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欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1理化性质与结构的生物信息学分析 被引量:2
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作者 曹淑芬 李文 +3 位作者 何颖 邹泽红 李林梅 艾云灿 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1291-1294,1298,共5页
目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、... 目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、信号肽(Signal P 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHCⅡ类抗原表位(Net MHCⅡ2.2 Server)、B细胞抗原表位(ProteanTM5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Lig v 1在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Lig v 1潜在MHCⅡ类抗原表位为30~44区域;B细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Lig v 1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Lig v 1的表达系统,Lig v 1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。 展开更多
关键词 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig V 1 抗原表位
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将现代信息技术融入微生物学综合实验的教学探讨 被引量:2
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作者 韩国民 《现代农业科技》 2018年第16期276-277,共2页
本科生所掌握的现代信息技术与真正的科研应用差距较大,体现在本科论文答辩时图表、参考文献不规范等。结合多年教学经验,笔者将文献管理、信息追踪、图表制作、生物信息学软件使用等多种技能融入微生物学综合实验教学中,显著增强了本... 本科生所掌握的现代信息技术与真正的科研应用差距较大,体现在本科论文答辩时图表、参考文献不规范等。结合多年教学经验,笔者将文献管理、信息追踪、图表制作、生物信息学软件使用等多种技能融入微生物学综合实验教学中,显著增强了本科生论文写作的规范性,并初步培养了生物相关专业本科生科学素养及综合能力。 展开更多
关键词 生物学综合实验 文献管理 信息追踪 图表制作 生物信息学软件
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基因表达模式分析及软件系统 被引量:4
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作者 谢建明 孙啸 +1 位作者 谢雪英 陆祖宏 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据... 研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择和结果可视化等功能 .对于同一组基因表达数据 ,可通过不同的聚类算法的组合 ,提供更多的基因分类信息 。 展开更多
关键词 基因表达模式 聚类分析 软件系统 模糊聚类 生物信息学软件 两两平均连锁聚类法 系统聚类法 自组织特征映射法
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大豆过敏原11S球蛋白G2中A2链结合表位的预测 被引量:10
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作者 刘阳星月 张迪 +3 位作者 姚亚亚 苗字叶 刘壮 李慧静 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第18期152-158,共7页
采用生物信息学软件NCBI Gen Bank数据库、PDB数据库、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等预测11S球蛋白G2中A2链的二级结构和三级结构模型,使用Disco Tope 2.0 Server软件预测B细胞构象表位,发现构象表位多位于无规则卷曲处。定位B细胞线性... 采用生物信息学软件NCBI Gen Bank数据库、PDB数据库、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等预测11S球蛋白G2中A2链的二级结构和三级结构模型,使用Disco Tope 2.0 Server软件预测B细胞构象表位,发现构象表位多位于无规则卷曲处。定位B细胞线性结合表位,结果表明11S球蛋白G2中A2链的可能线性表位有:^(37)KPDNRIE^(43)、^(79)PSYTNGP^(85)、^(114)SQQRGRSQRP^(123)、^(52)WNPNNK^(57)、^(196)QQGGSQSQKGKQQE^(209)、^(241)QGENEEED^(248)、^(267)RKPQQEEDDDDEEEQ^(281)、^(287)TDKGC^(291)。此表位预测为后续制肽、免疫等操作找出更准确的肽序,以便建立适合我国大豆过敏人群的食品大豆过敏原的检测技术。 展开更多
关键词 大豆过敏原 11S球蛋白G2中A2链 生物信息学软件 蛋白质二级结构 三级结构模型 B细胞表位
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minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1靶向融合蛋白促进2型糖尿病条件下钛种植体骨结合的研究
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作者 王君俊 张旻 张茜 《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期398-398,共1页
目的通过生物信息学软件设计融合蛋白minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1,构建钛种植体仿生化生物活性涂层,提高2型糖尿病(T2DM)钛种植体-骨结合力。方法采用同源建模法结合AutoDock软件设计minTBP-1-GQGQGQGQGQGRGD及3 minTBP-1-GSIEGR-IGF-... 目的通过生物信息学软件设计融合蛋白minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1,构建钛种植体仿生化生物活性涂层,提高2型糖尿病(T2DM)钛种植体-骨结合力。方法采用同源建模法结合AutoDock软件设计minTBP-1-GQGQGQGQGQGRGD及3 minTBP-1-GSIEGR-IGF-1融合蛋白,修饰钛种植体并植入T2DM大鼠股骺端。 展开更多
关键词 钛种植体 同源建模法 种植体骨结合 生物活性涂层 融合蛋白 RGD TBP 生物信息学软件
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RNA干扰在抑制PRRSV复制上的研究进展
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作者 樊宏超 姚睿智 +1 位作者 邓清华 马德慧 《山东畜牧兽医》 2016年第4期50-51,共2页
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起猪的一种病毒性疾病,给养猪业造成了巨大的经济损失。
关键词 RNA 养猪业 病毒性疾病 病毒基因组 结构蛋白基因 生物信息学软件 非结构蛋白 基因功能研究 基因合成 抗病毒
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中美中医方证代谢组学技术合作中心成立
7
作者 陆嘉骏 《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期105-105,共1页
2016年1月9日,沃特世公司(Waters)在第四届中医药代谢组学研究高峰论坛上宣布与黑龙江中医药大学共同建立中美中医方证代谢组学技术合作中心。该中心由黑龙江中医药大学副校长王喜军教授领导。
关键词 代谢组学技术 方证 合作中心 沃特世 代谢组学研究 副校长 代谢网络 全新技术 生物信息学软件 方法策略
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