法:参照入组标准收集2023年1—6月河南省胸科医院收治的因治疗需要行肺叶切除、淋巴结切除、骨关节手术治疗,且术后组织传统病理学结果提示为肉芽肿性炎的82例患者临床资料(包括传统病理学检测结果等),应用NTS技术检测术后病灶组织的FFPE标本,以最终临床诊断为参照评估NTS技术和传统病理学方法对肉芽肿性疾病的诊断价值。结果:82例患者中,组织病理学报告疑似结核病73例(89.0%)、结核分枝杆菌合并曲霉菌感染4例(4.9%)、隐球菌感染3例(3.7%)、肉芽肿性炎2例(2.4%);NTS检出菌种分别为结核分枝杆菌31例(37.8%)、真菌14例(17.1%)、非结核分枝杆菌9例(11.0%)、诺卡菌5例(6.1%)、布鲁杆菌和结核分枝杆菌合并黑曲霉各2例(2.4%)、未检出病原体16例(19.5%),以及结核分枝杆菌合并耶氏肺孢子菌、合并聚多曲霉、合并鸟分枝杆菌各1例(1.2%);最终临床诊断为结核病43例(52.4%)、真菌病13例(15.9%)、非结核分枝杆菌病9例(11.0%)、诺卡菌病和结核分枝杆菌合并真菌感染各5例(6.1%)、布鲁杆菌病2例(2.4%)、结核分枝杆菌合并非结核分枝杆菌1例(1.2%),4例(4.9%)患者诊断未明。以最终临床诊断为参照,病理学诊断对感染性肉芽肿的检测敏感度为60.3%(47/78),Kappa值为0.129;NTS检测感染性肉芽肿的敏感度为83.3%(65/78),Kappa值为0.328;组织病理学联合NTS技术检测感染性肉芽肿的敏感度为97.4%(76/78),Kappa值为0.788;三者特异度均为4/4。结论:NTS技术可检测肉芽肿性疾病到菌种水平,联合传统组织病理学可明显提高诊断感染性疾病病因学的效能,推荐作为传统组织病理学的补充方法。 展开更多
关键词 肉芽肿病 慢性 石蜡包埋 组织固定 纳米技术 分子诊断技术 对比研究
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福尔马林固定石蜡包埋组织中DNA提取 被引量:32
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作者 谭卓毅 丁梅 王保捷 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第6期455-458,共4页
由于甲醛介导的DNA损伤和石蜡对DNA提取的阻碍作用,使得常规DNA提取方法很难从福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPET)中获取高质量的DNA。近年来,众多学者的研究表明,通过改良预处理方法,优化蛋白酶K消化作用,简化DNA提取步骤,纯化DNA提取物... 由于甲醛介导的DNA损伤和石蜡对DNA提取的阻碍作用,使得常规DNA提取方法很难从福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPET)中获取高质量的DNA。近年来,众多学者的研究表明,通过改良预处理方法,优化蛋白酶K消化作用,简化DNA提取步骤,纯化DNA提取物等,可以有效提高FFPET中提取的DNA质量,为FFPET的DNA分析奠定了基础。 展开更多
关键词 福尔马林固定 石蜡包埋组织 DNA提取
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福尔马林固定石蜡包埋组织切片蛋白质组分析方法与应用研究进展 被引量:5
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作者 翁爽 王明超 +1 位作者 应万涛 钱小红 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期75-81,共7页
福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-fixed and paraffin-embedding,FFPE)是最常见的临床组织保存技术,FFPE组织具有标准化的制备流程、易于存储、标本量大、包含较完整的临床回顾性信息等特点,而成为疾病生物标志物发掘的良好载体。近年来... 福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-fixed and paraffin-embedding,FFPE)是最常见的临床组织保存技术,FFPE组织具有标准化的制备流程、易于存储、标本量大、包含较完整的临床回顾性信息等特点,而成为疾病生物标志物发掘的良好载体。近年来,基于临床FFPE组织的特点,发展了系列蛋白质组学研究方法,包括样本制备、消解、分离到蛋白质质谱鉴定等多个领域,总体呈现出微量、高灵敏度、高通量的技术特点,并已成功用于肿瘤精准医学等临床蛋白质组研究。该综述将对FFPE组织切片样本的蛋白质组学方法,以及其在肿瘤研究中的应用进行概述,从而为临床精准医学蛋白质组学的研究提供借鉴思路。 展开更多
关键词 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE) 临床蛋白质组学 交联 生物标志物
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人体脑组织福尔马林固定石蜡包埋样本中长链非编码RNA的提取及定量分析方法 被引量:2
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作者 吕叶辉 李志宏 +4 位作者 刘丽 黎世莹 李堃 杨智昉 陈忆九 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期400-406,共7页
目的·比较脑组织新鲜样本和福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)样本中RNA的质量,并分析长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)的表达情况。方法·收集不同保存条件下的FFPE及成对新鲜脑组织,... 目的·比较脑组织新鲜样本和福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)样本中RNA的质量,并分析长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)的表达情况。方法·收集不同保存条件下的FFPE及成对新鲜脑组织,提取并检测RNA质量,运用实时定量PCR(RT-q PCR)分析各RNA指标的扩增效率和表达稳定度,筛选内参指标并对比不同扩增长度候选指标的△Ct值改变情况,以明确FFPE样本中lnc RNA真实表达水平。结果·FFPE样本中RNA纯度相对较高,但完整性明显低于新鲜样本。所有指标均成功扩增,长链RNA的扩增效率与产物长度、样本处理方式、保存温度及保存时间有关,而5S、mi R-9及mi R-125b扩增效率均接近理想状态并在所有样本中稳定表达,适合作为内参指标。与新鲜样本相比,在4℃保存的FFPE样本中,只有HAR1F和MALAT1-L(>200 bp)的△Ct值升高;在室温保存的FFPE样本中,多数指标的△Ct值显著增加,但是短扩增(<60 bp)指标在所有样本中表达一致。结论·尽管处理方式和保存条件会影响组织RNA的完整性,但通过选择合适的扩增长度及内参指标,能够准确定量FFPE组织中lnc RNA的表达水平。 展开更多
关键词 脑组织 福尔马林固定石蜡包埋 RNA 质量 扩增效率 内参指标 长链非编码RNA
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福尔马林固定石蜡包埋组织DNA提取方法对PCR的影响 被引量:5
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作者 高文涛 张泽兵 +1 位作者 孙宏晨 欧阳喈 《白求恩医科大学学报》 CSCD 1999年第1期103-104,共2页
目的:比较多种福尔马林固定石蜡包埋组织DNA提取方法对PCR的影响,探讨临床组织病理标本理想的DNA提取方法及PCR应用。方法:采用5种不同的DNA提取方法应用PCR技术进行了比较。结果:Tween20,NP40... 目的:比较多种福尔马林固定石蜡包埋组织DNA提取方法对PCR的影响,探讨临床组织病理标本理想的DNA提取方法及PCR应用。方法:采用5种不同的DNA提取方法应用PCR技术进行了比较。结果:Tween20,NP40加蛋白酶K法和亚氨基二乙酸法处理标本时PCR结果较为理想。结论:合适的福尔马林固定石蜡包埋组织DNA提取方法可应用PCR进行DNA水平的相应的研究。 展开更多
关键词 福尔马林固定 石蜡包埋 DNA提取 病理组织学 PCR
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从福尔马林固定-石蜡包埋样本中抽提RNA的方法与可行性 被引量:2
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作者 朱萌 张宁 +2 位作者 任牡丹 卢新兰 和水祥 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期301-305,共5页
目的探讨从福尔马林固定-石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)组织中抽提RNA的可行性和有效性。方法收集胃癌和癌旁FFPE样本各41例,10μm厚连续切片3张,采用蛋白酶消化盐析法抽提纯化RNA,检测提取RNA的产量和质量并分析其... 目的探讨从福尔马林固定-石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)组织中抽提RNA的可行性和有效性。方法收集胃癌和癌旁FFPE样本各41例,10μm厚连续切片3张,采用蛋白酶消化盐析法抽提纯化RNA,检测提取RNA的产量和质量并分析其应用价值。结果 41对胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度为1.578~3.175,平均2.022±0.190,其中癌组织为1.578~3.175,平均2.033±0.240,癌旁组织为1.726~2.329,平均2.011±0.123;RNA浓度为(26.8~1 087)ng/μl,平均(267.062±210.435)ng/μl,其中癌组织为(50.5~1 087)ng/μl,平均(336.5±228.927)ng/μl,癌旁组织为(26.8~820)ng/μl,平均(197.62±165.47)ng/μl;琼脂糖凝胶电泳条带弥散分布,约300 bp;胃癌和癌旁RNA的纯度比较P=0.564,尚不能认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度有不同,但浓度比较P=0.001,可认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA浓度有所不同,癌组织中较高。结论从FFPE样本中抽提的RNA在不可避免地出现降解的情况下仍然具有很高的纯度和合适的浓度;在确保扩增产物大小处于一定范围内的前提下从FFPE样本中抽提的RNA具有可以满足下游应用的纯度、浓度和完整性;建立从FFPE样本中抽提RNA的方法在各种影响因素符合要求后完全可行。 展开更多
关键词 福尔马林固定-石蜡包埋 RNA抽提 方法
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福尔马林固定组织电镜标本制作法 被引量:1
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作者 井建华 《湖南医科大学学报》 CSCD 1999年第6期581-582,共2页
本文介绍了一种能使福尔马林固定、石蜡包埋的组织达到电镜观察要求的样品制备方法。对于取材新鲜、固定及时的石蜡包埋组织,脱蜡后再以4 % 戊二醛固定24 h ,1 % 锇酸后固定1 ~2 h ,再常规丙酮脱水、Epon812 包埋、超薄切片,可获得基... 本文介绍了一种能使福尔马林固定、石蜡包埋的组织达到电镜观察要求的样品制备方法。对于取材新鲜、固定及时的石蜡包埋组织,脱蜡后再以4 % 戊二醛固定24 h ,1 % 锇酸后固定1 ~2 h ,再常规丙酮脱水、Epon812 包埋、超薄切片,可获得基本上符合诊断要求的超微结构。此外。 展开更多
关键词 电子显微镜 福尔马林 石蜡包埋
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甲醛固定石蜡包埋胃癌组织中三种DNA提取方法的比较 被引量:4
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作者 郭丽 祁荣 +2 位作者 臧旭 郑瑞 付佳 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1412-1413,共2页
目前国内大多数医院均用10%中性福尔马林固定手术标本。随着分子生物学技术的不断发展,这些标本是可靠的分子生物学研究材料来源,在医学检验、法医鉴定、大宗病例回顾性研究等方面得到广泛应用。已有研究证明石蜡包埋组织在制作及保... 目前国内大多数医院均用10%中性福尔马林固定手术标本。随着分子生物学技术的不断发展,这些标本是可靠的分子生物学研究材料来源,在医学检验、法医鉴定、大宗病例回顾性研究等方面得到广泛应用。已有研究证明石蜡包埋组织在制作及保存过程中受多种试剂等因素的影响, 展开更多
关键词 甲醛固定 石蜡包埋 DNA提取 聚合酶链式反应
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甲醛固定及石蜡包埋组织的DNA分型及其应用 被引量:1
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作者 林源 郑颂国 +3 位作者 陆孝禹 阙庭志 罗建民 肖立 《法医学杂志》 CAS CSCD 1999年第2期82-83,共2页
目的:建立甲醛固定及石蜡包埋组织DNA的基因分型方法并使之应用于实际检案。方法:用Chelex和有机溶剂提取法提取DNA,以PCR与反向探针杂交技术作PM和HLA-DQA1位点分型。结果:26份包埋组织块有24份能得... 目的:建立甲醛固定及石蜡包埋组织DNA的基因分型方法并使之应用于实际检案。方法:用Chelex和有机溶剂提取法提取DNA,以PCR与反向探针杂交技术作PM和HLA-DQA1位点分型。结果:26份包埋组织块有24份能得到理想的分型结果。 展开更多
关键词 PCR 甲醛固定 石蜡包埋组织 DNA型
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非小细胞肺癌甲醛固定石蜡包埋切片DNA再利用的可行性研究 被引量:4
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作者 魏雪 叶胜兵 +4 位作者 王璇 吴楠 章如松 马恒辉 饶秋 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第2期187-192,共6页
目的对非小细胞肺癌(NSCLC)甲醛固定石蜡包埋(FFPE)标本经免疫组化染色后的DNA质量进行评估,旨在探讨针对标本量较少或难以获取的标本利用免疫组化染色后进行DNA提取及相关分子检测的可行性。方法随机选取2017年6月至2017年12月东部战... 目的对非小细胞肺癌(NSCLC)甲醛固定石蜡包埋(FFPE)标本经免疫组化染色后的DNA质量进行评估,旨在探讨针对标本量较少或难以获取的标本利用免疫组化染色后进行DNA提取及相关分子检测的可行性。方法随机选取2017年6月至2017年12月东部战区总医院病理科NSCLC FFPE标本50份,每份标本分别切片12张。随机选取其中6张切片作为对照组,直接进行DNA提取;其余6张切片作为实验组进行免疫组化Envision二步法染色后进行DNA提取。对所有提取DNA进行表皮生长因子受体(EGFR)、鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)以及鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌基因同源体B1(BRAF)基因突变检测。结果 50份NSCLC FFPE标本实验组提取DNA浓度及纯度与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。50份实验组NSCLC FFPE标本中,EGFR基因突变率为40%(20/50)、KRAS基因突变率为16%(8/50)、BRAF基因突变率为10%(5/50);50份对照组NSCLC FFPE标本中,33份分别检测出相应的EGFR、KRAS、BRAF基因突变,17份检测出阴性结果。实验组和对照组检测结果符合率达100%。结论 NSCLC FFPE标本,尤其是标本量较少或难以获取的样本,经免疫组化染色后能够提取高质量的DNA,且可用于靶基因的下游分子分析,为稀缺或难以获取的临床样本后续分子检测提供一种解决办法。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 甲醛固定石蜡包埋 免疫组化 DNA质量评估
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甲醛固定石蜡包埋切片经特殊染色后荧光定量聚合酶链反应检测的再利用 被引量:1
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作者 魏雪 叶胜兵 +4 位作者 章如松 夏秋媛 饶秋 马恒辉 吴楠 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期239-240,共2页
结核病是由结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的特异性炎症,在甲醛固定石蜡包埋组织切片中查见MTB是确诊结核的“金标准”。目前,结核病诊断的主要辅助检测方法是特殊染色和qRT-PCR检测。在临床病理诊断中,部分结... 结核病是由结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的特异性炎症,在甲醛固定石蜡包埋组织切片中查见MTB是确诊结核的“金标准”。目前,结核病诊断的主要辅助检测方法是特殊染色和qRT-PCR检测。在临床病理诊断中,部分结核病患者由于获取标本困难,穿刺标本微小,病理组织多被用于HE染色、特殊染色,所剩组织太少无法进行相关分子检测。 展开更多
关键词 特殊染色 石蜡包埋切片 临床病理诊断 荧光定量聚合酶链反应 甲醛固定 特异性炎症 结核病诊断 结核分枝杆菌
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一种从石蜡包埋组织中快速提取DNA的方法 被引量:8
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作者 张惠丹 任辉 +1 位作者 王晓楠 方瑾 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期590-593,共4页
目的建立从甲醛固定石蜡包埋组织中高效、快速提取基因组DNA的方法。方法将一片10μm厚石蜡包埋大肠癌组织切片直接浸入150μl消化液中,56℃孵育0.5h、1h和2h,灭活蛋白酶K后离心取上清即为DNA提取物。琼脂糖凝胶电泳检测所提取DNA的片... 目的建立从甲醛固定石蜡包埋组织中高效、快速提取基因组DNA的方法。方法将一片10μm厚石蜡包埋大肠癌组织切片直接浸入150μl消化液中,56℃孵育0.5h、1h和2h,灭活蛋白酶K后离心取上清即为DNA提取物。琼脂糖凝胶电泳检测所提取DNA的片段分布,紫外分光光度法测定DNA的产量及纯度。以提取的DNA为模板,PCR扩增不同长度产物片段并进行产物的直接测序以评价提取方法。结果该提取方法能够获得较长片段的基因组DNA,从一片10μm厚石蜡切片中即可获得大约60μg的DNA,在0.5h消化条件下获取的模板DNA,即可实现对152bp、293bp、392bp和541bp等4种不同片段的100%扩增,1h消化组的PCR产物可直接用于DNA测序。结论建立了一种简单、快速地从甲醛固定石蜡包埋组织中提取DNA的方法,只需一步消化即可获得满足普通PCR及测序需要的基因组DNA。 展开更多
关键词 甲醛固定 石蜡包埋组织 DNA提取 聚合酶链式反应(PCR)
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胃癌新鲜和石蜡组织及癌前病变组织中miR-106a的表达 被引量:3
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作者 朱萌 张宁 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期611-614,共4页
目的比较miR-106a在胃癌新鲜和石蜡组织中的表达,探讨其在胃癌前病变组织中的表达。方法收集人胃癌和对应癌旁组织新鲜样本30对和石蜡样本40对,采用实时荧光定量PCR技术检测miR-106a在两组样本中的表达。收集人胃癌前病变石蜡样本20例... 目的比较miR-106a在胃癌新鲜和石蜡组织中的表达,探讨其在胃癌前病变组织中的表达。方法收集人胃癌和对应癌旁组织新鲜样本30对和石蜡样本40对,采用实时荧光定量PCR技术检测miR-106a在两组样本中的表达。收集人胃癌前病变石蜡样本20例和胃腺癌石蜡样本40例,采用原位杂交技术检测miR-106a在胃癌早期发生阶段中的表达并与胃癌组织相比较。结果新鲜组织中miR-106a的相对表达量为3.25±1.99,石蜡组织中miR-106a的相对表达量为3.18±2.14,两组相比miR-106a表达量差异无统计学意义(P>0.05),两组样本miR-106a的表达具有显著相关性(rs=0.998,P<0.001)。在胃癌前病变阶段可以检测到miR-106a的表达,阳性率为70%,阳性颗粒位于不典型增生的上皮细胞内,呈深蓝色细颗粒状物;胃癌组织中miR-106a的阳性率为87.5%,阳性表达范围和强度较癌前病变明显扩大和增强。结论胃癌新鲜组织和石蜡组织中miR-106a的表达呈显著正相关,应用石蜡组织检测miR-106a在胃癌前病变中出现的早期表达变化,可以为胃癌的早期诊断提供有价值的信息。 展开更多
关键词 胃肿瘤 福尔马林固定-石蜡包埋 miR-106a 早期诊断
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组织固定对下游基因和蛋白分子检测的影响 被引量:7
14
作者 苟继周 李晓星 +6 位作者 孙炎 张鸿英 彭程 赵霞 孙宜康 喻宏 罗伟仁 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期439-441,共3页
甲醛固定石蜡包埋(formalin fixed and paraffin embedded,FFPE)组织是检测特异性生物标志物的主要标本来源之一。若未进行标准化的固定,用甲醛固定的组织作为下游检测的标本出现的问题较多,如会发生DNA碱基与附近组蛋白的交联、会引起... 甲醛固定石蜡包埋(formalin fixed and paraffin embedded,FFPE)组织是检测特异性生物标志物的主要标本来源之一。若未进行标准化的固定,用甲醛固定的组织作为下游检测的标本出现的问题较多,如会发生DNA碱基与附近组蛋白的交联、会引起组织中的DNA片段化等等。为全面了解FFPE标本对下游检测的影响,该文从其对蛋白质、DNA、RNA和miRNA等检测的影响作一综述,使病理工作者在今后的工作中,做好FFPE标本的固定处理,为下游的检测打好基础,让整个固定过程更加标准化,实现病理组织标本的精准固定。 展开更多
关键词 甲醛固定石蜡包埋组织 蛋白质 DNA RNA MIRNA
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qPCR检测结核杆菌在肺和胸膜上皮样肉芽肿性疾病诊断中的意义 被引量:9
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作者 陈昕 陈灵锋 黄颖 《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第10期1132-1134,共3页
目的探讨荧光定量聚合酶链反应(Real-time polymerase chain reaction,q PCR)法在诊断及鉴别诊断肺和胸膜结核病和其他肉芽肿性疾病中的意义。方法收集经病理学检查发现上皮样肉芽肿性病变的肺和胸膜活检的石蜡包埋组织142例,应用q PCR... 目的探讨荧光定量聚合酶链反应(Real-time polymerase chain reaction,q PCR)法在诊断及鉴别诊断肺和胸膜结核病和其他肉芽肿性疾病中的意义。方法收集经病理学检查发现上皮样肉芽肿性病变的肺和胸膜活检的石蜡包埋组织142例,应用q PCR法检测结核分枝杆菌DNA,同时行抗酸染色,并与临床资料对比进行回顾性分析。结果在142例肺胸膜活检标本中,60例临床诊断确诊为结核病。采用q PCR法检测结核分枝杆菌DNA阳性者58例,敏感性为96.67%,特异性为100%;抗酸染色阳性者17例,敏感性为28.33%,特异性为97.56%,差异有统计学意义(χ~2=21.47,P<0.001)。结论结核分枝杆菌核酸检测有助于在石蜡包埋的肺和胸膜小活检组织中快速、准确的诊断结核病,可用于疑似结核的肉芽肿性病变的鉴别诊断。 展开更多
关键词 结核 分枝杆菌 福尔马林固定石蜡包埋组织 荧光定量聚合酶链反应
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建立科研使用FFPE肿瘤组织库的几点建议 被引量:3
16
作者 程凯 章如松 +2 位作者 余波 马恒辉 石群立 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期463-464,共2页
福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed paraffn embed-ded,FFPE)是病理科普遍采用的组织处理和保存方法。组织标本经取材、固定、脱水、透明、浸蜡以及包埋等程序处理之后,可长时间保存《临床技术操作规范一病理学分册》(以下简称... 福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed paraffn embed-ded,FFPE)是病理科普遍采用的组织处理和保存方法。组织标本经取材、固定、脱水、透明、浸蜡以及包埋等程序处理之后,可长时间保存《临床技术操作规范一病理学分册》(以下简称《操作规范》)要求,FFPE组织需保存15年。该操作由于流程简单,易于掌握,可以实现高度自动化处理,且代价低廉,适合大多数医院病理科开展。目前,FFPE组织已广泛应用于病理科的常规病理工作中。 展开更多
关键词 肿瘤组织库 技术操作规范 科研 福尔马林固定 石蜡包埋 保存方法 长时间保存 自动化处理
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聚羟基丙烯酸和Van-clear替代传统试剂在FISH法检测宫颈hTERC基因中的应用比较 被引量:6
17
作者 陈志强 王莹 +7 位作者 米贤军 陈昂 黄华勇 钟守军 邓文同 刘超凡 徐秀梅 代新珍 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期356-360,共5页
目的:观察环保固定液(聚羟基丙烯酸、环保透明脱蜡液Van-clear单独或联合)替代传统固定液[4%(体积分数)中性缓冲甲醛、传统透明脱蜡液二甲苯]应用于荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)法检测宫颈组织中人端粒酶核... 目的:观察环保固定液(聚羟基丙烯酸、环保透明脱蜡液Van-clear单独或联合)替代传统固定液[4%(体积分数)中性缓冲甲醛、传统透明脱蜡液二甲苯]应用于荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)法检测宫颈组织中人端粒酶核糖核酸组分(human telomerase RNA component,h TERC)基因扩增的差异。方法:收集2013年3月到2015年4月于中山市博爱医院妇科住院部送检的255例宫颈组织标本,同一病变部位切取4个样本,分为4组,命名为A、B、C、D组:A组采用4%中性缓冲甲醛固定、二甲苯透明脱蜡制作切片;B组采用聚羟基丙烯酸固定、二甲苯透明脱蜡制作切片;C组采用4%中性缓冲甲醛固定、Van-clear透明脱蜡制作切片;D组采用聚羟基丙烯酸固定、Van-clear透明脱蜡制作切片。采用FISH技术检测4组宫颈标本中h TERC基因。结果:在FISH法检测宫颈各级病变组织h TERC基因时,荧光显微镜下,A、B、C、D四组的组织轮廓和背景均清晰,探针定位准确,可见耀眼的红/绿荧光信号。B、C、D组与A组阳性率相比差异均无统计学意义(P>0.05),且FISH结果符合率高。结论:环保试剂聚羟基丙烯酸、Van-clear有潜在的可能单独或联合替代4%中性缓冲甲醛、二甲苯应用于FISH法检测宫颈h TERC基因。 展开更多
关键词 病理学 临床 组织固定 石蜡包埋 原位杂交 荧光 末端转移酶端粒RNA
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PCR-SSCP技术分析线粒体DNA多态性及其法医学应用 被引量:3
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作者 张明阳 单海燕 +5 位作者 徐冬冬 丁梅 王保捷 庞灏 周勤虎 冯春梅 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期334-336,共3页
目的探讨SSCP法在线粒体DNA分析中的应用及其在法医实际检案中的意义。方法利用PCR方法直接扩增D-LOOP区的HVI16106-16297区域192bp片段作为目的片段,进行SSCP分型。检验150例随机个体、10例正常组织和5例甲醛固定石蜡包埋的组织。结果... 目的探讨SSCP法在线粒体DNA分析中的应用及其在法医实际检案中的意义。方法利用PCR方法直接扩增D-LOOP区的HVI16106-16297区域192bp片段作为目的片段,进行SSCP分型。检验150例随机个体、10例正常组织和5例甲醛固定石蜡包埋的组织。结果在150例随机个体中,SSCP检测发现9种单倍型,DP值为0.881。在10例正常组织中,各个组织的SSCP带型完全相同。5例包埋组织的SSCP分型与对照组织一致。结论 SSCP技术分析线粒体DNA有较高的鉴别能力,适用于陈旧降解检材的检验。 展开更多
关键词 法医物证学 多态性 PCR-SSCP技术 甲醛固定石蜡包埋组织
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Hsa-miR-181a在子宫内膜癌变过程中的表达及意义 被引量:4
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作者 何淑明 曾淑梅 +1 位作者 陈秀卿 梁秋红 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第12期1895-1897,共3页
目的:探讨hsa-miR-181a(miR-181a)在子宫内膜癌变过程中的表达及其意义。方法:选取甲醛固定石蜡包埋组织75例,其中正常子宫内膜13例,子宫内膜增生症18例,子宫内膜癌44例。提取总RNA,采用实时荧光定量PCR技术检测各组子宫内膜组织中miR-1... 目的:探讨hsa-miR-181a(miR-181a)在子宫内膜癌变过程中的表达及其意义。方法:选取甲醛固定石蜡包埋组织75例,其中正常子宫内膜13例,子宫内膜增生症18例,子宫内膜癌44例。提取总RNA,采用实时荧光定量PCR技术检测各组子宫内膜组织中miR-181a的表达量。结果:在甲醛固定石蜡包埋组织中可检测到miR-181a的表达。miR-181a在子宫内膜癌组织中的表达高于子宫内膜增生症,在子宫内膜增生症组织中的表达高于正常子宫内膜,差异均有统计学意义(P<0.05);miR-181a的表达与FIGO分期有关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:miR-181a在子宫内膜癌组织中表达上调,可能起到了癌基因的作用;miR-181a在子宫内膜癌变过程中的差异表达可能与子宫内膜癌的发生、发展有关。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 hsa—miR-181a MICRORNA 甲醛固定石蜡包埋组织
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乳腺癌组织样本中HER2基因拷贝数的检测分析
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作者 孙亚蒙 马晔 郭润生 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1589-1597,共9页
目的·利用微滴式数字PCR系统(droplet digital PCR system,ddPCR)建立乳腺癌组织福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin embedded,FFPE)样本和血浆样本中HER2基因拷贝数检测体系,并对检测体系进行性能评估,为临床辅助诊疗... 目的·利用微滴式数字PCR系统(droplet digital PCR system,ddPCR)建立乳腺癌组织福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin embedded,FFPE)样本和血浆样本中HER2基因拷贝数检测体系,并对检测体系进行性能评估,为临床辅助诊疗提供科学依据。方法·收集2020年1月—2021年6月就诊于上海健康医学院附属嘉定区中心医院普外科乳腺癌患者组织样本12例及其中4例配对血浆样本用于检测体系评价,同期收集健康志愿者血浆样本24例及就诊的乳腺癌组织切片样本77例,提取核酸,用于建立检测体系空白检测限及性能评价。设计及筛选检测体系,使用ddPCR检测体系的空白检测限、精密度、灵敏度及线性范围,使用高通量测序(next generation sequencing,NGS)验证ddPCR检测一致性,并与荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,IHC)/免疫组化(immunohistochemistry,FISH)金标准方法比对检测体系准确性。定量资料比较采用χ^(2)检验和配对样本t检验进行分析,使用Poisson概率函数分析体系空白检测限,变异系数(coefficient of variation,CV)评价灵敏度及精密度,线性回归相关系数(R^(2))评价线性范围。结果·使用ddPCR平台建立了乳腺癌患者组织切片DNA中HER^(2)基因拷贝数定量和扩增检测体系,配对样本t检验评价:与NGS方法检测组织核酸和血浆游离核酸样本结果相比,检测拷贝数结果相关系数0.987,扩增判读一致性100%。评估检测体系的批内精密度为6.8%、批间精密度为9.4%,灵敏度为1 ng,线性良好(R^(2)>0.98)。与传统的IHC/FISH方法相比,检测体系的灵敏度和特异度分别为84.6%(95%CI 64.3%~95.0%)和76.5%(95%CI 62.2%~86.8%),Kappa为0.57,一致率为79.2%。结论·使用ddPCR建立乳腺癌患者HER^(2)拷贝数检测体系,临床检测一致性良好,可能为乳腺癌患者的诊疗和预后判断的研究提供辅助手段。 展开更多
关键词 乳腺癌 福尔马林固定石蜡包埋 血浆 微滴式数字PCR HER2拷贝
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