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基于转录组测序分析自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织差异表达基因富集的生物学功能模块 被引量:4
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作者 杨惠 刘淑英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期992-997,1057,共7页
为鉴定自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织之间的差异表达基因(DEGs),本研究采用Illumina Hiseq 4000高通量RNA-seq测序技术对自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织及绵羊健康肺组织进行转录组测序和生物信息学分析。参考绵羊基因组... 为鉴定自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织之间的差异表达基因(DEGs),本研究采用Illumina Hiseq 4000高通量RNA-seq测序技术对自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织及绵羊健康肺组织进行转录组测序和生物信息学分析。参考绵羊基因组(Ovisaries3.1.88)对测序结果进行拼接与质量评估,测序数据处理后获得DEGs,上调的DEGs和下调的DEGs分别利用GO数据库进行富集分析。结果显示:自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织比较,DEGs共有366个,其中上调的DEGs 154个,下调的DEGs 212个。通过GO功能富集分析,表达上调的DEGs主要富集于L-亮氨酸跨膜转运蛋白活性、铜还原酶活性、NADH脱氢酶活性、NAD+二磷酸酶活性、磷酸蛋白酶活性的负调控、Nem1-Spo7磷酸酶复合物等生物学功能;表达下调的DEGs主要富集于Ⅲ型转化生长因子β受体结合、DNA导向聚合酶活性、胃气化趋同延伸、面部发育等生物学功能。随机选取7个DEGs利用RT-qPCR方法验证,结果显示这7个DEGs的转录水平与上述结果一致,进一步表明转录组分析数据可信。本实验分析并验证了自然感染后期的绵羊肺腺瘤肿瘤组织的DEGs,为研究自然感染的绵羊肺腺瘤相关分子致瘤机制提供了数据支持。 展开更多
关键词 绵羊肺腺瘤 转录组 高通量RNA测序 DEGs 生物学功能模块
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以上问题为基础的教学法在《生物技术实践》模块教学中的应用 被引量:1
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作者 陈国 《生物学教学》 2012年第7期23-24,共2页
本文结合具体教学案例,阐述了以问题为基础(PBL)教学法在《生物技术实践》模块教学中的应用。并通过问卷调查、成绩统计等方法分析了PBL的教学效果。
关键词 以上问题为基础(PBL)教学法 生物技术实践》模块 应用
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基于无细胞体系的生物合成代谢模块设计、构建与快速途径原型
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作者 唐士茗 胡纪元 +2 位作者 郑穗平 韩双艳 林影 《合成生物学》 CSCD 2022年第6期1250-1261,共12页
随着代谢工程及合成生物学技术的发展,化学品高效生物合成与绿色制造成为可能。高效生物合成体系的设计与构建是绿色生物制造的核心,其理论体系建立及关键技术突破,将为实现绿色生物制造领域高效生产及资源与环境可持续发展提供有力支... 随着代谢工程及合成生物学技术的发展,化学品高效生物合成与绿色制造成为可能。高效生物合成体系的设计与构建是绿色生物制造的核心,其理论体系建立及关键技术突破,将为实现绿色生物制造领域高效生产及资源与环境可持续发展提供有力支撑。本文借助代谢途径模块设计的案例,探讨化合物生物合成过程中潜在通用模块设计原则、设计工具,以及基于无细胞蛋白合成体系的代谢模块快速构建及测试的方法,将突破生物合成途径多基因、多模块“设计-构建-测试”(Design-Build-Test cycle,DBT cycle)高效循环迭代的技术瓶颈。结合机器学习方法的应用,将使“设计-构建-测试”向“设计-构建-测试-学习”(Design-Build-Test-Learn cycle,DBTL cycle)进一步延伸,对高效合成模块的“精准-鲁棒性”设计与构建、推动合成生物学科学与技术发展具有重要意义。 展开更多
关键词 生物合成模块 无细胞蛋白合成 无细胞快速原型 机器学习
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“模块心理学”的挑战:反“文化心理观” 被引量:6
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作者 熊哲宏 《华中师范大学学报(人文社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2005年第4期111-115,126,共6页
流行的“文化心理观”认为,人的心理(Mind)本质上是社会文化塑造的产物。本文试图依据“模块心理观”——它假设人的心理实质上是许多功能上独立的单元(即模块)相互作用的产物——对这一心理学主导观念提出挑战。论文表明,文化的变异性... 流行的“文化心理观”认为,人的心理(Mind)本质上是社会文化塑造的产物。本文试图依据“模块心理观”——它假设人的心理实质上是许多功能上独立的单元(即模块)相互作用的产物——对这一心理学主导观念提出挑战。论文表明,文化的变异性、种族的差异性其实是最不重要的;正是心理的模块性(如语言模块、生物模块、心理理解模块等)使得表面上看起来的文化差异下面存在着普遍性人性。 展开更多
关键词 文化心理观 模块心理学 语言模块 生物模块 心理理解模块
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