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长链非编码RNA癌症易感性候选物2与印记基因H19在肝外胆管癌中差异表达的分析
被引量：
2
1
作者
王家兴
申文凤
+4 位作者
肖瑞
冯学敏
马睿婷
王泽锋
任建军
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期72-80,共9页
目的探讨肝外胆管癌(ECC)中长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性候选物2(CASC2)和印记基因H19表达及其潜在的功能作用。方法收集ECC患者样本4例,基于高通量测序技术进行转录组测序,分析lncRNA CASC2和H19的表达模式,并基于生物信息学方法...
目的探讨肝外胆管癌(ECC)中长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性候选物2(CASC2)和印记基因H19表达及其潜在的功能作用。方法收集ECC患者样本4例,基于高通量测序技术进行转录组测序,分析lncRNA CASC2和H19的表达模式,并基于生物信息学方法预测潜在功能。另取22例ECC组织样本和不同分化程度的胆管癌细胞株(RBE、QBC939、HuH-28、HuCCT1)进行验证,分别以癌旁组织和正常胆管上皮细胞(HIBEC)作为对照,应用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法分别检测癌组织、癌旁组织与细胞系中lncRNA CASC2和H19的表达水平。汇总患者临床指标并结合目标基因的差异表达进行相关性分析。结果4对ECC癌组织与癌旁组织中lncRNA CASC2和H19的表达差异有统计学意义(P均<0.05)。qRT-PCR结果显示,lncRNA CASC2在ECC癌组织中表达水平明显高于癌旁组织(t=1.262,P=0.025),而lncRNA H19在ECC癌组织中表达水平明显低于癌旁组织(t=1.285,P=0.005);细胞系QBC939(t=8.114,P=0.015)和HuH-28(t=9.202,P=0.012)中CASC2的表达水平显著高于对照组,而RBE(t=-10.244,P<0.001)、QBC939(t=-10.476,P<0.001)、HuH-28(t=-19.798,P<0.001)和HuCCT1(t=-16.193,P=0.004)中H19的表达水平均显著低于对照组。生物信息分析结果显示,CASC2主要参与代谢过程,而H19参与多细胞生物发展等过程,两者均与催化活性功能相关。相关性分析结果显示,lncRNA CASC2表达水平与病理中分化(χ^(2)=6.222,P=0.022)、淋巴结转移(χ^(2)=5.455,P=0.020)显著相关;而lncRNA H19表达水平与病理中分化(χ^(2)=1.174,P=0.029)、肿物大小(χ^(2)=-0.507,P=0.037)显著相关。结论ECC中lncRNA CASC2和H19均出现转录失调,其中lncRNA CASC2在癌组织中呈上调趋势,H19呈下调趋势,两者具有成为ECC新的分子标志物的潜力。
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关键词
肝外胆管癌
长链非编码RNA
癌症易感性候选物2
H19
表达分析
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职称材料
题名
长链非编码RNA癌症易感性候选物2与印记基因H19在肝外胆管癌中差异表达的分析
被引量：
2
1
作者
王家兴
申文凤
肖瑞
冯学敏
马睿婷
王泽锋
任建军
机构
内蒙古医科大学附属医院肝胆外科
内蒙古医科大学附属医院超声科
内蒙古医科大学附属医院分子病理学重点实验室
内蒙古医科大学附属医院外科重点实验室
内蒙古医科大学附属医院影像诊断科
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期72-80,共9页
基金
内蒙古自治区高等学校科学技术研究项目(NJZZ22685)
内蒙古医科大学附属医院重大科研项目(NYFY ZD003)
+1 种基金
内蒙古自治区卫生健康科研计划项目(201702096)
内蒙古自治区自然科学基金项目(2018MS08082)。
文摘
目的探讨肝外胆管癌(ECC)中长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性候选物2(CASC2)和印记基因H19表达及其潜在的功能作用。方法收集ECC患者样本4例,基于高通量测序技术进行转录组测序,分析lncRNA CASC2和H19的表达模式,并基于生物信息学方法预测潜在功能。另取22例ECC组织样本和不同分化程度的胆管癌细胞株(RBE、QBC939、HuH-28、HuCCT1)进行验证,分别以癌旁组织和正常胆管上皮细胞(HIBEC)作为对照,应用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法分别检测癌组织、癌旁组织与细胞系中lncRNA CASC2和H19的表达水平。汇总患者临床指标并结合目标基因的差异表达进行相关性分析。结果4对ECC癌组织与癌旁组织中lncRNA CASC2和H19的表达差异有统计学意义(P均<0.05)。qRT-PCR结果显示,lncRNA CASC2在ECC癌组织中表达水平明显高于癌旁组织(t=1.262,P=0.025),而lncRNA H19在ECC癌组织中表达水平明显低于癌旁组织(t=1.285,P=0.005);细胞系QBC939(t=8.114,P=0.015)和HuH-28(t=9.202,P=0.012)中CASC2的表达水平显著高于对照组,而RBE(t=-10.244,P<0.001)、QBC939(t=-10.476,P<0.001)、HuH-28(t=-19.798,P<0.001)和HuCCT1(t=-16.193,P=0.004)中H19的表达水平均显著低于对照组。生物信息分析结果显示,CASC2主要参与代谢过程,而H19参与多细胞生物发展等过程,两者均与催化活性功能相关。相关性分析结果显示,lncRNA CASC2表达水平与病理中分化(χ^(2)=6.222,P=0.022)、淋巴结转移(χ^(2)=5.455,P=0.020)显著相关;而lncRNA H19表达水平与病理中分化(χ^(2)=1.174,P=0.029)、肿物大小(χ^(2)=-0.507,P=0.037)显著相关。结论ECC中lncRNA CASC2和H19均出现转录失调,其中lncRNA CASC2在癌组织中呈上调趋势,H19呈下调趋势,两者具有成为ECC新的分子标志物的潜力。
关键词
肝外胆管癌
长链非编码RNA
癌症易感性候选物2
H19
表达分析
Keywords
extrahepatic cholangiocarcinoma
long non-coding RNA
cancer susceptibility candidate
2
H19
expression analysis
分类号
R735.8 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长链非编码RNA癌症易感性候选物2与印记基因H19在肝外胆管癌中差异表达的分析
王家兴
申文凤
肖瑞
冯学敏
马睿婷
王泽锋
任建军
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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