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马铃薯硝态氮转运蛋白基因的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
南运有
吕婷婷
+3 位作者
曹敏轩
刘恒志
陈越
陈勤
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期588-594,共7页
该研究以马铃薯双单倍体‘DM’为材料,克隆到高亲和性硝态氮转运蛋白基因StNRT2.1的全长cDNA(JGI登录号PGSC0003DMT400002924),并对其进行表达模式和生物信息学分析,为深入探索StNRT2.1基因的生物学功能以及提高马铃薯对氮素的利用效率...
该研究以马铃薯双单倍体‘DM’为材料,克隆到高亲和性硝态氮转运蛋白基因StNRT2.1的全长cDNA(JGI登录号PGSC0003DMT400002924),并对其进行表达模式和生物信息学分析,为深入探索StNRT2.1基因的生物学功能以及提高马铃薯对氮素的利用效率奠定理论基础。结果表明:(1)通过同源克隆与PCR扩增获得StNRT2.1基因cDNA全长片段,并构建pCEGFP-StNRT2.1表达载体;测序结果显示其实际所编码的蛋白质序列与数据库中目的基因蛋白质序列完全一致,表明成功克隆到StNRT2.1基因且未出现错义突变。(2)StNRT2.1基因位于马铃薯第11号染色体,cDNA序列全长1 593 bp,编码530个氨基酸,预测蛋白相对分子质量约为57.60 kD,理论等电点为9.36。(3)生物信息学分析显示,StNRT2.1由20种氨基酸组成,其中甘氨酸(Gly)所占比例最多,达到10.8%,并且主要由228个α-螺旋、27个β-折叠、87个延伸链和188个无规则卷曲构成;StNRT2.1存在功能保守结构MFS_1(PF07690)和12个跨膜螺旋结构域,且N端和C端均位于细胞膜内; StNRT2.1位于质膜上且不具有信号肽,可能为非分泌型膜蛋白。(4)以氮充足(7.5 mmol/L)水平作为对照,马铃薯幼苗经无氮(0 mmol/L)和低氮(0.75 mmol/L)处理3周后呈现出叶片发黄及植株矮化等明显表型差异。(5)qRT-PCR结果显示,在无氮条件下,马铃薯根组织中StNRT2.1基因表达量升高3.98倍,说明StNRT2.1可能为诱导型高亲和转运蛋白。
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关键词
马铃薯
硝
态
氮
硝
态
氮
转运
蛋白
2(
nrt
2)
生物信息学分析
QRT-PCR
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职称材料
不同浓度硝态氮供应下小麦生长、硝态氮累积及根系钙信号特征
被引量:
10
2
作者
江华波
王盛锋
+4 位作者
杨峰
张中华
邱亨池
乙引
汪洪
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期362-368,共7页
以小麦品种‘石麦15’和‘衡观35’为材料进行营养液水培试验,研究不同浓度硝态氮供应对小麦苗期根系形态、钙离子流特征及钙调蛋白(CaM)含量的影响。结果表明,与适宜浓度硝态氮处理(2.5mmol/L)相比,无外源硝态氮供应时小麦地上部鲜重...
以小麦品种‘石麦15’和‘衡观35’为材料进行营养液水培试验,研究不同浓度硝态氮供应对小麦苗期根系形态、钙离子流特征及钙调蛋白(CaM)含量的影响。结果表明,与适宜浓度硝态氮处理(2.5mmol/L)相比,无外源硝态氮供应时小麦地上部鲜重、硝态氮含量均降低,侧根数量显著减少;高浓度硝态氮处理(50mmol/L)下两个小麦品种地上部硝态氮含量升高,根系总长度降低,‘石麦15’侧根数量减少。无硝态氮和高浓度硝态氮处理下,根系中钙调蛋白含量降低,且‘衡观35’的降低幅度大于‘石麦15’。无外源硝态氮供应时小麦根尖表现出较为明显的钙离子外流特征;与适宜浓度硝态氮处理相比,高硝态氮处理下小麦根尖Ca2+的内流速度显著下降。说明硝态氮供应不足和高浓度硝态氮供应会影响小麦根系生长,根系Ca2+外流或Ca2+内流速度下降,CaM含量减少,Ca2+/CaM可能介导硝态氮调控小麦根系生长发育。
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关键词
小麦
硝
态
氮
根系
Ca
2
+流
钙调
蛋白
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职称材料
木薯MeNRT2.1基因的克隆及表达分析
被引量:
4
3
作者
胡春吉
邹良平
彭明
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期117-124,共8页
木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me N...
木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me NRT2.1,该基因含有1 593 bp的开放阅读框架,编码530个氨基酸。生物信息学分析结果表明,木薯Me NRT2.1与苜蓿、拟南芥、可可、杨树等物种的NRT2.1同源性高,其中与可可树Tc NRT2.1的亲缘关系最近,氨基酸相似性达到90%。实时荧光定量PCR检测结果表明,Me NRT2.1在木薯组培苗的根中表达,并且在NO_3^-浓度为0.2 mmol/L时,其相对表达量较高,NO_3^-浓度为10 mmol/L时其相对表达量较低,NO_3^-浓度为0时几乎不表达;Me NRT2.1在茎、叶中也几乎不表达,即该基因具有诱导型组织特异性表达模式。原生质体瞬时表达发现Me NRT2.1定位在细胞膜上。此研究为进一步通过NRT2基因提高木薯的抗逆性奠定了基础。
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关键词
木薯
硝
态
氮
nrt
2
实时荧光定量PCR
亚细胞定位
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职称材料
黄瓜NRT2基因的鉴定和特征分析
4
作者
孙建磊
董玉梅
+3 位作者
王崇启
肖守华
李利斌
焦自高
《山东农业科学》
2016年第6期11-14,共4页
本研究利用生物信息学方法,从黄瓜基因组中鉴定出3个NRT2基因,并对这些基因的基因组分布、结构、遗传进化和顺式元件进行了系统分析。结果显示,黄瓜的NRT2基因分别位于1号、1号和5号染色体,具有2个或3个外显子,分别与拟南芥的NRT2.4或者...
本研究利用生物信息学方法,从黄瓜基因组中鉴定出3个NRT2基因,并对这些基因的基因组分布、结构、遗传进化和顺式元件进行了系统分析。结果显示,黄瓜的NRT2基因分别位于1号、1号和5号染色体,具有2个或3个外显子,分别与拟南芥的NRT2.4或者NRT2.5直系同源;它们都具有数个植物激素和逆境应答元件,暗示它们不仅在氮素吸收过程中具有一定功能,而且与植物逆境应答有关。该结果为进一步研究黄瓜NRT2的功能提供了线索。
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关键词
黄瓜
硝
态
氮
转运
蛋白
nrt
2
分子特征
系统进化
顺式元件
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职称材料
题名
马铃薯硝态氮转运蛋白基因的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
南运有
吕婷婷
曹敏轩
刘恒志
陈越
陈勤
机构
西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室
西北农林科技大学食品科学与工程学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期588-594,共7页
基金
国家重点研发项目(2018YFD0200805)
文摘
该研究以马铃薯双单倍体‘DM’为材料,克隆到高亲和性硝态氮转运蛋白基因StNRT2.1的全长cDNA(JGI登录号PGSC0003DMT400002924),并对其进行表达模式和生物信息学分析,为深入探索StNRT2.1基因的生物学功能以及提高马铃薯对氮素的利用效率奠定理论基础。结果表明:(1)通过同源克隆与PCR扩增获得StNRT2.1基因cDNA全长片段,并构建pCEGFP-StNRT2.1表达载体;测序结果显示其实际所编码的蛋白质序列与数据库中目的基因蛋白质序列完全一致,表明成功克隆到StNRT2.1基因且未出现错义突变。(2)StNRT2.1基因位于马铃薯第11号染色体,cDNA序列全长1 593 bp,编码530个氨基酸,预测蛋白相对分子质量约为57.60 kD,理论等电点为9.36。(3)生物信息学分析显示,StNRT2.1由20种氨基酸组成,其中甘氨酸(Gly)所占比例最多,达到10.8%,并且主要由228个α-螺旋、27个β-折叠、87个延伸链和188个无规则卷曲构成;StNRT2.1存在功能保守结构MFS_1(PF07690)和12个跨膜螺旋结构域,且N端和C端均位于细胞膜内; StNRT2.1位于质膜上且不具有信号肽,可能为非分泌型膜蛋白。(4)以氮充足(7.5 mmol/L)水平作为对照,马铃薯幼苗经无氮(0 mmol/L)和低氮(0.75 mmol/L)处理3周后呈现出叶片发黄及植株矮化等明显表型差异。(5)qRT-PCR结果显示,在无氮条件下,马铃薯根组织中StNRT2.1基因表达量升高3.98倍,说明StNRT2.1可能为诱导型高亲和转运蛋白。
关键词
马铃薯
硝
态
氮
硝
态
氮
转运
蛋白
2(
nrt
2)
生物信息学分析
QRT-PCR
Keywords
potato
nitrate
nitrate transporter
2
(
nrt
2
)
bioinformatics analysis
qRT-PCR
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
不同浓度硝态氮供应下小麦生长、硝态氮累积及根系钙信号特征
被引量:
10
2
作者
江华波
王盛锋
杨峰
张中华
邱亨池
乙引
汪洪
机构
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所/农业部植物营养与肥料重点实验室
四川省达州市农业科学研究所
贵州师范大学生命科学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期362-368,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划课题(2013CB127402)
北京市自然科学基金项目(6112021)
文摘
以小麦品种‘石麦15’和‘衡观35’为材料进行营养液水培试验,研究不同浓度硝态氮供应对小麦苗期根系形态、钙离子流特征及钙调蛋白(CaM)含量的影响。结果表明,与适宜浓度硝态氮处理(2.5mmol/L)相比,无外源硝态氮供应时小麦地上部鲜重、硝态氮含量均降低,侧根数量显著减少;高浓度硝态氮处理(50mmol/L)下两个小麦品种地上部硝态氮含量升高,根系总长度降低,‘石麦15’侧根数量减少。无硝态氮和高浓度硝态氮处理下,根系中钙调蛋白含量降低,且‘衡观35’的降低幅度大于‘石麦15’。无外源硝态氮供应时小麦根尖表现出较为明显的钙离子外流特征;与适宜浓度硝态氮处理相比,高硝态氮处理下小麦根尖Ca2+的内流速度显著下降。说明硝态氮供应不足和高浓度硝态氮供应会影响小麦根系生长,根系Ca2+外流或Ca2+内流速度下降,CaM含量减少,Ca2+/CaM可能介导硝态氮调控小麦根系生长发育。
关键词
小麦
硝
态
氮
根系
Ca
2
+流
钙调
蛋白
Keywords
Wheat ( Triticum aestivum L. )
Nitrate
Roots
Net Ca
2
+ flux
Calmodulin
分类号
Q945 [生物学—植物学]
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
木薯MeNRT2.1基因的克隆及表达分析
被引量:
4
3
作者
胡春吉
邹良平
彭明
机构
海南大学农学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期117-124,共8页
基金
国际科技合作与交流项目(No.2013DFA32020)
海南省重大科技项目子课题热带生物种质与基因资源研究(No.ZDZX2013023-1)
国家高技术研究发展计划重点项目(No.2012AA101204)
文摘
木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me NRT2.1,该基因含有1 593 bp的开放阅读框架,编码530个氨基酸。生物信息学分析结果表明,木薯Me NRT2.1与苜蓿、拟南芥、可可、杨树等物种的NRT2.1同源性高,其中与可可树Tc NRT2.1的亲缘关系最近,氨基酸相似性达到90%。实时荧光定量PCR检测结果表明,Me NRT2.1在木薯组培苗的根中表达,并且在NO_3^-浓度为0.2 mmol/L时,其相对表达量较高,NO_3^-浓度为10 mmol/L时其相对表达量较低,NO_3^-浓度为0时几乎不表达;Me NRT2.1在茎、叶中也几乎不表达,即该基因具有诱导型组织特异性表达模式。原生质体瞬时表达发现Me NRT2.1定位在细胞膜上。此研究为进一步通过NRT2基因提高木薯的抗逆性奠定了基础。
关键词
木薯
硝
态
氮
nrt
2
实时荧光定量PCR
亚细胞定位
Keywords
Cassava
Nitrate nitrogen
nrt
2
Quantitative real-time PCR
Subcellular localization
分类号
S533 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
黄瓜NRT2基因的鉴定和特征分析
4
作者
孙建磊
董玉梅
王崇启
肖守华
李利斌
焦自高
机构
山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心
出处
《山东农业科学》
2016年第6期11-14,共4页
基金
山东省蔬菜良种工程项目(2014-03-07)
山东省农业科学院青年科研基金项目(2015YQN29)
文摘
本研究利用生物信息学方法,从黄瓜基因组中鉴定出3个NRT2基因,并对这些基因的基因组分布、结构、遗传进化和顺式元件进行了系统分析。结果显示,黄瓜的NRT2基因分别位于1号、1号和5号染色体,具有2个或3个外显子,分别与拟南芥的NRT2.4或者NRT2.5直系同源;它们都具有数个植物激素和逆境应答元件,暗示它们不仅在氮素吸收过程中具有一定功能,而且与植物逆境应答有关。该结果为进一步研究黄瓜NRT2的功能提供了线索。
关键词
黄瓜
硝
态
氮
转运
蛋白
nrt
2
分子特征
系统进化
顺式元件
Keywords
Cucumber
Nitrate transporter
nrt
2
Molecular feature
Phylogeny
Cis-element
分类号
S642.201 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯硝态氮转运蛋白基因的克隆及表达分析
南运有
吕婷婷
曹敏轩
刘恒志
陈越
陈勤
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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职称材料
2
不同浓度硝态氮供应下小麦生长、硝态氮累积及根系钙信号特征
江华波
王盛锋
杨峰
张中华
邱亨池
乙引
汪洪
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
10
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下载PDF
职称材料
3
木薯MeNRT2.1基因的克隆及表达分析
胡春吉
邹良平
彭明
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016
4
在线阅读
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职称材料
4
黄瓜NRT2基因的鉴定和特征分析
孙建磊
董玉梅
王崇启
肖守华
李利斌
焦自高
《山东农业科学》
2016
0
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职称材料
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