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生物信息学分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其与免疫细胞浸润的相关性
被引量:
1
1
作者
张瀚
张津豪
王涛
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期205-212,共8页
目的 采用生物信息学方法分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其在肿瘤免疫细胞浸润中的作用。方法 利用仙桃学术在线分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中CALN1基因在胶质瘤中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存分析法评价...
目的 采用生物信息学方法分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其在肿瘤免疫细胞浸润中的作用。方法 利用仙桃学术在线分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中CALN1基因在胶质瘤中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存分析法评价其预后价值,利用受试者工作特征(ROC)曲线评价其临床诊断效能,采用基因集富集分析(GSEA)探究CALN1在胶质瘤中的潜在作用机制,探讨CALN1 mRNA与胶质瘤免疫细胞浸润的关系。结果 胶质瘤中CALN1表达显著降低,且其表达水平与肿瘤分级负相关。与对照组比,CALN1在异柠檬酸脱氢酶突变型和染色体1p/19q共缺失胶质瘤中表达水平显著升高。CALN1低表达的胶质瘤患者预后较差,整体存活率、疾病相关存活率和无进展间隔期显著降低。ROC曲线分析显示CALN1表达水平具有较好的临床诊断价值。GSEA基因富集结果提示CALN1表达水平与有丝分裂和中性粒细胞脱颗粒负相关。免疫浸润分析显示CALN1低表达组中2型辅助T(Th2)细胞、巨噬细胞和中性粒细胞显著升高。结论 胶质瘤中CALN1表达水平与预后正相关,其表达异常降低可导致具有促肿瘤作用的免疫细胞浸润。CALN1可作为胶质瘤预后判断的潜在标志物和治疗靶点。
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关键词
癌症基因组图谱(TCGA)
胶质瘤
神经元
钙蛋白
1(
caln
1)
免疫细胞浸润
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职称材料
题名
生物信息学分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其与免疫细胞浸润的相关性
被引量:
1
1
作者
张瀚
张津豪
王涛
机构
空军军医大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室
吉林医药学院检验学院
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期205-212,共8页
基金
国家自然科学基金(82073361)
肿瘤生物学国家重点实验室自主课题(CBSKL2019ZZ20)
陕西省重点研发计划(2020SF-201)。
文摘
目的 采用生物信息学方法分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其在肿瘤免疫细胞浸润中的作用。方法 利用仙桃学术在线分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中CALN1基因在胶质瘤中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存分析法评价其预后价值,利用受试者工作特征(ROC)曲线评价其临床诊断效能,采用基因集富集分析(GSEA)探究CALN1在胶质瘤中的潜在作用机制,探讨CALN1 mRNA与胶质瘤免疫细胞浸润的关系。结果 胶质瘤中CALN1表达显著降低,且其表达水平与肿瘤分级负相关。与对照组比,CALN1在异柠檬酸脱氢酶突变型和染色体1p/19q共缺失胶质瘤中表达水平显著升高。CALN1低表达的胶质瘤患者预后较差,整体存活率、疾病相关存活率和无进展间隔期显著降低。ROC曲线分析显示CALN1表达水平具有较好的临床诊断价值。GSEA基因富集结果提示CALN1表达水平与有丝分裂和中性粒细胞脱颗粒负相关。免疫浸润分析显示CALN1低表达组中2型辅助T(Th2)细胞、巨噬细胞和中性粒细胞显著升高。结论 胶质瘤中CALN1表达水平与预后正相关,其表达异常降低可导致具有促肿瘤作用的免疫细胞浸润。CALN1可作为胶质瘤预后判断的潜在标志物和治疗靶点。
关键词
癌症基因组图谱(TCGA)
胶质瘤
神经元
钙蛋白
1(
caln
1)
免疫细胞浸润
Keywords
TCGA
glioma
caln
euron
1
(
caln
1
)
immune cell infiltration
分类号
S853.53 [农业科学—临床兽医学]
Q297 [生物学—细胞生物学]
R392 [医药卫生—免疫学]
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1
生物信息学分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其与免疫细胞浸润的相关性
张瀚
张津豪
王涛
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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