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小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
被引量：
2
1
作者
白子彧
丁博
+5 位作者
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期307-311,共5页
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中...
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中,分别处理0、0.5、1、2、4和8h,分析候选基因的表达模式。结果表明,其中1个候选基因的表达模式与生物信息学分析结果相近,受盐胁迫诱导明显上调表达,命名为TaSR1。该基因编码区含有948个核苷酸,编码315个氨基酸。TaSR1蛋白含有KRTAP和PHA01732两个保守结构域,富含脯氨酸残基。
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关键词
小麦
生物信息学
盐应答基因
表达验证
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职称材料
NaCl胁迫对水稻品种中花11幼苗根系生长发育的影响
被引量：
8
2
作者
高林
陈春丽
《种子》
CSCD
北大核心
2012年第7期7-12,共6页
以水稻中花11幼苗为材料,探讨高浓度NaCl处理对其根系生长发育的影响。结果表明,200 mmol/L NaCl胁迫下,幼苗胚根生长受到抑制,不定根数目减少,根毛数量减少长度变短;幼苗根系出现褐化,且根系木质素含量增加,根系过氧化物酶(POD)活力显...
以水稻中花11幼苗为材料,探讨高浓度NaCl处理对其根系生长发育的影响。结果表明,200 mmol/L NaCl胁迫下,幼苗胚根生长受到抑制,不定根数目减少,根毛数量减少长度变短;幼苗根系出现褐化,且根系木质素含量增加,根系过氧化物酶(POD)活力显著上升;半定量RT-PCR检测显示,盐胁迫应答基因OsCDPK7表达显著下降,P 5 CS 1表达上升,OsHKT 1;5、OsNHX 1在处理初期表达上升,其后随处理时间延长而下降。
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关键词
水稻
盐
胁迫
根生长发育
过氧化物酶
半定量RT—PCR
盐
胁迫
应答
基因
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职称材料
题名
小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
被引量：
2
1
作者
白子彧
丁博
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
机构
天津农学院农学与资源环境学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期307-311,共5页
基金
国家大学生创新创业训练计划项目(201410061004
201510061047)
+1 种基金
天津市131创新型人才团队计划项目
天津市高校学科领军人才培养计划项目
文摘
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中,分别处理0、0.5、1、2、4和8h,分析候选基因的表达模式。结果表明,其中1个候选基因的表达模式与生物信息学分析结果相近,受盐胁迫诱导明显上调表达,命名为TaSR1。该基因编码区含有948个核苷酸,编码315个氨基酸。TaSR1蛋白含有KRTAP和PHA01732两个保守结构域,富含脯氨酸残基。
关键词
小麦
生物信息学
盐应答基因
表达验证
Keywords
Wheat
Bioinformatics
Salt-responsive gene
Expression validation
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
NaCl胁迫对水稻品种中花11幼苗根系生长发育的影响
被引量：
8
2
作者
高林
陈春丽
机构
华中农业大学生命科学技术学院
出处
《种子》
CSCD
北大核心
2012年第7期7-12,共6页
基金
国家自然科学青年基金(编号:30900070)
中央高校基本科研业务费专项资金(编号:2011 PY091)
文摘
以水稻中花11幼苗为材料,探讨高浓度NaCl处理对其根系生长发育的影响。结果表明,200 mmol/L NaCl胁迫下,幼苗胚根生长受到抑制,不定根数目减少,根毛数量减少长度变短;幼苗根系出现褐化,且根系木质素含量增加,根系过氧化物酶(POD)活力显著上升;半定量RT-PCR检测显示,盐胁迫应答基因OsCDPK7表达显著下降,P 5 CS 1表达上升,OsHKT 1;5、OsNHX 1在处理初期表达上升,其后随处理时间延长而下降。
关键词
水稻
盐
胁迫
根生长发育
过氧化物酶
半定量RT—PCR
盐
胁迫
应答
基因
Keywords
Oryza Sativa L.
salt stress
root growth and development
peroxidases
semi-quantitativeRT-PCR
salt-responsive gene
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
白子彧
丁博
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
NaCl胁迫对水稻品种中花11幼苗根系生长发育的影响
高林
陈春丽
《种子》
CSCD
北大核心
2012
8
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职称材料
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