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瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
被引量：
2
1
作者
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
+2 位作者
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第7期38-44,共7页
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、...
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、蛋白序列和系统发育分析。结果显示,28份样本呈现CABYV阳性,检出率为59.57%,巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县、洛浦县的检出率分别为80.00%、28.57%、83.33%、60.00%、37.50%、71.42%、66.67%。克隆测序获得了707 bp的核酸序列,核苷酸多样性值在0.012~0.018之间,所有序列均具有2个开放阅读框(ORF)。ORF1编码199个氨基酸的外壳蛋白(CP),各县/市的序列相似性为99.07%。ORF2编码191个氨基酸的运动蛋白(MP),各县/市的序列相似性为98.80%。基于CP和MP序列构建的系统发育树表明,各县/市得到的所有CP和MP均聚在亚洲分支。CABYV在南疆甜瓜主产区普遍发生,且不同区域核苷酸变异很低,这些地区的CABYV与中国及日本分离物的亲缘关系较近,而与欧洲及中国台湾分离物的亲缘关系较远。
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关键词
瓜类蚜传黄化病毒
甜
瓜
病毒
分布
系统进化
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职称材料
甜瓜瓜类蚜传黄化病毒侵染响应基因鉴定
被引量：
1
2
作者
杨思语
宫子惠
+2 位作者
胡仲远
张明方
杨景华
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期696-707,共12页
瓜类蚜传黄化病毒(cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)是侵染甜瓜(Cucumis melo)等葫芦科作物的重要病毒之一,严重影响作物产量和品质。响应CABYV侵染的关键基因鉴定可为甜瓜抗病毒病育种提供靶基因。本研究用构建的CABYV侵染...
瓜类蚜传黄化病毒(cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)是侵染甜瓜(Cucumis melo)等葫芦科作物的重要病毒之一,严重影响作物产量和品质。响应CABYV侵染的关键基因鉴定可为甜瓜抗病毒病育种提供靶基因。本研究用构建的CABYV侵染性克隆载体接种‘西州蜜’甜瓜,并对0 dpi(days post inoculation,感染后时间)、5 dpi、10 dpi、15 dpi、20 dpi时的甜瓜进行病情鉴定与转录组分析。结果表明:‘西州蜜’在20 dpi时表现出叶片明显褪绿、黄化和增厚等典型症状;基于转录组测序鉴定到响应CABYV侵染的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)为1654个,其中上调基因677个,下调基因977个。对这些响应基因进行基因本体(gene ontology,GO)与京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,发现其主要富集在植物-病原互作、光合作用、淀粉和蔗糖代谢、乙醛酸盐和二羧酸盐代谢等途径和过程。差异基因共表达与互作分析发现,在CABYV侵染后,病原防御反应过程中的关键基因RIN4表达量呈下调趋势,推测其负调控甜瓜对CABYV的侵染响应。本研究结果为解析CABYV侵染甜瓜后基因响应的分子机制和甜瓜抗CABYV育种提供了重要依据。
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关键词
甜
瓜
瓜类蚜传黄化病毒
转录组测序
响应基因
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职称材料
黄瓜瓜类蚜传黄化病毒的检测与分析
被引量：
2
3
作者
张广荣
孙述俊
+1 位作者
文朝慧
何苏琴
《寒旱农业科学》
2023年第11期1074-1078,共5页
黄瓜是我国重要的蔬菜种类之一,目前已报道约36种病毒可侵染黄瓜,其中瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)平均检出率为0.65%。2021年9月在甘肃省白银地区发生病毒病的黄瓜田,发现叶片呈现黄化、明脉症状黄瓜...
黄瓜是我国重要的蔬菜种类之一,目前已报道约36种病毒可侵染黄瓜,其中瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)平均检出率为0.65%。2021年9月在甘肃省白银地区发生病毒病的黄瓜田,发现叶片呈现黄化、明脉症状黄瓜病株。为明确其病原,采集病株后,采用分子生物学方法对病样进行了检测。RT-PCR及病毒CP基因序列测定分析结果表明,该病样受到瓜类蚜传黄化病毒Cucurbit aphid-borne yellows virus(CABYV)的感染。这是继2017年在甘肃酒泉市瓜州县的甜瓜上检测到CABYV后,在甘肃白银市靖远县的黄瓜上再次检测到该病毒。
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关键词
黄
瓜
瓜类蚜传黄化病毒
病毒
病
白银市
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职称材料
题名
瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
被引量：
2
1
作者
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
机构
新疆农业科学院植物保护研究所
阿勒泰市菜篮子工程办公室
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第7期38-44,共7页
基金
新疆维吾尔自治区科技援疆计划项目(2019E0243)
新疆维吾尔自治区公益性科研院所基本科研业务经费资助项目(KYGY2016123)。
文摘
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、蛋白序列和系统发育分析。结果显示,28份样本呈现CABYV阳性,检出率为59.57%,巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县、洛浦县的检出率分别为80.00%、28.57%、83.33%、60.00%、37.50%、71.42%、66.67%。克隆测序获得了707 bp的核酸序列,核苷酸多样性值在0.012~0.018之间,所有序列均具有2个开放阅读框(ORF)。ORF1编码199个氨基酸的外壳蛋白(CP),各县/市的序列相似性为99.07%。ORF2编码191个氨基酸的运动蛋白(MP),各县/市的序列相似性为98.80%。基于CP和MP序列构建的系统发育树表明,各县/市得到的所有CP和MP均聚在亚洲分支。CABYV在南疆甜瓜主产区普遍发生,且不同区域核苷酸变异很低,这些地区的CABYV与中国及日本分离物的亲缘关系较近,而与欧洲及中国台湾分离物的亲缘关系较远。
关键词
瓜类蚜传黄化病毒
甜
瓜
病毒
分布
系统进化
Keywords
Cucurbit aphid-borne yellows virus
Melon
Virus distribution
System evolution
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
甜瓜瓜类蚜传黄化病毒侵染响应基因鉴定
被引量：
1
2
作者
杨思语
宫子惠
胡仲远
张明方
杨景华
机构
浙江大学农业与生物技术学院
浙江大学海南研究院
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期696-707,共12页
基金
海南省重点研发计划项目(ZDYF2021XDNY166)
国家西甜瓜产业技术体系项目(CARS-25-17)。
文摘
瓜类蚜传黄化病毒(cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)是侵染甜瓜(Cucumis melo)等葫芦科作物的重要病毒之一,严重影响作物产量和品质。响应CABYV侵染的关键基因鉴定可为甜瓜抗病毒病育种提供靶基因。本研究用构建的CABYV侵染性克隆载体接种‘西州蜜’甜瓜,并对0 dpi(days post inoculation,感染后时间)、5 dpi、10 dpi、15 dpi、20 dpi时的甜瓜进行病情鉴定与转录组分析。结果表明:‘西州蜜’在20 dpi时表现出叶片明显褪绿、黄化和增厚等典型症状;基于转录组测序鉴定到响应CABYV侵染的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)为1654个,其中上调基因677个,下调基因977个。对这些响应基因进行基因本体(gene ontology,GO)与京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,发现其主要富集在植物-病原互作、光合作用、淀粉和蔗糖代谢、乙醛酸盐和二羧酸盐代谢等途径和过程。差异基因共表达与互作分析发现,在CABYV侵染后,病原防御反应过程中的关键基因RIN4表达量呈下调趋势,推测其负调控甜瓜对CABYV的侵染响应。本研究结果为解析CABYV侵染甜瓜后基因响应的分子机制和甜瓜抗CABYV育种提供了重要依据。
关键词
甜
瓜
瓜类蚜传黄化病毒
转录组测序
响应基因
Keywords
melon
cucurbit aphid-borne yellows virus
transcriptome sequencing
responsive genes
分类号
S652.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
黄瓜瓜类蚜传黄化病毒的检测与分析
被引量：
2
3
作者
张广荣
孙述俊
文朝慧
何苏琴
机构
白银市植保植检站
兰州海关技术中心
甘肃省农业科学院植物保护研究所
出处
《寒旱农业科学》
2023年第11期1074-1078,共5页
基金
兰州海关科研项目(LK-2022-004)。
文摘
黄瓜是我国重要的蔬菜种类之一,目前已报道约36种病毒可侵染黄瓜,其中瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)平均检出率为0.65%。2021年9月在甘肃省白银地区发生病毒病的黄瓜田,发现叶片呈现黄化、明脉症状黄瓜病株。为明确其病原,采集病株后,采用分子生物学方法对病样进行了检测。RT-PCR及病毒CP基因序列测定分析结果表明,该病样受到瓜类蚜传黄化病毒Cucurbit aphid-borne yellows virus(CABYV)的感染。这是继2017年在甘肃酒泉市瓜州县的甜瓜上检测到CABYV后,在甘肃白银市靖远县的黄瓜上再次检测到该病毒。
关键词
黄
瓜
瓜类蚜传黄化病毒
病毒
病
白银市
Keywords
Cucumis sativus
Cucurbit aphid-borne yellows virus
Virus disease
Baiyin
分类号
S436.42 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《中国蔬菜》
北大核心
2020
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甜瓜瓜类蚜传黄化病毒侵染响应基因鉴定
杨思语
宫子惠
胡仲远
张明方
杨景华
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
黄瓜瓜类蚜传黄化病毒的检测与分析
张广荣
孙述俊
文朝慧
何苏琴
《寒旱农业科学》
2023
2
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职称材料
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