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靶向G-四链体的抗番茄丛矮病毒卟啉类衍生物的筛选
被引量:
2
1
作者
谢从宝
祝强强
+2 位作者
张涛
宁丽红
位灯国
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期319-328,352,共11页
植物病毒病给蔬菜生产带来很大影响,目前蔬菜病毒防控主要采用非药剂措施,广谱抗病毒剂效果有限,需要基于新的药物靶点开发新的病毒抑制剂。G-四链体(G4s)是一种特殊的核酸高级结构,其在病毒基因组中的形成或解链可调节基因的复制、转...
植物病毒病给蔬菜生产带来很大影响,目前蔬菜病毒防控主要采用非药剂措施,广谱抗病毒剂效果有限,需要基于新的药物靶点开发新的病毒抑制剂。G-四链体(G4s)是一种特殊的核酸高级结构,其在病毒基因组中的形成或解链可调节基因的复制、转录和翻译等过程,进而影响病毒增殖。一些可调节G-四链体结构稳定性的小分子呈现出抗病毒活性,使得G-四链体有望成为新的抗病毒药物的靶标。番茄丛矮病毒(tomato bushy stunt virus,TBSV)是一种分布广泛的植物病毒,有关其基因组的复制、转录和翻译等分子机制已研究得较为成熟,是一种研究病毒与寄主互作的模式病毒。揭示TBSV中G-四链体的结构及功能,有望为植物病毒基因中G-四链体的研究奠定基础。本研究通过生物信息学分析,在TBSV基因中鉴定出两条保守的、潜在的G-四链体可形成序列(putative G-quadruplex sequences,PQS)——TBSV-PQS2和TBSV-PQS4;通过紫外、荧光光谱和圆二色光谱(CD光谱)方法筛选出与TBSV-PQS2和TBSV-PQS4互作的G4配体;通过烟草体内侵染性克隆试验发现,G-四链体配体N-甲基中卟啉IX(NMM)可抑制TBSV病毒的增殖。本研究结果表明,以植物病毒中G-四链体为靶点开发抗植物病毒的生态友好型农药,有望成为控制植物病毒危害的新策略。
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关键词
RNA
G-四链体
植物
病毒
番茄
丛
矮
病毒
(
tbsv
)
N-甲基中卟啉IX(NMM)
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职称材料
半巢式RT-Realtime PCR检测番茄丛矮病毒
被引量:
2
2
作者
粟智平
杨益娥
+3 位作者
赵伟铎
李金庆
邓丛良
尹伟力
《现代农业科技》
2015年第18期148-150,共3页
番茄丛矮病毒(ToBSV)是我国进境植物检疫对象,也是进境种子苗木等必检项目。该病毒能侵染番茄、曼陀罗、葡萄、豇豆等20余科120余种植物。该研究根据ToBSV全基因组中p33蛋白基因,设计引物和Taq Man探针,建立了半巢式实时PCR检测ToBSV的...
番茄丛矮病毒(ToBSV)是我国进境植物检疫对象,也是进境种子苗木等必检项目。该病毒能侵染番茄、曼陀罗、葡萄、豇豆等20余科120余种植物。该研究根据ToBSV全基因组中p33蛋白基因,设计引物和Taq Man探针,建立了半巢式实时PCR检测ToBSV的新方法。该研究巧妙地融合了巢式PCR和Taq Man探针技术,第二步半巢式-RT-Realtime PCR既进一步放大了第一步检测信号,也是对第一步PCR产物的确认,与单一的巢式PCR或Realtime PCR等方法相比其检测的准确性、灵敏度更高。该方法检测灵敏度可达50 fg/μL植物总RNA。
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关键词
番茄
丛
矮
病毒
(ToBSV)
半巢式RT—RealtimePCR
检测
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职称材料
烟草丛顶病毒云南不同分离物全基因组序列测定与分析
3
作者
吕婧
刘芳
+7 位作者
谭冠林
魏薇
尹朝先
马龑
陈小姣
和理淮
陈海如
李凡
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第3期410-420,共11页
【目的】探明烟草丛顶病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)云南不同分离物之间的遗传差异并完成系统进化分析。【方法】采用RT-PCR方法扩增获得云南不同地区10个TBTV分离物的全基因组序列。【结果】10个TBTV云南分离物的全基因组序列均...
【目的】探明烟草丛顶病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)云南不同分离物之间的遗传差异并完成系统进化分析。【方法】采用RT-PCR方法扩增获得云南不同地区10个TBTV分离物的全基因组序列。【结果】10个TBTV云南分离物的全基因组序列均为4 152 bp,基因组结构由4个开放阅读框(ORFs)构成,ORF2通过与ORF1发生-1位的移码(frameshift)表达融合蛋白,推测ORF1末端的GGAUUUU特征序列是确定ORF1与ORF2是否发生移码翻译的依据。各TBTV云南分离物全基因组序列的核苷酸序列同源性为84.9%~99.1%,其中来自德宏的分离物(TBTV-YDHo)变异最大。TBTV不同分离物间存在重组现象,且分离物之间亲缘关系与重组的发生有关,重组主要发生在变异较大的ORF1~ORF2区段。TBTV分离物的各区段中,ORF1和ORF1~ORF2变异最大,而ORF4和3'UTR较为保守。系统进化分析结果表明:TBTV作为幽影病毒属(Umbravirus)的成员之一,其与同属中的罂粟花叶病毒(Opium poppy mosaic virus,OPMV)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性为61.1%~61.6%;与CMo V和CMo MV亲缘关系较远,同源性为54%~55.1%。除幽影病毒属外,TBTV与番茄丛矮病毒科(Tombusviridae)其他属的病毒核苷酸序列同源性为25.1%~49.8%;Tombusviridae中Umbravirus与香石竹环斑病毒属(Dianthovirus)的RNA2亲缘关系最远,与其他病毒属成员的亲缘关系都相对较近。【结论】TBTV云南各分离物之间存在一定的分子变异,有的存在重组现象;TBTV与OPMV亲缘关系最近。
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关键词
烟草
丛
顶
病毒
幽影
病毒
属
番茄
丛
矮
病毒
科
序列分析
重组
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职称材料
特异于病毒的抗体在转基因植物中的表达:研究遗传工程病毒抗性的新方法
4
作者
陶冶
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1994年第5期13-13,共1页
最近几年内,通过在转基因植物体内表达各种病毒基因,已经成功地获得了转基因植物病毒感染的减毒作用。但在某些情况下,该方法可能受到限制,即缺乏广泛的应用性以及与在植物中表达病毒基因有关联的潜在风险。最近Paraskevi Tavladoraki、...
最近几年内,通过在转基因植物体内表达各种病毒基因,已经成功地获得了转基因植物病毒感染的减毒作用。但在某些情况下,该方法可能受到限制,即缺乏广泛的应用性以及与在植物中表达病毒基因有关联的潜在风险。最近Paraskevi Tavladoraki、Eugenio Benvenuto及同事们(ENEA,Rome和Antonio Cattaneo from SISSA,Trieste,Italy)用实验证实了一种选择方法,以减少植物病毒感染(《自然》)(1993),366,469~472)。他们的工作第一次表明,在转基因植物中组成性表达单链Fv(scFv)抗体能够降低感染发病率,并延缓症状发展。scFv抗体能直接抗植物二十面体的菊芋斑皱番茄丛矮病毒(AMCV)。
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关键词
转基因植物
番茄
丛
矮
病毒
抗体片段
SCFV
病毒
感染
病毒
基因
组成性表达
减毒作用
二十面体
体内表达
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职称材料
题名
靶向G-四链体的抗番茄丛矮病毒卟啉类衍生物的筛选
被引量:
2
1
作者
谢从宝
祝强强
张涛
宁丽红
位灯国
机构
华中农业大学农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室
湖北洪山实验室
华中农业大学
华中农业大学深圳营养与健康研究院
中国农业科学院深圳农业基因组研究所和岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心
华中农业大学交叉科学研究院
华中农业大学理学院
华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室
出处
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期319-328,352,共11页
基金
国家自然科学基金(21732002,22077043,31672558)
华中农业大学-中国农业科学院深圳农业基因组研究所合作基金(SZYJY2022016)
湖北省杰出青年基金(2021CFA061).
文摘
植物病毒病给蔬菜生产带来很大影响,目前蔬菜病毒防控主要采用非药剂措施,广谱抗病毒剂效果有限,需要基于新的药物靶点开发新的病毒抑制剂。G-四链体(G4s)是一种特殊的核酸高级结构,其在病毒基因组中的形成或解链可调节基因的复制、转录和翻译等过程,进而影响病毒增殖。一些可调节G-四链体结构稳定性的小分子呈现出抗病毒活性,使得G-四链体有望成为新的抗病毒药物的靶标。番茄丛矮病毒(tomato bushy stunt virus,TBSV)是一种分布广泛的植物病毒,有关其基因组的复制、转录和翻译等分子机制已研究得较为成熟,是一种研究病毒与寄主互作的模式病毒。揭示TBSV中G-四链体的结构及功能,有望为植物病毒基因中G-四链体的研究奠定基础。本研究通过生物信息学分析,在TBSV基因中鉴定出两条保守的、潜在的G-四链体可形成序列(putative G-quadruplex sequences,PQS)——TBSV-PQS2和TBSV-PQS4;通过紫外、荧光光谱和圆二色光谱(CD光谱)方法筛选出与TBSV-PQS2和TBSV-PQS4互作的G4配体;通过烟草体内侵染性克隆试验发现,G-四链体配体N-甲基中卟啉IX(NMM)可抑制TBSV病毒的增殖。本研究结果表明,以植物病毒中G-四链体为靶点开发抗植物病毒的生态友好型农药,有望成为控制植物病毒危害的新策略。
关键词
RNA
G-四链体
植物
病毒
番茄
丛
矮
病毒
(
tbsv
)
N-甲基中卟啉IX(NMM)
Keywords
RNA G-quadruplex
plant virus
tomato bushy stunt virus(
tbsv
)
N-methyl mesophorphyrin IX(NMM)
分类号
TQ450.1 [化学工程—农药化工]
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职称材料
题名
半巢式RT-Realtime PCR检测番茄丛矮病毒
被引量:
2
2
作者
粟智平
杨益娥
赵伟铎
李金庆
邓丛良
尹伟力
机构
烟台出入境检验检疫局
湖南省会同县农业局
北京出入境检验检疫局
出处
《现代农业科技》
2015年第18期148-150,共3页
基金
烟台市科学技术发展计划项目(2008324)
国家973研课题(2011CB932800)
+1 种基金
山东检验检疫局科研项目(SK201305)
山东检验检疫局科研项目(SK2011)
文摘
番茄丛矮病毒(ToBSV)是我国进境植物检疫对象,也是进境种子苗木等必检项目。该病毒能侵染番茄、曼陀罗、葡萄、豇豆等20余科120余种植物。该研究根据ToBSV全基因组中p33蛋白基因,设计引物和Taq Man探针,建立了半巢式实时PCR检测ToBSV的新方法。该研究巧妙地融合了巢式PCR和Taq Man探针技术,第二步半巢式-RT-Realtime PCR既进一步放大了第一步检测信号,也是对第一步PCR产物的确认,与单一的巢式PCR或Realtime PCR等方法相比其检测的准确性、灵敏度更高。该方法检测灵敏度可达50 fg/μL植物总RNA。
关键词
番茄
丛
矮
病毒
(ToBSV)
半巢式RT—RealtimePCR
检测
Keywords
tomato bushy stunt virus(ToBSV )
semi-Nested RT-Realtime PCR
dectectlon
分类号
S41-30 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
烟草丛顶病毒云南不同分离物全基因组序列测定与分析
3
作者
吕婧
刘芳
谭冠林
魏薇
尹朝先
马龑
陈小姣
和理淮
陈海如
李凡
机构
云南农业大学
云南农业大学教务处现代教育技术中心
丽江市古城区农业局农业技术推广中心
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第3期410-420,共11页
基金
云南省高校科技创新团队支持计划(云教科[2014]22号)
国家自然科学基金(30660101,31571983)
云南农业大学杰出人才专项资助计划(2015JY01)
文摘
【目的】探明烟草丛顶病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)云南不同分离物之间的遗传差异并完成系统进化分析。【方法】采用RT-PCR方法扩增获得云南不同地区10个TBTV分离物的全基因组序列。【结果】10个TBTV云南分离物的全基因组序列均为4 152 bp,基因组结构由4个开放阅读框(ORFs)构成,ORF2通过与ORF1发生-1位的移码(frameshift)表达融合蛋白,推测ORF1末端的GGAUUUU特征序列是确定ORF1与ORF2是否发生移码翻译的依据。各TBTV云南分离物全基因组序列的核苷酸序列同源性为84.9%~99.1%,其中来自德宏的分离物(TBTV-YDHo)变异最大。TBTV不同分离物间存在重组现象,且分离物之间亲缘关系与重组的发生有关,重组主要发生在变异较大的ORF1~ORF2区段。TBTV分离物的各区段中,ORF1和ORF1~ORF2变异最大,而ORF4和3'UTR较为保守。系统进化分析结果表明:TBTV作为幽影病毒属(Umbravirus)的成员之一,其与同属中的罂粟花叶病毒(Opium poppy mosaic virus,OPMV)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性为61.1%~61.6%;与CMo V和CMo MV亲缘关系较远,同源性为54%~55.1%。除幽影病毒属外,TBTV与番茄丛矮病毒科(Tombusviridae)其他属的病毒核苷酸序列同源性为25.1%~49.8%;Tombusviridae中Umbravirus与香石竹环斑病毒属(Dianthovirus)的RNA2亲缘关系最远,与其他病毒属成员的亲缘关系都相对较近。【结论】TBTV云南各分离物之间存在一定的分子变异,有的存在重组现象;TBTV与OPMV亲缘关系最近。
关键词
烟草
丛
顶
病毒
幽影
病毒
属
番茄
丛
矮
病毒
科
序列分析
重组
Keywords
tobacco bushy top virus
Umbravirus
tombusviridae
sequence analysis
recombinant
分类号
S435.72 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
特异于病毒的抗体在转基因植物中的表达:研究遗传工程病毒抗性的新方法
4
作者
陶冶
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1994年第5期13-13,共1页
文摘
最近几年内,通过在转基因植物体内表达各种病毒基因,已经成功地获得了转基因植物病毒感染的减毒作用。但在某些情况下,该方法可能受到限制,即缺乏广泛的应用性以及与在植物中表达病毒基因有关联的潜在风险。最近Paraskevi Tavladoraki、Eugenio Benvenuto及同事们(ENEA,Rome和Antonio Cattaneo from SISSA,Trieste,Italy)用实验证实了一种选择方法,以减少植物病毒感染(《自然》)(1993),366,469~472)。他们的工作第一次表明,在转基因植物中组成性表达单链Fv(scFv)抗体能够降低感染发病率,并延缓症状发展。scFv抗体能直接抗植物二十面体的菊芋斑皱番茄丛矮病毒(AMCV)。
关键词
转基因植物
番茄
丛
矮
病毒
抗体片段
SCFV
病毒
感染
病毒
基因
组成性表达
减毒作用
二十面体
体内表达
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
靶向G-四链体的抗番茄丛矮病毒卟啉类衍生物的筛选
谢从宝
祝强强
张涛
宁丽红
位灯国
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
2
半巢式RT-Realtime PCR检测番茄丛矮病毒
粟智平
杨益娥
赵伟铎
李金庆
邓丛良
尹伟力
《现代农业科技》
2015
2
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职称材料
3
烟草丛顶病毒云南不同分离物全基因组序列测定与分析
吕婧
刘芳
谭冠林
魏薇
尹朝先
马龑
陈小姣
和理淮
陈海如
李凡
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
4
特异于病毒的抗体在转基因植物中的表达:研究遗传工程病毒抗性的新方法
陶冶
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1994
0
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