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碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌肠道定植继发血流感染遗传同源性分析
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作者 李欣玥 张鸿娟 +6 位作者 朱晓雁 黄美佳 许云敏 李寻蝶 郑心怡 李少轩 单斌 《协和医学杂志》 北大核心 2025年第5期1138-1147,共10页
目的 探究碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia,CRKP)肠道定植菌株与血流感染菌株之间的遗传关联性。方法 回顾性收集2023年1月-2024年12月昆明医科大学第一附属医院行碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(carbap... 目的 探究碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia,CRKP)肠道定植菌株与血流感染菌株之间的遗传关联性。方法 回顾性收集2023年1月-2024年12月昆明医科大学第一附属医院行碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, CRE)筛选患者的临床资料。对于存在肠道定植CRKP者,追踪其继发血流感染情况并对存在血流感染患者的肠道定植菌株与血流感染菌株进行配对分析。采用抗菌药物敏感性试验、生物被膜形成能力、铁载体定量及血清抗性试验比较肠道定植菌株与血流感染菌株的耐药性及毒力表型差异。结合全基因组测序,解析两组菌株遗传同源性。结果 共12 878例患者行CRE筛查,发现存在肠道定植CRKP 60例(0.47%),其中6例(10.0%)发生血流感染,此类患者住院期间全因死亡率为66.7%(4/6)。配对菌株以ST11-KL64型产KPC-2酶为主,占比91.7%(11/12)。除1例患者(分类一致性为82.6%)外,余肠道定植菌株与血流感染菌株在除替加环素外的其他抗菌药物的耐药谱上表现出高度一致性(分类一致性均达100%)。所有配对菌株生物被膜形成能力及铁载体合成量的组内相关系数均>0.75,表明毒力表型高度一致。除1例患者外,核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)分析及系统发育树结果表明,同一患者的肠道定植菌株与血流感染菌株基因组高度同源(SNP差异<10),且不同科室来源的定植菌株之间出现克隆相关性(SNP差异<120)。结论 CRKP肠道定植阳性率虽低,但继发血流感染后死亡风险高。肠道定植菌株与血流感染菌株耐药谱、生物被膜形成及铁载体合成量高度一致,基因组同源性高,表明肠道定植为继发感染的直接来源。建议加强高危患者的早期筛查与动态监测,实施风险分级防控与干预,优化防治策略,以降低CRKP的感染及死亡风险。 展开更多
关键词 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 肠道定植 血流感染 全基因组测序 同源性
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1株动物源碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌基因组及耐药质粒水平扩散研究
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作者 王晓旭 张玉杰 +5 位作者 沈莉萍 徐锋 齐新永 刘健 何随彬 赵洪进 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第4期197-205,共9页
肺炎克雷伯菌(KP)可引起呼吸道、泌尿生殖系感染,创伤、败血症及腹泻,是一种重要的人畜共患病原体。本研究利用细菌基因组三代测序技术和生物信息学平台,对前期工作中分离出的奶牛场养殖环节来源肺炎克雷伯碳青霉烯耐药菌KP329进行了基... 肺炎克雷伯菌(KP)可引起呼吸道、泌尿生殖系感染,创伤、败血症及腹泻,是一种重要的人畜共患病原体。本研究利用细菌基因组三代测序技术和生物信息学平台,对前期工作中分离出的奶牛场养殖环节来源肺炎克雷伯碳青霉烯耐药菌KP329进行了基因组分析及碳青霉烯耐药机制研究。结果显示:KP329染色体总长度为5 337 963 bp,共编码5163个基因,GC含量为57.3%,含有23个耐药基因,MLST分型显示KP329为肺炎克雷伯菌ST101型;KP329携带3个质粒,大小分别为291 962 bp(KP329-1)、105 109 bp(KP329-2)以及4572 bp(KP329-3),其中KP329-1为多重耐药质粒,含有10个耐药基因:aac(3)-IIa、qnrS1、LAP-2、sul1、qacEdelta1、sul2、dfrA1、tet(A)、aph(6)-Id、aph(3'')-Ib,KP329-2只含有1个耐药基因(blaKPC-2),而KP329-3不含有任何已知耐药基因;尽管KP329外膜蛋白OmpK35/OmpK36/ OmpK37发生了氨基酸突变,但对KP329碳青霉烯药物敏感性并无显著影响。细菌结合转移实验则表明,KP329-2质粒可在不同种属细菌发生水平转移,增加宿主菌对碳青霉烯及其他抗生素的抵抗性,具有较高的环境扩散风险。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯 青霉 基因组分析
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ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的毒力基因分布及分子流行病学特征 被引量:1
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作者 黄雅轩 蔡依含 +2 位作者 何婉霞 张莉滟 赵越 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期730-736,共7页
目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜... 目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜血清型及分子流行病学特征,了解ICU中CRKP的感染特点,为ICU有效监测和防控CRKP感染提供科学依据。方法:收集2021年1月至2022年12月广东省人民医院ICU所分离并已确定为CRKP的非重复菌株共40株。采用全基因组测序方法,分析待测菌株耐药基因、毒力基因、荚膜血清型的分布,同时将CRKP基因组7个管家基因序列上传至肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)数据库进行分析,以明确菌株的序列型(sequence typing,ST)。结果:40例ICU CRKP感染患者年龄为(69.03±17.82)岁,且伴有多种基础疾病,临床结局好转和死亡各20例。所分离菌株主要来源于中段尿、肺泡灌洗液等标本。全基因组测序结果显示其主要携带blaKPC-1(29株,72.5%)和blaNDM-1(6株,15.0%),另有5株同时携带blaKPC-1和blaNDM-1。所携带的毒力基因有多种,其中entA、entB、entE、entS、fepA、fepC、fepG、yag/ecp、ompA等基因的携带率达100%,entD、fimB、iroB、iroD、fes、pla等基因携带率较低。ICU所分离的CRKP以ST11型(27例,67.5%)为主,荚膜血清型以KL64型(29例,72.5%)为主。共检出23例ST11-KL64型CRKP,占57.5%。结论:ICU CRKP主要为ST11-KL64型,并携带多种毒力基因,其中以铁吸收类毒力基因为主;且blaKPC已由blaKPC-2转为blaKPC-1。因此,需密切监测CRKP的分子流行病学变化,同时制订严格的防控措施,有效遏制CRKP感染的发生。 展开更多
关键词 重症监护室 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 全基因组测序 毒力基因 荚膜血清型 多位点序列分型 分子流行病学
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MALDI-TOF MS在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌流行病学分析中的应用 被引量:13
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作者 程国平 简雪峰 +1 位作者 许德英 郭海军 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期62-66,共5页
目的:用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)检测碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKp)同源性,... 目的:用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)检测碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKp)同源性,并与脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)两种检测方法进行对比,探讨质谱在日常工作中的应用价值。方法:选取2017年10—12月从河南科技大学第一附属医院院患者分离的以及ICU环境采集的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌10株,检测8种耐药基因:blaTEM、blaSHV、blaCTX-M、blaKPC、blaIMP、blaNDM、blaVIM、blaOXA。采用PFGE、MLST和MALDI-TOF MS 3种方法对这些菌株进行同源性分析。结果:PFGE证实10株CRKp均为同一克隆株的传播,ST型同属于ST11。MALDI-TOF MS经过对细菌进行聚类分析和主成分分析可以区分不同型别肺炎克雷伯菌,对同型肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumonia,Kp)的同源性检测在80%左右。结论:MALDI-TOF MS在肺炎克雷伯菌的同源性检测方面可以应用于院内爆发局部感染的监测,与PFGE和MLST两种方法检测结果一致,但需要尽快建立规范的判断标准。 展开更多
关键词 MALDI-TOF MS 青霉肺炎克雷伯 同源性
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碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌耐药机制及分子流行病学研究 被引量:24
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作者 储雯雯 刘周 +1 位作者 杨凯 管世鹤 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2016年第6期809-813,共5页
目的探讨临床分离的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的耐药基因及分子流行病学研究。方法收集并鉴定临床分离非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌株44株。采用Vitek 2compact全自动微生物鉴定药敏分析仪鉴定进行常规药敏试验,改良Hodge试验检测KPC... 目的探讨临床分离的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的耐药基因及分子流行病学研究。方法收集并鉴定临床分离非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌株44株。采用Vitek 2compact全自动微生物鉴定药敏分析仪鉴定进行常规药敏试验,改良Hodge试验检测KPC型碳青霉烯酶,EDTA协同法检测金属β-内酰胺酶,聚合酶链反应(PCR)法检测细菌携带的耐药基因。肠杆菌基因间重复性共有序列ERIC-PCR对菌株进行同源性分析,了解其分子流行病学特征。结果44株肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类、青霉素类、头孢菌素类和氨曲南等抗菌药物显示了较高的耐药性。改良Hodge试验阳性41株,金属酶检测试验结果均为阴性。PCR结果显示,临床分离的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌以KPC-2型为主,共42株。ERIC-PCR将44株肺炎克雷伯菌分为14型,以Ⅰ型为主,共18株,集中于重症监护室(ICU)和神经外科。结论分离的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌对临床常用抗菌药物表现出高水平耐药;其耐药机制主要是该类细菌产KPC-2碳青霉烯酶,ICU与其它科室的患者频繁转诊治疗可能是导致碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌在全院范围播散流行的主要原因。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯 青霉 ERIC-PCR KPC-2
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头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南联合对临床分离碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的协同作用 被引量:4
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作者 宋洁 陈先华 +3 位作者 朱科 刘灵 熊玮 冯伟 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第20期2026-2030,共5页
目的探讨头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南联合对碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的协同作用。方法采用琼脂平板倍比稀释法测定细菌的最低抑菌浓度,PCR扩增碳青霉烯酶基因和超广谱β-内酰胺酶基因,RT-PCR检测碳青霉烯酶基因的表达量,多位点序列分型... 目的探讨头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南联合对碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的协同作用。方法采用琼脂平板倍比稀释法测定细菌的最低抑菌浓度,PCR扩增碳青霉烯酶基因和超广谱β-内酰胺酶基因,RT-PCR检测碳青霉烯酶基因的表达量,多位点序列分型分析菌株的基因型,棋盘法测定头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南的协同作用。结果10株碳青霉烯高耐药菌株除对替加环素敏感性较高外,对其他实验药物均具有较高的耐药性。β-内酰胺酶基因NDM、CTX-M和SHV在菌株中分布广泛,且对碳青霉烯耐药高的菌株其碳青霉烯酶基因表达也较高(r=0.805,P=0.029)。菌株共有4个ST型,ST11是最流行的基因型,NDM基因存在于3种不同的基因型菌株中。头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南联合对7株碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌具有协同作用,3株为无关作用。结论碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的高耐药与其携带的耐药基因相关,头孢他啶/阿维巴坦与氨曲南有较高的协同作用。 展开更多
关键词 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 头孢他啶/阿维巴坦 氨曲南 协同作用 多位点序列分型
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社区获得性碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌血流感染临床特征及预后 被引量:12
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作者 曾唐怡 曹理言 +4 位作者 贺丹 李彪 严新光 姚小红 谢和宾 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期793-797,共5页
目的探讨社区获得性碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌血流感染的临床特征及预后。方法回顾性分析某院2017年2月—2021年3月社区获得性肺炎克雷伯菌血流感染病例,根据药敏结果分为碳青霉烯耐药组(CRKP组)和敏感组(CSKP组),比较两组患者临床特征... 目的探讨社区获得性碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌血流感染的临床特征及预后。方法回顾性分析某院2017年2月—2021年3月社区获得性肺炎克雷伯菌血流感染病例,根据药敏结果分为碳青霉烯耐药组(CRKP组)和敏感组(CSKP组),比较两组患者临床特征以及30 d预后。结果两组患者在冠心病或者心力衰竭、慢性阻塞性肺疾病、近期住院史、慢性肾功能不全、贫血、深静脉置管、机械通气、留置胃管、留置导尿管等方面比较,差异均有统计学意义,CRKP组均高于CSKP组(均P<0.05)。CRKP组患者30天病死率高于CSKP组(58.82%VS 9.68%,P<0.001)。结论社区获得性碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌血流感染在有心肺肾基础疾病及近期住院史的患者中比例高,CRKP组预后差,临床需要重点关注。 展开更多
关键词 社区获得 青霉 肺炎克雷伯 血流感染 临床特征 预后
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2018-2020年河北省儿童医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的耐药特征分析
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作者 于文静 李梅 +3 位作者 郭映辉 徐茜茹 李圆龙 王启 《中国感染与化疗杂志》 北大核心 2025年第2期181-186,共6页
目的 了解儿童患者分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药特性和分布特征,为儿童CRKP感染的预防和治疗以及感染控制提供依据。方法 收集2018年1月-2020年12月河北省儿童医院临床分离的182株CRKP,并采用MALDI-TOF MS鉴定细菌。... 目的 了解儿童患者分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药特性和分布特征,为儿童CRKP感染的预防和治疗以及感染控制提供依据。方法 收集2018年1月-2020年12月河北省儿童医院临床分离的182株CRKP,并采用MALDI-TOF MS鉴定细菌。采用聚合酶链反应检测碳青霉烯酶基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(VIM)、bla_(OXA-48))。采用多位点序列分型(MLST)对菌株进行同源性分析。结果 182例感染CRKP的患儿主要为婴儿(>28 d~<1岁),占49.45%(90/182);其次为新生儿(≤28 d),占36.26%(66/182)。182株CRKP主要来源于痰液(50.55%,92/182)、血液(15.93%,29/182)和尿液(13.19%,24/182);主要分布在新生儿科(30.22%,55/182)、普外科(21.43%,39/182)、心外科(13.19%,24/182)和重症科(11.54%,21/182)。药敏结果显示182株CRKP对头孢吡肟、头孢他啶、哌拉西林-他唑巴坦和头孢哌酮-舒巴坦耐药率为100%;对氨曲南的耐药率为97.8%;对阿米卡星、环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率分别为71.4%、81.9%和75.8%;对多西环素的耐药率为69.2%;对替加环素的耐药率较低,为2.7%。碳青霉烯酶基因主要为bla_(KPC-2)(73.63%,134/182),其次为bla_(NDM-5) (15.38%,28/182)和bla_(NDM-1) (11.54%,21/182)。MLST共鉴定出15种不同的序列型,其中最常见的分型是ST11型(72.53%,132/182);其次为ST17型(11.54%,21/182)。结论 该院临床分离的CRKP耐药情况严重,临床应尽量根据药敏结果选用敏感药物,以减少耐药菌株的出现。携带bla_(KPC-2)基因的ST11型CRKP可能已在医院内播散,应采取有效的控制措施,避免耐药菌株进一步扩散。 展开更多
关键词 儿童 青霉肺炎克雷伯 多位点序列分型
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析
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作者 储雯雯 刘周 +4 位作者 李昕 叶乃芳 龚真 曾晓娇 周强 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期37-44,共8页
目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基... 目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基因测序技术分析CRKP菌株多位点序列分型、荚膜血清型、耐药基因和毒力基因,并对所有菌株序列进行单核苷酸多态性分析,采用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增与黏菌素耐药相关基因。结果57株CRKP对除替加环素外的14种抗菌药物均为耐药。测序结果显示,93.0%(53/57)的CRKP携带bla KPC-2,ST11型CRKP菌株检出率最高(51/57,89.5%)。单核苷酸多态性聚类分析表明,57株CRKP分为11个克隆群,其中有4个克隆群均为ST11-KL64型CRKP。40株(70.2%)CRKP携带多种毒力基因。5株黏菌素耐药CRKP,其耐药机制是在mgr B基因70位点处插入一个ISKpn26元件。结论CRKP菌株以产KPC-2 ST11-KL64型为主要流行型,在重症监护病房有播散性流行。ISKpn26元件插入引起mgr B基因突变与该地区CRKP黏菌素耐药有关。 展开更多
关键词 青霉肺炎克雷伯 全基因组测序 单核苷酸多态性分析 ISKpn26
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海南省高毒力耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药及毒力因子特征的初步研究
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作者 李天娇 龙文芳 +2 位作者 陈颖 张培 陈英 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第9期1222-1228,共7页
目的分析海南某医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学特征,探讨高毒力CRKP(hv-CRKP)与非hv-CRKP的耐药基因、毒力因子分布差异及临床意义,为优化治疗和防控策略提供依据。方法回顾性收集2023年7月—2024年6月海南省某医院... 目的分析海南某医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学特征,探讨高毒力CRKP(hv-CRKP)与非hv-CRKP的耐药基因、毒力因子分布差异及临床意义,为优化治疗和防控策略提供依据。方法回顾性收集2023年7月—2024年6月海南省某医院分离的CRKP菌株,通过药敏试验检测其耐药表型,采用聚合酶链式反应(PCR)检测碳青霉烯酶基因(KPC-2、NDM-1、IPM)及毒力因子(rmp A/rmp A2、iuc A、iro B等),并分析其科室来源、标本分布及耐药-毒力特征。结果共分离CRKP菌株76株,总分离率为7.7%(76/985),菌株主要分布于重症监护病房(ICU,28.9%)和神经外科ICU(23.6%),呼吸道标本占比最高(60.5%)。耐药基因以KPC-2(72.4%)和NDM-1(21.1%)为主,毒力因子mrk D(Ⅲ型菌毛,85.5%)和fim H(Ⅰ型菌毛,84.2%)普遍存在。在76株CRKP中,39株(51.3%)符合hv-CRKP标准,均携带KPC-2基因(100%),其耐药基因和毒力因子rmp A2(97.4%)、iuc A(100%)、iro B(89.7%)检出率均高于非hv-CRKP(KPC-2,43.2%;rmp A2,0;iuc A,8.1%;iro B,13.5%)。hv-CRKP的主要特征为KPC-2耐药基因与rmp A2+iuc A+iut A+iro B毒力因子组合(64.1%)。hv-CRKP与非hv-CRKP耐药表型不同,hv-CRKP对氨基糖苷类和复方磺胺甲口恶唑的敏感率高于非hv-CRKP。结论该院CRKP菌株中,hv-CRKP和非hv-CRKP占比相当。hv-CRKP以携带KPC-2耐药基因与rmp A2+iuc A+iut A+iro B毒力因子组合为主要特征,携带多种毒力因子菌株的比例高于非hv-CRKP。两者对β-内酰胺类和喹诺酮类药物普遍耐药,hv-CRKP对氨基糖苷类和复方磺胺甲口恶唑的耐药率低于非hv-CRKP,其氨基糖苷类敏感性优势为治疗提供新选择。建议通过分子分型指导差异化用药,并强化ICU感染控制措施以遏制耐药菌扩散。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯 青霉 基因 毒力因子 差异性
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耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌对磷霉素耐药性研究
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作者 李敏 黎萍 左玮 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第6期845-854,共10页
目的探讨磷霉素耐药的高毒力耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(hv-CRKP)菌株的临床和流行病学特征,以及对磷霉素耐药的潜在分子机制,为临床抗感染治疗决策提供参考依据。方法通过药物敏感性试验,筛选并收集2023年1-12月某地三级甲等医院的非重... 目的探讨磷霉素耐药的高毒力耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(hv-CRKP)菌株的临床和流行病学特征,以及对磷霉素耐药的潜在分子机制,为临床抗感染治疗决策提供参考依据。方法通过药物敏感性试验,筛选并收集2023年1-12月某地三级甲等医院的非重复hv-CRKP菌株,分析其临床特征和耐药性,并采用全基因组测序研究非磷霉素敏感hv-CRKP的分子流行病学特征。结果共纳入73株hv-CRKP,其中34株(46.6%)对磷霉素耐药。磷霉素非敏感组患者糖尿病患病率高于磷霉素敏感组(P<0.05),其他临床特征比较差异无统计学意义。药敏结果显示,除替加环素、黏菌素、头孢他啶/阿维巴坦和磷霉素外,hv-CRKP对其他常见抗菌药物的耐药率均超过90%。荚膜血清型和毒力基因检测显示,所有hv-CRKP均为产KPC酶ST11型菌株,主要血清型为KL64(47.9%)和KL25(52.1%),磷霉素敏感组与磷霉素非敏感组hv-CRKP荚膜血清型分布比较,差异无统计学意义。耐药基因检测结果显示,碳青霉烯酶耐药基因bla KPC和磷霉素耐药基因fos A和fos A6在hv-CRKP中广泛存在,仅在磷霉素非敏感组检测到1株携带fos A3基因;73株hv-CRKP均携带mur A中的Leu359Gln突变修饰,部分具有转运系统相关基因glp T突变,未检出其他磷霉素修饰酶耐药基因,如fos A2、fos A5、fos A10、fos B、fos C和fos X。结论hv-CRKP对磷霉素的耐药率较高,mur A、glp T修饰突变,以及磷霉素耐药基因fos A和fos A6的广泛存在是本研究中磷霉素耐药的主要机制。需要注意的是,fos A类基因可能被含有强启动子的高拷贝质粒捕获,从而导致磷霉素耐药。 展开更多
关键词 青霉肺炎克雷伯 高毒力 磷霉素 机制 分子流行病学
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肺炎克雷伯菌血流感染患儿碳青霉烯类耐药的临床特征及预后危险因素分析
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作者 曹金俊 黄河玉 +5 位作者 沙月娇 蒋永新 王超 段萍萍 李华君 夏昊 《华中科技大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第5期694-701,共8页
目的探讨肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)血流感染患儿的临床特点,分析发生碳青霉烯类耐药及不良预后的高危因素,为减少耐药菌株产生和改善预后提供依据。方法纳入2016~2022年间于上海交通大学医学院附属新华医院儿内科、儿外... 目的探讨肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)血流感染患儿的临床特点,分析发生碳青霉烯类耐药及不良预后的高危因素,为减少耐药菌株产生和改善预后提供依据。方法纳入2016~2022年间于上海交通大学医学院附属新华医院儿内科、儿外科、儿科重症监护室(PICU)、新生儿重症监护室(NICU)住院且血培养结果为肺炎克雷伯菌的患儿,收集其临床资料,根据药敏结果分为耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)组和非CRKP组,根据患者临床预后情况分为预后良好(痊愈、好转)组和预后不良(死亡、自动出院)组,比较分析其临床特点、实验室检查和危险因素。结果177份血培养肺炎克雷伯菌阳性,其中97份菌株(54.8%)药敏结果提示为CRKP。Logistic回归分析提示住院期间手术史(OR=2.678,95%CI:1.248~5.746,P=0.011)、呼吸机使用(OR=2.774,95%CI:1.235~6.229,P=0.013)、住院时长≥25 d(OR=3.467,95%CI:1.431~8.401,P=0.006)、血小板≥237×10^(9)/L(OR=3.005,95%CI:1.268~7.124,P=0.012)、血小板平均体积(MPV)≥12 fL(OR=3.011,95%CI:1.140~7.955,P=0.026)是发生CRKP血流感染的高危因素,住院期间使用呼吸机(OR=2.819,95%CI:1.138~6.985,P=0.025)、血小板<149×10^(9)/L(OR=0.238,95%CI:0.079~0.717,P=0.011)是肺炎克雷伯菌血流感染患儿不良预后的高危因素。结论肺炎克雷伯菌血流感染的耐药率高且有增加趋势,对住院时长超过25 d、存在手术史、使用呼吸机、血小板≥237×10^(9)/L、MPV≥12 fL的肺炎克雷伯菌血流感染患儿需警惕为CRKP感染;CRKP感染并非肺炎克雷伯菌血流感染患儿不良预后的高危因素,但对使用呼吸机、血小板<149×10^(9)/L的患儿需警惕不良预后。对于存在高危因素的患儿需予以特别关注并及时干预,争取改善患儿预后。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯 血流感染 青霉 预后 危险因素
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基于全基因组测序的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的流行病学特征与耐药及毒力基因研究
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作者 饶玉婷 姜蕾 +3 位作者 葛茹 朱留洋 刘艳会 张雨 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第10期1367-1376,共10页
目的探讨某地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的临床特点、耐药基因及毒力基因分子流行病学特征,为CRKP感染的防治及流行病学研究提供科学依据。方法回顾性分析2023年11月—2024年9月濮阳油田总医院临床分离的非重复CRKP 60株。采用VI... 目的探讨某地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的临床特点、耐药基因及毒力基因分子流行病学特征,为CRKP感染的防治及流行病学研究提供科学依据。方法回顾性分析2023年11月—2024年9月濮阳油田总医院临床分离的非重复CRKP 60株。采用VITEK 2 Compact全自动微生物分析仪、K-B纸片扩散法及微量肉汤稀释法进行药敏试验;拉丝试验鉴定菌株的黏液表型;碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测碳青霉烯酶;通过全基因组测序及生物信息学分析确定菌株的多位点序列分型(MLST)、荚膜血清型、耐药基因、毒力基因、质粒复制类型等分子特征及菌株的亲缘与进化关系。结果CRKP主要分离自老年男性住院患者,标本多来源于痰(71.67%),主要分布在呼吸内科(30.00%)。所有菌株对多种常见抗菌药物均高度耐药,仅对头孢他啶/阿维巴坦、替加环素和多黏菌素B敏感率较高(>60.00%)。2株CRKP拉丝试验阳性,95.00%的菌株产A类丝氨酸碳青霉烯酶。所有菌株均携带氟喹诺酮类、磷霉素类、β-内酰胺类和氨基糖苷类耐药基因,肠杆菌素、大肠埃希菌共有菌毛(ECP)和外膜蛋白相关毒力基因,以及IncF质粒家族的质粒。碳青霉烯酶基因以bla KPC-2(95.00%)为主,荚膜血清型以KL19(43.33%)为主,MLST中ST11(51.67%)为主要优势克隆群,ST11-KL62(12株)为优势亚型。结论该院CRKP对多种常见抗菌药物高度耐药,其对碳青霉烯类药物耐药的机制主要与携带bla KPC-2耐药基因相关。所有菌株多种耐药基因、多种毒力基因共存,呈多克隆传播现象,ST11为主要优势克隆群,ST11-KL62为主要流行的亚克隆型别。 展开更多
关键词 青霉肺炎克雷伯 全基因组测序 毒力 克隆群 荚膜血清型
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重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌定植与传播研究 被引量:4
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作者 陈翔 高晓东 +5 位作者 周春妹 黄声雷 潘文彦 刘霄 梅静骅 史庆丰 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期77-84,共8页
目的探讨和分析重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)菌株特征与传播途径。方法选取2023年1—10月某院肝外科监护病房CRKP临床感染株17株(临床感染组)、主动筛查株5株(主动筛查组)、环境分离株7株(环境组)进行全基因组测序分析,... 目的探讨和分析重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)菌株特征与传播途径。方法选取2023年1—10月某院肝外科监护病房CRKP临床感染株17株(临床感染组)、主动筛查株5株(主动筛查组)、环境分离株7株(环境组)进行全基因组测序分析,并比较其耐药基因、毒力基因、ST分型差异,根据系统发育树分析其传播途径。结果29株CRKP分别携带4~18种耐药基因,52~98个毒力基因,3组CRKP的耐药基因、毒力基因的数量及基因型别分布比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。ST分型显示,29株CRKP主要包含ST11和ST15两大类,基于核心基因组构建的系统发育树显示,共有7组不同的CRKP高度同源,其中4组有较为明确的流行病学关联。结论重症监护病房的CRKP携带较多的耐药基因、毒力基因,部分菌株ST分型和系统发育树高度同源,存在交叉传播的可能,今后应加强防控措施以减少CRKP的传播。 展开更多
关键词 重症监护病房 青霉肺炎克雷伯 全基因组测序 传播
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上海市医疗机构ST11型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学特征与高毒力进化研究 被引量:1
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作者 毕菁 陈雯杰 +7 位作者 田靓 刘倩 吴寰宇 陈敏 陈泰尧 施婷婷 马伟 张红芝 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第8期1075-1082,共8页
目的了解上海市医疗机构分离的ST11型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学特征及高毒力进化趋势,为制定耐药菌的预防控制措施提供科学依据。方法收集2021—2022年上海市12所医疗机构分离的201株CRKP,检测药敏结果并进行全基... 目的了解上海市医疗机构分离的ST11型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学特征及高毒力进化趋势,为制定耐药菌的预防控制措施提供科学依据。方法收集2021—2022年上海市12所医疗机构分离的201株CRKP,检测药敏结果并进行全基因组测序,拼接后的数据用于多位点序列分型(MLST)、血清分型(wzi分型),以及耐药基因和毒力基因分析。结果201株CRKP均为多重耐药菌(MDROs)。对碳青霉烯类、头孢菌素类、喹诺酮类药物几乎全耐药;耐药基因分析显示,93.03%的CRKP菌株携带KPC基因。201株CRKP分为6种ST型和10种荚膜wzi分型,以ST11-KL64型(104株)为主,ST15-KL19型(54株)次之。52.24%(105株)的CRKP携带rpm A/rpm A2+iuc A+iut A+iro N基因。结论上海市医疗机构分离的CRKP以ST11-KL64型为主,多重耐药情况严重,且半数以上菌株为高毒力耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(hv-CRKP),需持续加强对CRKP的分子特征监测,防止医院感染的暴发。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯 血清分型 MLST ST11型 高毒力青霉肺炎克雷伯 hv-CRKP 基因 毒力基因
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江西地区某综合医院ST11型耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌的分子流行病学研究 被引量:1
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作者 黄珊珊 施博文 +4 位作者 魏丹丹 霍炳慧 洪涵旭 江昕竹 刘洋 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期30-36,共7页
目的探究ST11型耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)菌株的临床特征、耐药现状、毒力特征及分子流行病学特征。方法收集某三级甲等教学医院2018—2021年临床标本分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)菌株,通过耐药基因、毒力基因... 目的探究ST11型耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)菌株的临床特征、耐药现状、毒力特征及分子流行病学特征。方法收集某三级甲等教学医院2018—2021年临床标本分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)菌株,通过耐药基因、毒力基因检测,以及多位点序列分型(MLST)筛选出ST11型CR-hvKP,分析其基本临床信息、耐药基因、毒力基因;随机选取其中23株ST11型CR-hvKP菌株进行毒力表型分析;随机选取其中45株CR-hvKP,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析其同源性。结果2018—2021年临床分离ST11型CR-hvKP菌株共124株,主要来自神经外科(33.87%),标本以痰为主(56.45%),感染患者平均年龄为(55.2±16.4)岁,男性为主(77.42%)。药敏试验结果显示其对大部分临床常用抗菌药物耐药;毒力试验结果显示菌株毒力存在差异,但多为高毒力毒株;PFGE分析结果显示菌株以A1亚型为主(63.4%)。结论ST11型CR-hvKP表现出多重耐药性和高毒力特征,部分菌株在该院存在克隆性传播现象,给临床抗感染治疗及防控带来巨大挑战,需加强医院感染的防控和管理。 展开更多
关键词 青霉类高毒力肺炎克雷伯 ST11型CR-hvKP CRKP hvKP 青霉 肺炎克雷伯
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1株牛源耐碳青霉烯K57型肺炎克雷伯菌噬菌体的分离鉴定及其全基因组分析
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作者 庞舒琪 韩正慧 +12 位作者 汤昆平 王乐平 黎春玲 白慧丽 李常挺 李显 尹杨燕 马春霞 滕翎 李军 陈忠伟 周以林 彭昊 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第11期5476-5487,共12页
【目的】以牛源K57型耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌临床分离株KLB-04为宿主菌,分离该菌的强裂解性噬菌体,并对该噬菌体的生化特性及全基因组进行分析,为后续肺炎克雷伯菌噬菌体临床应用、噬菌体衍生蛋白的开发与使用提供一定的科学依据。【方... 【目的】以牛源K57型耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌临床分离株KLB-04为宿主菌,分离该菌的强裂解性噬菌体,并对该噬菌体的生化特性及全基因组进行分析,为后续肺炎克雷伯菌噬菌体临床应用、噬菌体衍生蛋白的开发与使用提供一定的科学依据。【方法】采用双层琼脂平板法从污水中分离肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体;通过透射电镜观察、宿主谱测定、pH耐受和温度稳定性评估、最佳感染复数测定、一步生长曲线测定、全基因组测序等方法分析噬菌体的形态学、生物学特性和全基因组特性。【结果】分离到1株裂解性噬菌体并命名为GXKP01,该噬菌体的噬菌斑直径约3 mm,带有约2 mm外圈晕环;透射电镜观察显示,该噬菌体由头部和较短的收缩性尾部组成,头部为正二十面体,直径约60 nm,尾部长15~20 nm,属于Studiervirinae亚科、Przondovirus属。噬菌体GXKP01感染肺炎克雷菌KLB-04的潜伏期约10 min,一个感染周期约持续70 min,每感染一个细菌约可产生136个子代噬菌体病毒颗粒。噬菌体GXKP01仅可裂解宿主菌KLB-04,特异性较强;在4~60℃,pH 3.0~12.0条件下稳定性良好。噬菌体GXKP01基因组为双链线性DNA,全长39795 bp,GC含量为53.13%,共有44个编码基因;不携带毒力因子和耐药基因,显示出遗传的安全性。【结论】本研究分离出1株可裂解K57血清型耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的强裂解性噬菌体,为利用噬菌体预防和治疗高毒力耐药肺炎克雷伯菌感染提供一定的研究基础。 展开更多
关键词 分离鉴定 青霉肺炎克雷伯 全基因组测序
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产气克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制研究
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作者 寿晓玲 王佳庆 +2 位作者 苏芳 沈蓓琼 张淑琦 《中国抗生素杂志》 北大核心 2025年第8期944-949,共6页
目的明确耐碳青霉烯酶产气克雷伯菌株(carbapenem-resistant Klebsiella aerogenes,CRKA)对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制。方法收集2022—2023年浙江省两家医院分离的产气克雷伯菌,通过药敏实验筛选CRKA菌株,应用PCR筛查碳青霉烯耐药相... 目的明确耐碳青霉烯酶产气克雷伯菌株(carbapenem-resistant Klebsiella aerogenes,CRKA)对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制。方法收集2022—2023年浙江省两家医院分离的产气克雷伯菌,通过药敏实验筛选CRKA菌株,应用PCR筛查碳青霉烯耐药相关基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(IMP)和bla_(OXA-48)),通过药敏试验、接合试验和全基因组测序等方法明确CRKA菌株对碳青霉烯类抗菌药物耐药机制。同时基于全基因组单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)对CRKA进行系统发育分析。结果本研究共鉴定出9株携带bla_(NDM)基因的CRKA菌株,所有菌株对包括碳青霉烯类抗菌药物在内的多种抗菌药物耐药,仅对阿米卡星和多黏菌素敏感,均为多重耐药菌。所有菌株携带bla_(NDM)基因,且该基因均位于质粒,可成功接合转移入大肠埃希菌J53,提示该耐药基因存在质粒传播风险。系统发育分析发现,产气克雷伯菌主要在临床环境中发生克隆传播。结论bla_(NDM)基因是介导CRKA菌株对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要原因。临床应注意CRKA菌株存在院内感染暴发流行可能,持续筛查和监测尤为重要。 展开更多
关键词 青霉类产气克雷伯 NDM 质粒 进化分析 机制
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一起耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌聚集事件的调查与分析
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作者 霍嫚 徐文娟 +1 位作者 王芳 蒋翔 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期93-98,共6页
目的对某中医院重症监护病房(ICU)发生的一起耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)聚集事件进行调查,为医院内多重耐药菌的防控提供参考。方法2023年1—7月,某中医院ICU出现多例CRKP感染患者,检出水平超过历年同期水平。收集患者临床信息,并... 目的对某中医院重症监护病房(ICU)发生的一起耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)聚集事件进行调查,为医院内多重耐药菌的防控提供参考。方法2023年1—7月,某中医院ICU出现多例CRKP感染患者,检出水平超过历年同期水平。收集患者临床信息,并进行流行病学调查、环境卫生学监测,对所分离的CRKP进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)鉴定,查找可能传播的原因,并采取相应的控制措施。结果研究期间共确认13例患者发生CRKP感染,主要为呼吸道感染、血流感染以及腹腔感染。环境监测显示,131份环境物体表面和工作人员手标本仅有2份标本检出CRKP,经PFGE鉴定显示2株分离自洗手池水槽标本的CRKP与2例近期住院患者检出的菌株高度同源。另有部分患者分离菌株同源性较高,存在交叉传播的可能。结论CRKP容易在ICU患者之间交叉传播并污染环境,应早期对其进行预警和调查,以防医院感染暴发事件的出现。 展开更多
关键词 青霉肺炎克雷伯 医院感染聚集 重症监护病房 脉冲场凝胶电泳
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌荚膜特异性解聚酶克隆表达及其相关功能研究
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作者 闫涛 汪娜 +5 位作者 王秋妍 马成成 滕宣 余可雪 葛宏华 刘周 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第7期1251-1257,共7页
目的构建K64型荚膜特异性解聚酶重组蛋白Dep44,探讨其在对抗耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染中的应用效力。方法分离表达解聚酶的噬菌体(vB_Kpn_HF1013,GenBank:PP803128),分析其基因序列,筛选具有解聚酶活性的候选蛋白,构建重组蛋... 目的构建K64型荚膜特异性解聚酶重组蛋白Dep44,探讨其在对抗耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染中的应用效力。方法分离表达解聚酶的噬菌体(vB_Kpn_HF1013,GenBank:PP803128),分析其基因序列,筛选具有解聚酶活性的候选蛋白,构建重组蛋白Dep44并验证其解聚酶活性。通过滴板法验证Dep44重组蛋白的敏感谱,通过生物膜清除及血清杀菌实验评估Dep44抗菌活性。结果噬菌体vB_Kpn_HF1013尾刺蛋白具有解聚酶活性,能特异性裂解K64型CRKP荚膜。生物膜清除实验结果显示:与对照组比较,2μg/mL与10μg/mL剂量的Dep44重组蛋白均可有效破坏细菌生物膜。血清杀菌实验结果显示:Dep44重组蛋白具有协同血清杀菌能力,但这种作用需要依赖补体系统的存在,Dep44本身不具备直接杀菌活性。结论Dep44重组蛋白能够特异性裂解K64型CRKP荚膜,具备破坏生物膜及协同血清杀菌能力,有望应用于K64型CRKP相关感染的控制及医疗器械表面生物膜的清除。 展开更多
关键词 解聚酶 青霉肺炎克雷伯 荚膜 生物膜 重组蛋白
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