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题名生物序列集成式分析平台的研制及其应用
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作者
郑珩
王非
吴梧桐
杨欣
张玉彬
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机构
中国药科大学生物制药学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2002年第5期33-37,共5页
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文摘
应用生物信息学基础理论 ,以信息技术为手段 ,开发了方便高效的生物序列分析平台。该系统可进行核酸及蛋白质序列统计、性质分析、PCR引物设计、联配及同源性分析等。使用该系统设计PCR引物 ,克隆了灰葡萄孢霉菌 3-羟 - 3-甲基戊二酰辅酶A还原酶序列片段 ,并进行同源性分析 ,表明该系统操作简便、分析结果可靠。
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关键词
生物序列集成式分析平台
研制
应用
生物信息学
同源性分析
联配
引物设计
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Keywords
Bioinformatics Conservation analysis Sequence alignment Primer desig
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分类号
Q5
[生物学—生物化学]
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题名截形苜蓿生物数据分析平台的构建与应用
被引量:2
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作者
刘云岩
苏震
董江丽
申小叶
李道丰
王涛
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机构
中国农业大学农业与生物技术国家重点实验室
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出处
《草地学报》
CAS
CSCD
2006年第3期231-235,共5页
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文摘
为更有效地利用截形苜蓿(M.truncatula)的表达序列标签和其他公共数据,加快对截形苜蓿功能基因的研究步伐,构建了“M.trunca tula Home”生物数据分析平台,并以此为中心,整合了专门为截形苜蓿定制的电子克隆系统。该数据分析平台具有序列基本信息查询、电子克隆系统、试验一致性序列动态分类查询的功能。进一步利用“M.truncatula Home”生物数据分析平台大规模预测了截形苜蓿盐胁迫相关基因,从截形苜蓿的36878条试验一致性序列中预测出650条与耐盐相关的序列,为进一步克隆截形苜蓿耐盐相关功能基因奠定了基础。
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关键词
截形苜蓿
生物数据分析平台
电子克隆
表达序列标签
试验一致性序列
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Keywords
Medicago truncatula
Bio-data analysis platform
In silico clone system~ Expressed SequenceTags
Tentative consensus sequences
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分类号
S812
[农业科学—草业科学]
Q943
[生物学—植物学]
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