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不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析 被引量:3
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作者 杨佳栋 刘月琴 张英杰 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第15期41-45,共5页
为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过Codon W软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲... 为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过Codon W软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲缘关系。GCT、TGT、TTT、ATT、CCT、AGA、ACT为哺乳动物GDF9基因的最优密码子,该基因偏爱使用以A或T结尾的密码子;G、C含量和蛋白质亲水性是影响GDF9基因密码子偏性的主要因素;聚类分析提示不同哺乳动物间的同源性越高,GDF9基因密码子使用特征的相似性越高。 展开更多
关键词 哺乳动物 GDF9 碱基替换 密码子偏性 聚类分析
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遗传性耳聋的基本概念(2) 被引量:5
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作者 王秋菊 纵亮 《听力学及言语疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期110-112,共3页
3 HHL的遗传学描述3.1 HHL相关基因座的描述由遗传连锁分析方法获得的遗传性聋的新基因座位应有一个官方的座位命名,这个官方的命名必须来自人类基因组命名委员会(Human Genome Organization Nomenclature Committee,HUGO)。基因座位... 3 HHL的遗传学描述3.1 HHL相关基因座的描述由遗传连锁分析方法获得的遗传性聋的新基因座位应有一个官方的座位命名,这个官方的命名必须来自人类基因组命名委员会(Human Genome Organization Nomenclature Committee,HUGO)。基因座位是根据其所在的染色体(分为常染色体和性染色体)、相关家系的遗传方式及同类基因座位发现的先后序惯命名的,包括一个前缀(体现所在染色体和遗传方式信息),后面紧跟一个号码(体现同类基因座位发现的先后顺序)。 展开更多
关键词 基因座位 遗传性耳聋 常染色体 人类基因组 遗传连锁 Genome 家系图 耳聋基因 碱基替换 新生儿听力筛查
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一个新的A等位基因突变所致A亚型的血清学特点及家系调查
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作者 邱芳 丁琴丽 +3 位作者 邹姣 邹丽萍 陈瑜 朱颖 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期509-512,共4页
目的:1名诊断为支气管扩张症的男性患者的血型正反定型不一致,正向和反向血型分别为O型和A型。本研究对其进行了包括基因分型和测序在内的多项实验及家系调查,以确定其亚型,并探讨该亚型的血清学特点。方法:用标准的血清学技术对先证者... 目的:1名诊断为支气管扩张症的男性患者的血型正反定型不一致,正向和反向血型分别为O型和A型。本研究对其进行了包括基因分型和测序在内的多项实验及家系调查,以确定其亚型,并探讨该亚型的血清学特点。方法:用标准的血清学技术对先证者及其部分家系成员进行正反定型、反定型增强试验、H抗原鉴定、吸收放散试验、唾液血型物质试验,并利用PCR-SSP法进行ABO基因分型及6、7外显子测序。结果:先证者血型正定型为O型,但吸收放散试验可检出A抗原,反定型增强试验可检出抗-A1,唾液中有H物质但无A物质,血清学特征符合Ael亚型。基因测序分析显示,在A102的基础上发生了从未报道过的c.625T>G碱基替换,家系调查显示c.625T>G的碱基替换出现在了该家系的三代人中。结论:本研究确定了一个由c.625T>G突变引起的具有Ael血清学特征的新等位基因型,c.625T>G碱基替换导致A抗原减弱,这种突变可以稳定地遗传给后代。 展开更多
关键词 ABO血型 c.625T>G碱基替换 Ael亚型
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高良姜叶绿体基因组测序与特征分析 被引量:22
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作者 黄琼林 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期1-6,共6页
为了探究高良姜的叶绿体基因组特征及其系统进化发育关系,本研究以高良姜总DNA为材料,采用NovaSeq高通量测序平台进行高良姜叶绿体基因组测序,并基于生物信息学方法进行高良姜叶绿体基因组的图谱构建及注释分析。结果表明:高良姜叶绿体... 为了探究高良姜的叶绿体基因组特征及其系统进化发育关系,本研究以高良姜总DNA为材料,采用NovaSeq高通量测序平台进行高良姜叶绿体基因组测序,并基于生物信息学方法进行高良姜叶绿体基因组的图谱构建及注释分析。结果表明:高良姜叶绿体基因组全长162137 bp,呈典型的环状四段式结构,包括87264 bp的大单拷贝区、15349 bp的小单拷贝区以及2个29762 bp的反向互补重复区;共编码132个基因,其中蛋白编码基因86个、核糖体RNA基因8个以及转运RNA基因38个。高良姜叶绿体基因组密码子偏好性较弱,偏向于以A/T碱基结尾。碱基替换分析表明,高良姜叶绿体基因组中大多数编码基因的碱基替换没有引起氨基酸的改变。基于20种物种叶绿体基因组的系统发育分析发现,高良姜与同属植物艳山姜、益智的亲缘关系更近。本研究获得了高良姜的叶绿体基因组特征信息,为高良姜资源保护、遗传进化和品种选育奠定了基础。 展开更多
关键词 高良姜 叶绿体基因组 密码子偏好性 碱基替换分析 系统发育分析
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沃森基因组科学研究院王俊等在《Nature》上发表论文
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《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期667-667,共1页
10月14日,浙江大学沃森基因组科学研究院王俊等研究人员在国际著名杂志《Nature》上发表论文“Mouse Transcriptome:Neutral Evolution of‘Non-coding’Complementary DNAs”,对现行非蛋白编码RNA基因判断标准提出质疑。
关键词 浙江大学 沃森基因组科学研究院 非蛋白编码RNA基因 碱基替换 插入缺失率
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