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2023—2024年我国部分地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查
1
作者 刘逸龙 熊谋康 +7 位作者 王淇 商琦 张乐宜 钟帆 苗俊好 宋长绪 徐铮 马晓莉 《中国兽医杂志》 北大核心 2025年第9期87-97,共11页
为调查分析2023—2024年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本试验采用实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测了9省42家猪场的806份疑似PEDV阳性样品,对阳性样品的PEDV刺突蛋白1(S1)、膜蛋白(M)和辅助蛋白(ORF3)基因进行... 为调查分析2023—2024年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本试验采用实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测了9省42家猪场的806份疑似PEDV阳性样品,对阳性样品的PEDV刺突蛋白1(S1)、膜蛋白(M)和辅助蛋白(ORF3)基因进行反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增并测序,得到的代表毒株序列与参考毒株进行比对,构建遗传进化树,分析核苷酸序列相似性和氨基酸序列突变位点。结果显示,806份样品中检出阳性样品473份,样品阳性率为58.68%。共测序鉴定出10株PEDV代表毒株,其S1基因核苷酸序列的相似性介于97.4%~99.7%,均属于G2-2亚型;M基因核苷酸序列的相似性介于96.0%~100%,其中8株属于G2-2亚型,2株属于G2-1亚型;ORF3基因核苷酸序列的相似性介于95.6%~100%,其中8株属于G1-2亚型,1株属于G1-1亚型,1株属于G2-1亚型。与各亚型参考毒株相比,10株代表毒株的S1、M和ORF3基因均存在多个氨基酸位点突变。结果表明,2023—2024年我国部分地区猪群中PEDV感染情况较为严重,主要流行G2型毒株。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 遗传变异 遗传进化分析
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猪流行性腹泻病毒流行毒株对4周龄仔猪的致病性研究 被引量：1
2
作者 孙艳永 张冲 王亚林 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期64-71,共8页
本试验旨在评估猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行毒株对4周龄仔猪的致病性。将60头4周龄PEDV抗原抗体阴性断奶仔猪分为4组,每组15头,第1、2、3组试验用猪逐头分别口服2.0 mL的PEDV毒株PEDV-FJ06、PEDV-0016和PEDV-TT;第4组作为阴性对照组(NC)... 本试验旨在评估猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行毒株对4周龄仔猪的致病性。将60头4周龄PEDV抗原抗体阴性断奶仔猪分为4组,每组15头,第1、2、3组试验用猪逐头分别口服2.0 mL的PEDV毒株PEDV-FJ06、PEDV-0016和PEDV-TT;第4组作为阴性对照组(NC),逐头口服2.0 mL磷酸盐缓冲溶液(PBS)。攻毒后,PEDV-FJ06和PEDV-TT组试验用猪在1 d内即出现水样性腹泻,PEDV-0016组试验用猪在第2 d出现水样性腹泻,各组发病率分别为90%(PEDV-FJ06)、80%(PEDV-0016)、100%(PEDV-TT)和0%(NC)。试验用猪在攻毒后第1 d即可通过粪便排毒,排毒高峰期在感染后第2~7 d,至试验结束仍有部分猪持续排毒。攻毒后第3 d和第7 d攻毒各组平均日增重均显著低于阴性对照组(P<0.001),试验后期,随着临床症状减轻,被感染猪的健康状况逐步好转,平均日增重也略有恢复,但仍明显低于对照组。攻毒后第7、14和21 d,每组随机选取5头猪剖检,大体病理学检查可见肠腔扩张、肠壁变薄和肠系膜充血等;病变严重的试验用猪组织病理学检查,可见小肠绒毛严重萎缩、脱落,并伴有炎性细胞浸润。免疫组化结果显示,可在感染猪十二指肠、空肠和回肠绒毛上皮细胞胞质中检测到PEDV阳性信号,且攻毒后第7 d攻毒各组试验用猪的回肠组织PEDV免疫组化阳性率为100%。本试验研究表明PEDV-FJ06、PEDV-0016和PEDV-TT毒株对4周龄仔猪均具有较高的致病性,病毒感染后可迅速在小肠上皮细胞中增殖,造成小肠绒毛损伤,进而导致腹泻,并严重影响其平均日增重;PEDV感染后持续排毒,增加了PEDV传播风险。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 4周龄仔猪 致病性
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1326例儿童下呼吸道感染的病毒流行病学统计 被引量：3
3
作者 余嘉飞 顾兰琴 夏绍源 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期218-220,共3页
本院多年来对下呼吸道感染住院患儿进行多病原监察,其中对于病毒鉴别采用无选择地进行患儿下呼吸道分泌物中脱落细胞内病毒抗原检测,现将近2年来的检测结果报道如下。 资料与方法 一、对象 1995年6月至1997年12月在本院住院治疗的下呼... 本院多年来对下呼吸道感染住院患儿进行多病原监察,其中对于病毒鉴别采用无选择地进行患儿下呼吸道分泌物中脱落细胞内病毒抗原检测,现将近2年来的检测结果报道如下。 资料与方法 一、对象 1995年6月至1997年12月在本院住院治疗的下呼吸道感染患儿1326例,其中男780例,女546例;年龄从1个月至12岁,其中小于1岁537例,～3岁417例,> 展开更多
关键词 儿童 下呼吸道感染 病毒流行病学 统计
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人类杯状病毒流行病学及疫苗研究进展 被引量：5
4
作者 黄湘 金玉 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期151-154,共4页
关键词 人类杯状病毒 疫苗研究 病毒流行病学 流行病学特征 分子生物学技术 非细菌性腹泻 世界范围内 轮状病毒 发病过程 检测手段
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2011年河南省猪流行性腹泻病毒流行株的遗传进化分析 被引量：24
5
作者 沈永恕 陈陆 +2 位作者 皇甫和平 张华 张磊 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期672-674,共3页
2011年前后,猪流行性腹泻(PED)在河南省爆发流行。为探明该病再次流行的原因,本研究对2011年收集的7份来自河南省不同地区PED病毒(PEDV)流行病毒株M基因进行RT-PCR扩增、克隆、测序及分析。序列分析显示,7株PEDV河南流行株M基因部分核... 2011年前后,猪流行性腹泻(PED)在河南省爆发流行。为探明该病再次流行的原因,本研究对2011年收集的7份来自河南省不同地区PED病毒(PEDV)流行病毒株M基因进行RT-PCR扩增、克隆、测序及分析。序列分析显示,7株PEDV河南流行株M基因部分核苷酸及氨基酸发生变异,不同于以往参考病毒株。基于M基因的遗传进化分析显示,PEDV河南流行株和参考株可以分为3个群(G1、G2、G3),7株PEDV河南流行株均属于第3群,与2010年中国BJ2010株、2007年韩国PFF188株及2008年泰国08RB03株亲缘关系密切,而与欧洲病毒株(CV777、Br1/87)、1995年和2004年泰国株(M_NIAH1795_04、M_NIAH2013_95)及2006年中国LZC株亲缘关系较远。结果表明,2011年在中国河南省及其它地区流行的PEDV是一个新的基因型,可能起源于韩国和泰国。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传进化分析 M基因
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贵州省地方品种鸡禽白血病病毒流行株的亚型鉴定及其分子特征分析 被引量：8
6
作者 杨树青 王丽媛 +3 位作者 贠鲁祥 黄新 鞠孜敬 孙淑红 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期233-236,共4页
为了解贵州省9个地方品种鸡群中禽白血病病毒(ALV)流行株亚型与分子特征,本研究2016年从该省8个地区9个地方品种鸡群共采集380份鸡蛋样品。采集卵白用ELISA试剂盒检测ALV-P27抗原,阳性卵白接种CEF和DF1细胞分离病毒,培养7 d后检测细胞... 为了解贵州省9个地方品种鸡群中禽白血病病毒(ALV)流行株亚型与分子特征,本研究2016年从该省8个地区9个地方品种鸡群共采集380份鸡蛋样品。采集卵白用ELISA试剂盒检测ALV-P27抗原,阳性卵白接种CEF和DF1细胞分离病毒,培养7 d后检测细胞培养液中ALV-P27抗原,对感染细胞cDNA以4对ALV特异性引物进行PCR鉴定与分型。并选取9个鸡群的部分ALV分离株进行gp85基因的克隆测序与序列分析。结果表明,9个鸡群的卵白样品ALV-P27抗原阳性率为0~36%;阳性卵白的CEF和DF1细胞培养上清P27抗原检测结果相同,阳性率为26.8%(15/56),并鉴定出其亚型全部为J亚型(ALV-J)。已测序的21株ALV-J gp85基因序列与国内外ALV-J参考株同源性为86.6%~100%;进化树分析显示,21株ALV-J分离株在不同的分支,其进化关系和来源之间未发现明显规律。本研究表明,贵州省9个地方品种鸡群有6个存在ALV-J感染。其中,3个当地培育的品种鸡ALV感染率为0;而来自3个地区的绿壳蛋鸡ALV-P27抗原阳性率普遍较高(26.7%~36.0%)。本研究补充了我国禽白血病流行病学的数据并为该病的防制提供了调查依据。 展开更多
关键词 禽白血病病毒 贵州 地方品种鸡 流行病毒株
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我国猪流行性腹泻病毒流行现状及分子遗传演化特征 被引量：27
7
作者 左媛媛 徐天刚 +2 位作者 戈胜强 路皓东 吴晓东 《中国动物检疫》 CAS 2022年第9期9-17,共9页
猪流行性腹泻(PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的,以腹泻为主要症状的急性肠道传染病,是长期以来危害我国养猪业健康发展的常见疾病之一。PEDV通过基因插入、缺失和重组等方式不断发生演化和变异,高致病力毒株、变异毒株不断出现,... 猪流行性腹泻(PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的,以腹泻为主要症状的急性肠道传染病,是长期以来危害我国养猪业健康发展的常见疾病之一。PEDV通过基因插入、缺失和重组等方式不断发生演化和变异,高致病力毒株、变异毒株不断出现,各类毒株之间的抗原性存在明显差异,导致临床上猪腹泻情况更加复杂。自2010年10月以来,由PEDV变异株引起的PED在我国大规模暴发流行,用经典毒株制备疫苗的免疫效果并不理想,因而造成重大经济损失。本文综述了PEDV在我国的流行现状及分子遗传演化特征,旨在为PED疫苗和诊断试剂研发提供参考。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传演化 流行 基因分型 变异毒株
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猪流行性腹泻病毒流行毒株S基因的遗传变异和B细胞线性抗原表位分析 被引量：7
8
作者 程小娜 张志 +8 位作者 樊雅婷 刘自立 吴发兴 刘爽 董雅琴 邵卫星 杨雨辉 王树双 李晓成 《动物医学进展》 北大核心 2015年第8期45-50,共6页
为了解我国猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异规律,应用连续RTPCR 方法扩增分离的4株PEDV 流行毒株的S基因,并对S基因进行测序、同源进化和B 细胞抗原表位分析.结果显示,4个流行毒株S基因长4161（4158）个碱基,在59-62位（GENQ）和... 为了解我国猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异规律,应用连续RTPCR 方法扩增分离的4株PEDV 流行毒株的S基因,并对S基因进行测序、同源进化和B 细胞抗原表位分析.结果显示,4个流行毒株S基因长4161（4158）个碱基,在59-62位（GENQ）和140（N）位的插入突变和163-164位（NI）缺失突变,属于与CV777、DR13和KPEDV-9等参考疫苗毒株不同的进化分支G2群,与参考疫苗毒株之间的氨基酸同源性为92.4%～93.3%;B细胞线性抗原表位分析显示,流行毒株52-62、360-365、752-781位抗原表位显著高于疫苗毒株,提示可能与流行毒株的致病性、受体结合能力和侵染性等相关. 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 遗传变异 突变 B细胞抗原表位
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猪流行性腹泻病毒流行毒株COE基因的原核表达及免疫原性分析 被引量：4
9
作者 霍军 宋予震 董青 《江苏农业科学》 北大核心 2014年第9期34-36,共3页
应用RT-PCR方法从PEDV流行毒株中扩增COE基因,并将其克隆至原核表达载体pET-32a,构建pET-32a-COE重组质粒。将重组质粒转化至宿主菌BL21(DE3)中,加入IPTG进行诱导表达。SDS-PAGE分析结果显示,该重组蛋白获得了表达,主要以包涵体形式存在... 应用RT-PCR方法从PEDV流行毒株中扩增COE基因,并将其克隆至原核表达载体pET-32a,构建pET-32a-COE重组质粒。将重组质粒转化至宿主菌BL21(DE3)中,加入IPTG进行诱导表达。SDS-PAGE分析结果显示,该重组蛋白获得了表达,主要以包涵体形式存在,分子量约为35.5 ku;Western-blot分析结果显示,所表达的重组蛋白能与抗PEDV小鼠血清反应。应用纯化的重组蛋白加入弗氏佐剂免疫6周龄BALB/C小鼠并采集血清,ELISA检测抗体效价达1∶3 200以上,说明所表达的蛋白具有良好的免疫原性。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 COE基因 原核表达 免疫原性 诊断抗原 PED基因工程疫苗
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猪流行性腹泻病毒流行病学调查综述 被引量：10
10
作者 张海明 田野 +5 位作者 王艳丽 熊志轩 尤刘阳 倪挺 张必兴 贺东生 《猪业科学》 2014年第3期90-91,共2页
由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引发的猪流行性腹泻在世界范围内造成了巨大的经济损失,给广大养猪业主带来了沉重的苦恼。针对近年来我国PEDV的流行病学进行综述报告,为广大临床兽医人士提供一个基础性认识。
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行病学 研究进展
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对虾病毒流行年代养殖技术的探讨
11
作者 沈尔康 《中国水产》 北大核心 1995年第8期32-33,共2页
对虾养殖连续遭受病毒危害,造成大面积减产或绝收。目前广大养虾单位和虾农对病毒流行束手无束,抛荒、改淡和随意养殖现象极为严重。作者提出从阻截病源、提高免疫功能、改进养殖方法、调整养殖结构和改善养殖环境等方面入手,趋吉避害,... 对虾养殖连续遭受病毒危害,造成大面积减产或绝收。目前广大养虾单位和虾农对病毒流行束手无束,抛荒、改淡和随意养殖现象极为严重。作者提出从阻截病源、提高免疫功能、改进养殖方法、调整养殖结构和改善养殖环境等方面入手,趋吉避害,实现抗病减灾的目标。 一、阻截病源 1.杜绝外部致病因子的入侵 主要从虾池、蓄水池、进水渠、生产用水,育苗设施、各种工具等方面进行彻底清淤、消毒,清除或杀死病源体,杜绝外部病源的侵入,具体措施: (1)池底清淤消毒 春节后,凡虾池、蓄水池、进水渠均要清淤消毒。清除表层污泥15—20厘米,清出的污泥要运送到100米以外地方,雨淋后污水不流入进水渠道。清淤后进水20—30厘米,用富氯消毒,浓度掌握在3ppm,水未及地方均匀泼洒。 (2) 展开更多
关键词 对虾 病毒流行 免疫 抗病力
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2014年部分地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查 被引量：39
12
作者 常铁城 陈建飞 +1 位作者 冯力 倪宏波 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期335-338,共4页
为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,本研究利用RT-PCR方法对2014年来自全国11个省市42个猪场的165份病料样品进行了检测。结果显示,在检测的42个猪场中,共有36个猪场显示PEDV阳性,猪场阳性率为85.71%。其中单独感染PEDV的猪场有25... 为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,本研究利用RT-PCR方法对2014年来自全国11个省市42个猪场的165份病料样品进行了检测。结果显示,在检测的42个猪场中,共有36个猪场显示PEDV阳性,猪场阳性率为85.71%。其中单独感染PEDV的猪场有25个,占总数的59.52%;混合感染PEDV和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的猪场有2个,占总数的4.76%,PEDV和猪轮状病毒(Po RV)混合感染猪场有7个,占总数的16.67%;3种病毒均混合感染的猪场有2个,占总数的4.76%。结果表明PEDV在我国的猪腹泻病病原中仍占主导地位。对2014年分离的21株PEDV ORF3基因进行测序分析,并与Gen Bank中登录的12株国内外PEDV参考株相关序列进行遗传变异分析。这33个PEDV株的ORF3基因系统发育树显示,目前我国的PEDV现地病毒株分布在Ⅰ群中的Ⅰ-Ⅰ亚群和Ⅰ-Ⅲ亚群。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行病学调查 ORF3基因 序列分析
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中国蝙蝠中冠状病毒流行病学和基因多样性的研究
13
作者 孔琪 《中国比较医学杂志》 CAS 2006年第8期498-498,共1页
关键词 冠状病毒 病毒流行病学 基因多样性 蝙蝠 中国 野生动物 SAILS 生态系统 种间传播 生态学
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湖北地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查及N基因的序列分析 被引量：5
14
作者 王妍 赵润泽 +6 位作者 谭旭 张子微 李桐 李春琪 郭利伟 杨小林 刘国平 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第4期135-143,共9页
为了解湖北地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征及变异情况。2021年3月-2022年2月,从湖北地区共收集腹泻症状的粪便-肛门棉拭子1580份,采用双重巢式PCR法进行检测,分析不同养殖阶段、季节间的感染差异;并选取部分阳性样品进行PEDV-N... 为了解湖北地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征及变异情况。2021年3月-2022年2月,从湖北地区共收集腹泻症状的粪便-肛门棉拭子1580份,采用双重巢式PCR法进行检测,分析不同养殖阶段、季节间的感染差异;并选取部分阳性样品进行PEDV-N基因的扩增与遗传进化分析。1580份样品共检出阳性样品318份,阳性率为20.13%(318/1580)。其中0~28 d仔猪、28~70 d保育猪、70~120 d后备猪、120~270 d中大猪和>270 d猪只的阳性率分别为40.27%、26.89%、10.33%、8.07%和5.50%。冬季为PEDV感染的高发期(36.66%),其次是春季(19.00%)和秋季(11.49%),夏季(5.55%)的检出率相对较低。将部分阳性样品进行PEDV-N基因测序,随机挑选12株测序序列与24株参考株进行遗传进化分析,测序序列间N基因的核苷酸同源性为94.0%~99.7%,氨基酸同源性为93.9%~100.0%;测序序列与参考毒株的核苷酸同源性为94.5%~99.8%,氨基酸同源性为94.6%~100.0%。通过系统性发育进化树分析,PEDV流行株可分为三个亚型,G1-a、G1-b和G2-a型,其中2株属于G1-a型,1株属于G1-b型,其余均属于G2-a型。本研究结果为明确PEDV在湖北地区的流行特点及变异情况提供了参考依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行病学 序列分析
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猪流行性腹泻病毒流行株感染小型猪的组织病理学观察 被引量：5
15
作者 周书亭 谢洋洋 +4 位作者 丁思嘉 罗依然 郑煜明 闫清源 杨志彪 《上海农业学报》 CSCD 2017年第4期93-97,共5页
为了探究猪流性腹泻病毒(PEDV)感染对小型猪组织脏器的影响,将PEDV流行株SHpd/2012经口服感染5日龄小型猪,待其出现明显临床症状且濒临死亡时剖杀,并采集小肠、肠系膜淋巴结、脾、肾、肝等组织脏器制作病理切片进行显微观察,同时利用抗P... 为了探究猪流性腹泻病毒(PEDV)感染对小型猪组织脏器的影响,将PEDV流行株SHpd/2012经口服感染5日龄小型猪,待其出现明显临床症状且濒临死亡时剖杀,并采集小肠、肠系膜淋巴结、脾、肾、肝等组织脏器制作病理切片进行显微观察,同时利用抗PEDV特异性单抗对各组织进行免疫组织化学观察。结果显示:小型猪在攻毒后24 h即出现猪流行性腹泻的典型临床症状,猪只表现出明显的水样腹泻,同时伴随有呕吐、脱水等症状,甚至出现身体衰竭。解剖观察攻毒组小型猪内脏,可见肠腔内充满黄白色内容物和气体,肠壁变薄,呈半透明状;肠系膜淋巴结显著肿大,其他组织脏器未发现肉眼可见的病理变化。组织病理学观察显示攻毒组小型猪小肠组织病变最为严重,主要表现为小肠绒毛脱落、崩解、萎缩。此外,肠系膜淋巴结出血、有大量炎性细胞浸润;脾脏有大量炎性细胞浸润,脾小梁溶解消失,红髓白髓界限不清;肾脏肾小球变性坏死,肾单位结构崩解,模糊不清。免疫组化分析结果显示,攻毒组试验猪的小肠组织中可检测到大量病毒感染的细胞,而在肺脏、肝脏、肾脏、脾脏等组织中均未检测到PEDV分布。这一结果表明SHpd/2012株与经典毒株相比病变范围有所扩大,为深入研究PEDV致病机制积累了科学数据。 展开更多
关键词 小型猪 猪流行性腹泻病毒 组织病理学 免疫组化
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2016—2018年四川地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查与ORF3、S1部分基因序列分析 被引量：9
16
作者 德西措姆 王印 +8 位作者 杨泽晓 姚学萍 罗燕 廖倡宇 张鹏飞 江地科 项明源 姜瑞姣 宋勇 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第9期1423-1428,共6页
为分析四川地区猪流行性腹泻流行状况及分子遗传演化特征,对2016年6月至2018年6月收集的71份猪腹泻病例进行RT-PCR检测与相关的流行病学调查,并对其中4份阳性样品进行ORF3、S1基因的检测与序列分析。结果显示,近2年的发病高峰日分别在1... 为分析四川地区猪流行性腹泻流行状况及分子遗传演化特征,对2016年6月至2018年6月收集的71份猪腹泻病例进行RT-PCR检测与相关的流行病学调查,并对其中4份阳性样品进行ORF3、S1基因的检测与序列分析。结果显示,近2年的发病高峰日分别在1月28日和2月11日,发病高峰期在12月至3月;猪场连年感染数量下降,新疫源地增加;ORF3基因可分为2个基因型,部分毒株发生少量碱基突变;从S1基因高变区段分型结果显示,2016年底至2018年初流行的PEDV毒株为GⅡ群,与目前流行的PEDV变异毒株在同一分支,同源性为92.8%~99.3%,碱基变异数量较大,与国内的经典疫苗株CV777亲缘关系较远,同源性为82.7%~87.3%,发病时期更集中,较传统PEDV有轻度后移。结果表明,四川地区规模化猪场PED发病率呈下降趋势,对于该病的防控取得初步成效。目前流行PEDV毒株有变异的趋势,为PEDV的防控奠定基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行病学调查 基因序列分析
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猪流行性腹泻病毒流行株M基因的克隆与序列分析
17
作者 丁卫星 王荣谈 +5 位作者 李春华 夏叶 郭佳宏 倪建平 缪德年 赵敏 《上海农业学报》 CSCD 2018年第1期79-83,共5页
采用RT-PCR方法对收集的2株猪流行性腹泻病毒(PEDV)临床毒株(D1、D3)的M基因进行克隆,并对其核苷酸和推导的氨基酸序列进行分析。结果表明:2株PEDV流行毒株M基因间核苷酸序列同源性为98.1%,氨基酸序列同源性为97.8%。流行毒株D1与参考株... 采用RT-PCR方法对收集的2株猪流行性腹泻病毒(PEDV)临床毒株(D1、D3)的M基因进行克隆,并对其核苷酸和推导的氨基酸序列进行分析。结果表明:2株PEDV流行毒株M基因间核苷酸序列同源性为98.1%,氨基酸序列同源性为97.8%。流行毒株D1与参考株EAS1、SM98、CHM2013分离株亲缘性较近,流行毒株D3与参考株PEDV-LY、PEDV-WS、CH22分离株亲缘性较近。与参考株CV777相比,D1株M蛋白有4个抗原决定簇的位置和序列组成发生了变化。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行毒株 M基因
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2021年湖南省猪流行性腹泻病毒流行调查及M基因序列分析 被引量：5
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作者 周宇骏 杜雅萍 +4 位作者 陈宇明 胡鹏辉 袁智 龙明英 谭镜明 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2022年第6期88-92,共5页
为初步了解湖南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行情况,本试验于2021年1—12月从湖南省不同地区213个猪场采集疑似感染PEDV样品共1406份,采用实时荧光定量反转录PCR(RT-qPCR)方法对采集样品进行病原检测,并对22份阳性样品的M基因序列进行扩... 为初步了解湖南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行情况,本试验于2021年1—12月从湖南省不同地区213个猪场采集疑似感染PEDV样品共1406份,采用实时荧光定量反转录PCR(RT-qPCR)方法对采集样品进行病原检测,并对22份阳性样品的M基因序列进行扩增和测序,以进一步分析其基因型和遗传变异情况。结果显示:2021年湖南省PEDV场阳性率为39.91%,样品平均检出率为21.55%;M基因遗传进化分析结果显示:19个毒株属于G2亚型(变异株),3个毒株则属于G1亚型(传统株),说明湖南省流行的PEDV毒株存在2种基因型,但以变异株为主。结果表明,PEDV是湖南省猪群腹泻的主要病因之一,且该地区流行的PEDV基因型较为复杂,但仍然以变异株为主,本试验为湖南省猪流行性腹泻的防控提供了流行病学依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行调查 M基因 遗传进化
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河北省部分地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查与分析 被引量：5
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作者 刘利莎 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第4期85-89,共5页
本研究旨在初步了解河北省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和遗传变异情况,于2016-2017年从保定市及周边地区采集腹泻猪粪便样品327份,采用RT-PCR检测PEDV流行情况,同时对获得的11株PEDV的S基因部分基因(S1)进行扩增、测序和分析... 本研究旨在初步了解河北省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和遗传变异情况,于2016-2017年从保定市及周边地区采集腹泻猪粪便样品327份,采用RT-PCR检测PEDV流行情况,同时对获得的11株PEDV的S基因部分基因(S1)进行扩增、测序和分析。结果显示:327份粪便样品中有84份检测为PEDV阳性,检出率为25.08%;获得的11株PEDV分离株S1基因序列核苷酸同源性为95.8%~100.0%,与疫苗株CV777、LZC株相比,核苷酸同源性为89.5%~90.8%;本次研究获得的11株PEDV分离株均位于G2亚群,与2010年后国内流行的PEDV分离株相距较近,但与PEDV经典毒株亲源性较远。本次研究表明,河北省流行的PEDV毒株多为变异株,生猪养殖企业(户)应注意且加强猪场生物安全。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行情况调查 S1基因 序列分析
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5株猪流行性腹泻病毒流行株的遗传变异分析 被引量：1
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作者 朱海侠 《福建畜牧兽医》 2019年第1期27-32,共6页
为了解当前猪流行性腹泻流行情况,对4个地区疑似PEDV S1、ORF3基因进行RT-PCR扩增,并对5株PEDV流行株进行核苷酸同源性及遗传进化分析。S1基因核苷酸同源性比较与进化分析显示,5株PEDV流行株与意大利Italy/69979-25株、美国OH851株、我... 为了解当前猪流行性腹泻流行情况,对4个地区疑似PEDV S1、ORF3基因进行RT-PCR扩增,并对5株PEDV流行株进行核苷酸同源性及遗传进化分析。S1基因核苷酸同源性比较与进化分析显示,5株PEDV流行株与意大利Italy/69979-25株、美国OH851株、我国主要变异株W-pintung-52株、AH2012、JXGZ2013等位于同一进化分支,其核苷酸同源性达98%以上。ORF3基因核苷酸同源性比较与进化分析发现,5株PEDV流行株均属于野毒株,与Tottori/JPN/2014变异株亲缘关系较近,其核苷酸同源性高达98.8%～100%。提示当前猪流行性腹泻病毒仍以变异株为主。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传进化 变异
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