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环羟基化双加氧酶α亚基保守序列的克隆及基因定位
1
作者
钟鸣
裴铁浓
+4 位作者
李浩戈
陈丽静
马慧
郭志富
张丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期69-70,79,共3页
利用PCR法成功地克隆了不动杆菌(Acinetobacter)L2菌株的环羟基化双加氧酶α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。序列分析结果表明该片段与3苯-基丙酸盐双加氧酶α亚基、苯1,2双-加氧酶α亚基、甲苯2,3双-加氧酶α亚基的氨基酸序...
利用PCR法成功地克隆了不动杆菌(Acinetobacter)L2菌株的环羟基化双加氧酶α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。序列分析结果表明该片段与3苯-基丙酸盐双加氧酶α亚基、苯1,2双-加氧酶α亚基、甲苯2,3双-加氧酶α亚基的氨基酸序列同源性分别为72%、75%和78%。Southern杂交将菌株L2的环羟基化双加氧酶α亚基基因定位在L2质粒的不同酶切片段上。
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关键词
环羟基化双加氧酶
α亚基
克隆
基因定位
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职称材料
双加氧酶α亚基保守序列克隆及探针制备
2
作者
钟鸣
董章成
+3 位作者
郭致富
马慧
陈丽静
张丽
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第3期86-89,共4页
制备地高辛标记的环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列探针。利用PCR法成功地克隆了环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。利用PCR法制备地高辛标记探针,对新标记的探针进行检测,结果显示其标记效率在0.1 pg/μL;...
制备地高辛标记的环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列探针。利用PCR法成功地克隆了环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。利用PCR法制备地高辛标记探针,对新标记的探针进行检测,结果显示其标记效率在0.1 pg/μL;敏感性检测表明,对同源DNA的检出限量为100 pg;对提取的副溶血性孤菌质粒DNA、短小芽胞杆菌总DNA杂交均呈阴性,说明该探针具有较强的特异性。
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关键词
环羟基化双加氧酶
克隆
基因探针
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职称材料
冶炼企业周边农田土壤的多环芳烃污染及其细菌群落效应
被引量：
7
3
作者
吴宇澄
林先贵
+2 位作者
朱清禾
曾军
丁庆旻
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期484-491,共8页
多环芳烃是一类持久性有机污染物,进入土壤后可能产生多方面生态效应。为研究多环芳烃对土壤微生物的影响,选取南京某冶炼企业周边农田样品,在分析污染物含量基础上,采用高通量测序、定量PCR等方法综合评价了土壤细菌多样性和组成以及...
多环芳烃是一类持久性有机污染物,进入土壤后可能产生多方面生态效应。为研究多环芳烃对土壤微生物的影响,选取南京某冶炼企业周边农田样品,在分析污染物含量基础上,采用高通量测序、定量PCR等方法综合评价了土壤细菌多样性和组成以及多环芳烃降解细菌丰度等特征。17个土壤样品中,多环芳烃总量为0.25~31.08 mg·kg-1,并具有随污染源距离增加而降低的空间分布特征。与土壤理化性质如p H相比较,多环芳烃污染对土壤细菌的总体多样性和群落组成影响不显著。进一步分析发现多环芳烃与潜在降解微生物的相对丰度和降解功能基因(芳香环羟基化双加氧酶,PAH-RHDα)拷贝数显著正相关。污染较重样品的克隆、测序分析表明,土壤中PAH-RHDα基因主要属于革兰氏阳性细菌nid A3/fad A1类群,且与分支杆菌相关序列较为接近。这些结果综合评价了冶炼企业周边农田土壤多环芳烃污染对微生物群落的影响,提示土壤污染在多环芳烃潜在降解细菌中的富集作用,将为后续污染土壤生物修复提供重要科学依据。
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关键词
多
环
芳烃
土壤细菌
芳香
环羟基化双加氧酶
分枝杆菌
群落效应
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职称材料
题名
环羟基化双加氧酶α亚基保守序列的克隆及基因定位
1
作者
钟鸣
裴铁浓
李浩戈
陈丽静
马慧
郭志富
张丽
机构
沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期69-70,79,共3页
基金
辽宁省自然科学基金(20062111)
辽宁省重点实验室专项资金计划项目
中国科学院陆地生态过程重点实验室开放课题资助项目
文摘
利用PCR法成功地克隆了不动杆菌(Acinetobacter)L2菌株的环羟基化双加氧酶α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。序列分析结果表明该片段与3苯-基丙酸盐双加氧酶α亚基、苯1,2双-加氧酶α亚基、甲苯2,3双-加氧酶α亚基的氨基酸序列同源性分别为72%、75%和78%。Southern杂交将菌株L2的环羟基化双加氧酶α亚基基因定位在L2质粒的不同酶切片段上。
关键词
环羟基化双加氧酶
α亚基
克隆
基因定位
Keywords
Ring-hydroxylation dioxygenaseα subunit Cloning Genelocation
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
双加氧酶α亚基保守序列克隆及探针制备
2
作者
钟鸣
董章成
郭致富
马慧
陈丽静
张丽
机构
沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第3期86-89,共4页
基金
辽宁省自然科学基金项目(20062111)
辽宁省重点实验室专项资金计划项目
中国科学院陆地生态过程重点实验室开放课题资助项目
文摘
制备地高辛标记的环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列探针。利用PCR法成功地克隆了环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。利用PCR法制备地高辛标记探针,对新标记的探针进行检测,结果显示其标记效率在0.1 pg/μL;敏感性检测表明,对同源DNA的检出限量为100 pg;对提取的副溶血性孤菌质粒DNA、短小芽胞杆菌总DNA杂交均呈阴性,说明该探针具有较强的特异性。
关键词
环羟基化双加氧酶
克隆
基因探针
Keywords
ring-hydroxylation dioxygenase
cloning
gene probe
分类号
Q939.96 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
冶炼企业周边农田土壤的多环芳烃污染及其细菌群落效应
被引量：
7
3
作者
吴宇澄
林先贵
朱清禾
曾军
丁庆旻
机构
中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室
中国科学院南京土壤研究所-香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室
出处
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期484-491,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB441106)
国家自然科学基金(41371310
+2 种基金
41201301)
江苏省自然科学基金(BK20131462)
土壤与农业可持续发展国家重点实验室优秀青年人才项目(Y212000014)
文摘
多环芳烃是一类持久性有机污染物,进入土壤后可能产生多方面生态效应。为研究多环芳烃对土壤微生物的影响,选取南京某冶炼企业周边农田样品,在分析污染物含量基础上,采用高通量测序、定量PCR等方法综合评价了土壤细菌多样性和组成以及多环芳烃降解细菌丰度等特征。17个土壤样品中,多环芳烃总量为0.25~31.08 mg·kg-1,并具有随污染源距离增加而降低的空间分布特征。与土壤理化性质如p H相比较,多环芳烃污染对土壤细菌的总体多样性和群落组成影响不显著。进一步分析发现多环芳烃与潜在降解微生物的相对丰度和降解功能基因(芳香环羟基化双加氧酶,PAH-RHDα)拷贝数显著正相关。污染较重样品的克隆、测序分析表明,土壤中PAH-RHDα基因主要属于革兰氏阳性细菌nid A3/fad A1类群,且与分支杆菌相关序列较为接近。这些结果综合评价了冶炼企业周边农田土壤多环芳烃污染对微生物群落的影响,提示土壤污染在多环芳烃潜在降解细菌中的富集作用,将为后续污染土壤生物修复提供重要科学依据。
关键词
多
环
芳烃
土壤细菌
芳香
环羟基化双加氧酶
分枝杆菌
群落效应
Keywords
polycyclic aromatic hydrocarbons
soil bacteria
PAH-ring hydroxylating dioxygenase
Mycobacterium
community effect
分类号
Q142 [生物学—生态学]
X53 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
环羟基化双加氧酶α亚基保守序列的克隆及基因定位
钟鸣
裴铁浓
李浩戈
陈丽静
马慧
郭志富
张丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
双加氧酶α亚基保守序列克隆及探针制备
钟鸣
董章成
郭致富
马慧
陈丽静
张丽
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2008
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
冶炼企业周边农田土壤的多环芳烃污染及其细菌群落效应
吴宇澄
林先贵
朱清禾
曾军
丁庆旻
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
7
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