棉花耐盐相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记筛选 被引量：14

1

作者 刘雅辉 王秀萍 +2 位作者 鲁雪林 张国新 李强 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第3期484-488,共5页

利用相关序列扩增多态性(SRAP)和群体分离分析法(BSA)对棉花耐盐材料×敏盐材料组合的F2群体及26个耐、敏品种(系)进行分析和鉴定,筛选与棉花耐盐相关的分子标记。在88对正反引物组合中,筛选出在2个亲本间具有多态性的引物6对,经F2... 利用相关序列扩增多态性(SRAP)和群体分离分析法(BSA)对棉花耐盐材料×敏盐材料组合的F2群体及26个耐、敏品种(系)进行分析和鉴定,筛选与棉花耐盐相关的分子标记。在88对正反引物组合中,筛选出在2个亲本间具有多态性的引物6对,经F2群体分析,发现1对引物能够在耐盐单株中扩增出350 bp的特异片段,而在敏盐单株中没有。品种鉴定显示,耐盐材料均能扩增出该片段,而敏盐材料没有该片段扩增。推测该片段是与棉花耐盐性紧密连锁的分子标记。 展开更多

关键词 棉花 耐盐性 相关序列扩增多态性(srap) 分子标记

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相关序列扩增多态性分子标记及其在植物研究中的应用 被引量：1

2

作者 王芳 华慧颖 +1 位作者 李晓静 耿风华 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第23期13960-13961,14011,共3页

在阐述相关序列扩增多态性(SRAP)的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传多样性分析、遗传图谱构建、绘制基因组转录图谱、重要性状基因标记、标记测序与基因克隆等方面的研究进展及应用前景。

关键词 相关序列扩增多态性 分子标记 基因克隆

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黄瓜白粉病抗性序列相关扩增多态性的分子标记研究 被引量：9

3

作者 景然 陈新娟 +3 位作者 朱育强 张鹏 张玉琼 周胜军 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期387-392,共6页

以高抗和高感白粉病的黄瓜亲本及其杂交后代F2分离群体为材料,应用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)技术开展与黄瓜白粉病抗性基因连锁的SRAP分子标记研究.结果表明:从437对SRAP引物组合中筛选出62对... 以高抗和高感白粉病的黄瓜亲本及其杂交后代F2分离群体为材料,应用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)技术开展与黄瓜白粉病抗性基因连锁的SRAP分子标记研究.结果表明:从437对SRAP引物组合中筛选出62对能够在2个亲本抗、感池间扩增出稳定多态性条带的引物组合,进一步用这些引物分析F2群体,发现有1对引物组合Me1/Em9扩增出的SRAP标记(Me1/Em9—284 bp)能与黄瓜抗白粉病基因连锁,遗传距离为9.8 c M.获得的分子标记对克隆抗病基因和利用分子标记辅助选择提高育种效率具有重要意义. 展开更多

关键词 黄瓜 白粉病 序列相关扩增多态性分子标记

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一种基于表达序列标签(EST)的新型目标分子标记技术——保守区域扩增多态性(CoRAP) 被引量：3

4

作者 熊发前 唐荣华 +5 位作者 庄伟建 蒋菁 钟瑞春 韩柱强 贺梁琼 李忠 《广西农业科学》 CAS CSCD 2010年第2期100-103,共4页

CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是:根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度... CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是:根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度为52℃的常规3步法PCR程序下,扩增产生偏向表达序列标签附近区域的显性或共显性标记。该分子标记可以作为SRAP、TRAP标记有效补充的目标分子标记新技术,在生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状基因标记、QTL定位及分子标记辅助育种等方面均有较大的应用潜力。 展开更多

关键词 保守区域扩增多态性(CoRAP) 目标分子标记 表达序列标签(EST) 内含子多态性

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应用简单序列重复区间扩增多态性分子标记鉴定我国12个城市与地区常见嗜尸蝇类的研究 被引量：2

5

作者 胡佳林 郑学礼 +2 位作者 王倩 陈晓光 黄勇平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期524-528,共5页

目的探讨应用ISSR分子标记鉴定我国不同地区常见嗜尸蝇类,分析其亲源关系及基因差异。方法采集广州、深圳、阳江、南京、长春、宜昌、北京、武汉等12个城市与地区常见嗜尸蝇类:家蝇(Musca domestica),丝光绿蝇(Lucilia sericata),大头金... 目的探讨应用ISSR分子标记鉴定我国不同地区常见嗜尸蝇类,分析其亲源关系及基因差异。方法采集广州、深圳、阳江、南京、长春、宜昌、北京、武汉等12个城市与地区常见嗜尸蝇类:家蝇(Musca domestica),丝光绿蝇(Lucilia sericata),大头金蝇(Chrysomyia megacephala),黑尾麻蝇(Helicophagella melanura),棕尾别麻蝇(Boetthcherisca peregrina)。设计22个ISSR引物,对采集的蝇类基因组DNA进行PCR扩增,从中筛选出8个引物用于我国不同地区法医蝇类的鉴定,进行ISSR分析,用PAUP聚类分析软件绘制聚类图。结果8种ISSR引物鉴定我国部分城市与地区5种蝇类,总共扩增样品次数为121,可放大679个清晰和稳定的带,其中516个是多态性。结果表明我国不同城市与地区的家蝇、大头金蝇、丝光绿蝇、棕尾麻蝇、黑尾麻蝇分别呈现不同带谱,不同地区的家蝇呈现种内与地域多态性的遗传带谱,而5种腐尸性蝇种间呈现完全不同的带谱,发现种特异性的片段。聚类分析结果显示:10个不同地区的家蝇聚类为一棵分枝树,细分为4个不同层次的类群,不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇的绝大多数种类聚类在一起,亦存在种内基因型与地理株的基因组DNA差异。结论应用ISSR技术,首次对我国12个城市和地区的常见嗜尸蝇类做出鉴定,揭示我国10个城市与地区的家蝇种类存在种内基因型和遗传的差异;不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇亦存在种内基因型与地理株基因组DNA的差异。 展开更多

关键词 法医昆虫 中国不同地区 嗜尸蝇 分子标记 简单序列重复区间扩增多态性

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基于SRAP分子标记的刨花润楠遗传多样性分析 被引量：7

6

作者 周鹏 林玮 +3 位作者 朱芹 周祥斌 吴林瑛 陈晓阳 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期16-24,共9页

采用相关序列扩增多态性分子标记方法,对7个省份23个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明：1）12对引物组合共扩增出157条带,其中115条为多态性条带,占总条带数的73.24%;2）12对引物的多态性指数介于0.406~0.502,平均值为0.476;... 采用相关序列扩增多态性分子标记方法,对7个省份23个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明：1）12对引物组合共扩增出157条带,其中115条为多态性条带,占总条带数的73.24%;2）12对引物的多态性指数介于0.406~0.502,平均值为0.476;3）通过分子方差分析发现,刨花润楠种源内差异占总差异的72.19%,种源间差异占总差异的27.81%,种源内差异为刨花润楠差异的主要来源;4）基于遗传距离的聚类分析显示,23个种源的刨花润楠可分为4类：第1类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源,第2类为浙江参试的3个种源,第3类为江西婺源和安徽黄山2个种源,第4类为福建参试的4个种源,分类结果表现出明显的地理趋势。本研究结果为刨花润楠种质资源的保存及良种选育提供了一定理论基础。 展开更多

关键词 刨花润楠 相关序列扩增多态性(srap) 遗传多样性

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高羊茅单株耐热性相关分子标记的筛选及其与越夏性的关系研究 被引量：10

7

作者 陈群 袁晓君 何亚丽 《草业学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期84-95,共12页

筛选与高羊茅单株耐热性和越夏性相关的分子标记有利于建立高效育种体系。以来自于耐热性不同的12个高羊茅种质资源的216个单株为耐热性分子标记筛选的基础群体,在人工高温(40℃/35℃,昼/夜各12h)和夏季田间自然条件下分别进行了耐热性... 筛选与高羊茅单株耐热性和越夏性相关的分子标记有利于建立高效育种体系。以来自于耐热性不同的12个高羊茅种质资源的216个单株为耐热性分子标记筛选的基础群体,在人工高温(40℃/35℃,昼/夜各12h)和夏季田间自然条件下分别进行了耐热性和越夏性鉴定。运用简单重复序列区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)和随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphism DNA,RAPD)分子标记技术,采用改良的集团分离分析法(modified bulked segregant analysis,BSA),从800个RAPD和100个ISSR分子标记中筛选与耐热性相关分子标记,并研究其与单株越夏性的关系。结果表明,单株的耐热性与越夏性的相关程度较低(决定系数为3.4%);引物351扩增的750bp条带(351-T750)与耐热性显著相关,而引物138扩增的950bp条带(138-T950)则与耐热性和越夏性均显著相关。可以推论,耐热性强和/或越夏性强单株材料需要分别在人工高温和夏季田间自然条件下加以鉴定筛选;351-T750可应用于耐热性强单株的辅助选择,而138-T950则可以用于耐热性强与越夏性强单株的辅助选择。 展开更多

关键词 高羊茅 耐热性 越夏性 简单重复序列区间分子标记(ISSR) 随机扩增多态性DNA(RAPD) 集团分离分析法(BSA)

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利用ITS和SRAP分子标记对黑龙江省野生黑木耳菌株进行遗传多样性分析 被引量：9

8

作者 陶朋飞 许修宏 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期144-149,共6页

利用ITS和SRAP标记对黑龙江省境内采集的14株野生黑木耳菌株和一个南方栽培菌株进行遗传多样性分析。ITS序列分析结果显示:供试菌株的ITS序列变异程度较小,仅存在碱基的变化,无区域长度变异,菌株之间的遗传差异较小。利用8对引物对15个... 利用ITS和SRAP标记对黑龙江省境内采集的14株野生黑木耳菌株和一个南方栽培菌株进行遗传多样性分析。ITS序列分析结果显示:供试菌株的ITS序列变异程度较小,仅存在碱基的变化,无区域长度变异,菌株之间的遗传差异较小。利用8对引物对15个供试菌株进行SRAP扩增,共得到215条条带,其中155条为多态性条带,多态性比率为72.1%,表明黑龙江省境内野生黑木耳遗传多样性较为丰富。 展开更多

关键词 黑木耳 内转录间隔区(ITS) 相关序列扩增多态性(srap) 遗传多样性

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丹参遗传多样性的SRAP标记分析 被引量：20

9

作者 李廷春 樊洪泓 +2 位作者 高正良 周应兵 杨华应 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期576-580,共5页

相关序列扩增多态性（SRAP）是一种新发展起来的分子标记。试验通过建立优化的丹参SRAP反应体系，从88对引物组合中筛选得到36对多态性引物组合，对生长在四川中江、陕西商洛、山东临沂、安徽亳州和安徽凤阳5个丹参主产区的6个丹参种群... 相关序列扩增多态性（SRAP）是一种新发展起来的分子标记。试验通过建立优化的丹参SRAP反应体系，从88对引物组合中筛选得到36对多态性引物组合，对生长在四川中江、陕西商洛、山东临沂、安徽亳州和安徽凤阳5个丹参主产区的6个丹参种群进行了遗传多样性分析。结果表明：36对多态性引物组合共产生782条多态性条带，平均每个引物组合产生21．7条多态性条带，显示了较高的多态性。应用NTSYS软件聚类分析36对引物组合的扩增结果，供试材料分为两大类，Jaccard’s遗传相似系数在0．6774—0．8225之间，说明SRAP技术可有效地应用于丹参的遗传多样性及亲缘关系的研究。 展开更多

关键词 相关序列扩增多态性 丹参 分子标记 遗传变异

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基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 被引量：8

10

作者 李亚萍 戴惠明 +3 位作者 姜武 陈家栋 段晓婧 陶正明 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期658-664,共7页

【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(... 【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(四川、贵州、云南)等4个居群的47份黄精种质资源的遗传多样性。【结果】对88对SRAP引物进行筛选,有7对可用于黄精种质资源的SRAP-PCR分析,共得到159条扩增条带,其中多态性条带140条。物种水平上,多态性比率为88.05%,有效等位基因数(Ne)为1.600 6,Nei’s基因多样性指数(H)为0.204 1,Shannon信息指数(I)为0.308 0;居群水平上,多态性比率为42.14%~86.16%,H和I分别为0.188 1~0.259 1和0.238 2~0.399 4;4个居群的基因分化系数(G_(st))为0.194 1,表明有80.59%的遗传变异在种群内进行,基因流(N_(m))为2.075 4,表明居群间存在一定的基因流动;从非加权组平均法(UPGMA)聚类结果可知:当相似系数为0.66时,47份样品分成4组,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ类的均为华东地区浙江种质资源,当相似系数为0.68时,Ⅱ类分成2支。西南与西北聚为一类,浙江庆元黄精聚类结果复杂,表明地理位置差异与亲缘关系远近没有特定关系。整体上华东居群遗传多样性丰富,而庆元黄精种质遗传多样性最丰富。【结论】黄精遗传多样性水平较高,居群间存在一定的基因交流,可为黄精新品种选育工作提供参考。图3表4参22。 展开更多

关键词 黄精 相关序列扩增多态性(srap)分子标记 遗传多样性 产区

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不同地理种源无患子的分子多态性分析 被引量：10

11

作者 刘宝 范辉华 +2 位作者 彭珠清 刘燕 陈存及 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期151-155,共5页

利用筛选出的18对相关序列扩增多态性(SRAP)引物对12个来自印度和中国不同种源的无患子进行SRAP扩增,计算Dice遗传相似系数后用非加权组平均法(UPGMA)法进行聚类,分析其亲缘关系,以便为今后无患子Sapindus mukorossi优质种质资源的保存... 利用筛选出的18对相关序列扩增多态性(SRAP)引物对12个来自印度和中国不同种源的无患子进行SRAP扩增,计算Dice遗传相似系数后用非加权组平均法(UPGMA)法进行聚类,分析其亲缘关系,以便为今后无患子Sapindus mukorossi优质种质资源的保存、选育和后续研究提供参考。试验结果表明:12个样本共扩增出253个带型,其中191条为多态性条带,多态性百分率为75.16%,样本的平均遗传相似系数为0.739,显示出无患子种内的相似度较高,遗传分化不明显。聚类分析表明:印度南的种源与其他种源产生较大的遗传分异,而印度北的种源由于地理纬度与中国国内种源较为相近,因此,和中国国内种源的遗传距离没有印度南种源相差那么大,各种源间的遗传距离与地理距离基本服从正相关的关系。 展开更多

关键词 植物学 无患子 地理种源 相关序列扩增多态性(srap) 亲缘关系 分子多态性

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苎麻多胚苗遗传多样性的SRAP标记分析 被引量：5

12

作者 温岚 喻春明 +4 位作者 王延周 陈平 陈继康 谭龙涛 熊和平 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期243-247,共5页

为分析苎麻多胚苗的遗传多样性,以靖西青麻和中苎1号杂交收获F1代种子,从中筛选出21对双胚苗、3株三胚苗和1株单胚苗,用SRAP标记对这些材料及其亲本进行遗传分析。结果表明:筛选出的24个引物组合共扩增出159个稳定的多态性条带,平均每... 为分析苎麻多胚苗的遗传多样性,以靖西青麻和中苎1号杂交收获F1代种子,从中筛选出21对双胚苗、3株三胚苗和1株单胚苗,用SRAP标记对这些材料及其亲本进行遗传分析。结果表明:筛选出的24个引物组合共扩增出159个稳定的多态性条带,平均每个组合6.8个;48份材料中成对遗传相似系数为0.360～0.876,在遗传相似系数0.51处可将全部材料划分为A、B、C、D四类群,在遗传相似系数0.586处,A类群又可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3个亚群;多胚苗与亲本没有出现扩增条带完全一致的情况,本研究中苎麻多胚材料与无融合生殖无关。 展开更多

关键词 苎麻 多胚苗 相关序列扩增多态性(srap) 遗传多样性

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花椰菜自交不亲和性的分子标记研究 被引量：6

13

作者 宋丽娜 张赛群 +2 位作者 张丽芳 陈德海 周涵韬 《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期140-143,共4页

运用随机扩增多态性DNA(RAPD)和inter简单重复序列(ISSR)等分子标记技术,分别对5组花椰菜自交不亲和系和对应的自交亲和系的基因组进行指纹差异分析.采用10个10mer随机引物和5个ISSR引物进行PCR扩增,结果表明,扩增片段分子量在0.3～5kb... 运用随机扩增多态性DNA(RAPD)和inter简单重复序列(ISSR)等分子标记技术,分别对5组花椰菜自交不亲和系和对应的自交亲和系的基因组进行指纹差异分析.采用10个10mer随机引物和5个ISSR引物进行PCR扩增,结果表明,扩增片段分子量在0.3～5kb之间,指纹图谱的稳定性和重复性较好.经过3次以上重复发现,ISSR4引物扩增图谱中,自交亲和系比不亲和系多扩增出3800bp片段;ISSR6引物扩增图谱中,除第3组外,不亲和系比亲和系多扩增出1100bp片段.结果表明,花椰菜自交不亲和系与自交系基因组DNA之间存在差异,扩增出的差异片段与花椰菜自交不亲和性相关,并可作为自交不亲和系和自交亲和系育种筛选的分子标记.初步探讨了花椰菜自交不亲和性的遗传机制及RAPD和ISSR技术在自交不亲和系选育过程中的应用前景. 展开更多

关键词 自交不亲和性 花椰菜 随机扩增多态性DNA(RAPD) 自交不亲和系 分子标记技术 简单重复序列 基因组DNA 扩增图谱 PCR扩增 SSR引物 SSR技术 随机引物 差异分析 扩增片段 指纹图谱 选育过程 遗传机制 分子量 重复性 稳定性

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怀地黄SRAP分子标记优化体系的建立 被引量：3

14

作者 周春娥 谷凤平 +2 位作者 路淑霞 段红英 周延清 《湖北农业科学》 北大核心 2009年第3期536-540,共5页

为了建立适宜怀地黄的SRAP反应体系,以22个不同类型的怀地黄品种为材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、TaqDNA聚合酶浓度、Mg2+浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立的适合... 为了建立适宜怀地黄的SRAP反应体系,以22个不同类型的怀地黄品种为材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、TaqDNA聚合酶浓度、Mg2+浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立的适合怀地黄SRAP反应的体系为:在25μL的反应体系中,模板DNA20ng、2.5mmol·L-1Mg2+、0.32μmol·L-1的上下游引物、0.30mmol·L-1的dNTPs以及2.5UTaq酶。并利用该反应体系对怀地黄22个不同品种进行了SRAP反应,发现不同品种间的DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠,可以用于怀地黄的分子标记研究。 展开更多

关键词 怀地黄 相关序列扩增多态性分子标记 扩增体系优化

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油菜核不育系827AB育性基因的SRAP标记 被引量：1

15

作者 黄团 黄先群 +2 位作者 侯国佐 侯燕 李丽 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2011年第12期9-11,共3页

为加速油菜不育基因转育、提高育种选择效率,利用SRAP结合集群分离分析法,对甘蓝型油菜827AB核不育两用系的可育和不育基因池进行标记分析。结果表明:88对SRAP引物只筛选到1个与827AB不育系育性相关基因的标记,即me2em10-510;该标记的F... 为加速油菜不育基因转育、提高育种选择效率,利用SRAP结合集群分离分析法,对甘蓝型油菜827AB核不育两用系的可育和不育基因池进行标记分析。结果表明:88对SRAP引物只筛选到1个与827AB不育系育性相关基因的标记,即me2em10-510;该标记的F2群体单株验证准确率为98.28%。该目的标记me2em10-510与827AB育性相关基因紧密连锁。 展开更多

关键词 油菜 核不育系 827AB 育性基因 相关序列扩增多态性(srap)

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应用 SRAP 分子标记构建黄麻遗传资源 DNA 指纹图谱 被引量：1

16

作者 陈惠端 陈美霞 +6 位作者 蔡金月 徐鲜钧 方平平 徐建堂 陶爱芬 牛小平 祁建民 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第2期113-118,共6页

以36个黄麻野生种和栽培种为材料,对其基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析.结果表明:从50对引物中筛选出扩增带型好、品种间带型差异明显、易于识别的34对多态性引物,共扩增出1845条多态性条带,平均每对引物扩增出51.25... 以36个黄麻野生种和栽培种为材料,对其基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析.结果表明:从50对引物中筛选出扩增带型好、品种间带型差异明显、易于识别的34对多态性引物,共扩增出1845条多态性条带,平均每对引物扩增出51.25条,最后从中筛选出14对核心引物构建了36个黄麻品种的DNA指纹图谱,每个品种均有各自特异的DNA指纹,可为黄麻种质资源分子身份证绘制提供依据. 展开更多

关键词 黄麻 种质资源 相关序列扩增多态性(srap) DNA指纹图谱

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一株酿酒酵母的特征区域序列扩增标记

17

作者 方维明 杨智 +2 位作者 杨振泉 孟庆阳 汪志君 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1-4,共4页

以23株不同来源的酿酒酵母为研究对象,分别提取基因组DNA,试用50条随机引物对其进行随机扩增多态性DNA分析,筛选到两条具有菌株鉴别能力的随机引物。P09可以从2.412,ST—01,SK—26,ZD—01四株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为433bp的Sc... 以23株不同来源的酿酒酵母为研究对象,分别提取基因组DNA,试用50条随机引物对其进行随机扩增多态性DNA分析,筛选到两条具有菌株鉴别能力的随机引物。P09可以从2.412,ST—01,SK—26,ZD—01四株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为433bp的Sc—433片断Sc—433;P46可以从2.1882,ST—01,NJ—02三株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为665bp的Sc—665片断,其中仅有目的菌株ST—01能稳定的扩增出这2个标记。把这2个片断分别克隆到pUCmT质粒载体中,经过酶切鉴定后测序,根据序列设计特异性引物,把RAPD标记转化为特征区域序列扩增标记,为酿酒酵母菌株的分子鉴别提供了新的借鉴。 展开更多

关键词 酿酒酵母 随机扩增多态性DNA分析 特征区域序列扩增 分子标记

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利用ITS和SRAP分子标记对中国白灵菇和欧洲侧耳属菌株进行亲缘关系鉴定 被引量：6

18

作者 姜超 师亮 +5 位作者 徐颖洁 尚常花 薛芹 赵明文 曹继业 冯志勇 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期31-36,共6页

为了评价白灵菇的分类地位,采用内转录间隔区(ITS)序列分析和相关序列扩增多态性(SRAP)两种分子标记技术,系统分析了包括中国白灵菇商业菌株和欧洲Pleurotus nebrodensis菌株在内的34株侧耳属菌株的DNA多态性。ITS序列分析结果显示:供... 为了评价白灵菇的分类地位,采用内转录间隔区(ITS)序列分析和相关序列扩增多态性(SRAP)两种分子标记技术,系统分析了包括中国白灵菇商业菌株和欧洲Pleurotus nebrodensis菌株在内的34株侧耳属菌株的DNA多态性。ITS序列分析结果显示:供试菌株的ITS序列变异不仅表现在碱基的变异,也表现在区域长度的变异。利用7对扩增条带清晰、多态性较丰富、稳定性较好的引物对34个供试菌株进行SRAP扩增,共得到420条条带,且均为多态性条带。ITS序列分析和SRAP分析结果均显示:白灵菇和Pleurotus nebrodensis具有很近的遗传关系。将ITS和SRAP两种标记联合使用能得到更好的结果。 展开更多

关键词 白灵菇 PLEUROTUS nebrodensis 内转录间隔区(ITS) 相关序列扩增多态性(srap) 遗传多样性

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西瓜全雌基因连锁的SRAP分子标记 被引量：5

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作者 朱小茜 孙治强 +1 位作者 李晓慧 徐小利 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第3期105-108,共4页

采用SRAP技术探寻与西瓜全雌基因连锁的分子标记。以全雌母本和弱雌父本为双亲杂交获得F1,自交获得F2群体,用分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)构建全雌和弱雌2个基因池,筛选957对引物。结果发现,只有引物me16-em20能... 采用SRAP技术探寻与西瓜全雌基因连锁的分子标记。以全雌母本和弱雌父本为双亲杂交获得F1,自交获得F2群体,用分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)构建全雌和弱雌2个基因池,筛选957对引物。结果发现,只有引物me16-em20能在两池之间扩增得到2条特异带。经F2代单株验证,结果表明该特异带能稳定出现。以MAPMAKER(Version 3.0)软件分析,2个标记与全雌性位点的连锁距离分别为18.4 cM和11.4 cM。 展开更多

关键词 西瓜 全雌 分子标记 相关序列扩增多态性

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山桐子性别分子标记的通用性验证 被引量：2

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作者 严莉 仝铸 +5 位作者 何秀娟 肖翠 王泽琼 袁龙义 孙中海 邱文明 《湖北农业科学》 2023年第10期109-114,共6页

采用已知性别的120份山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)样品,检验了2个已报道UBC841和STZ分子标记在山桐子性别鉴定中的通用性。同时,分析了大量简单重复序列间区扩增多态性(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)标记在山桐子雌雄株中的多态... 采用已知性别的120份山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)样品,检验了2个已报道UBC841和STZ分子标记在山桐子性别鉴定中的通用性。同时,分析了大量简单重复序列间区扩增多态性(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)标记在山桐子雌雄株中的多态性。结果表明,UBC841标记在24份山桐子样品中可检测到多态性条带,但未检测到雌雄性别特异性条带;STZ标记可在部分样本中扩增出目的条带,但未表现出雌雄株性别特异性;说明这2组标记均未表现出良好的通用性,雌雄性别鉴别准确率较低。此外,筛选了26条ISSR引物和780对SRAP引物组,也未能获得雌雄性别特异标记,说明采用通用型分子标记ISSR和SRAP在山桐子中较难筛选到稳定、可靠的性别特异的标记。 展开更多

关键词 山桐子(Idesia polycarpa Maxim.) 性别鉴定 简单重复序列间区扩增多态性(ISSR) 相关序列扩增多态性(srap) 通用性验证

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