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β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析
被引量：
1
1
作者
肖亦舒
许兰
+4 位作者
刘春亚
杜乐
孙元田
李冬娜
任立成
《海南医学院学报》
CAS
2022年第24期1841-1847,共7页
目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式。为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调...
目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式。为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调控元件进行筛选,对β-珠蛋白基因动态调控转换机制进行深入研究。方法:早幼粒细胞经全反式维甲酸诱导分化,以β-珠蛋白基因启动子区及LCR作为环形染色体构象捕获(4C)技术分析的靶位点,通过测序技术与调控元件分析结合,在全基因组筛选与β-珠蛋白家族基因座位发生相互作用关系的位点。结果:根据4C测序结果,筛选出与HBD启动子区及LCR存在相互作用关系的位点。通过染色体构象捕获(3C)验证,结果与测序结果一致。通过甲醛辅助分离调控元件技术及Epiregio在线网站对调控元件功能性分析,结果表明筛选位点AC105129.4、AL354707.17、AC078785.22及AC021646.35均为潜在的参与β-珠蛋白基因调控元件。结论:4C筛选位点与锚定位点相互作用表明了β-珠蛋白家族基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。
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关键词
Β-珠蛋白基因
环形染色体构象捕获
染色
质相互作用
染色体
构象
捕获
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职称材料
题名
β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析
被引量：
1
1
作者
肖亦舒
许兰
刘春亚
杜乐
孙元田
李冬娜
任立成
机构
海南医学院生物学教研室
出处
《海南医学院学报》
CAS
2022年第24期1841-1847,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31660318)
海南省自然科学基金高层次人才项目(820RC638)
海南省研究生创新课题(Hys2020-377)。
文摘
目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式。为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调控元件进行筛选,对β-珠蛋白基因动态调控转换机制进行深入研究。方法:早幼粒细胞经全反式维甲酸诱导分化,以β-珠蛋白基因启动子区及LCR作为环形染色体构象捕获(4C)技术分析的靶位点,通过测序技术与调控元件分析结合,在全基因组筛选与β-珠蛋白家族基因座位发生相互作用关系的位点。结果:根据4C测序结果,筛选出与HBD启动子区及LCR存在相互作用关系的位点。通过染色体构象捕获(3C)验证,结果与测序结果一致。通过甲醛辅助分离调控元件技术及Epiregio在线网站对调控元件功能性分析,结果表明筛选位点AC105129.4、AL354707.17、AC078785.22及AC021646.35均为潜在的参与β-珠蛋白基因调控元件。结论:4C筛选位点与锚定位点相互作用表明了β-珠蛋白家族基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。
关键词
Β-珠蛋白基因
环形染色体构象捕获
染色
质相互作用
染色体
构象
捕获
Keywords
Globin gene
Circular chromosome conformation capture
Chromatin interaction
Chromosome conformation capture
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
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出处
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被引量
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1
β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析
肖亦舒
许兰
刘春亚
杜乐
孙元田
李冬娜
任立成
《海南医学院学报》
CAS
2022
1
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