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基于系统生物学的生物过程全局优化
1
作者
孙靖淳
储炬
《生物产业技术》
2018年第1期74-85,共12页
随着检测手段的丰富和测序手段的日渐发达,生物过程表现出数据量大、种类多、时变性和相关耦合性的特征,反映了过程中基因、细胞、反应器不同尺度特性的混杂性。提出了基于系统生物学的生物过程全局优化方法,利用基因组学、数学模型、...
随着检测手段的丰富和测序手段的日渐发达,生物过程表现出数据量大、种类多、时变性和相关耦合性的特征,反映了过程中基因、细胞、反应器不同尺度特性的混杂性。提出了基于系统生物学的生物过程全局优化方法,利用基因组学、数学模型、转录组学、蛋白组学、代谢物组学和代谢流组学数据,结合反应器流场特性和细胞生理特性的关系,对生产菌株的限制性瓶颈问题进行了探索和解决。以广泛应用于合成生物学的宿主大肠杆菌和酿酒酵母、产抗生素的放线菌属和顶头孢霉,以及用于有机酸和异源蛋白表达的黑曲霉为主要案例,对生物过程的研究进展进行综述,并为生物过程的全局优化提供了新的思路。
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关键词
系统
生物
学
生物过程优化
纵向组学
流场特性
细胞生理特性
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题名
基于系统生物学的生物过程全局优化
1
作者
孙靖淳
储炬
机构
华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室
出处
《生物产业技术》
2018年第1期74-85,共12页
文摘
随着检测手段的丰富和测序手段的日渐发达,生物过程表现出数据量大、种类多、时变性和相关耦合性的特征,反映了过程中基因、细胞、反应器不同尺度特性的混杂性。提出了基于系统生物学的生物过程全局优化方法,利用基因组学、数学模型、转录组学、蛋白组学、代谢物组学和代谢流组学数据,结合反应器流场特性和细胞生理特性的关系,对生产菌株的限制性瓶颈问题进行了探索和解决。以广泛应用于合成生物学的宿主大肠杆菌和酿酒酵母、产抗生素的放线菌属和顶头孢霉,以及用于有机酸和异源蛋白表达的黑曲霉为主要案例,对生物过程的研究进展进行综述,并为生物过程的全局优化提供了新的思路。
关键词
系统
生物
学
生物过程优化
纵向组学
流场特性
细胞生理特性
Keywords
systems biology
bioprocess optimization
vertical omics
field characteristics
cell physiology
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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作者
出处
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1
基于系统生物学的生物过程全局优化
孙靖淳
储炬
《生物产业技术》
2018
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