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环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达谱芯片的研究
1
作者
梁韡
周萍
+2 位作者
袁小艳
樊静
张舒
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期1013-1018,共6页
目的研究环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达的影响。方法实验组(EG)和对照组(CG)小鼠分别灌胃给予环丙沙星和生理盐水7d提取肝细胞,采用Agilent基因表达谱芯片技术检测基因表达,对差异表达基因进行生物信息学分析,并挑选部分基因进行荧...
目的研究环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达的影响。方法实验组(EG)和对照组(CG)小鼠分别灌胃给予环丙沙星和生理盐水7d提取肝细胞,采用Agilent基因表达谱芯片技术检测基因表达,对差异表达基因进行生物信息学分析,并挑选部分基因进行荧光定量PCR验证。结果 (1)实验组小鼠肝细胞中共筛选到328个差异表达基因(fold-change>1.5或<0.667)。(2)基因本体论(gene ontology,GO)功能分析显示差异表达基因主要富集在细胞有丝分裂周期、转移酶活性调节、催化活性调节和细胞周期调控等生物学过程;KEGG pathway分析则显示内吞、P53和HIF-1信号通路受到影响。(3)环丙沙星上调SCARA5和OSGIN1基因,下调PFKFB3和SMOC2基因,4个基因表达的荧光定量PCR与芯片测试结果相符。结论环丙沙星影响肿瘤发生发展的生物学过程,并可能通过调控SCARA5、OSGIN1、PFKFB3和SMOC2等肿瘤相关基因发挥抗肿瘤活性。
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关键词
环丙沙星
小鼠原代肝细胞基因芯片
生物信息肿瘤
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题名
环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达谱芯片的研究
1
作者
梁韡
周萍
袁小艳
樊静
张舒
机构
四川抗菌素工业研究所成都大学
出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期1013-1018,共6页
文摘
目的研究环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达的影响。方法实验组(EG)和对照组(CG)小鼠分别灌胃给予环丙沙星和生理盐水7d提取肝细胞,采用Agilent基因表达谱芯片技术检测基因表达,对差异表达基因进行生物信息学分析,并挑选部分基因进行荧光定量PCR验证。结果 (1)实验组小鼠肝细胞中共筛选到328个差异表达基因(fold-change>1.5或<0.667)。(2)基因本体论(gene ontology,GO)功能分析显示差异表达基因主要富集在细胞有丝分裂周期、转移酶活性调节、催化活性调节和细胞周期调控等生物学过程;KEGG pathway分析则显示内吞、P53和HIF-1信号通路受到影响。(3)环丙沙星上调SCARA5和OSGIN1基因,下调PFKFB3和SMOC2基因,4个基因表达的荧光定量PCR与芯片测试结果相符。结论环丙沙星影响肿瘤发生发展的生物学过程,并可能通过调控SCARA5、OSGIN1、PFKFB3和SMOC2等肿瘤相关基因发挥抗肿瘤活性。
关键词
环丙沙星
小鼠原代肝细胞基因芯片
生物信息肿瘤
Keywords
Ciprofloxacin
Mice primary hepatocytes
Expression profile chip
Bioinformatics
Tumor
分类号
R978.1 [医药卫生—药品]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
环丙沙星对小鼠原代肝细胞基因表达谱芯片的研究
梁韡
周萍
袁小艳
樊静
张舒
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
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