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猪甲状腺激素应答spot14基因的克隆及组织表达研究
被引量：
4
1
作者
王丛梅
郭豫杰
+3 位作者
王月影
韩立强
李宏基
杨国宇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012年第3期55-59,共5页
基于电子延伸序列,设计1对克隆引物,成功克隆了猪甲状腺激素应答spot14(thyroid hormone responsive spot14,THRSP)基因(GenBank登录号:JF_951726),并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了THRSP基因的组织分布规律。结果发现,克隆的...
基于电子延伸序列,设计1对克隆引物,成功克隆了猪甲状腺激素应答spot14(thyroid hormone responsive spot14,THRSP)基因(GenBank登录号:JF_951726),并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了THRSP基因的组织分布规律。结果发现,克隆的猪THRSP基因长为621bp,包括一个完整的开放阅读框架453bp,编码150个氨基酸。克隆的猪THRSP基因与人、牛、小鼠、褐鼠、欧洲兔、鸡的核苷酸序列同源性分别为83.8%、88.5%、80.9%、80.7%、85.1%、47.1%;推导的cDNA编码区(CDs)的氨基酸序列与人、牛、小鼠、褐鼠、欧洲兔、鸡的同源性分别为76.9%、80.8%、76.2%、76.2%、82.1%、32.0%,构建的系统发育树显示猪与牛的亲缘关系最近。组织表达分析结果表明,THRSP基因在肝脏和脂肪组织中高表达,在脑、脾脏、胃、皮肤、盲肠、直肠中表达量相对较低,在肺脏、十二指肠、空肠、回肠中微量表达,在肾脏、肌肉中无表达。THRSP基因在肝脏、脂肪等脂肪生成组织的高表达暗示了其可能作为调节脂肪合成代谢的调控因子参与脂肪合成,但其调控机理有待进一步研究。
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关键词
猪
甲状腺
激素
应答
spot
14
克隆
组织表达
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职称材料
京海黄鸡甲状腺激素应答蛋白Spot14α基因外显子1多态性与屠体和腹脂性状的相关性分析
被引量：
1
2
作者
薛倩
王金玉
+4 位作者
张跟喜
王亚男
唐莹
魏岳
施会强
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第7期169-174,共6页
本研究旨在寻找甲状腺激素应答蛋白Spot14α(thyroid hormone responsive Spot14α,THRSPα)基因的多态位点,并分析其对京海黄鸡屠体和腹脂性状产生的影响。针对THRSPα基因外显子区,利用PCR-SSCP结合测序技术对379只140日龄京海黄鸡进...
本研究旨在寻找甲状腺激素应答蛋白Spot14α(thyroid hormone responsive Spot14α,THRSPα)基因的多态位点,并分析其对京海黄鸡屠体和腹脂性状产生的影响。针对THRSPα基因外显子区,利用PCR-SSCP结合测序技术对379只140日龄京海黄鸡进行SNP检测,结果发现,该基因第1外显子区存在9bp插入缺失多态位点,形成3种基因型:AA、AB和BB,2种等位基因:A、B,基因频率分别为0.4485、0.5515。相关分析结果表明,该位点对京海黄鸡140日龄活重、屠体性状(包括屠体重、头重、脚重、翅重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、半净膛重)和腹脂性状均没有显著影响(P>0.05)。因此推断该多态位点在京海黄鸡分子辅助标记育种中不能作为屠体和腹脂性状筛选的候选分子辅助标记。
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关键词
甲状腺
激素
应答
蛋白
spot
14
a基因
外显子
多态性
京海黄鸡
屠体和腹脂性状
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职称材料
鸭甲状腺激素应答基因(THRSPα)比较基因组学研究
被引量：
2
3
作者
詹凯
徐桂云
杨宁
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期521-525,共5页
为从比较基因组学角度研究鸭、鸡甲状腺激素应答Spot14alpha(THRSPα)基因突变的异同,根据对鸭THRSPα基因克隆和表达的研究结果,采用多样本PCR产物测序方法筛查鸭THRSPα基因编码区和部分内含子区的核苷酸变异,并与已知的鸡THRSPα基...
为从比较基因组学角度研究鸭、鸡甲状腺激素应答Spot14alpha(THRSPα)基因突变的异同,根据对鸭THRSPα基因克隆和表达的研究结果,采用多样本PCR产物测序方法筛查鸭THRSPα基因编码区和部分内含子区的核苷酸变异,并与已知的鸡THRSPα基因编码区多态进行比较分析。结果表明:鸭THRSPα基因突变频率远高于鸡,编码区平均突变频率为每1 000个碱基有23个碱基发生突变,内含子区平均每1 000个碱基有28个碱基发生突变。编码区16个突变有3个为错义突变,其余均为同义突变。并且THRSPα蛋白靠近亮氨酸拉链结构域N端的第81位天冬氨酸(Asp81),在鸭中错义替换为缬氨酸(Val),在鸡中发生插入或缺失。提示鸭在进化过程中所受选择程度低于鸡,使其THRSPα基因碱基替换频率和分布均匀度均高于鸡,二者在脂肪性状相关的Asp81位点处均发生缺失或突变。
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关键词
鸭
甲状腺
激素
应答
spot
14
alpha
(
thrspα
)
基因变异
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职称材料
题名
猪甲状腺激素应答spot14基因的克隆及组织表达研究
被引量：
4
1
作者
王丛梅
郭豫杰
王月影
韩立强
李宏基
杨国宇
机构
河南农业大学牧医工程学院
农业部动物生化与营养重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012年第3期55-59,共5页
基金
国际先进农业科技计划(948计划
30500065):猪应激相关基因功能研究及分子标记育种技术
文摘
基于电子延伸序列,设计1对克隆引物,成功克隆了猪甲状腺激素应答spot14(thyroid hormone responsive spot14,THRSP)基因(GenBank登录号:JF_951726),并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了THRSP基因的组织分布规律。结果发现,克隆的猪THRSP基因长为621bp,包括一个完整的开放阅读框架453bp,编码150个氨基酸。克隆的猪THRSP基因与人、牛、小鼠、褐鼠、欧洲兔、鸡的核苷酸序列同源性分别为83.8%、88.5%、80.9%、80.7%、85.1%、47.1%;推导的cDNA编码区(CDs)的氨基酸序列与人、牛、小鼠、褐鼠、欧洲兔、鸡的同源性分别为76.9%、80.8%、76.2%、76.2%、82.1%、32.0%,构建的系统发育树显示猪与牛的亲缘关系最近。组织表达分析结果表明,THRSP基因在肝脏和脂肪组织中高表达,在脑、脾脏、胃、皮肤、盲肠、直肠中表达量相对较低,在肺脏、十二指肠、空肠、回肠中微量表达,在肾脏、肌肉中无表达。THRSP基因在肝脏、脂肪等脂肪生成组织的高表达暗示了其可能作为调节脂肪合成代谢的调控因子参与脂肪合成,但其调控机理有待进一步研究。
关键词
猪
甲状腺
激素
应答
spot
14
克隆
组织表达
Keywords
Sus scrofa
thyroid hormone responsive
spot
14
clone
tissue expression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
京海黄鸡甲状腺激素应答蛋白Spot14α基因外显子1多态性与屠体和腹脂性状的相关性分析
被引量：
1
2
作者
薛倩
王金玉
张跟喜
王亚男
唐莹
魏岳
施会强
机构
扬州大学动物科学与技术学院
江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室
江苏京海集团
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第7期169-174,共6页
基金
江苏省科技支撑计划(BE2013386)
国家肉鸡产业技术体系资助(nycytx-42-G1-05)
+1 种基金
江苏高校优势学科建设工程资助
江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室资助
文摘
本研究旨在寻找甲状腺激素应答蛋白Spot14α(thyroid hormone responsive Spot14α,THRSPα)基因的多态位点,并分析其对京海黄鸡屠体和腹脂性状产生的影响。针对THRSPα基因外显子区,利用PCR-SSCP结合测序技术对379只140日龄京海黄鸡进行SNP检测,结果发现,该基因第1外显子区存在9bp插入缺失多态位点,形成3种基因型:AA、AB和BB,2种等位基因:A、B,基因频率分别为0.4485、0.5515。相关分析结果表明,该位点对京海黄鸡140日龄活重、屠体性状(包括屠体重、头重、脚重、翅重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、半净膛重)和腹脂性状均没有显著影响(P>0.05)。因此推断该多态位点在京海黄鸡分子辅助标记育种中不能作为屠体和腹脂性状筛选的候选分子辅助标记。
关键词
甲状腺
激素
应答
蛋白
spot
14
a基因
外显子
多态性
京海黄鸡
屠体和腹脂性状
Keywords
thrsp
a geneexon
polymorphism
Jinghai Yellow chicken
carcass and abdominal fat traits
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
鸭甲状腺激素应答基因(THRSPα)比较基因组学研究
被引量：
2
3
作者
詹凯
徐桂云
杨宁
机构
中国农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期521-525,共5页
基金
国家杰出青年科学基金项目资助(30225032)
文摘
为从比较基因组学角度研究鸭、鸡甲状腺激素应答Spot14alpha(THRSPα)基因突变的异同,根据对鸭THRSPα基因克隆和表达的研究结果,采用多样本PCR产物测序方法筛查鸭THRSPα基因编码区和部分内含子区的核苷酸变异,并与已知的鸡THRSPα基因编码区多态进行比较分析。结果表明:鸭THRSPα基因突变频率远高于鸡,编码区平均突变频率为每1 000个碱基有23个碱基发生突变,内含子区平均每1 000个碱基有28个碱基发生突变。编码区16个突变有3个为错义突变,其余均为同义突变。并且THRSPα蛋白靠近亮氨酸拉链结构域N端的第81位天冬氨酸(Asp81),在鸭中错义替换为缬氨酸(Val),在鸡中发生插入或缺失。提示鸭在进化过程中所受选择程度低于鸡,使其THRSPα基因碱基替换频率和分布均匀度均高于鸡,二者在脂肪性状相关的Asp81位点处均发生缺失或突变。
关键词
鸭
甲状腺
激素
应答
spot
14
alpha
(
thrspα
)
基因变异
Keywords
duck
thrspα
genetic variation
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪甲状腺激素应答spot14基因的克隆及组织表达研究
王丛梅
郭豫杰
王月影
韩立强
李宏基
杨国宇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
京海黄鸡甲状腺激素应答蛋白Spot14α基因外显子1多态性与屠体和腹脂性状的相关性分析
薛倩
王金玉
张跟喜
王亚男
唐莹
魏岳
施会强
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
鸭甲状腺激素应答基因(THRSPα)比较基因组学研究
詹凯
徐桂云
杨宁
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
2
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