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西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
被引量:
3
1
作者
潘宏
高天一
+3 位作者
吴明德
杨龙
张静
李国庆
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期27-35,共9页
利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因...
利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对,筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析,预测部分分泌蛋白的生物学功能。
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关键词
细
菌
性
果斑
病
瓜
类
果斑
病菌
(
西瓜
嗜
酸
菌
)
分泌蛋白
筛选
功能
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职称材料
云南省瓜类细菌性果斑病的鉴定
被引量:
4
2
作者
朱晓媛
王文成
+4 位作者
徐烨
刘雅婷
郑元仙
江常杰
王金龙
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期175-179,共5页
瓜类细菌性果斑病(BFB)是严重危害葫芦科作物的细菌病害。2009—2010年,通过田间调查,发现云南西双版纳州和普洱市部分地区的西瓜(Citrullus lanatus)和甜瓜(Cucumis melo)上出现疑似瓜类细菌性果斑病病害发生。通过菌株分离纯化、菌体...
瓜类细菌性果斑病(BFB)是严重危害葫芦科作物的细菌病害。2009—2010年,通过田间调查,发现云南西双版纳州和普洱市部分地区的西瓜(Citrullus lanatus)和甜瓜(Cucumis melo)上出现疑似瓜类细菌性果斑病病害发生。通过菌株分离纯化、菌体形态和菌落形态特征、革兰氏染色、致病性测定、微生物鉴定系统测定、分子鉴定等方法进行诊断鉴定,结果表明获得的yn2和yn3菌株与西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)的特征一致。确定了云南省已有瓜类细菌性果斑病分布,为云南省首次报道。
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关键词
瓜
类
细
菌
性
果斑
病
噬
酸
菌
属燕麦种
西瓜
亚种
形态特征
微生物鉴定系统
分子鉴定
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职称材料
西瓜食酸菌CusB蛋白的生物信息学分析
被引量:
1
3
作者
刘星
胡金凤
+1 位作者
王希东
刘君
《江苏农业科学》
北大核心
2016年第5期34-37,共4页
为了解西瓜食酸菌耐药结节细胞分化(RND)家族外排转运体中膜融合蛋白CusB生物信息学信息,利用相关软件对西瓜食酸菌和其他革兰氏阴性细菌的CusB蛋白进行理化性质分析,同时对西瓜食酸菌CusB蛋白的疏水性、跨膜结构域、磷酸化位点、信...
为了解西瓜食酸菌耐药结节细胞分化(RND)家族外排转运体中膜融合蛋白CusB生物信息学信息,利用相关软件对西瓜食酸菌和其他革兰氏阴性细菌的CusB蛋白进行理化性质分析,同时对西瓜食酸菌CusB蛋白的疏水性、跨膜结构域、磷酸化位点、信号肽及分泌蛋白亚细胞定位、蛋白质二级结构进行预测。结果表明:西瓜食酸菌CusB蛋白理化性质及进化树分析结果与大肠杆菌较为接近,梨火疫病菌、荧光假单胞菌与其他5种细菌遗传距离较远,预测西瓜食酸菌CusB蛋白有1个区域疏水性较高,存在1个近N端的跨膜结构域,且还有多个磷酸化位点,前1-36个氨基酸残基组成了信号肽,分泌蛋白位于周质空间,二级结构含有较多的α-螺旋、无规则卷曲。对CusB蛋白进行生物信息学分析,既丰富了信息学信息,又有助于在其分子水平的研究,同时也为西瓜食酸菌的抗铜性机理研究提供了依据。
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关键词
瓜
类
细
菌
性
果斑
病
西瓜
食
酸
菌
RND外排转运体
CusB蛋白
生物信息学分析
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职称材料
广西甜瓜细菌性果斑病病原鉴定及16S rDNA序列分析
被引量:
11
4
作者
谢慧婷
李战彪
+4 位作者
秦碧霞
杨世安
崔丽贤
邓铁军
蔡健和
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1698-1703,共6页
【目的】对广西区内疑似甜瓜细菌性果斑病的病原菌进行分离鉴定,明确引起该病害的病原菌,为甜瓜细菌性果斑病的抗病育种及综合防治提供理论依据。【方法】分别采集南宁市和贺州市疑似甜瓜细菌性果斑病的病叶(编号:WM0922)和病果(编号:XD...
【目的】对广西区内疑似甜瓜细菌性果斑病的病原菌进行分离鉴定,明确引起该病害的病原菌,为甜瓜细菌性果斑病的抗病育种及综合防治提供理论依据。【方法】分别采集南宁市和贺州市疑似甜瓜细菌性果斑病的病叶(编号:WM0922)和病果(编号:XD0611)样品,对样品进行分离纯化,并通过测定分离菌株的致病性、观察菌落形态和培养性状、测定其生理生化性状及比对分析16S rDNA序列,对供试病原菌进行鉴定。【结果】从编号WM0922的病叶上分离得到5株菌株,经致病性测定有3株菌株(WM0922-2、WM0922-3和WM0922-4)具有致病性;从编号XD0611的病果上分离得到8株菌株,经致病性测定有4株菌株(XD0611-5、XD0611-6、XD0611-7和XD0611-8)具有致病性;择优选取具有代表性的菌株WM0922-3和XD061 1-7进行后续试验,发现二者均可侵染葫芦子叶,革兰氏反应均为阴性,培养性状及生理生化测定结果一致,对比分析16S rDNA基因序列,与Acidororax citrulli的相似性均在99%以上。【结论】引起甜瓜细菌性果斑病的病原菌为燕麦嗜酸菌西瓜亚种(A.avenae subsp.citrulli)。
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关键词
甜
瓜
果斑
病菌
病原
菌
鉴定
燕麦
嗜
酸
菌
西瓜
亚种
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职称材料
警惕瓜类果斑病进入河南省
5
作者
丁华锋
《河南农业》
2022年第7期34-34,共1页
瓜类果斑病是由西瓜嗜酸菌引起的一种传染性细菌性病害,被农业农村部列入全国农业植物检疫性有害生物,可为害西瓜、甜瓜等多种葫芦科作物。瓜类果斑病是一种毁灭性病害,它一旦暴发会对西瓜、甜瓜的安全生产造成威胁,一般产量损失可达20%...
瓜类果斑病是由西瓜嗜酸菌引起的一种传染性细菌性病害,被农业农村部列入全国农业植物检疫性有害生物,可为害西瓜、甜瓜等多种葫芦科作物。瓜类果斑病是一种毁灭性病害,它一旦暴发会对西瓜、甜瓜的安全生产造成威胁,一般产量损失可达20%,严重的可以造成整个大棚毁掉。一、瓜类果斑病在我国发生分布现状2021年农业农村部发布的《全国农业植物检疫性有害生物分布行政区名录》显示,瓜类果斑病分布于我国16个省(自治区、直辖市),80个县(区、市).
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关键词
瓜
类
果斑
病
细
菌
性病害
葫芦科作物
西瓜
嗜
酸
菌
甜
瓜
产量损失
分布现状
植物检疫性有害生物
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职称材料
题名
西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
被引量:
3
1
作者
潘宏
高天一
吴明德
杨龙
张静
李国庆
机构
华中农业大学植物科学技术学院
天津农学院图书馆
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期27-35,共9页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201003066)
文摘
利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对,筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析,预测部分分泌蛋白的生物学功能。
关键词
细
菌
性
果斑
病
瓜
类
果斑
病菌
(
西瓜
嗜
酸
菌
)
分泌蛋白
筛选
功能
Keywords
bacterial fruit blotch
Acidovorax citrulli
secretory proteins
screening
function
分类号
S432.42 [农业科学—植物病理学]
S436.42 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
云南省瓜类细菌性果斑病的鉴定
被引量:
4
2
作者
朱晓媛
王文成
徐烨
刘雅婷
郑元仙
江常杰
王金龙
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
云南大学生态学与地植物学研究所
经济林木种质改良与资源综合利用湖北省重点实验室
云南省烟草公司临沧市公司
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期175-179,共5页
基金
云南省科技厅社会发展科技计划项目
经济林木种质改良与资源综合利用湖北省重点实验室开放基金(20011BLKF244)
文摘
瓜类细菌性果斑病(BFB)是严重危害葫芦科作物的细菌病害。2009—2010年,通过田间调查,发现云南西双版纳州和普洱市部分地区的西瓜(Citrullus lanatus)和甜瓜(Cucumis melo)上出现疑似瓜类细菌性果斑病病害发生。通过菌株分离纯化、菌体形态和菌落形态特征、革兰氏染色、致病性测定、微生物鉴定系统测定、分子鉴定等方法进行诊断鉴定,结果表明获得的yn2和yn3菌株与西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)的特征一致。确定了云南省已有瓜类细菌性果斑病分布,为云南省首次报道。
关键词
瓜
类
细
菌
性
果斑
病
噬
酸
菌
属燕麦种
西瓜
亚种
形态特征
微生物鉴定系统
分子鉴定
Keywords
bacterial fruit blotch of melons(BFB)
Acidovorax citrulli
morphological characteristic
microbial identification system
molecular identification
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
西瓜食酸菌CusB蛋白的生物信息学分析
被引量:
1
3
作者
刘星
胡金凤
王希东
刘君
机构
新疆农业大学农学院
新疆农业大学林学与园艺学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2016年第5期34-37,共4页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(编号:2015211A020)
文摘
为了解西瓜食酸菌耐药结节细胞分化(RND)家族外排转运体中膜融合蛋白CusB生物信息学信息,利用相关软件对西瓜食酸菌和其他革兰氏阴性细菌的CusB蛋白进行理化性质分析,同时对西瓜食酸菌CusB蛋白的疏水性、跨膜结构域、磷酸化位点、信号肽及分泌蛋白亚细胞定位、蛋白质二级结构进行预测。结果表明:西瓜食酸菌CusB蛋白理化性质及进化树分析结果与大肠杆菌较为接近,梨火疫病菌、荧光假单胞菌与其他5种细菌遗传距离较远,预测西瓜食酸菌CusB蛋白有1个区域疏水性较高,存在1个近N端的跨膜结构域,且还有多个磷酸化位点,前1-36个氨基酸残基组成了信号肽,分泌蛋白位于周质空间,二级结构含有较多的α-螺旋、无规则卷曲。对CusB蛋白进行生物信息学分析,既丰富了信息学信息,又有助于在其分子水平的研究,同时也为西瓜食酸菌的抗铜性机理研究提供了依据。
关键词
瓜
类
细
菌
性
果斑
病
西瓜
食
酸
菌
RND外排转运体
CusB蛋白
生物信息学分析
分类号
S182 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
广西甜瓜细菌性果斑病病原鉴定及16S rDNA序列分析
被引量:
11
4
作者
谢慧婷
李战彪
秦碧霞
杨世安
崔丽贤
邓铁军
蔡健和
机构
广西农业科学院植物保护研究所/广西作物病虫害生物学重点实验室
广西大学农学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1698-1703,共6页
基金
国家现代农业产业技术体系广西特色水果创新团队项目(nycytxgxcxtd-04-19-2)
广西农业科学院科技发展基金项目(2015JZ58)
文摘
【目的】对广西区内疑似甜瓜细菌性果斑病的病原菌进行分离鉴定,明确引起该病害的病原菌,为甜瓜细菌性果斑病的抗病育种及综合防治提供理论依据。【方法】分别采集南宁市和贺州市疑似甜瓜细菌性果斑病的病叶(编号:WM0922)和病果(编号:XD0611)样品,对样品进行分离纯化,并通过测定分离菌株的致病性、观察菌落形态和培养性状、测定其生理生化性状及比对分析16S rDNA序列,对供试病原菌进行鉴定。【结果】从编号WM0922的病叶上分离得到5株菌株,经致病性测定有3株菌株(WM0922-2、WM0922-3和WM0922-4)具有致病性;从编号XD0611的病果上分离得到8株菌株,经致病性测定有4株菌株(XD0611-5、XD0611-6、XD0611-7和XD0611-8)具有致病性;择优选取具有代表性的菌株WM0922-3和XD061 1-7进行后续试验,发现二者均可侵染葫芦子叶,革兰氏反应均为阴性,培养性状及生理生化测定结果一致,对比分析16S rDNA基因序列,与Acidororax citrulli的相似性均在99%以上。【结论】引起甜瓜细菌性果斑病的病原菌为燕麦嗜酸菌西瓜亚种(A.avenae subsp.citrulli)。
关键词
甜
瓜
果斑
病菌
病原
菌
鉴定
燕麦
嗜
酸
菌
西瓜
亚种
Keywords
melon
bacterial fruit blotch
pathogen identification
Acidororax avenae subsp.citrulli
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
警惕瓜类果斑病进入河南省
5
作者
丁华锋
机构
河南省植物保护植物检疫站
出处
《河南农业》
2022年第7期34-34,共1页
文摘
瓜类果斑病是由西瓜嗜酸菌引起的一种传染性细菌性病害,被农业农村部列入全国农业植物检疫性有害生物,可为害西瓜、甜瓜等多种葫芦科作物。瓜类果斑病是一种毁灭性病害,它一旦暴发会对西瓜、甜瓜的安全生产造成威胁,一般产量损失可达20%,严重的可以造成整个大棚毁掉。一、瓜类果斑病在我国发生分布现状2021年农业农村部发布的《全国农业植物检疫性有害生物分布行政区名录》显示,瓜类果斑病分布于我国16个省(自治区、直辖市),80个县(区、市).
关键词
瓜
类
果斑
病
细
菌
性病害
葫芦科作物
西瓜
嗜
酸
菌
甜
瓜
产量损失
分布现状
植物检疫性有害生物
分类号
S43 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
潘宏
高天一
吴明德
杨龙
张静
李国庆
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
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职称材料
2
云南省瓜类细菌性果斑病的鉴定
朱晓媛
王文成
徐烨
刘雅婷
郑元仙
江常杰
王金龙
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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职称材料
3
西瓜食酸菌CusB蛋白的生物信息学分析
刘星
胡金凤
王希东
刘君
《江苏农业科学》
北大核心
2016
1
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职称材料
4
广西甜瓜细菌性果斑病病原鉴定及16S rDNA序列分析
谢慧婷
李战彪
秦碧霞
杨世安
崔丽贤
邓铁军
蔡健和
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
11
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职称材料
5
警惕瓜类果斑病进入河南省
丁华锋
《河南农业》
2022
0
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职称材料
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