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基于代谢组学方法的两株酿酒酵母菌胞内差异代谢产物分析
被引量：
3
1
作者
欧科
陈福欣
+5 位作者
王婷
冯光文
严贝贝
白巧秀
钱卫东
毛培宏
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期39-44,共6页
为了解不同发酵时期的酿酒酵母菌的胞内小分子化合物的代谢状况,该研究应用代谢组学方法,分析了重组酵母菌株N6076及其原始菌株Kh08的胞内差异代谢产物。UPLC-Q-TOF/MS的检测分析结果表明,2株酵母菌不同发酵时间点的胞内小分子代谢产物...
为了解不同发酵时期的酿酒酵母菌的胞内小分子化合物的代谢状况,该研究应用代谢组学方法,分析了重组酵母菌株N6076及其原始菌株Kh08的胞内差异代谢产物。UPLC-Q-TOF/MS的检测分析结果表明,2株酵母菌不同发酵时间点的胞内小分子代谢产物存在差异,其种类分别为11和10种,且以高丰度的脂类物质居多,其中甲羟戊酸-5-磷酸和胱氨酸分别为2株酵母菌胞内的显著差异代谢产物。应用LC-MS/MS对甲羟戊酸代谢途径中甲羟戊酸-5-磷酸(MVAP)的检测分析结果表明,重组菌株N6076发酵48 h时胞内MVAP浓度为1.32μg/mL,而原始菌株Kh08在相同发酵时间点未检出MVAP。该研究为进一步认识酵母菌胞内小分子化合物的代谢提供了依据。
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关键词
酵母菌
代谢组
代谢产物
质谱
甲羟戊酸-5-磷酸
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职称材料
茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因的克隆和表达分析
被引量：
3
2
作者
刘巍玮
吴君贤
+7 位作者
徐睿
管凤雅
胡健鹏
刘军玲
张亚中
刘超
彭华胜
查良平
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1018-1024,共7页
目的从茅苍术中克隆萜类化合物生物合成途径中的甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)基因,并对其进行序列分析、原核表达及基因表达分析。方法基于茅苍术转录组数据,采用RT-qPCR法克隆获得茅苍术的2条甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因的全长序列,命名为AlP...
目的从茅苍术中克隆萜类化合物生物合成途径中的甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)基因,并对其进行序列分析、原核表达及基因表达分析。方法基于茅苍术转录组数据,采用RT-qPCR法克隆获得茅苍术的2条甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因的全长序列,命名为AlPMK1、AlPMK2,使用生物信息学软件预测AlPMK1,AlPMK2编码蛋白的特征;利用MEGA 6.06软件构建系统进化树;构建原核表达载体,在大肠杆菌中诱导表达;运用RT-qPCR检测该基因在不同产地茅苍术中的相对表达及经不同时间茉莉酸甲酯诱导后的表达情况。结果AlPMK1、AlPMK2基因的ORF长度分别为1512、1590 bp,分别编码503 aa、529 aa。2个基因的二级结构中α螺旋和无规则卷曲占比最高,均属不稳定的酸性蛋白;结构功能域分析证明AlPMK1、AlPMK2分别在4~490 aa,40~527 aa处包含甲羟戊酸激酶的保守结构域;跨膜结构域分析预测,两者均为膜外蛋白;SDS-PAGE结果显示,分别在55、58 kDa处有清晰的目的蛋白表达。基因表达结果显示,在不同时间的茉莉酸甲酯诱导下AlPMK1、AlPMK2的基因表达分别在48、24 h达到最高值,且均在3 h表达最低。不同产地的茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因具有组织特异性,两者均在岳西茅苍术的叶中表达量最高。结论本研究首次克隆2条茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因,并对其进行表达分析,为进一步探究茅苍术萜类生物合成途径奠定基础。
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关键词
茅苍术
甲羟戊酸-5-磷酸
激酶
基因克隆
原核表达
表达分析
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职称材料
题名
基于代谢组学方法的两株酿酒酵母菌胞内差异代谢产物分析
被引量：
3
1
作者
欧科
陈福欣
王婷
冯光文
严贝贝
白巧秀
钱卫东
毛培宏
机构
新疆大学物理科学与技术学院
西安科技大学化学与化工学院
陕西科技大学食品与生物工程学院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期39-44,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31760016
11575149)
文摘
为了解不同发酵时期的酿酒酵母菌的胞内小分子化合物的代谢状况,该研究应用代谢组学方法,分析了重组酵母菌株N6076及其原始菌株Kh08的胞内差异代谢产物。UPLC-Q-TOF/MS的检测分析结果表明,2株酵母菌不同发酵时间点的胞内小分子代谢产物存在差异,其种类分别为11和10种,且以高丰度的脂类物质居多,其中甲羟戊酸-5-磷酸和胱氨酸分别为2株酵母菌胞内的显著差异代谢产物。应用LC-MS/MS对甲羟戊酸代谢途径中甲羟戊酸-5-磷酸(MVAP)的检测分析结果表明,重组菌株N6076发酵48 h时胞内MVAP浓度为1.32μg/mL,而原始菌株Kh08在相同发酵时间点未检出MVAP。该研究为进一步认识酵母菌胞内小分子化合物的代谢提供了依据。
关键词
酵母菌
代谢组
代谢产物
质谱
甲羟戊酸-5-磷酸
Keywords
yeast
metabolome
metabolite
mass spectrometry
mevalonate
-
5
-
phosphate
分类号
TS261.11 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因的克隆和表达分析
被引量：
3
2
作者
刘巍玮
吴君贤
徐睿
管凤雅
胡健鹏
刘军玲
张亚中
刘超
彭华胜
查良平
机构
安徽中医药大学药学院
安徽省食品药品检验研究院
安徽医科大学基础医学院
中国中医科学院中药资源中心
中国医学科学院道地药材研究创新单元(
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1018-1024,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFC1711505)
国家自然科学基金项目(82073957)。
文摘
目的从茅苍术中克隆萜类化合物生物合成途径中的甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)基因,并对其进行序列分析、原核表达及基因表达分析。方法基于茅苍术转录组数据,采用RT-qPCR法克隆获得茅苍术的2条甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因的全长序列,命名为AlPMK1、AlPMK2,使用生物信息学软件预测AlPMK1,AlPMK2编码蛋白的特征;利用MEGA 6.06软件构建系统进化树;构建原核表达载体,在大肠杆菌中诱导表达;运用RT-qPCR检测该基因在不同产地茅苍术中的相对表达及经不同时间茉莉酸甲酯诱导后的表达情况。结果AlPMK1、AlPMK2基因的ORF长度分别为1512、1590 bp,分别编码503 aa、529 aa。2个基因的二级结构中α螺旋和无规则卷曲占比最高,均属不稳定的酸性蛋白;结构功能域分析证明AlPMK1、AlPMK2分别在4~490 aa,40~527 aa处包含甲羟戊酸激酶的保守结构域;跨膜结构域分析预测,两者均为膜外蛋白;SDS-PAGE结果显示,分别在55、58 kDa处有清晰的目的蛋白表达。基因表达结果显示,在不同时间的茉莉酸甲酯诱导下AlPMK1、AlPMK2的基因表达分别在48、24 h达到最高值,且均在3 h表达最低。不同产地的茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因具有组织特异性,两者均在岳西茅苍术的叶中表达量最高。结论本研究首次克隆2条茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因,并对其进行表达分析,为进一步探究茅苍术萜类生物合成途径奠定基础。
关键词
茅苍术
甲羟戊酸-5-磷酸
激酶
基因克隆
原核表达
表达分析
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于代谢组学方法的两株酿酒酵母菌胞内差异代谢产物分析
欧科
陈福欣
王婷
冯光文
严贝贝
白巧秀
钱卫东
毛培宏
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
茅苍术AlPMK1、AlPMK2基因的克隆和表达分析
刘巍玮
吴君贤
徐睿
管凤雅
胡健鹏
刘军玲
张亚中
刘超
彭华胜
查良平
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
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