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甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)在生态学中的应用
被引量：
6
1
作者
龚治
张亚楠
+1 位作者
周世豪
符悦冠
《生物安全学报》
2016年第1期7-12,共6页
DNA甲基化是生物体内最为重要的表观遗传修饰形式之一,在生态学上的应用越来越广泛。在收集、整理生态表观遗传学相关文献的基础上,介绍了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)的原理、优势与局限性及其在生态学上的应用和展望。MSAP因其应...
DNA甲基化是生物体内最为重要的表观遗传修饰形式之一,在生态学上的应用越来越广泛。在收集、整理生态表观遗传学相关文献的基础上,介绍了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)的原理、优势与局限性及其在生态学上的应用和展望。MSAP因其应用广泛、操作简便等优点成为研究DNA甲基化水平的有力工具,特别是在探究生物体如何快速适应生境变化以及外来入侵生物如何突破遗传瓶颈等问题上。MSAP技术能够很好地揭示生物种群内部或种群之间的表观遗传差异,是对遗传多样性、遗传变异研究的有力补充。
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关键词
甲基化敏感扩增多态性技术
生态
学
种群变异
生态表观遗传学
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职称材料
我多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制
2
作者
梅志超
位竹君
+2 位作者
于佳慧
冀凤丹
解莉楠
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期321-331,共11页
表观等位基因一般是指仅由DNA甲基化差异引起的表达量不同的等位基因,对植物形态结构和各种生理过程具有重要影响。但自然条件下环境因素对植物表观等位基因的影响还不清楚,同时表观等位基因在植物环境适应性进化中的作用和机制还亟待...
表观等位基因一般是指仅由DNA甲基化差异引起的表达量不同的等位基因,对植物形态结构和各种生理过程具有重要影响。但自然条件下环境因素对植物表观等位基因的影响还不清楚,同时表观等位基因在植物环境适应性进化中的作用和机制还亟待探究。为了在全基组水平鉴定拟南芥(Arabidopsis thaliana)中与特定环境因素相关的表观等位基因,并分析它们参与拟南芥环境适应性进化的可能机制,本研究利用623株拟南芥生态型的转录组、甲基化组和种源地气候数据进行多组学关联分析,并同时进行了蛋白互作网络和基因富集分析。以春季和夏季降水量为例,本研究最终鉴定到5个基因(AGL36、AT2G34100、AT4G09360、LSU4和AT5G56910)可能具有相应的表观等位基因,基因内部或附近特定区域不同甲基化水平对它们的表达可能具有调控作用。其中与种子发育有关的印记基因AGL36首次被发现可能作为表观等位基因参与拟南芥环境适应性进化,其他4个基因均与生物胁迫响应有关。自然条件下降水量能影响当地病虫害的严重程度,而DNA甲基化能通过影响这4个免疫基因的表达来影响拟南芥免疫能力。在长期演化过程中有利于个体适应当地降水模式的表观等位基因受到正向选择,这可能是这些表观等位基因参与拟南芥降水适应性进化的潜在机制。通过蛋白互作网络、GO功能分析和KEGG通路分析,本研究还首次发现LSU4可能与LSU基因家族其他成员一样参与硫代谢网络,并通过影响硫代葡萄糖苷代谢参与拟南芥生物胁迫响应。
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关键词
植物
生态表观遗传学
多组学关联分析
表观
等位基因
环境适应性进化
拟南芥
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职称材料
题名
甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)在生态学中的应用
被引量：
6
1
作者
龚治
张亚楠
周世豪
符悦冠
机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室
海南大学环境与植物保护学院
出处
《生物安全学报》
2016年第1期7-12,共6页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201103026-1
201403075)
文摘
DNA甲基化是生物体内最为重要的表观遗传修饰形式之一,在生态学上的应用越来越广泛。在收集、整理生态表观遗传学相关文献的基础上,介绍了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)的原理、优势与局限性及其在生态学上的应用和展望。MSAP因其应用广泛、操作简便等优点成为研究DNA甲基化水平的有力工具,特别是在探究生物体如何快速适应生境变化以及外来入侵生物如何突破遗传瓶颈等问题上。MSAP技术能够很好地揭示生物种群内部或种群之间的表观遗传差异,是对遗传多样性、遗传变异研究的有力补充。
关键词
甲基化敏感扩增多态性技术
生态
学
种群变异
生态表观遗传学
Keywords
methylation-sensitive amplified polymorphism
ecology
population variation
ecological epigenetics
分类号
Q346 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
我多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制
2
作者
梅志超
位竹君
于佳慧
冀凤丹
解莉楠
机构
东北林业大学生命科学学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期321-331,共11页
基金
国家自然科学基金项目(编号:31871220)
中央高校基本科研业务费专项资金(编号:2572017DA06)
东北林业大学教育教学改革专项资金项目资助。
文摘
表观等位基因一般是指仅由DNA甲基化差异引起的表达量不同的等位基因,对植物形态结构和各种生理过程具有重要影响。但自然条件下环境因素对植物表观等位基因的影响还不清楚,同时表观等位基因在植物环境适应性进化中的作用和机制还亟待探究。为了在全基组水平鉴定拟南芥(Arabidopsis thaliana)中与特定环境因素相关的表观等位基因,并分析它们参与拟南芥环境适应性进化的可能机制,本研究利用623株拟南芥生态型的转录组、甲基化组和种源地气候数据进行多组学关联分析,并同时进行了蛋白互作网络和基因富集分析。以春季和夏季降水量为例,本研究最终鉴定到5个基因(AGL36、AT2G34100、AT4G09360、LSU4和AT5G56910)可能具有相应的表观等位基因,基因内部或附近特定区域不同甲基化水平对它们的表达可能具有调控作用。其中与种子发育有关的印记基因AGL36首次被发现可能作为表观等位基因参与拟南芥环境适应性进化,其他4个基因均与生物胁迫响应有关。自然条件下降水量能影响当地病虫害的严重程度,而DNA甲基化能通过影响这4个免疫基因的表达来影响拟南芥免疫能力。在长期演化过程中有利于个体适应当地降水模式的表观等位基因受到正向选择,这可能是这些表观等位基因参与拟南芥降水适应性进化的潜在机制。通过蛋白互作网络、GO功能分析和KEGG通路分析,本研究还首次发现LSU4可能与LSU基因家族其他成员一样参与硫代谢网络,并通过影响硫代葡萄糖苷代谢参与拟南芥生物胁迫响应。
关键词
植物
生态表观遗传学
多组学关联分析
表观
等位基因
环境适应性进化
拟南芥
Keywords
plant ecological epigenetics
multi-omics association analysis
epiallele
environmental adaptive evolution
Arabidopsis thaliana
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)在生态学中的应用
龚治
张亚楠
周世豪
符悦冠
《生物安全学报》
2016
6
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职称材料
2
我多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制
梅志超
位竹君
于佳慧
冀凤丹
解莉楠
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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职称材料
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