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番鸭细小病毒VP3蛋白的生物信息学分析
1
作者 许泽军 刘宽辉 +1 位作者 张海燕 朱广双 《山东畜牧兽医》 2025年第5期7-10,15,共5页
番鸭细小病毒病是由番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MDPV)引起雏番鸭的一种急性、败血性传染病。为分析MDPVVP3蛋白的生物信息学特征,本研究利用ExPASY等在线分析网站对MDPVVP3蛋白进行相关的生物信息学预测分析,结果显示MDPVVP... 番鸭细小病毒病是由番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MDPV)引起雏番鸭的一种急性、败血性传染病。为分析MDPVVP3蛋白的生物信息学特征,本研究利用ExPASY等在线分析网站对MDPVVP3蛋白进行相关的生物信息学预测分析,结果显示MDPVVP3蛋白由534个氨基酸组成,包含20种氨基酸,相对分子质量(Mr)为60 035.82,无潜在的信号肽序列以及跨膜区,具有亲水性,并预测为稳定性蛋白;MDPVVP3具有4个潜在N-糖基化修饰位点、8个潜在O-糖基化修饰位点,以及56个潜在磷酸化修饰位点;同时具有18个潜在抗原决定簇以及11个连续氨基酸数量超过10位的B细胞抗原表位。本研究通过生物信息学分析手段,对MDPVVP3蛋白进行了全面预测解析,为MDPV VP3蛋白的功能研究以及MDPV新型疫苗的研发提供了一定的研究基础。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 VP3蛋白 生物信息学 B细胞抗原表位
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新型番鸭细小病毒荧光RPA恒温检测方法的建立
2
作者 陈炜 梁齐章 +7 位作者 张佳雪 焦文龙 林永强 刘荣昌 傅秋玲 傅光华 朱婷 黄瑜 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1044-1050,共7页
【目的】建立新型番鸭细小病毒(New-genotype muscovy duck parvovirus,N-MDPV)荧光RPA恒温检测方法,为基层提供可视化快速检测技术手段。【方法】以N-MDPV的VP3基因保守片段为靶点,使用EXO荧光探针特定结合VP3基因保守片段,设计特异的... 【目的】建立新型番鸭细小病毒(New-genotype muscovy duck parvovirus,N-MDPV)荧光RPA恒温检测方法,为基层提供可视化快速检测技术手段。【方法】以N-MDPV的VP3基因保守片段为靶点,使用EXO荧光探针特定结合VP3基因保守片段,设计特异的RPA扩增引物并利用重组酶聚合酶扩增技术扩增目的基因,从而建立一种荧光RPA恒温检测N-MDPV的方法,确定反应体系的最佳反应时间和温度,分析该方法特异性和灵敏性;对收集的病料进行核酸检测,并与传统PCR和病毒分离鉴定方法检测结果进行比较。【结果】建立的荧光RPA恒温检测方法最佳反应温度为39℃,最佳反应时间为30 min;灵敏性高,最低核酸检测限度可达10 fg·μL^(−1);对新型番鸭细小病毒核酸进行特异性扩增,结果显示对鸭腺病毒3型(Duck adenovirus type 3,DAdV-3)、禽腺病毒4型(Fowl adenovirus serotype 4,FAdV-4)、鸭圆环病毒(Duck circovirus,DuCV)、鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)、鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)、鸭坦布苏病毒(Duck tembusu virus,DTMUV)和新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)的核酸均未有发生交叉反应,特异性良好。利用本研究建立的RPA快检方法、传统PCR方法以及病毒分离鉴定方法对收集的38份鸭组织病料核酸样品进行检测,结果显示阳性率分别为36.8%(14/38)、36.8%(14/38)和31.6%(12/38);RPA检测后呈阳性的样品经PCR方法检测与病毒分离鉴定方法检测均呈现阳性,阳性符合率为100%。【结论】该方法可以很好地应用于缺乏相应检测设备的基层进行新型番鸭细小病毒的大规模临床样本检测,为新型番鸭细小病毒的可视化快速检测提供技术手段。 展开更多
关键词 新型番鸭细小病毒 RPA恒温检测 重组酶聚合酶扩增技术
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雏番鸭细小病毒病快速诊断方法的建立 被引量：12
3
作者 季艳菊 张伟 +1 位作者 李福伟 王林川 《家禽科学》 2007年第6期3-5,共3页
番鸭三周病、番鸭细小病毒型“白点病”以及番鸭小鹅瘟在临床上发病日龄非常相似,也是各个养鸭场经常出现的疾病,它们有时会出现混合感染或继发感染,给诊断带来了困难。针对这种情况,本文通过对三周病病原、番鸭细小病毒型“白点病”病... 番鸭三周病、番鸭细小病毒型“白点病”以及番鸭小鹅瘟在临床上发病日龄非常相似,也是各个养鸭场经常出现的疾病,它们有时会出现混合感染或继发感染,给诊断带来了困难。针对这种情况,本文通过对三周病病原、番鸭细小病毒型“白点病”病原以及番鸭小鹅瘟病原核酸的分析比较,在三周病病原的特异性区域设计了一对特异性引物,通过PCR检测,能够快速、准确的诊断出雏番鸭细小病毒病。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 番鸭小鹅瘟病毒 番鸭细小病毒型“白点病”病毒 聚合酶链反应 诊断
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鹅和番鸭细小病毒全基因克隆与序列分析 被引量：40
4
作者 张云 耿宏伟 +5 位作者 郭东春 胡奇林 相文华 刘明 杨涛 林巍 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期415-419,共5页
本研究采用PCR技术扩增了鹅和番鸭全长细小病毒基因;其中鹅和番鸭细小病毒非结构蛋白基因(NS)全长为1884bp,编码627个氨基酸;结构基因(VP)全长为2199bp,编码732个氨基酸;序列分析表明:鹅和番鸭细小病毒NS之间的核苷酸和氨基酸同源性分别... 本研究采用PCR技术扩增了鹅和番鸭全长细小病毒基因;其中鹅和番鸭细小病毒非结构蛋白基因(NS)全长为1884bp,编码627个氨基酸;结构基因(VP)全长为2199bp,编码732个氨基酸;序列分析表明:鹅和番鸭细小病毒NS之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.9%～82.9%和89.5%～91.2%,而相应的鹅细小病毒之间的同源性为93.7%～99.8%和96.8%～99.7%,番鸭细小病毒之间的同源性为98.8%～99.8%和98.6%～99.5%;在核苷酸和氨基酸水平上,鹅和番鸭细小病毒VP1之间的同源性分别为79.7%～88.7%和85.5%～93.3%,而相应的鹅细小病毒之间的同源性为88.8%～99.6%和91.5%～99.2%,番鸭细小病毒之间的同源性为98.1%～99.6%和97.1%～98.8%;番鸭和鹅细小病毒NS和vp1基因的系统进化树分析表明:番鸭和鹅呼细小病毒来自共同的祖先,但随着宿主的不同而演化为不同的分支。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 番鸭细小病毒 NS基因 VP1基因 序列分析
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新型番鸭细小病毒的发现及其感染的临床表现 被引量：21
5
作者 黄瑜 万春和 +7 位作者 傅秋玲 陈红梅 傅光华 陈翠腾 程龙飞 程小兵 施少华 林建生 《福建农业学报》 CAS 北大核心 2015年第5期442-445,共4页
2008年下半年以来,福建省、浙江省、安徽省及江苏省等地部分鸭场或养鸭户的雏半番鸭和台湾白鸭出现低病死率,约于40日龄起脚易断、上喙变短占近30%,至出栏时残次鸭达60%;免疫接种了雏番鸭细小病毒弱毒活疫苗的雏番鸭依然发生类雏番鸭&qu... 2008年下半年以来,福建省、浙江省、安徽省及江苏省等地部分鸭场或养鸭户的雏半番鸭和台湾白鸭出现低病死率,约于40日龄起脚易断、上喙变短占近30%,至出栏时残次鸭达60%;免疫接种了雏番鸭细小病毒弱毒活疫苗的雏番鸭依然发生类雏番鸭"三周病",除出现死亡外,幸存鸭的番鸭翅脚易断、上喙变短,83%感染鸭成为僵鸭,对我国养鸭业造成了较大的直接经济损失。经病原学检测、病毒分离鉴定和实验室感染试验,发现其病原为与原经典的雏番鸭细小病毒(MDPV)在基因组上、感染宿主范围和致病性存在较大差异的番鸭细小病毒,鉴于此,将之暂定名为新型番鸭细小病毒(NMDPV)。 展开更多
关键词 新型番鸭细小病毒 雏番鸭 雏半番鸭 临床感染 上喙变短
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番鸭细小病毒和鹅细小病毒广东株VP1基因的克隆与序列分析 被引量：17
6
作者 季芳 张毓金 +1 位作者 杨增岐 宋长绪 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期245-247,251,共4页
参考GenBank中的MDPVFM株和GPVB株全基因序列 ,设计并合成一对引物 ,分别对MDPVGD株和GPVGD株的结构蛋白基因 (VP1)进行PCR扩增 ,并克隆到pMD18_T载体 ,筛选到重组质粒并测序。通过对MDPVGD株和GPVGD株的VP1基因的核苷酸序列分析 ,这两... 参考GenBank中的MDPVFM株和GPVB株全基因序列 ,设计并合成一对引物 ,分别对MDPVGD株和GPVGD株的结构蛋白基因 (VP1)进行PCR扩增 ,并克隆到pMD18_T载体 ,筛选到重组质粒并测序。通过对MDPVGD株和GPVGD株的VP1基因的核苷酸序列分析 ,这两种病毒VP1基因大小均为 2 199bp ,核苷酸序列同源性为 87% ,而位于VP1基因上的VP2至VP3基因起始密码子之间的核苷酸序列的差异较大 ,同源性仅为 6 4 %。另外对MDPVGD株和GPVGD株与各地方毒株的VP1和VP3基因核苷酸序列的同源性比较 。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 鹅细小病毒 VP1基因 基因克隆 序列分析 广东株
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番鸭细小病毒和鹅细小病毒的抗原相关性研究 被引量：17
7
作者 程晓霞 陈仕龙 +3 位作者 陈少莺 林锋强 王劭 朱小丽 《福建农业学报》 CAS 2013年第9期869-871,共3页
应用微量交叉中和试验(NT)和胶乳凝集抑制试验(LPAI)比较番鸭细小病毒、鹅细小病毒和番鸭源鹅细小病毒之间的抗原相关性。结果显示:3种病毒与同源抗血清的中和效价和LPAI效价均明显高于异源血清;番鸭细小病毒与番鸭源鹅细小病毒、鹅细... 应用微量交叉中和试验(NT)和胶乳凝集抑制试验(LPAI)比较番鸭细小病毒、鹅细小病毒和番鸭源鹅细小病毒之间的抗原相关性。结果显示:3种病毒与同源抗血清的中和效价和LPAI效价均明显高于异源血清;番鸭细小病毒与番鸭源鹅细小病毒、鹅细小病毒之间的R值均小于0.1;番鸭源鹅细小病毒与鹅细小病毒的R值大于0.25。结果表明番鸭细小病毒与鹅细小病毒(番鸭源或鹅源)的抗原相关性较低,提示番鸭源鹅细小病毒与鹅细小病毒属于同一血清型的不同亚型。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 番鸭源鹅细小病毒 鹅细小病毒 抗原相关性
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番鸭细小病毒与鹅细小病毒的PCR鉴别诊断 被引量：17
8
作者 娄华 杨德威 +3 位作者 贺东升 白挨泉 秦智锋 刘福安 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第6期459-461,共3页
通过比较基因bank中番鸭细小病毒 (MDPV)和鹅细小病毒 (GPV)的全基因序列 ,针对两种病毒非结构蛋白基因序列的相同区段 ,分别设计了两对PCR引物LHMP1/LHMP2和LHGP1/LHGP2 ,用这两对引物分别对MDPV和GPV进行检测 ,其结果引物LHMP1/LHMP2... 通过比较基因bank中番鸭细小病毒 (MDPV)和鹅细小病毒 (GPV)的全基因序列 ,针对两种病毒非结构蛋白基因序列的相同区段 ,分别设计了两对PCR引物LHMP1/LHMP2和LHGP1/LHGP2 ,用这两对引物分别对MDPV和GPV进行检测 ,其结果引物LHMP1/LHMP2只特异性地扩增MDPV ,而引物LHGP1/LHGP2也只特异性地扩增GPV ,并且两对引物均扩增出约 72 0bp的长度序列。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 鹅细小病毒 鉴别诊断
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番鸭细小病毒荧光定量PCR方法的建立及初步应用 被引量：8
9
作者 谢丽基 谢芝勋 +4 位作者 刘加波 庞耀珊 邓显文 谢志勤 范晴 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期218-221,共4页
为建立一种快速检测番鸭细小病毒(MDPV)的方法,本研究根据GenBank中MDPV的REP基因序列,设计一对特异性引物和一条TaqMan探针。对反应条件和试剂浓度进行优化,建立了检测MDPV的荧光定量PCR方法。检测结果表明,该方法检测敏感性达到20 cop... 为建立一种快速检测番鸭细小病毒(MDPV)的方法,本研究根据GenBank中MDPV的REP基因序列,设计一对特异性引物和一条TaqMan探针。对反应条件和试剂浓度进行优化,建立了检测MDPV的荧光定量PCR方法。检测结果表明,该方法检测敏感性达到20 copies,比常规PCR灵敏度高100倍;而且该方法对鸭I型肝炎病毒、鸭圆环病毒、鹅细小病毒、鸭副粘病毒、鸭瘟病毒和禽流感病毒等的检测均为阴性,具有良好的特异性;该方法的批内和批间的检测变异系数均小于2%。对广西地区鸭群收集的118份病料进行检测,其MDPV阳性率为11.02%。结果提示广西地区的鸭群中MDPV的感染比较普遍,建立的荧光定量PCR方法可以用于MDPV的临床快速检测。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 荧光定量PCR 建立
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基于生物信息学预测的番鸭细小病毒和鹅细小病毒免疫交叉反应研究 被引量：7
10
作者 黎明 于天飞 +4 位作者 徐爽 索荔 王傲 姚宇 彭亮 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第24期120-121,共2页
通过生物信息学软件开展了基于表位预测的番鸭细小病毒（MDPV）和鹅细小病毒（GPV）免疫交叉反应研究。番鸭细小病毒非结构蛋白线性抗原表位预测结果表明：AA248~252、503~509和545~554可能是线性表位优势区域,与已知的鹅细小病毒非结... 通过生物信息学软件开展了基于表位预测的番鸭细小病毒（MDPV）和鹅细小病毒（GPV）免疫交叉反应研究。番鸭细小病毒非结构蛋白线性抗原表位预测结果表明：AA248~252、503~509和545~554可能是线性表位优势区域,与已知的鹅细小病毒非结构蛋白线性抗原表位区进行比较,可能具有交叉反应性的区段为AA503~509。番鸭细小病毒衣壳蛋白线性抗原表位预测结果表明：肽段AA27~33、39~50、67~75、111~115、149~155、260~264、321~325、426~430、448~452、485~489、521~525、540~544和685~691等区域可能是线性表位优势区域,与已知的鹅细小病毒衣壳蛋白线性抗原表位区进行比较,可能具有交叉反应性的区段为AA321~325、426~430、540~544和685~691。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 鹅细小病毒 交叉反应 预测
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番鸭细小病毒鹅胚化弱毒株FZ91-30的全基因组克隆及序列分析 被引量：8
11
作者 王建业 黄钰 +2 位作者 龚建森 蒋志伟 朱国强 《中国家禽》 北大核心 2015年第22期46-48,共3页
通过酶切番鸭细小病毒（MPDV）鹅胚化弱毒株FZ91—30基因组DNA，将各片段分别克隆入载体质粒pBluescriptⅡ（SK）并进行测序。序列分析表明FZ91—30基因组由5131个碱基组成，5’端和3’端具有一致的末端倒置重复序列（ITR），均由456个... 通过酶切番鸭细小病毒（MPDV）鹅胚化弱毒株FZ91—30基因组DNA，将各片段分别克隆入载体质粒pBluescriptⅡ（SK）并进行测序。序列分析表明FZ91—30基因组由5131个碱基组成，5’端和3’端具有一致的末端倒置重复序列（ITR），均由456个碱基组成，包括370个碱基配对形成的回文茎部、45个碱基构成的Bubble区以及41个碱基组成的D序列，5’端ITR的D序列和3’端ITR的D’序列反向互补。FZ91—30疫苗株与已发表的5个MPDV毒株VP1蛋白氨基酸序列同源性在97．8％～98．8％，FZ91—30疫苗株在6个位点发生了氨基酸突变，而所有强毒株在这些位点均高度保守，预示这些突变与FZ91—30株对雏番鸭的毒力减弱有关。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 FZ91—30 基因组 末端倒置重复 突变
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番鸭细小病毒琼扩抗原研制及初步应用 被引量：13
12
作者 何海蓉 季明 +1 位作者 朱国强 王永坤 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第1期59-60,共2页
应用番鸭细小病毒鹅胚适应毒M91毒株接种易感鹅胚,收获鹅胚尿囊液毒经浓缩后制成琼扩抗原。
关键词 番鸭细小病毒 鹅细小病毒 琼扩试验
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番鸭细小病毒浙江分离株VP基因的克隆与序列分析 被引量：8
13
作者 万春和 陈红梅 +5 位作者 傅秋玲 施少华 傅光华 程龙飞 黄瑜 胡开辉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第10期2600-2605,共6页
为明确番鸭细小病毒结构蛋白VP的特征,本研究运用PCR从已分离鉴定的番鸭细小病毒浙江分离株(MDPV-ZJ)中分段扩增出VP基因,并对其进行克隆测序和分析。结果表明,番鸭细小病毒浙江分离株VP基因全长为2 199bp,编码732个氨基酸。所编码的包... 为明确番鸭细小病毒结构蛋白VP的特征,本研究运用PCR从已分离鉴定的番鸭细小病毒浙江分离株(MDPV-ZJ)中分段扩增出VP基因,并对其进行克隆测序和分析。结果表明,番鸭细小病毒浙江分离株VP基因全长为2 199bp,编码732个氨基酸。所编码的包膜蛋白大小为81.32ku、理论等电点为6.59、不稳定系数为37.49、亲水性平均系数为-0.667,属于亲水性稳定类蛋白,该编码的结构蛋白没有信号肽,为非分泌蛋白。根据VP基因特征从遗传进化上可将MDPV分为2个大的基因型:经典型和基因重组型,经典型MDPV可以进一步划分为台湾亚群、大陆亚群和欧洲群,MDPV各分离株在遗传进化上存在明显的地域性。本试验中MDPV浙江分离株株处于MDPV大陆亚群。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 VP基因 克隆 序列分析
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鸭坦布苏病毒、鸭肠炎病毒和番鸭细小病毒TaqMan三重实时荧光定量PCR检测方法的建立与临床应用 被引量：7
14
作者 吴双 姜勇 +6 位作者 徐建生 吴植 谢军 宋海港 魏若瑶 高悦 朱善元 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第3期626-633,共8页
本研究旨在建立一种快速、敏感和高特异性检测鸭坦布苏病毒(DTMUV)、鸭肠炎病毒(DEV)和番鸭细小病毒(MDPV)的TaqMan三重实时荧光定量PCR(q-PCR)的诊断方法并应用于临床疑似样品检测。根据DTMUV的E基因、DEV的UL2基因和MDPV的VP3基因保... 本研究旨在建立一种快速、敏感和高特异性检测鸭坦布苏病毒(DTMUV)、鸭肠炎病毒(DEV)和番鸭细小病毒(MDPV)的TaqMan三重实时荧光定量PCR(q-PCR)的诊断方法并应用于临床疑似样品检测。根据DTMUV的E基因、DEV的UL2基因和MDPV的VP3基因保守区域,分别设计合成了3对特异性引物和探针,在建立单重q-PCR方法的基础上建立了三重q-PCR方法。运用三重q-PCR方法对198份来自江苏和安徽的鸭组织疑似病料进行检测,结果表明,建立的TaqMan三重q-PCR可同时检测这3种病毒,检测灵敏度至少达100个拷贝,相关系数(R2)均在0.99以上,扩增效率为90%~110%。同时,该方法对H9亚型禽流感病毒(H9N2 AIV)、鸭甲肝病毒Ⅰ型(DHAV-1)、番鸭呼肠孤病毒(MDRV)、鸭呼肠孤病毒(DRV)、新城疫病毒(NDV)、鹅细小病毒(GPV)的检测均为阴性,表明该方法具备特异性强、灵敏度高、重复性好和快速等优点。与常规PCR检测方法相比,三重q-PCR方法灵敏度大约高100倍。临床疑似样品检测结果表明DTMUV的检出率最高,3种病毒混合感染亦常见。建立的TaqMan三重q-PCR检测方法为DTMUV、DEV和MDPV的临床样品检测提供了快速、有效、特异和灵敏的工具,也为临床分子流行病学调查及定量分析奠定了基础。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 鸭肠炎病毒 番鸭细小病毒 TaqMan实时荧光定量PCR
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番鸭源小鹅瘟病毒和番鸭细小病毒的结构蛋白及其抗原性 被引量：9
15
作者 刘伟 程晓霞 陈少莺 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2015年第1期64-68,共5页
应用交叉免疫印迹方法,分析比较了番鸭源小鹅瘟病毒(MDGPV)和番鸭细小病毒(MDPV)结构蛋白抗原性的差异.结果表明:MDGPV和MDPV纯化病毒在SDS-PAGE分析中均呈现3种结构蛋白,分子质量分别为81、65和55 ku;在免疫印迹试验中,MDGPV和MDPV的VP... 应用交叉免疫印迹方法,分析比较了番鸭源小鹅瘟病毒(MDGPV)和番鸭细小病毒(MDPV)结构蛋白抗原性的差异.结果表明:MDGPV和MDPV纯化病毒在SDS-PAGE分析中均呈现3种结构蛋白,分子质量分别为81、65和55 ku;在免疫印迹试验中,MDGPV和MDPV的VP1、VP2和VP3三种结构蛋白均可被同源抗血清识别,而异源抗血清均不能识别VP1蛋白;免疫番鸭血清和感染耐过番鸭血清识别的条带无明显区别.可见,MDGPV和MDPV的抗原性差异主要体现在VP1蛋白上. 展开更多
关键词 番鸭源小鹅瘟病毒 番鸭细小病毒 结构蛋白 抗原性
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番鸭细小病毒NS1基因的克隆与原核表达 被引量：7
16
作者 董嘉文 孙敏华 +3 位作者 李林林 袁建丰 邝瑞欢 胡奇林 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第3期33-37,共5页
本研究利用PCR方法扩增番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MPV)非结构蛋白NS1基因,并将其克隆至原核表达载体pET32a(+),构建重组表达质粒pET32a-NS1。将其转化受体菌E.coli Rosetta感受态细胞,经IPTG诱导表达。SDS-PAGE和Western b... 本研究利用PCR方法扩增番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MPV)非结构蛋白NS1基因,并将其克隆至原核表达载体pET32a(+),构建重组表达质粒pET32a-NS1。将其转化受体菌E.coli Rosetta感受态细胞,经IPTG诱导表达。SDS-PAGE和Western blot试验结果表明,NS1基因在大肠杆菌中得到了表达,并且可与抗MPV的多克隆抗体发生特异性反应。MPV NS1基因的成功表达为研制MPV的诊断试剂盒、基因工程疫苗等奠定了基础。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 NS1基因 克隆 表达
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区别鹅细小病毒和番鸭细小病毒的PCR-RFLP方法的建立 被引量：6
17
作者 万春和 潘异哲 +4 位作者 陈红梅 施少华 傅光华 程龙飞 黄瑜 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第9期56-59,共4页
根据GenBank登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)非结构蛋白(NS)基因特征,本研究设计1对特异性引物对GPV和MDPV基因组DNA进行PCR扩增,目的片段大小均为810bp,并对PCR产物进行切胶回收。用EcoRⅠ酶对GPV和MDPV特异性胶回收产物进... 根据GenBank登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)非结构蛋白(NS)基因特征,本研究设计1对特异性引物对GPV和MDPV基因组DNA进行PCR扩增,目的片段大小均为810bp,并对PCR产物进行切胶回收。用EcoRⅠ酶对GPV和MDPV特异性胶回收产物进行酶切鉴定,结果显示MDPV经EcoRⅠ酶切后琼脂糖凝胶电泳检测片段为2段,大小为530和280bp;而GPV经EcoRⅠ酶切后琼脂糖凝胶电泳检测片段大小不变。本研究建立了一种快速区别GPV和MDPV感染的检测方法,可对番鸭感染水禽细小病毒的情况进行快速鉴别诊断。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 番鸭细小病毒 EcoRⅠ限制性内切酶 聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性
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番鸭细小病毒免疫原蛋白基因的序列测定与分析 被引量：3
18
作者 娄华 白挨泉 +3 位作者 顾万军 陆英杰 贺东升 刘福安 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第7期393-393,395,共2页
关键词 番鸭细小病毒 MDPV 免疫原蛋白基因 序列分析
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安徽番鸭细小病毒的分离和PCR检测 被引量：5
19
作者 戴银 张丹俊 +5 位作者 沈学怀 赵瑞宏 胡晓苗 侯宏艳 潘孝成 周学利 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2016年第8期35-37,共3页
为研究安徽省番鸭细小病毒遗传变异状况,通过番鸭胚接种分离了安徽流行株,并进行PCR检测。将扩增基因序列AH-MDPV-1和AH-MDPV-2在NCBI数据库中进行相似性搜索比对,结果显示,两者与番鸭细小病毒基因同源性均大于99%;与鹅细小病毒基因同... 为研究安徽省番鸭细小病毒遗传变异状况,通过番鸭胚接种分离了安徽流行株,并进行PCR检测。将扩增基因序列AH-MDPV-1和AH-MDPV-2在NCBI数据库中进行相似性搜索比对,结果显示,两者与番鸭细小病毒基因同源性均大于99%;与鹅细小病毒基因同源性分别介于79%~90%和78%~81%之间。进一步将AH-MDPV-1与7条参比的细小病毒基因序列进行比对,可见番鸭细小病毒的该部分基因相对较为保守,而与鹅细小病毒基因相应区域具有明显差异,表明该基因特异性较强,可以作为番鸭细小病毒的鉴定依据。同时可判定该病毒分离株为番鸭细小病毒。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 病毒分离 PCR检测
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番鸭细小病毒ZQ分离株非结构蛋白基因的克隆及序列分析 被引量：4
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作者 王文秀 张松林 +1 位作者 付强 沈志强 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第12期79-83,共5页
为了解番鸭细小病毒（MDPV）ZQ株非结构蛋白（NS）基因的分子生物学特性,根据已发表的MDPV基因组分别设计并合成了扩增NS1和NS2基因的特异性引物,应用PCR从MDPV阳性病料中扩增出NS1和NS2基因片段,将其分别连接到pMD 18-T载体上,通过双... 为了解番鸭细小病毒（MDPV）ZQ株非结构蛋白（NS）基因的分子生物学特性,根据已发表的MDPV基因组分别设计并合成了扩增NS1和NS2基因的特异性引物,应用PCR从MDPV阳性病料中扩增出NS1和NS2基因片段,将其分别连接到pMD 18-T载体上,通过双酶切和PCR筛选出阳性重组质粒。序列分析结果表明,克隆的NS1片段全长1 884bp,编码627个氨基酸,NS2片段全长为1 356bp,编码451个氨基酸。NS1与国内外已发表过的病毒株的核苷酸序列的同源性为98.1%-99.6%,NS2核苷酸序列的同源性为98.2%-100%。系统进化树分析表明,该分离株与福建和广东株亲缘关系最近。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 NS1基因 NS2基因 克隆 序列分析
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