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应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性
被引量：
5
1
作者
王娜
蔡玉勇
+2 位作者
李赟
王崇明
崔红
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期51-56,共6页
为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。...
为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带,其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高,为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。
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关键词
PCR-DGGE
18S
RDNA序列
真核浮游生物多样性
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职称材料
题名
应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性
被引量：
5
1
作者
王娜
蔡玉勇
李赟
王崇明
崔红
机构
中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
中国水产科学研究院黄海水产研究所
山东省潍坊市畜牧检测中心
出处
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期51-56,共6页
基金
国家高技术研究发展计划项目(2006AA100307)
现代农业产业技术体系建设专项(nycytx-4)资助
文摘
为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带,其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高,为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。
关键词
PCR-DGGE
18S
RDNA序列
真核浮游生物多样性
Keywords
PCR-DGGE
18S rDNA
eukarytic plankton diversity
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性
王娜
蔡玉勇
李赟
王崇明
崔红
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
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