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利用SPIDER和IP-MS技术鉴定小立碗藓着丝粒关键蛋白
1
作者
刘学东
翁玉明
+1 位作者
王铭亮
莫蓓莘
《深圳大学学报(理工版)》
2025年第5期513-520,共8页
着丝粒关键蛋白是合成植物人工染色体的核心组分,本研究以分布于细胞核的小立碗藓着丝粒特异组蛋白3(Physcomitrella patens-specific centromere histone,PpCENH3)为诱饵,利用免疫沉淀-质谱联用(immunoprecipitation-mass spectrometry...
着丝粒关键蛋白是合成植物人工染色体的核心组分,本研究以分布于细胞核的小立碗藓着丝粒特异组蛋白3(Physcomitrella patens-specific centromere histone,PpCENH3)为诱饵,利用免疫沉淀-质谱联用(immunoprecipitation-mass spectrometry,IP-MS)技术,鉴定13个潜在的着丝粒相关蛋白.通过分析小立碗藓中保守的着丝粒单体重复序列,设计了长度为72 bp(base pair)的诱饵脱氧核糖核酸,利用邻近标记技术SPIDER(specific pupylation as IDEntity reporter)成功鉴定27个着丝粒相关蛋白.与IP-MS技术相比,SPIDER技术鉴定了16个新的潜在的着丝粒关键蛋白,说明在鉴定着丝粒关键蛋白方面SPIDER技术优于传统的IP-MS技术.利用SPIDER和IP-MS技术,本研究共鉴定29个着丝粒相关蛋白,其中,11种蛋白为两种技术共同鉴定.这一发现不仅为理解植物着丝粒的结构和功能提供了新视角,还为构建稳定的植物人工染色体奠定了基础.
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关键词
植物人工染色体
小立碗藓
邻近标记技术
免疫沉淀-质谱联用
着丝粒
关键蛋白
着丝粒单体序列
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职称材料
题名
利用SPIDER和IP-MS技术鉴定小立碗藓着丝粒关键蛋白
1
作者
刘学东
翁玉明
王铭亮
莫蓓莘
机构
深圳大学生命与海洋科学学院
出处
《深圳大学学报(理工版)》
2025年第5期513-520,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划资助项目(2019YFA0903902)
国家自然科学基金资助项目(32402310)
广东省基础与运用基础研究基金项目(2023A1515110407)。
文摘
着丝粒关键蛋白是合成植物人工染色体的核心组分,本研究以分布于细胞核的小立碗藓着丝粒特异组蛋白3(Physcomitrella patens-specific centromere histone,PpCENH3)为诱饵,利用免疫沉淀-质谱联用(immunoprecipitation-mass spectrometry,IP-MS)技术,鉴定13个潜在的着丝粒相关蛋白.通过分析小立碗藓中保守的着丝粒单体重复序列,设计了长度为72 bp(base pair)的诱饵脱氧核糖核酸,利用邻近标记技术SPIDER(specific pupylation as IDEntity reporter)成功鉴定27个着丝粒相关蛋白.与IP-MS技术相比,SPIDER技术鉴定了16个新的潜在的着丝粒关键蛋白,说明在鉴定着丝粒关键蛋白方面SPIDER技术优于传统的IP-MS技术.利用SPIDER和IP-MS技术,本研究共鉴定29个着丝粒相关蛋白,其中,11种蛋白为两种技术共同鉴定.这一发现不仅为理解植物着丝粒的结构和功能提供了新视角,还为构建稳定的植物人工染色体奠定了基础.
关键词
植物人工染色体
小立碗藓
邻近标记技术
免疫沉淀-质谱联用
着丝粒
关键蛋白
着丝粒单体序列
Keywords
plant artificial chromosomes
Physcomitrella patens
proximity labeling technology
immunoprecipitation-mass spectrometry(IP-MS)
key centromere protein
centromere monomer sequence
分类号
Q946.1 [生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用SPIDER和IP-MS技术鉴定小立碗藓着丝粒关键蛋白
刘学东
翁玉明
王铭亮
莫蓓莘
《深圳大学学报(理工版)》
2025
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