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广西壮瑶药瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系建立及引物筛选
被引量：
1
1
作者
张尚文
杨天为
+4 位作者
黄诗宇
李婷
高曼熔
何龙飞
张向军
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1646-1655,共10页
【目的】建立瘤果紫玉盘SCoT-PCR最佳反应体系,并筛选出适宜的SCoT引物,为瘤果紫玉盘种质鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析提供理论参考。【方法】以广西河池、百色、柳州、南宁4份瘤果紫玉盘野生种质为试材,通过单因素试验和正...
【目的】建立瘤果紫玉盘SCoT-PCR最佳反应体系,并筛选出适宜的SCoT引物,为瘤果紫玉盘种质鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析提供理论参考。【方法】以广西河池、百色、柳州、南宁4份瘤果紫玉盘野生种质为试材,通过单因素试验和正交试验对瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系的DNA模板用量、引物用量和Mix预混液用量3个因素进行优化,并使用优化后最佳反应体系进行SCoT引物筛选。最后将SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的引物用于瘤果紫玉盘种质的遗传多样性分析。【结果】单因素试验结果显示,DNA模板用量为40~70 ng,引物(10μmoL/L)用量为1.0~1.4μL,Mix预混液用量为9.0~12.0μL范围内扩增效果较好,通过L16(43)正交试验确定瘤果紫玉盘的SCoT-PCR最佳反应体系20.0μL:DNA模板(40 ng/μL)1.0μL,引物(10μmoL/L)1.2μL,Mix预混液10.0μL,7.8μL ddH2O。利用最佳反应体系筛选出26条适用于瘤果紫玉盘的SCoT引物,并确定了各引物最适的退火温度。26条SCoT引物在4份瘤果紫玉盘材料中共扩增出305个基因位点,其中多态性位点204个,多态性比率为66.89%,平均每条引物扩增出11.7个基因位点,有8.7个多态性位点。4份瘤果紫玉盘种质的平均等位基因数(Na)为1.7377,平均有效等位基因数(Ne)为1.5344,Nei’s基因多样性指数(H′)为0.3053,Shannon指数(I)为0.4449。4份瘤果紫玉盘间的遗传相似系数为0.5443~0.6492,遗传距离为0.4320~0.6083,说明4份瘤果紫玉盘种质间存在较大的遗传变异,遗传多样性水平较高。【结论】建立的SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的26条SCoT标记引物扩增效果较好,可用于瘤果紫玉盘种质资源的鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析。
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关键词
瘤果紫玉盘
SCoT-PCR
反应体系优化
引物筛选
遗传多样性
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职称材料
广西瘤果紫玉盘种质资源调查、收集与繁育
被引量：
1
2
作者
张尚文
杨天为
+5 位作者
黄诗宇
李婷
高曼熔
田姗姗
何龙飞
张向军
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1498-1506,共9页
中国特有植物瘤果紫玉盘(Uvaria kweichowensis),分布范围狭窄,数量稀少。为系统了解广西瘤果紫玉盘的资源数量、分布现状及资源利用等情况,2016-2022年作者团队通过实地走访、问卷调研等形式,对全区9个县开展了瘤果紫玉盘种质资源调查...
中国特有植物瘤果紫玉盘(Uvaria kweichowensis),分布范围狭窄,数量稀少。为系统了解广西瘤果紫玉盘的资源数量、分布现状及资源利用等情况,2016-2022年作者团队通过实地走访、问卷调研等形式,对全区9个县开展了瘤果紫玉盘种质资源调查和种质收集工作,共收集到瘤果紫玉盘资源95份。调查结果显示:瘤果紫玉盘多年生藤本植物,成熟叶革质,主要分布在广西隆安县、天峨县等9个县共197株,生境为海拔650~1100 m之间的喀斯特石山区,依托乔木向上攀附生长,野生资源数量稀少,个体之间距离较远,基本上处于无保护状态,分布地群众有采集瘤果紫玉盘叶片治疗疾病或用于茶饮的习惯。通过种子播种、枝条扦插的形式开展了瘤果紫玉盘种质资源的繁育试验,结果表明不同来源的瘤果紫玉盘种子发芽率在25.7%~34.4%,扦插成活率在4.4%~14.4%,总体成活率较低。本研究探讨了瘤果紫玉盘受威胁的主要因素,提出了保护措施,为广西民族药瘤果紫玉盘种质资源的保护、挖掘和创新利用提供基本依据。
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关键词
瘤果紫玉盘
种质资源
调研
收集保护
繁育研究
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职称材料
题名
广西壮瑶药瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系建立及引物筛选
被引量：
1
1
作者
张尚文
杨天为
黄诗宇
李婷
高曼熔
何龙飞
张向军
机构
广西农业科学院生物技术研究所
广西大学农学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1646-1655,共10页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-21)
广西重点研发计划项目(桂科AB21220042)
+1 种基金
广西特色作物试验站项目(桂TS2022002)
广西水土保持学会重点领域创新项目(202009001)。
文摘
【目的】建立瘤果紫玉盘SCoT-PCR最佳反应体系,并筛选出适宜的SCoT引物,为瘤果紫玉盘种质鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析提供理论参考。【方法】以广西河池、百色、柳州、南宁4份瘤果紫玉盘野生种质为试材,通过单因素试验和正交试验对瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系的DNA模板用量、引物用量和Mix预混液用量3个因素进行优化,并使用优化后最佳反应体系进行SCoT引物筛选。最后将SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的引物用于瘤果紫玉盘种质的遗传多样性分析。【结果】单因素试验结果显示,DNA模板用量为40~70 ng,引物(10μmoL/L)用量为1.0~1.4μL,Mix预混液用量为9.0~12.0μL范围内扩增效果较好,通过L16(43)正交试验确定瘤果紫玉盘的SCoT-PCR最佳反应体系20.0μL:DNA模板(40 ng/μL)1.0μL,引物(10μmoL/L)1.2μL,Mix预混液10.0μL,7.8μL ddH2O。利用最佳反应体系筛选出26条适用于瘤果紫玉盘的SCoT引物,并确定了各引物最适的退火温度。26条SCoT引物在4份瘤果紫玉盘材料中共扩增出305个基因位点,其中多态性位点204个,多态性比率为66.89%,平均每条引物扩增出11.7个基因位点,有8.7个多态性位点。4份瘤果紫玉盘种质的平均等位基因数(Na)为1.7377,平均有效等位基因数(Ne)为1.5344,Nei’s基因多样性指数(H′)为0.3053,Shannon指数(I)为0.4449。4份瘤果紫玉盘间的遗传相似系数为0.5443~0.6492,遗传距离为0.4320~0.6083,说明4份瘤果紫玉盘种质间存在较大的遗传变异,遗传多样性水平较高。【结论】建立的SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的26条SCoT标记引物扩增效果较好,可用于瘤果紫玉盘种质资源的鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析。
关键词
瘤果紫玉盘
SCoT-PCR
反应体系优化
引物筛选
遗传多样性
Keywords
Uvaria kweichowensis
SCoT-PCR
reaction system optimization
primer screening
genetic diversity
分类号
S567.19 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
广西瘤果紫玉盘种质资源调查、收集与繁育
被引量：
1
2
作者
张尚文
杨天为
黄诗宇
李婷
高曼熔
田姗姗
何龙飞
张向军
机构
广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所
广西大学农学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1498-1506,共9页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-21)
广西重点研发计划(桂科AB21220042)
广西特色作物试验站(桂TS2022002)。
文摘
中国特有植物瘤果紫玉盘(Uvaria kweichowensis),分布范围狭窄,数量稀少。为系统了解广西瘤果紫玉盘的资源数量、分布现状及资源利用等情况,2016-2022年作者团队通过实地走访、问卷调研等形式,对全区9个县开展了瘤果紫玉盘种质资源调查和种质收集工作,共收集到瘤果紫玉盘资源95份。调查结果显示:瘤果紫玉盘多年生藤本植物,成熟叶革质,主要分布在广西隆安县、天峨县等9个县共197株,生境为海拔650~1100 m之间的喀斯特石山区,依托乔木向上攀附生长,野生资源数量稀少,个体之间距离较远,基本上处于无保护状态,分布地群众有采集瘤果紫玉盘叶片治疗疾病或用于茶饮的习惯。通过种子播种、枝条扦插的形式开展了瘤果紫玉盘种质资源的繁育试验,结果表明不同来源的瘤果紫玉盘种子发芽率在25.7%~34.4%,扦插成活率在4.4%~14.4%,总体成活率较低。本研究探讨了瘤果紫玉盘受威胁的主要因素,提出了保护措施,为广西民族药瘤果紫玉盘种质资源的保护、挖掘和创新利用提供基本依据。
关键词
瘤果紫玉盘
种质资源
调研
收集保护
繁育研究
Keywords
Uvaria kweichowensis
germplasm resources
investigation
collection and protection
breeding research
分类号
S567.19 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广西壮瑶药瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系建立及引物筛选
张尚文
杨天为
黄诗宇
李婷
高曼熔
何龙飞
张向军
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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职称材料
2
广西瘤果紫玉盘种质资源调查、收集与繁育
张尚文
杨天为
黄诗宇
李婷
高曼熔
田姗姗
何龙飞
张向军
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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引证文献
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