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几种常用生物分析软件的特点及其使用简介
被引量：
4
1
作者
韦荣编
邱高峰
张源
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2003年第3期30-34,共5页
基于代表性、实用性的原则选择了RAPDistance ,PHYLIP ,MEGA ,TREECON ,AMOVA ,DIPLO MO和MAPMAKER等 7种系统发育及遗传图谱构建方面的免费共享生物分析软件 ,简要介绍了它们各自的特点、功能、使用及获得的方法。以期这些软件对于从...
基于代表性、实用性的原则选择了RAPDistance ,PHYLIP ,MEGA ,TREECON ,AMOVA ,DIPLO MO和MAPMAKER等 7种系统发育及遗传图谱构建方面的免费共享生物分析软件 ,简要介绍了它们各自的特点、功能、使用及获得的方法。以期这些软件对于从事生物技术研究的人员具有一定的指导性 ,可操作性。
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关键词
生物分析软件
特点
使用简介
系统发育
遗传图谱构建
生物
信息学
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职称材料
利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构
被引量：
6
2
作者
苏晓娜
王惠梅
+7 位作者
黄雪雯
谢小燕
张孝天
牛恋
董琳
江绍琳
吴建利
江绍玫
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期579-589,共11页
菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料。从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析。同时...
菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料。从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析。同时,详细阐述了POPGENE、STRUCTURE、ARLEQUIN、MEGA及MVSP等统计分析软件的数据录入格式、软件操作方法,为相关领域的研究者提供完整可操作的参考依据。各软件分析结果表明:东北地区野生菰具有较为丰富的遗传多样性(PPB=71.88%、Ao=1.719、Ae=1.332、He=0.201、I=0.313,Gst=0.543);各野生菰居群间的遗传相似性系数和遗传距离分别介于0.605 5~0.955 6和0.045 4~0.501 6;东北地区野生菰的遗传变异主要存在于居群间;5个野生菰居群的遗传结构可以大致分为3组,5个居群不存在明显的亲缘地理关系。该研究结果不仅有助于加深对我国东北地区野生菰资源遗传多样性和遗传结构的认识,同时也为东北野生菰种质资源保护提供一定理论依据。
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关键词
野生菰
SSR标记
生物
统计
分析
软件
遗传多样性
遗传结构
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职称材料
题名
几种常用生物分析软件的特点及其使用简介
被引量：
4
1
作者
韦荣编
邱高峰
张源
机构
上海水产大学渔业学院
上海水产大学工程学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2003年第3期30-34,共5页
文摘
基于代表性、实用性的原则选择了RAPDistance ,PHYLIP ,MEGA ,TREECON ,AMOVA ,DIPLO MO和MAPMAKER等 7种系统发育及遗传图谱构建方面的免费共享生物分析软件 ,简要介绍了它们各自的特点、功能、使用及获得的方法。以期这些软件对于从事生物技术研究的人员具有一定的指导性 ,可操作性。
关键词
生物分析软件
特点
使用简介
系统发育
遗传图谱构建
生物
信息学
Keywords
Software Bioinformatics Application introduction
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构
被引量：
6
2
作者
苏晓娜
王惠梅
黄雪雯
谢小燕
张孝天
牛恋
董琳
江绍琳
吴建利
江绍玫
机构
江西农业大学南昌商学院
中国水稻研究所
黔南民族师范学院
江西财经大学艺术学院
江西农业大学农学院
江西财经大学统计学院
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期579-589,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31460378)~~
文摘
菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料。从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析。同时,详细阐述了POPGENE、STRUCTURE、ARLEQUIN、MEGA及MVSP等统计分析软件的数据录入格式、软件操作方法,为相关领域的研究者提供完整可操作的参考依据。各软件分析结果表明:东北地区野生菰具有较为丰富的遗传多样性(PPB=71.88%、Ao=1.719、Ae=1.332、He=0.201、I=0.313,Gst=0.543);各野生菰居群间的遗传相似性系数和遗传距离分别介于0.605 5~0.955 6和0.045 4~0.501 6;东北地区野生菰的遗传变异主要存在于居群间;5个野生菰居群的遗传结构可以大致分为3组,5个居群不存在明显的亲缘地理关系。该研究结果不仅有助于加深对我国东北地区野生菰资源遗传多样性和遗传结构的认识,同时也为东北野生菰种质资源保护提供一定理论依据。
关键词
野生菰
SSR标记
生物
统计
分析
软件
遗传多样性
遗传结构
Keywords
Zizania latifolia
SSR
statistical analysis software on biological
genetic diversity
genetic structure
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
几种常用生物分析软件的特点及其使用简介
韦荣编
邱高峰
张源
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2003
4
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职称材料
2
利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构
苏晓娜
王惠梅
黄雪雯
谢小燕
张孝天
牛恋
董琳
江绍琳
吴建利
江绍玫
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
6
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