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应用16SrDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性
被引量：
2
1
作者
王国娟
曹妍
+3 位作者
王芳
马焕成
郑艳玲
伍建榕
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期115-120,共6页
苏铁为古老孑遗植物，被誉为“植物界的大熊猫”和“活化石”。为了研究苏铁珊瑚状根内生放线菌的多样性，通过16SrDNA克隆文库开展了珊瑚状根内生放线菌种群多样性研究，从16SrDNA克隆文库中随机挑选了164个克隆子进行序列测定，对测...
苏铁为古老孑遗植物，被誉为“植物界的大熊猫”和“活化石”。为了研究苏铁珊瑚状根内生放线菌的多样性，通过16SrDNA克隆文库开展了珊瑚状根内生放线菌种群多样性研究，从16SrDNA克隆文库中随机挑选了164个克隆子进行序列测定，对测序结果进行了Blast对比，结果表明，苏铁珊瑚状根中放线菌多样性十分丰富，存在5个目7个科10个属，主要类群为短小杆菌属Curtobacterium、利夫森氏菌属Leifsonia、考克氏菌Kocuria、鸟氨酸微菌属Ornithinimicrobium、微球菌属Micrococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、链霉菌属Streptomyces、拟诺卡氏菌属Nocardiopsis、芽球菌属Blastococcus；克隆得到的内生放线菌优势菌为短小杆菌属Curtobacterium，其次为拟诺卡氏菌属Nocardiopsis和链霉菌属Streptomyces。其中68株内生放线菌是能分离培养的，经16SrDNA片段测序分析，结果表明这些内生放线菌分别与GenBank中已知属相似性达97％-100％；其余的序列相似性低于97％，表明苏铁珊瑚状根中可能存在着放线菌新种。
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关键词
苏铁
珊瑚状根
16S
rDNA克隆文库
内生放线菌
种群多样性
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职称材料
苏铁珊瑚状根及根周围土壤中蓝细菌的PCR指纹图谱
被引量：
2
2
作者
陈彬
宋铁英
郑伟文
《福建农业学报》
CAS
2004年第1期58-61,共4页
以福建苏铁(Cycas revoluta)珊瑚状根及根周围土壤的蓝细菌分离物的悬浮液作为PCR反应的模板,用引物STRRmod、STRRspecial和Hip TG对分离物进行PCR扩增,比较其指纹图谱。结果表明,苏铁珊瑚状根内蓝细菌的指纹图谱不同于其周围土壤中蓝...
以福建苏铁(Cycas revoluta)珊瑚状根及根周围土壤的蓝细菌分离物的悬浮液作为PCR反应的模板,用引物STRRmod、STRRspecial和Hip TG对分离物进行PCR扩增,比较其指纹图谱。结果表明,苏铁珊瑚状根内蓝细菌的指纹图谱不同于其周围土壤中蓝细菌的指纹图谱;也证实了同一地方不同株苏铁根周围的土壤蓝细菌具有多态性,苏铁珊瑚状根的不同分支的蓝细菌也具有多态性。
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关键词
苏铁
珊瑚状根
根际土壤
蓝细菌
PCR
指纹图谱
多态性
共生固氮
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职称材料
蓝细菌与福建苏铁(Cycad revoluta)的侵染性重组的研究
被引量：
1
3
作者
陈彬
郑斯平
郑伟文
《福建农业学报》
CAS
2007年第4期350-353,共4页
将苏铁珊瑚状根及根周围的土壤中分离的蓝细菌分离物与福建苏铁(Cycas revoluta)在实验室条件下进行重组。通过比较重组前后蓝细菌分离物的STRR指纹图谱和16S rRNA的序列得蓝细菌分离物RZHA4能重新侵染苏铁的珊瑚状根。通过NCBI比对,蓝...
将苏铁珊瑚状根及根周围的土壤中分离的蓝细菌分离物与福建苏铁(Cycas revoluta)在实验室条件下进行重组。通过比较重组前后蓝细菌分离物的STRR指纹图谱和16S rRNA的序列得蓝细菌分离物RZHA4能重新侵染苏铁的珊瑚状根。通过NCBI比对,蓝细菌分离物RZHA4的16S rRNA序列与蓝细菌NostocaceaeIL13-1的相似性为99%。
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关键词
珊瑚状根
蓝细菌
STRR
16S
RRNA
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职称材料
题名
应用16SrDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性
被引量：
2
1
作者
王国娟
曹妍
王芳
马焕成
郑艳玲
伍建榕
机构
国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室
西南林业大学林学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期115-120,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31360198
31260175)
+2 种基金
云南省高校干热河谷植被恢复创新团队项目
云南省重点学科森林保护学项目(XKZ200905)
云南省高等学校森林病虫害综合治理教学团队项目
文摘
苏铁为古老孑遗植物，被誉为“植物界的大熊猫”和“活化石”。为了研究苏铁珊瑚状根内生放线菌的多样性，通过16SrDNA克隆文库开展了珊瑚状根内生放线菌种群多样性研究，从16SrDNA克隆文库中随机挑选了164个克隆子进行序列测定，对测序结果进行了Blast对比，结果表明，苏铁珊瑚状根中放线菌多样性十分丰富，存在5个目7个科10个属，主要类群为短小杆菌属Curtobacterium、利夫森氏菌属Leifsonia、考克氏菌Kocuria、鸟氨酸微菌属Ornithinimicrobium、微球菌属Micrococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、链霉菌属Streptomyces、拟诺卡氏菌属Nocardiopsis、芽球菌属Blastococcus；克隆得到的内生放线菌优势菌为短小杆菌属Curtobacterium，其次为拟诺卡氏菌属Nocardiopsis和链霉菌属Streptomyces。其中68株内生放线菌是能分离培养的，经16SrDNA片段测序分析，结果表明这些内生放线菌分别与GenBank中已知属相似性达97％-100％；其余的序列相似性低于97％，表明苏铁珊瑚状根中可能存在着放线菌新种。
关键词
苏铁
珊瑚状根
16S
rDNA克隆文库
内生放线菌
种群多样性
Keywords
Cycas spp.
comlloid root
16S rDNA clone library
endophytic acfinomycetes diversity
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
苏铁珊瑚状根及根周围土壤中蓝细菌的PCR指纹图谱
被引量：
2
2
作者
陈彬
宋铁英
郑伟文
机构
福建省农业科学院生物技术中心
出处
《福建农业学报》
CAS
2004年第1期58-61,共4页
基金
福建省科技厅重点项目(2001Z026)
文摘
以福建苏铁(Cycas revoluta)珊瑚状根及根周围土壤的蓝细菌分离物的悬浮液作为PCR反应的模板,用引物STRRmod、STRRspecial和Hip TG对分离物进行PCR扩增,比较其指纹图谱。结果表明,苏铁珊瑚状根内蓝细菌的指纹图谱不同于其周围土壤中蓝细菌的指纹图谱;也证实了同一地方不同株苏铁根周围的土壤蓝细菌具有多态性,苏铁珊瑚状根的不同分支的蓝细菌也具有多态性。
关键词
苏铁
珊瑚状根
根际土壤
蓝细菌
PCR
指纹图谱
多态性
共生固氮
Keywords
Cyanobacteria
Cycas revoluta
PCR fingerprinting
Diversity
分类号
Q939.113 [生物学—微生物学]
Q949.62 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
蓝细菌与福建苏铁(Cycad revoluta)的侵染性重组的研究
被引量：
1
3
作者
陈彬
郑斯平
郑伟文
机构
福建省农业科学院生物技术研究所
出处
《福建农业学报》
CAS
2007年第4期350-353,共4页
基金
福建省科技计划项目(2001Z026)
文摘
将苏铁珊瑚状根及根周围的土壤中分离的蓝细菌分离物与福建苏铁(Cycas revoluta)在实验室条件下进行重组。通过比较重组前后蓝细菌分离物的STRR指纹图谱和16S rRNA的序列得蓝细菌分离物RZHA4能重新侵染苏铁的珊瑚状根。通过NCBI比对,蓝细菌分离物RZHA4的16S rRNA序列与蓝细菌NostocaceaeIL13-1的相似性为99%。
关键词
珊瑚状根
蓝细菌
STRR
16S
RRNA
Keywords
coralloid root
cyanohacteria
STRR
16S rRNA
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用16SrDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性
王国娟
曹妍
王芳
马焕成
郑艳玲
伍建榕
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
苏铁珊瑚状根及根周围土壤中蓝细菌的PCR指纹图谱
陈彬
宋铁英
郑伟文
《福建农业学报》
CAS
2004
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
蓝细菌与福建苏铁(Cycad revoluta)的侵染性重组的研究
陈彬
郑斯平
郑伟文
《福建农业学报》
CAS
2007
1
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