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一种基于表达序列标签(EST)的新型目标分子标记技术——保守区域扩增多态性(CoRAP)
被引量：
3
1
作者
熊发前
唐荣华
+5 位作者
庄伟建
蒋菁
钟瑞春
韩柱强
贺梁琼
李忠
《广西农业科学》
CAS
CSCD
2010年第2期100-103,共4页
CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是:根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度...
CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是:根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度为52℃的常规3步法PCR程序下,扩增产生偏向表达序列标签附近区域的显性或共显性标记。该分子标记可以作为SRAP、TRAP标记有效补充的目标分子标记新技术,在生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状基因标记、QTL定位及分子标记辅助育种等方面均有较大的应用潜力。
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关键词
保守区域扩增多态性(CoRAP)
目标分子标记
表达序列标签(EST)
内含子多态性
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职称材料
苦荞EMS突变体库的构建及SCoT标记筛选分析
被引量：
8
2
作者
方小梅
杨文娟
+8 位作者
王于栋
唐恬
吴银环
陶建波
王艺钢
王俊珍
朱剑锋
张建
易泽林
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期54-65,共12页
苦荞属于蓼科荞麦属1年生草本植物,药食两用,营养价值丰富.该研究以苦荞测序品种“品苦1号”为试验材料,利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变技术构建苦荞突变体库,并利用形态观察及目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对突变体进行了筛选分析,...
苦荞属于蓼科荞麦属1年生草本植物,药食两用,营养价值丰富.该研究以苦荞测序品种“品苦1号”为试验材料,利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变技术构建苦荞突变体库,并利用形态观察及目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对突变体进行了筛选分析,主要研究结果为:(1) 0.6%EMS处理12 h为“品苦1号”最佳诱变处理;(2)构建了包含966个株系的苦荞突变体库,M2代11个主要农艺性状主成分分析得到包括籽粒大小因子、籽粒形状因子、植株产量因子、植株表型因子的4大主成分因子;聚类分析将M2代群体按农艺性状的差异分为4大类;(3)利用26条SCoT引物对“品苦1号”诱变M2代群体进行PCR扩增,共得到263条清晰稳定的条带;诱变M2代与野生型之间的遗传距离在0.003 8~0.324 5之间,其中PKM2-803和对照“品苦1号”(CK)间的遗传距离最大,PKM2-097和CK间的遗传距离最小;聚类分析将966份材料分为4大类,与表型分类相似,表明EMS诱变导致苦荞在表型性状及DNA分子水平均发生了变异.
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关键词
苦荞
甲基磺酸乙酯诱变
突变体库
目标
起始密码子多态性
分子
标记
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职称材料
题名
一种基于表达序列标签(EST)的新型目标分子标记技术——保守区域扩增多态性(CoRAP)
被引量：
3
1
作者
熊发前
唐荣华
庄伟建
蒋菁
钟瑞春
韩柱强
贺梁琼
李忠
机构
福建农林大学生命科学学院
广西农业科学院经济作物研究所
广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室
福建农林大学作物科学学院
出处
《广西农业科学》
CAS
CSCD
2010年第2期100-103,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30660094)
广西自然科学基金项目(桂科自0832088)
文摘
CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是:根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度为52℃的常规3步法PCR程序下,扩增产生偏向表达序列标签附近区域的显性或共显性标记。该分子标记可以作为SRAP、TRAP标记有效补充的目标分子标记新技术,在生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状基因标记、QTL定位及分子标记辅助育种等方面均有较大的应用潜力。
关键词
保守区域扩增多态性(CoRAP)
目标分子标记
表达序列标签(EST)
内含子多态性
Keywords
CoRAP
targeted molecular marker technique
expressed sequence tags
intron polymorphism
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
苦荞EMS突变体库的构建及SCoT标记筛选分析
被引量：
8
2
作者
方小梅
杨文娟
王于栋
唐恬
吴银环
陶建波
王艺钢
王俊珍
朱剑锋
张建
易泽林
机构
西南大学农学与生物科技学院/重庆市荞麦产业体系创新团队
青岛市即墨区金口镇农业农村服务中心
凉山彝族自治州农业科学研究院
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期54-65,共12页
基金
中国博士后科学基金资助项目(2017M622944)
重庆市农委荞麦技术产业体系项目(20210249)
重庆市自然科学基金项目(cstc2018jcyjAX0394)。
文摘
苦荞属于蓼科荞麦属1年生草本植物,药食两用,营养价值丰富.该研究以苦荞测序品种“品苦1号”为试验材料,利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变技术构建苦荞突变体库,并利用形态观察及目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对突变体进行了筛选分析,主要研究结果为:(1) 0.6%EMS处理12 h为“品苦1号”最佳诱变处理;(2)构建了包含966个株系的苦荞突变体库,M2代11个主要农艺性状主成分分析得到包括籽粒大小因子、籽粒形状因子、植株产量因子、植株表型因子的4大主成分因子;聚类分析将M2代群体按农艺性状的差异分为4大类;(3)利用26条SCoT引物对“品苦1号”诱变M2代群体进行PCR扩增,共得到263条清晰稳定的条带;诱变M2代与野生型之间的遗传距离在0.003 8~0.324 5之间,其中PKM2-803和对照“品苦1号”(CK)间的遗传距离最大,PKM2-097和CK间的遗传距离最小;聚类分析将966份材料分为4大类,与表型分类相似,表明EMS诱变导致苦荞在表型性状及DNA分子水平均发生了变异.
关键词
苦荞
甲基磺酸乙酯诱变
突变体库
目标
起始密码子多态性
分子
标记
Keywords
Tartary buckwheat
EMS mutagenesis
mutant library
SCoT marker
分类号
S517 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于表达序列标签(EST)的新型目标分子标记技术——保守区域扩增多态性(CoRAP)
熊发前
唐荣华
庄伟建
蒋菁
钟瑞春
韩柱强
贺梁琼
李忠
《广西农业科学》
CAS
CSCD
2010
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
苦荞EMS突变体库的构建及SCoT标记筛选分析
方小梅
杨文娟
王于栋
唐恬
吴银环
陶建波
王艺钢
王俊珍
朱剑锋
张建
易泽林
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023
8
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