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侵染皇竹草的白草花叶病毒检测与鉴定
1
作者
高婧
赵明富
《云南农业科技》
2025年第2期15-19,共5页
昆明市的皇竹草种植基地近年出现了大量带有花叶症状的病株,对当地人工栽培皇竹草产业造成了巨大的产量和经济损失。为明确侵染皇竹草引起其花叶症状的病毒种类,采用透射电子显微镜、基于植物总RNA和病毒特异性引物的反转录聚合酶链式...
昆明市的皇竹草种植基地近年出现了大量带有花叶症状的病株,对当地人工栽培皇竹草产业造成了巨大的产量和经济损失。为明确侵染皇竹草引起其花叶症状的病毒种类,采用透射电子显微镜、基于植物总RNA和病毒特异性引物的反转录聚合酶链式反应技术以及宏转录组测序技术对采集的病样进行鉴定与检测。电镜扫描结果表明,在带有花叶症状的皇竹草病叶中存在大小约为750 nm的线状病毒粒子。通过宏转录组测序技术从皇竹草病叶中鉴定到一株新的白草花叶病毒分离株,命名为“Pennisetum mosaic virus isolate HZC(PenMVHZC)”。PenMV-HZC全基因组序列包含9611个核苷酸,不包括3’端poly(A)序列,编码一个包含3065个氨基酸的多聚蛋白。由RT-PCR扩增到病样中一段大小为520 bp的核苷酸序列。BLAST分析表明,PenMV-HZC与隶属于马铃薯Y病毒科马铃薯Y病毒属的Pennisetum mosaic virus编码外壳蛋白的氨基酸序列相似性为89%。外壳蛋白(CP)氨基酸序列的系统发育分析结果表明,PenMV-HZC与河北(AGF29575、AGF29577、AGF29579、AGF29582)、山西(AGF29567、AGF29581)的PenMV分离物聚类为一簇,CP氨基酸序列同源性为89.42%~89.97%,表现出较近的亲缘关系。以上结果为侵染皇竹草的PenMV检测与鉴定提供了科学依据。
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关键词
皇竹
草
白草花叶病毒
病毒
检测
病毒
鉴定
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职称材料
1个白草花叶病毒分离物的全基因组序列分析(英文)
被引量：
1
2
作者
邓丛良
黄金光
+3 位作者
高文娜
吕玉峰
范在丰
李怀方
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2005年第B08期118-124,共7页
从我国北方地区呈现花叶症状的白草上分离得到1个白草花叶病毒分离物(AY642590,PenMV-B),测定了其RNA的核苷酸全序列。结果发现,该病毒分离物的RNA基因组全长共9 611个核苷酸,5′-末端和3′-末端的非翻译区序列分别为172和241个核苷酸,...
从我国北方地区呈现花叶症状的白草上分离得到1个白草花叶病毒分离物(AY642590,PenMV-B),测定了其RNA的核苷酸全序列。结果发现,该病毒分离物的RNA基因组全长共9 611个核苷酸,5′-末端和3′-末端的非翻译区序列分别为172和241个核苷酸,中间为9 198个核苷酸的开放读框,编码3 065个氨基酸,分子量约为349 575 Da;其多聚蛋白P3/6K1处的E/H蛋白切割位点序列与Potyvirus属其他病毒均不相同,为该病毒所仅有。预期的Potyvirus属病毒的一些重要的、功能性保守基序特征都存在于该病毒的基因组序列中。Potyvirus属病毒多聚蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明,PenMV-B和MDMV,SrMV,SCMV有较近的亲缘关系。根据ICTV最新的马铃薯Y病毒属分类标准,进一步确定该病毒具有Potyvirus属SCMV亚组新成员的分类地位。对SCMV亚组病毒和分离物基因组各区域的多重序列比较结果表明,PenMV在进化过程中有可能发生了基因的重组和变异。
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关键词
白草花叶病毒
分离物
序列比较
核苷酸
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职称材料
白草花叶病毒基因RNAi表达载体的构建
被引量：
2
3
作者
马丽
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009年第4期53-55,共3页
对PenMV-B的HC基因与PenMV-C的HC基因进行同源性分析,确定HC基因的保守片段。根据保守序列设计引物,以PenMVHC-Pro基因的cDNA为模板,PCR扩增能形成"发夹结构"的正反向片段,连接后插入到质粒载体pCAMB IA3301。通过冻融法将载...
对PenMV-B的HC基因与PenMV-C的HC基因进行同源性分析,确定HC基因的保守片段。根据保守序列设计引物,以PenMVHC-Pro基因的cDNA为模板,PCR扩增能形成"发夹结构"的正反向片段,连接后插入到质粒载体pCAMB IA3301。通过冻融法将载体直接导入农杆菌中,用于农杆菌介导的玉米转化。
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关键词
玉米矮
花叶病毒
白草花叶病毒
RNAi表达载体
HC基因
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职称材料
题名
侵染皇竹草的白草花叶病毒检测与鉴定
1
作者
高婧
赵明富
机构
宜良县农业农村局
云南农业大学植物保护学院
出处
《云南农业科技》
2025年第2期15-19,共5页
文摘
昆明市的皇竹草种植基地近年出现了大量带有花叶症状的病株,对当地人工栽培皇竹草产业造成了巨大的产量和经济损失。为明确侵染皇竹草引起其花叶症状的病毒种类,采用透射电子显微镜、基于植物总RNA和病毒特异性引物的反转录聚合酶链式反应技术以及宏转录组测序技术对采集的病样进行鉴定与检测。电镜扫描结果表明,在带有花叶症状的皇竹草病叶中存在大小约为750 nm的线状病毒粒子。通过宏转录组测序技术从皇竹草病叶中鉴定到一株新的白草花叶病毒分离株,命名为“Pennisetum mosaic virus isolate HZC(PenMVHZC)”。PenMV-HZC全基因组序列包含9611个核苷酸,不包括3’端poly(A)序列,编码一个包含3065个氨基酸的多聚蛋白。由RT-PCR扩增到病样中一段大小为520 bp的核苷酸序列。BLAST分析表明,PenMV-HZC与隶属于马铃薯Y病毒科马铃薯Y病毒属的Pennisetum mosaic virus编码外壳蛋白的氨基酸序列相似性为89%。外壳蛋白(CP)氨基酸序列的系统发育分析结果表明,PenMV-HZC与河北(AGF29575、AGF29577、AGF29579、AGF29582)、山西(AGF29567、AGF29581)的PenMV分离物聚类为一簇,CP氨基酸序列同源性为89.42%~89.97%,表现出较近的亲缘关系。以上结果为侵染皇竹草的PenMV检测与鉴定提供了科学依据。
关键词
皇竹
草
白草花叶病毒
病毒
检测
病毒
鉴定
分类号
S432.4 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
1个白草花叶病毒分离物的全基因组序列分析(英文)
被引量：
1
2
作者
邓丛良
黄金光
高文娜
吕玉峰
范在丰
李怀方
机构
北京出入境检验检疫局植物检疫实验室
中国农业大学植物病理系植物病毒研究室
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2005年第B08期118-124,共7页
文摘
从我国北方地区呈现花叶症状的白草上分离得到1个白草花叶病毒分离物(AY642590,PenMV-B),测定了其RNA的核苷酸全序列。结果发现,该病毒分离物的RNA基因组全长共9 611个核苷酸,5′-末端和3′-末端的非翻译区序列分别为172和241个核苷酸,中间为9 198个核苷酸的开放读框,编码3 065个氨基酸,分子量约为349 575 Da;其多聚蛋白P3/6K1处的E/H蛋白切割位点序列与Potyvirus属其他病毒均不相同,为该病毒所仅有。预期的Potyvirus属病毒的一些重要的、功能性保守基序特征都存在于该病毒的基因组序列中。Potyvirus属病毒多聚蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明,PenMV-B和MDMV,SrMV,SCMV有较近的亲缘关系。根据ICTV最新的马铃薯Y病毒属分类标准,进一步确定该病毒具有Potyvirus属SCMV亚组新成员的分类地位。对SCMV亚组病毒和分离物基因组各区域的多重序列比较结果表明,PenMV在进化过程中有可能发生了基因的重组和变异。
关键词
白草花叶病毒
分离物
序列比较
核苷酸
Keywords
Pennisetum mosaic virus （PenMV）
isolate
sequence comparison
nucleotide（nt）
分类号
S436.8 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
白草花叶病毒基因RNAi表达载体的构建
被引量：
2
3
作者
马丽
机构
枣庄学院生命科学系
出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009年第4期53-55,共3页
基金
国家"973"项目(编号:2006CB101700)
文摘
对PenMV-B的HC基因与PenMV-C的HC基因进行同源性分析,确定HC基因的保守片段。根据保守序列设计引物,以PenMVHC-Pro基因的cDNA为模板,PCR扩增能形成"发夹结构"的正反向片段,连接后插入到质粒载体pCAMB IA3301。通过冻融法将载体直接导入农杆菌中,用于农杆菌介导的玉米转化。
关键词
玉米矮
花叶病毒
白草花叶病毒
RNAi表达载体
HC基因
分类号
Q782 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
侵染皇竹草的白草花叶病毒检测与鉴定
高婧
赵明富
《云南农业科技》
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
1个白草花叶病毒分离物的全基因组序列分析(英文)
邓丛良
黄金光
高文娜
吕玉峰
范在丰
李怀方
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2005
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
白草花叶病毒基因RNAi表达载体的构建
马丽
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
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