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杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)
被引量：
1
1
作者
张新叶
宋丛文
黄敏仁
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期85-94,共10页
利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端EST序列测序,共获得有效序列20023条。序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个Unigene,其中包括3734个Contig,708...
利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端EST序列测序,共获得有效序列20023条。序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个Unigene,其中包括3734个Contig,7082个独立的Singleton。被注释的8853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分3个不同分类角度进行分类。在具有功能注释的8853个Unigene中,选出330个与完成全基因组测序的毛果杨序列进行BLAST分析,结果发现有177个抗病相关候选基因出现在282个Unigene中,其中135个分布于杨树的18个不同连锁群上,其他42个基因位于还没定位的scaffolds上。所测定的这些EST序列为后期在基因组水平上研究杨树黑斑病的水平抗性遗传机制及进一步的相关基因发现奠定基础。
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关键词
杨树
表达序列标签
抗病
相关候选基因
表达谱
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职称材料
限制片段差异显示PCR分析金属基质蛋白酶家族在乳腺癌表达的差异
被引量：
1
2
作者
周鸿鹰
梅妍
+3 位作者
卢友光
蒋吉英
李爱冬
羊惠君
《解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期267-269,共3页
目的:建立乳腺癌差异表达谱,以筛选乳腺癌相关候选基因;比较金属基质蛋白酶家族(matrixmetalloproteinases,MMPs)在乳腺癌中的表达差异。方法:采集乳腺癌组织、转移淋巴结及正常乳腺组织,用限制片段差异显示PCR技术(Restrictionfragment...
目的:建立乳腺癌差异表达谱,以筛选乳腺癌相关候选基因;比较金属基质蛋白酶家族(matrixmetalloproteinases,MMPs)在乳腺癌中的表达差异。方法:采集乳腺癌组织、转移淋巴结及正常乳腺组织,用限制片段差异显示PCR技术(RestrictionfragmentsdifferentialdisplayPCR,RFDD-PCR)建立表达谱。以电泳和荧光扫描成像对表达谱片段进行分离、显示。筛选分析MMPs及其相关基因的表达差异。结果:共获得5407个基因片段,差异片段占30%以上;共显示13个MMPs基因及其相关基因金属蛋白酶组织抑制因子和转化生长因子β。其中除MMP20外,其余均有量或质的差异。结论:有多个MMPs基因参与了乳腺癌的发生、发展过程,其中MMP2、MMP10、MMP11、MMP14、MMP15、MMP28基因的开启可能为肿瘤进程的早期事件。
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关键词
金属基质蛋白酶
差异显示
PCR分析
金属蛋白酶组织抑制因子
家族
限制
display
转化生长因子β
相关候选基因
正常乳腺组织
表达差异
相关
基因
Ps
基因
乳腺癌组织
转移淋巴结
PCR技术
MMP20
表达谱
扫描成像
MMPS
筛选分析
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职称材料
题名
杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)
被引量：
1
1
作者
张新叶
宋丛文
黄敏仁
机构
湖北省林业科学研究院
南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期85-94,共10页
基金
"948"Introduced Project (2006-4-80) from State Administration of Forestry
文摘
利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端EST序列测序,共获得有效序列20023条。序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个Unigene,其中包括3734个Contig,7082个独立的Singleton。被注释的8853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分3个不同分类角度进行分类。在具有功能注释的8853个Unigene中,选出330个与完成全基因组测序的毛果杨序列进行BLAST分析,结果发现有177个抗病相关候选基因出现在282个Unigene中,其中135个分布于杨树的18个不同连锁群上,其他42个基因位于还没定位的scaffolds上。所测定的这些EST序列为后期在基因组水平上研究杨树黑斑病的水平抗性遗传机制及进一步的相关基因发现奠定基础。
关键词
杨树
表达序列标签
抗病
相关候选基因
表达谱
Keywords
poplar
expressed sequence tags
resistance-associated candidate gene
expression profile
分类号
S763.15 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
限制片段差异显示PCR分析金属基质蛋白酶家族在乳腺癌表达的差异
被引量：
1
2
作者
周鸿鹰
梅妍
卢友光
蒋吉英
李爱冬
羊惠君
机构
四川大学基础与法医学院人体解剖学教研室
成都医学院科研实验中心
出处
《解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期267-269,共3页
基金
Chinese Medical Board(CMB)课题基金(82412)
文摘
目的:建立乳腺癌差异表达谱,以筛选乳腺癌相关候选基因;比较金属基质蛋白酶家族(matrixmetalloproteinases,MMPs)在乳腺癌中的表达差异。方法:采集乳腺癌组织、转移淋巴结及正常乳腺组织,用限制片段差异显示PCR技术(RestrictionfragmentsdifferentialdisplayPCR,RFDD-PCR)建立表达谱。以电泳和荧光扫描成像对表达谱片段进行分离、显示。筛选分析MMPs及其相关基因的表达差异。结果:共获得5407个基因片段,差异片段占30%以上;共显示13个MMPs基因及其相关基因金属蛋白酶组织抑制因子和转化生长因子β。其中除MMP20外,其余均有量或质的差异。结论:有多个MMPs基因参与了乳腺癌的发生、发展过程,其中MMP2、MMP10、MMP11、MMP14、MMP15、MMP28基因的开启可能为肿瘤进程的早期事件。
关键词
金属基质蛋白酶
差异显示
PCR分析
金属蛋白酶组织抑制因子
家族
限制
display
转化生长因子β
相关候选基因
正常乳腺组织
表达差异
相关
基因
Ps
基因
乳腺癌组织
转移淋巴结
PCR技术
MMP20
表达谱
扫描成像
MMPS
筛选分析
Keywords
matrix metalloproteinase
differential expression profile
breast cancer
restriction fragments differential display PCR
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)
张新叶
宋丛文
黄敏仁
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
在线阅读
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职称材料
2
限制片段差异显示PCR分析金属基质蛋白酶家族在乳腺癌表达的差异
周鸿鹰
梅妍
卢友光
蒋吉英
李爱冬
羊惠君
《解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
1
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职称材料
已选择
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引证文献
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