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中华鳖MyoD1基因SNP鉴定及其与生长性状的关联分析
被引量：
2
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作者
黄龙
吴本丽
+5 位作者
何吉祥
陈静
宋光同
汪翔
张烨
武松
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期76-81,共6页
为了研究生肌决定因子1(MyoD1)基因多态性与中华鳖生长性状的相关性,采用直接测序法在MyoD1基因上共检测到6个SNP位点(T-49G、A-38G、C91T、A187T、C880T和T1522A),其中C880T位于外显子上,属于错义突变。对从同批繁殖、同块稻田养殖的2...
为了研究生肌决定因子1(MyoD1)基因多态性与中华鳖生长性状的相关性,采用直接测序法在MyoD1基因上共检测到6个SNP位点(T-49G、A-38G、C91T、A187T、C880T和T1522A),其中C880T位于外显子上,属于错义突变。对从同批繁殖、同块稻田养殖的2冬龄中华鳖群体中随机选取的178只个体中各位点的基因型进行检测。结果显示,所有位点在中华鳖群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.636 5、0.349 3和0.375 4,除A187T位点外,其余5个位点的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg定律。采用一般线性模型分析各位点与中华鳖生长性状之间的相关性,研究发现,T-49G位点GG基因型个体的背甲宽显著大于TT基因型,A-38G位点AG基因型个体的背甲宽显著大于AA基因型,A187T位点TT基因型个体的体高显著大于AA基因型,T1522A位点AA基因型个体的体质量显著大于TT、TA基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异。T-49G、A-38G、A187T和T1522A位点与生长性状显著相关,可作为中华鳖分子标记辅助育种的候选标记。
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关键词
中华鳖
生肌决定因子1基因
单核苷酸多态性标记
生
长性状
关联分析
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题名
中华鳖MyoD1基因SNP鉴定及其与生长性状的关联分析
被引量：
2
1
作者
黄龙
吴本丽
何吉祥
陈静
宋光同
汪翔
张烨
武松
机构
安徽省农业科学院水产研究所
水产增养殖安徽省重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期76-81,共6页
基金
安徽省农业科学院院长青年创新基金(17B0509)
安徽省科技攻关计划项目(1604a0702018)
安徽省重点研究与开发计划项目(1704g07020118)
文摘
为了研究生肌决定因子1(MyoD1)基因多态性与中华鳖生长性状的相关性,采用直接测序法在MyoD1基因上共检测到6个SNP位点(T-49G、A-38G、C91T、A187T、C880T和T1522A),其中C880T位于外显子上,属于错义突变。对从同批繁殖、同块稻田养殖的2冬龄中华鳖群体中随机选取的178只个体中各位点的基因型进行检测。结果显示,所有位点在中华鳖群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.636 5、0.349 3和0.375 4,除A187T位点外,其余5个位点的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg定律。采用一般线性模型分析各位点与中华鳖生长性状之间的相关性,研究发现,T-49G位点GG基因型个体的背甲宽显著大于TT基因型,A-38G位点AG基因型个体的背甲宽显著大于AA基因型,A187T位点TT基因型个体的体高显著大于AA基因型,T1522A位点AA基因型个体的体质量显著大于TT、TA基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异。T-49G、A-38G、A187T和T1522A位点与生长性状显著相关,可作为中华鳖分子标记辅助育种的候选标记。
关键词
中华鳖
生肌决定因子1基因
单核苷酸多态性标记
生
长性状
关联分析
Keywords
Pelodiscus sinensis
myogenic differentiation
1
gene
single nucleotide polymorphism
growth traits
correlation analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
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1
中华鳖MyoD1基因SNP鉴定及其与生长性状的关联分析
黄龙
吴本丽
何吉祥
陈静
宋光同
汪翔
张烨
武松
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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参考文献
引证文献
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