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基于环境DNA技术的元江鱼类生物多样性研究
1
作者 朱书礼 陈蔚涛 +3 位作者 李跃飞 武智 李捷 刘亚秋 《南方水产科学》 北大核心 2026年第1期60-73,共14页
元江是云南地区最主要的河流之一,拥有丰富的鱼类资源,近年来受人类活动影响,元江鱼类资源呈衰退趋势。本研究通过利用环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术对元江鱼类进行调查,为元江鱼类资源管理和保护提供基础数据。2023年10月在元... 元江是云南地区最主要的河流之一,拥有丰富的鱼类资源,近年来受人类活动影响,元江鱼类资源呈衰退趋势。本研究通过利用环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术对元江鱼类进行调查,为元江鱼类资源管理和保护提供基础数据。2023年10月在元江设置了16个站位采集水样,共检出鱼类47种,隶属于5目15科40属,包括红(鱼丕)(Bagarius rutilus)和斑鳠(Hemibagrus guttatus)等珍稀濒危鱼类,并检出8种外来鱼类。α多样性分析显示,各站位Shannon-Wiener指数为0.92~2.41,Simpson指数为0.44~0.88,Pielou均匀度指数为0.35~0.60,Margalef指数为0.30~1.16。采用层次聚类(Cluster)和非度量多维尺度分析(NMDS)方法对鱼类群落空间分布特征进行分析,结果显示鱼类群落在空间分布上存在差异,各站位从下游至上游分为3组,表现为在地理空间上相近的站位聚在一起。通过相似性百分比分析(SIMPER)物种对各组间差异的贡献,结果表明翘嘴鲌(Culter alburnus)、宽额鳢(Channa gachua)、鲮(Cirrhinus molitorella)和棒花鱼(Abbottina rivularis)等是造成各组间差异的主要种类。采用冗余分析方法(RDA)分析了鱼类多样性与环境因子的关系,发现元江鱼类群落主要受海拔、盐度、电导率、总溶解固体、氧化还原电位和总磷等环境因子影响。研究表明,环境DNA技术可有效分析元江鱼类的种类组成和分布,是开展元江鱼类生物多样性监测和保护的重要手段。 展开更多
关键词 环境dna(edna) 鱼类多样性 群落结构 环境因子 元江
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人工繁育环境中长江鲟繁殖活动的环境DNA动态研究
2
作者 申晓雪 满李君 +3 位作者 刘青娟 李莎 刘焕章 俞丹 《水生生物学报》 北大核心 2026年第4期19-28,共10页
本研究基于线粒体DNA(mtDNA)和核基因DNA(nuDNA)的数字PCR技术,揭示了国家一级重点保护鱼类长江鲟(Acipenser dabryanus)在人工繁殖过程中的环境DNA动态变化规律。通过设计长江鲟特异性引物与TaqMan探针,采集不同繁殖阶段的环境DNA样品,... 本研究基于线粒体DNA(mtDNA)和核基因DNA(nuDNA)的数字PCR技术,揭示了国家一级重点保护鱼类长江鲟(Acipenser dabryanus)在人工繁殖过程中的环境DNA动态变化规律。通过设计长江鲟特异性引物与TaqMan探针,采集不同繁殖阶段的环境DNA样品,对mtDNA、nuDNA的数字PCR产物浓度及核质比(nuDNA/mtDNA)的变化进行了定量分析。结果表明,mtDNA和nuDNA浓度均在繁殖发生后快速达到峰值,其中雄鱼挤精后mtDNA浓度升至繁殖前水平的27倍,nuDNA浓度升至130倍;在雌鱼挤卵后,mtDNA和nuDNA浓度分别达到繁殖前水平的8和13倍。同样,雄、雌鱼池的核质比在挤精和挤卵后迅速升至峰值(0.14和0.09)。整体来说,雄、雌鱼池峰值时的mtDNA浓度分别为nuDNA的12与11倍,且可在繁殖结束后持续检出24—36h,稳定性与持久性更强;nuDNA则在繁殖行为发生后迅速达到峰值并于12h内快速衰减,对瞬时繁殖行为的敏感性更强。因此,环境DNA监测能够精准捕捉长江鲟繁殖活动的分子信号及变化过程,为揭示长江鲟等珍稀濒危鱼类的繁殖生态特征及非侵入式监测提供了重要技术支撑。 展开更多
关键词 环境dna 繁殖 数字PCR MTdna nudna 长江鲟
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基于环境DNA技术检测木材中松材线虫的应用研究
3
作者 王旭 潘玥 +4 位作者 梁佳星 陈井生 葛建军 王建军 杨宁 《沈阳农业大学学报》 北大核心 2026年第2期48-55,共8页
[目的]旨在基于环境DNA(Environment DNA,eDNA)技术,筛选适用于富集松材线虫eDNA的高效滤膜,建立一种能够从大量木材中快速检测松材线虫的方法。[方法]以松材线虫组织研磨液为材料,比较混合纤维素膜(MCE)、聚醚砜膜(PES)和醋酸纤维素膜(... [目的]旨在基于环境DNA(Environment DNA,eDNA)技术,筛选适用于富集松材线虫eDNA的高效滤膜,建立一种能够从大量木材中快速检测松材线虫的方法。[方法]以松材线虫组织研磨液为材料,比较混合纤维素膜(MCE)、聚醚砜膜(PES)和醋酸纤维素膜(CA)对松材线虫核酸的富集效率,通过实时荧光PCR检测富集后的eDNA,评估不同滤膜的富集效率。进一步采用筛选出的最佳滤膜,对5个不同来源的木材样本(每份50 g)进行eDNA富集,并利用松材线虫特异性引物和探针进行实时荧光PCR检测,以验证该方法的实际应用效果。[结果]MCE、PES和CA这3种滤膜均能富集到松材线虫eDNA,其中MCE和PES的富集效果显著优于CA,而二者之间无显著差异;在低线虫浓度条件下,MCE滤膜表现出最高的回收率。基于此,选用MCE膜对实际木材样本进行eDNA富集与检测。结果显示,所有木材样本的eDNA检测结果与其对应木屑样本的分子检测结果完全一致,证实了该方法的可靠性。[结论]建立的基于eDNA技术与MCE滤膜富集的方法,可有效从大量罹病松木中检测松材线虫,适用于木材样本中松材线虫的高通量、快速筛查,为松材线虫的早期监测与防控提供了可行技术手段。 展开更多
关键词 环境dna 富集滤膜 松材线虫 检测效率
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基于环境DNA技术的花鳗鲡特异性检测及生物量评估
4
作者 尹晓强 曾金凤 +6 位作者 张娜 刘宇明 张鑫 张思源 罗佳林 谢松光 宋一清 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第2期195-203,共9页
基于eDNA定量技术建立花鳗鲡(Anguilla marmorata)种群丰度的qPCR检测方法,为野外种群资源评估提供一种快速、无损的工具,为花鳗鲡的种群保护和恢复提供科学基础。基于eDNA定量技术,根据花鳗鲡线粒体D-loop基因序列设计了特异性引物和Ta... 基于eDNA定量技术建立花鳗鲡(Anguilla marmorata)种群丰度的qPCR检测方法,为野外种群资源评估提供一种快速、无损的工具,为花鳗鲡的种群保护和恢复提供科学基础。基于eDNA定量技术,根据花鳗鲡线粒体D-loop基因序列设计了特异性引物和TaqMan探针,探究了个体密度与eDNA浓度关系以及eDNA降解规律。结果显示,创建的qPCR检测方法能特异地对花鳗鲡样本进行阳性扩增;构建的质粒标准品,最低检测浓度可达4.095×10^(-7) ng/μL,根据稀释后的标准品浓度对数和临界循环值(Ct)拟合了标准曲线,扩增效率达98.3%;eDNA浓度与花鳗鲡不同养殖密度成正相关性(R^(2)=0.998);花鳗鲡eDNA浓度随时间推移逐渐降解,能在水体中存在22 d左右。设计的花鳗鲡特异性引物和TaqMan探针以及qPCR检测方法特异性好、灵敏度高,可以对花鳗鲡生物量进行相对定量检测。 展开更多
关键词 花鳗鲡 环境dna 定性分析 生物量
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环境DNA宏条形码技术及其应用
5
作者 马鑫 侯鹏 谷晓云 《生物学教学》 北大核心 2026年第4期2-5,共4页
环境DNA(eDNA)宏条形码技术是将高通量测序与DNA条形码相结合,对环境中分离出的生物遗传物质进行物种分类鉴定的分子生物学前沿科学技术,被广泛应用于生物多样性监测和生态环境保护等研究领域。本文围绕eDNA宏条形码技术的发展、规范流... 环境DNA(eDNA)宏条形码技术是将高通量测序与DNA条形码相结合,对环境中分离出的生物遗传物质进行物种分类鉴定的分子生物学前沿科学技术,被广泛应用于生物多样性监测和生态环境保护等研究领域。本文围绕eDNA宏条形码技术的发展、规范流程和应用现状进行概述,旨在为高中生物学中基因工程的教学和实验设计提供前沿拓展资料。 展开更多
关键词 环境dna 宏条形码 多样性监测 物种鉴定
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海草床生态系统环境DNA研究进展
6
作者 沈捷 赖文婷 +4 位作者 蔡泽富 贾舒雯 张剑 黎夏敏 陈石泉 《广西科学》 北大核心 2026年第1期1-13,共13页
海草床是海洋典型的高生产力生态系统之一,具有维持生物多样性、净化水体环境、固碳储碳等核心生态功能,其生态状况对海洋生态系统稳定与功能发挥具有关键意义。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术作为一种非侵入性生物监测手段,突破... 海草床是海洋典型的高生产力生态系统之一,具有维持生物多样性、净化水体环境、固碳储碳等核心生态功能,其生态状况对海洋生态系统稳定与功能发挥具有关键意义。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术作为一种非侵入性生物监测手段,突破了传统海草床监测方法的技术局限,为海草床生态系统的精准研究与综合评估提供了全新技术路径。本文系统梳理了海草床生态系统研究中eDNA技术的基础理论与方法体系,涵盖海草及共生生物eDNA的生物学特性、样本采集与预处理、提取与检测技术及数据分析验证方法;全面阐述了该技术在物种多样性监测、生态健康与环境胁迫评估、生物量与分布动态监测、生态扰动与入侵物种监测等核心领域的研究进展,同时总结了其在海草床碳汇潜力评估、沉积物eDNA历史演变解析等前沿方向的应用成果;深入剖析了当前海草床生态系统eDNA研究面临的生境基质干扰、方法标准化缺失、本土参考序列数据库不足等关键挑战,并针对性提出技术优化、流程规范、数据库建设等解决策略;最后展望了eDNA技术与遥感、人工智能(AI)等技术集成融合,在海草床生态保护修复、监测网络构建、跨学科研究等领域的应用前景,旨在为海草床生态系统的科学保护、可持续管理及相关研究的深入开展提供理论参考与技术支撑。 展开更多
关键词 海草床生态系统 环境dna(edna) 生物监测 碳汇评估 沉积物edna 生态保护
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基于环境DNA宏条形码技术的大清河底栖动物生物多样性研究应用
7
作者 刘佳敏 王茜 《江西水产科技》 2026年第1期1-6,16,共7页
基于环境DNA宏条形码技术,以大清河流域中紫荆关、中唐梅和水堡三个站点的底栖动物为研究对象,对传统形态学方法与环境DNA宏条形码技术获得的底栖生物组成及多样性信息进行比较分析,探讨两种方法检获的底栖生物组成结构及多样性的异同... 基于环境DNA宏条形码技术,以大清河流域中紫荆关、中唐梅和水堡三个站点的底栖动物为研究对象,对传统形态学方法与环境DNA宏条形码技术获得的底栖生物组成及多样性信息进行比较分析,探讨两种方法检获的底栖生物组成结构及多样性的异同。研究结果表明,较于传统的形态学方法,环境DNA宏条形码技术揭示了更高的生物多样性,能较全面反映紫荆关、中唐梅和水堡三个站点的底栖生物群落结构,为丰富大清河水系底栖动物群落研究和解析底栖生物在大清河生态系统发挥的作用提供研究数据,也为后续采用分子技术检测多样性研究提供基础。 展开更多
关键词 环境dna 形态学鉴定 底栖动物
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基于环境DNA宏条形码的三峡水库变动回水区鱼类多样性研究 被引量：7
8
作者 杨威 舒政博 +3 位作者 张先炳 王丽 杨胜发 李文杰 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第2期122-133,共12页
应用环境DNA宏条形码(eDNA metabarcoding)检测三峡水库变动回水区鱼类多样性,为区域鱼类多样性监测和保护提供新方法。2021年8月在三峡水库变动回水区5个典型江段共26个采样区域进行水样采集,应用e DNA宏条形码标准化分析流程共检测分... 应用环境DNA宏条形码(eDNA metabarcoding)检测三峡水库变动回水区鱼类多样性,为区域鱼类多样性监测和保护提供新方法。2021年8月在三峡水库变动回水区5个典型江段共26个采样区域进行水样采集,应用e DNA宏条形码标准化分析流程共检测分析出鱼类68种,隶属于8目18科56属,包括国家一级重点保护鱼类1种,国家二级重点保护鱼类3种,长江上游特有鱼类15种,重庆市重点保护鱼类3种,外来鱼类1种,鲤(Cyprinus carpio)、草鱼(Ctenopharyngodon idella)、鲇(Silurus asotus)、鳙(Aristichthys nobilis)、波氏吻虾虎鱼(Rhinogobius cliffordpopei)等为优势种且具有较高的操作分类单元(OTU)序列数。5个典型江段的鱼类组成存在差异,且在平绥坝—丝瓜碛等重点淤积的江段检测出较高的鱼类丰度,库区新形成的边滩生境可能是鱼类重要的育幼场。研究结果表明eDNA宏条形码可用于快速检测三峡水库变动回水区鱼类多样性及其空间分布,可作为关键技术组建无损伤性的鱼类资源监测体系。 展开更多
关键词 环境dna宏条形码 鱼类多样性 变动回水区 三峡水库
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基于环境DNA技术的贵州山区河流鱼类多样性影响因素初步探究 被引量：3
9
作者 关晓玉 严晗璐 +5 位作者 尹智力 陈求稳 黄天宬 刘凌言 林育青 何术锋 《湖泊科学》 北大核心 2025年第4期1128-1139,I0011-I0016,共18页
本研究基于环境DNA(eDNA)技术,对贵州省内7个水系的30条典型山区河流开展鱼类多样性调查。结果显示,共调查到鱼类89种,以鲤形目为主,包含5种外来鱼类和4种珍稀濒危鱼类,其中至少74种鱼类(鉴定到种水平物种数的89.2%)在已有研究中有记载... 本研究基于环境DNA(eDNA)技术,对贵州省内7个水系的30条典型山区河流开展鱼类多样性调查。结果显示,共调查到鱼类89种,以鲤形目为主,包含5种外来鱼类和4种珍稀濒危鱼类,其中至少74种鱼类(鉴定到种水平物种数的89.2%)在已有研究中有记载。从栖息水层来看,以底层和中下层鱼类为主;从食性来看,以杂食性和肉食性鱼类为主。鲤(Cyprinus carpio)、鲫(Carassius auratus)、鳙(Hypophthalmichthys nobilis)、子陵吻虾虎鱼(Rhinogobius giurinus)分布较广,均在超过90%的采样点中出现。基于eDNA序列丰度计算鱼类多样性指数(Richness、Shannon-Wiener、Simpson、Pielou),根据多样性指数评价标准,山区河流的鱼类多样性状况总体良好;在空间分布上,鱼类多样性指数未表现出显著的海拔梯度变化特征。基于分段结构方程模型分析了海拔、景观类型、理化指标、污染指标、生态流量满足程度和人类活动对4种鱼类多样性指数的影响,结果表明水体理化指标和污染指标是影响贵州省山区河流鱼类多样性的关键因子,人类活动和生态流量满足程度是次要影响因子;进一步基于聚合增强树评估了不同水质指标对鱼类多样性指数的重要性,发现水温、电导率与氨氮是影响鱼类多样性指数的主要水质因子。此外,研究的环境因子中污染指标、人类活动和生态流量直接作用于鱼类多样性指数,其他因子则通过间接途径产生影响,且不同多样性指数对同一环境因子的响应存在差异。本研究可为山区河流鱼类调查方法的选择提供参考,并为山区河流鱼类多样性保护工作提供数据基础和理论支持。 展开更多
关键词 山区河流 环境dna 鱼类多样性 环境因子 结构方程模型
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利用环境DNA与生态网络分析探索赣江浮游植物对水质的指示作用 被引量：1
10
作者 何瑞 高保燕 +3 位作者 金宗安 朱子钦 赵建刚 张成武 《环境科学研究》 北大核心 2025年第7期1430-1439,共10页
为揭示赣江真核浮游植物群落结构及其对水环境因子的响应机制,本研究结合环境DNA(eDNA)高通量测序技术与生态网络分析方法,对2023年7月赣江上、中、下游9个典型采样点的水样及其主要理化因子进行系统分析,识别水质指示性浮游植物,探讨... 为揭示赣江真核浮游植物群落结构及其对水环境因子的响应机制,本研究结合环境DNA(eDNA)高通量测序技术与生态网络分析方法,对2023年7月赣江上、中、下游9个典型采样点的水样及其主要理化因子进行系统分析,识别水质指示性浮游植物,探讨其与环境因子的关系,并评估其在流域水质监测中的应用潜力。结果表明:①研究期间赣江共鉴定出49种真核浮游植物,隶属7纲17目28科39属,其中硅藻纲(Bacillariophyceae)和隐藻纲(Cryptophyceae)为优势类群,条纹小环藻(Cyclotella striata)为绝对优势种,广泛分布于各样点。②α-多样性分析显示,赣江下游群落多样性最高,中游最低,呈显著空间分异。指示种分析发现,球囊赭球藻(Ochromonas sphaerocystis)偏好高pH水体,水母菱形藻(Nitzschia aequorea)在高氮浓度环境中丰度显著,斯卡尔德小环藻(Cyclotella scaldensis)和孔形近囊孢藻(Paraphysomonas foraminifera)对高硝酸盐氮和总磷浓度具有指示作用。③冗余分析(RDA)显示,溶解性活性磷(SRP)和总溶解态磷(TDP)是影响浮游植物群落结构的主要环境因子,分别解释了14.3%和5.5%的物种分布变异。④共现网络分析揭示,浮游植物群落具有高度模块化结构,链星冠盘藻(Stephanodiscus suzukii)和钝脆杆藻(Fragilaria capucina)在网络中具有较高中心性,可能在维持群落稳定性中发挥关键作用。研究显示,将eDNA的群落监测与生态网络分析相结合,能够高效解析浮游植物的空间分布格局及其环境响应特征,识别关键指示种,为复杂河流生态系统的水质评估与管理提供了新的技术手段和科学依据。 展开更多
关键词 浮游植物 环境dna 生态网络分析 指示物种 赣江
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基于形态和环境DNA宏条形码技术的广西涠洲岛马尾藻场浮游动物群落结构及其粪便碳通量 被引量：1
11
作者 黎洁丽 邹立功 +1 位作者 杨宇峰 王庆 《热带海洋学报》 北大核心 2025年第3期104-120,共17页
为分析大型海藻对浮游动物群落结构及其粪便碳通量的影响,于2024年3月、5月和6月在广西涠洲岛马尾藻海藻场及其邻近对照海域进行了浮游动物群落结构调查,估算了浮游动物粪便碳通量,并于2024年5月马尾藻茂盛期利用环境DNA宏条形码对浮游... 为分析大型海藻对浮游动物群落结构及其粪便碳通量的影响,于2024年3月、5月和6月在广西涠洲岛马尾藻海藻场及其邻近对照海域进行了浮游动物群落结构调查,估算了浮游动物粪便碳通量,并于2024年5月马尾藻茂盛期利用环境DNA宏条形码对浮游动物群落进行了检测。调查期间基于形态分类学共鉴定浮游动物45种,其中桡足类38种,浮游动物丰度变化范围为1160~3960ind.·m^(−3),马尾藻海藻场的浮游动物种类及其丰度均高于对照海域(P<0.05)。通过形态学、18S rDNA和COI基因鉴定出的浮游动物种类组成有较大差异,其中形态学鉴定出较多的桡足类,18S rDNA检测出较多的纤毛虫,而COI基因检测出较多的水母类,综合三种方法共同检测到的种类为锥形宽水蚤(Temora turbinata)。浮游动物粪便碳通量的变化范围为0.215~0.574mg C·m^(−2)·d^(−1),马尾藻海藻场浮游动物的粪便碳通量高于对照海域。调查结果表明,大型海藻马尾藻场的生态环境能够提高浮游动物的多样性和丰度,增加浮游动物粪便碳通量。 展开更多
关键词 涠洲岛 马尾藻场 浮游动物 环境dna 粪便碳通量
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基于环境DNA技术与生态网络分析的长江口春季浮游植物群落研究 被引量：1
12
作者 翟帅 方泽平 +3 位作者 黄孝锋 高欣 孟顺龙 宋超 《环境科学研究》 北大核心 2025年第7期1407-1417,共11页
长江口作为河海交汇生态敏感区,其浮游植物群落是维持河口生态系统的核心环节,但传统形态学鉴定存在耗时长、易漏检稀有类群等局限。为精准掌握长江口浮游植物群落特征及与环境因子的相互关系,以支撑长江口生态保护需求,本研究结合环境D... 长江口作为河海交汇生态敏感区,其浮游植物群落是维持河口生态系统的核心环节,但传统形态学鉴定存在耗时长、易漏检稀有类群等局限。为精准掌握长江口浮游植物群落特征及与环境因子的相互关系,以支撑长江口生态保护需求,本研究结合环境DNA(e DNA)高通量测序技术与生态网络分析方法,对2024年5月长江口11个采样点的水样及其主要环境因子进行了综合分析。结果表明:①研究期间长江口共识别出67种浮游植物,涵盖5门7纲31科42属。其中,硅藻门(Bacillariophyta)、金藻门(Chrysophyta)、绿藻门(Chlorophyta)为主导类群,且汉斯冠盘藻(Stephanodiscus hantzschii)和彼德森黄群藻(Synura petersenii)是区域内的绝对优势种。②α-多样性分析显示,长江口北支与东海交汇点(HK02)的群落丰富度和多样性最高,长江口南支与长江支流交汇点(HK08)的群落丰富度最低,呈显著空间分异。③Mantel test检验、生态网络分析及冗余分析表明,盐度(SAL)和总溶解性固体(TDS)是影响长江口浮游植物的关键环境因子,透明度(SD)、温度(WT)、TN等环境因子影响浮游植物多样性和优势群落结构组成。研究显示,eDNA技术与生态网络分析的方法结合可高效解析浮游植物的空间分布及环境响应特征,可为长江口生态保护提供技术支撑与科学依据。 展开更多
关键词 浮游植物 环境dna 生态网络分析 多样性 长江口
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基于环境DNA的春季东海海域曼氏无针乌贼分布特征 被引量：2
13
作者 袁霞 钟兰萍 +2 位作者 张秀梅 周永东 王晓艳 《水生生物学报》 北大核心 2025年第3期26-35,共10页
研究设计了曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)的特异性引物和TaqMan探针,采用eDNA方法对东海海域44个站位的175个水层样品进行了曼氏无针乌贼的水平(44个站位)和垂直分布(175份水样)分析,并进行了曼氏无针乌贼e DNA与环境变量(总深度、... 研究设计了曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)的特异性引物和TaqMan探针,采用eDNA方法对东海海域44个站位的175个水层样品进行了曼氏无针乌贼的水平(44个站位)和垂直分布(175份水样)分析,并进行了曼氏无针乌贼e DNA与环境变量(总深度、采样深度、温度、盐度、溶氧量、浊度、叶绿素、PO_(4)^(3-)、NH_(4)^(+))的相关性分析。结果显示,在调查海域曼氏无针乌贼的eDNA检出率为17.14%,在各站位间无显著差异,但在垂直分布上有显著差异(P<0.05)。在中表层水中检测到较高的曼氏无针乌贼eDNA浓度,在深度大于81 m的海水中未检测到曼氏无针乌贼eDNA。此外,曼氏无针乌贼的eDNA浓度(Ln([eDNA]+1))和存在/不存在(YNeDNA)受总深度、浊度、盐度、溶氧量、SiO_(3)^(-)、NO_(3)^(-)、NO_(2)^(-)等环境变量的影响。研究证明了eDNA是一种可靠的物种调查方法,可以作为传统资源调查的补充,为进一步研究东海海域曼氏无针乌贼的资源分布及栖息地选择提供技术支持,并为其资源修复和可持续利用提供参考依据。 展开更多
关键词 环境dna 东海 分布 曼氏无针乌贼
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环境DNA技术在两栖动物监测中的研究与应用进展 被引量：2
14
作者 张靖雯 毛致伟 +2 位作者 杨江华 金小伟 张效伟 《湖泊科学》 北大核心 2025年第4期1162-1174,共13页
两栖动物是全球受威胁最严重的脊椎动物类群,其种群衰退主要源于栖息地丧失、气候变化、环境污染、入侵物种及病菌感染等多重压力。为提升两栖动物多样性保护成效,建立高效精准的监测技术以科学评估其生存现状和动态变化至关重要。传统... 两栖动物是全球受威胁最严重的脊椎动物类群,其种群衰退主要源于栖息地丧失、气候变化、环境污染、入侵物种及病菌感染等多重压力。为提升两栖动物多样性保护成效,建立高效精准的监测技术以科学评估其生存现状和动态变化至关重要。传统形态学和声学监测方法虽然应用广泛,但存在监测成本高、鉴定难度大、难以发现隐蔽稀有物种等局限。环境DNA(eDNA)技术以其高效、快速、无创的优势,为两栖动物多样性监测提供了新的解决方案。本文简要介绍了eDNA生物监测的两种主要方法,综述了eDNA技术在两栖动物“靶向”(入侵物种、珍稀/濒危物种)监测、生物多样性调查、物种丰度估测以及致病菌监测方面的应用进展,重点探讨了样品采集与eDNA捕获、引物选择与PCR扩增、生物信息学分析、假阴性与假阳性的控制等关键技术环节对监测准确性的影响,并提出了优化建议。此外,本文对未来的研究方向与应用前景进行了展望,以期为两栖动物多样性监测、保护与管理提供参考。 展开更多
关键词 两栖动物 环境dna 生物监测 宏条形码 生物多样性
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基于环境DNA宏条形码的东西溪鱼类物种多样性分析 被引量：1
15
作者 刘瑜 甄卓 +2 位作者 文策 郭文义 徐冬敏 《环境工程技术学报》 北大核心 2025年第6期1918-1927,共10页
了解东西溪流域鱼类多样性及分布特征对东西溪流域水生生物多样性保护具有重要意义。于2023—2024年分别在丰水期、枯水期、平水期使用环境DNA(eDNA)宏条形码技术和传统网具法对厦门市东西溪流域鱼类群落结构及多样性进行调查,并探讨eDN... 了解东西溪流域鱼类多样性及分布特征对东西溪流域水生生物多样性保护具有重要意义。于2023—2024年分别在丰水期、枯水期、平水期使用环境DNA(eDNA)宏条形码技术和传统网具法对厦门市东西溪流域鱼类群落结构及多样性进行调查,并探讨eDNA技术相较传统网具方法在鱼类监测方面的优势。结果表明:利用eDNA技术在丰水期共检测到鱼类134种,显著高于枯水期和平水期(61和48种),不同水文期鱼类组成均以鲤形目和鲈形目为主,占检测鱼类种类数的59.96%~99.56%,且存在以齐氏罗非鱼、奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼为主的鱼类生态入侵现象。东西溪流域不同采样点之间鱼类α多样性均无显著性差异,丰水期鱼类多样性指数和丰富度指数均显著高于枯水期和平水期(P<0.05),均匀度指数枯水期显著高于丰水期和平水期(P<0.05)。非度量多维尺度分析显示枯水期和平水期样本间异质性较低,物种组成相似,丰水期与其他2个水文时期鱼类种类组成差异显著,异质性较高。此外,eDNA技术检测出的鱼类物种数显著高于传统方法所捕获的鱼类物种数,且检出鱼类的生态类型(摄食习惯、栖息水层和耐污性)与传统方法检测结果高度一致。本研究证实了eDNA技术用于调查流域渔业资源的可行性,且其在鱼类物种检出效率上优于传统网具方法,与传统方法相结合,可以进一步增加监测调查的可靠性。 展开更多
关键词 环境dna宏条形码 鱼类 物种 生物多样性 东西溪流域
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基于环境DNA宏条形码技术的庙岛群岛海域大型底栖动物多样性研究 被引量：1
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作者 纪莹璐 陈琳琳 +4 位作者 李奇 曲方圆 宫英哲 曹湘悦 王智 《海洋科学进展》 北大核心 2025年第4期840-855,共16页
于2022年10月运用环境DNA宏条形码(Environmental DNA metabarcoding,eDNA metabarcoding)技术检测了渤海海峡庙岛群岛海域大型底栖动物群落结构和多样性,比较了环境DNA和传统形态学分类对大型底栖动物的检出效果,探索了影响底栖动物种... 于2022年10月运用环境DNA宏条形码(Environmental DNA metabarcoding,eDNA metabarcoding)技术检测了渤海海峡庙岛群岛海域大型底栖动物群落结构和多样性,比较了环境DNA和传统形态学分类对大型底栖动物的检出效果,探索了影响底栖动物种类组成的主要环境因子。结果显示,在庙岛群岛海域16个站位基于18S rDNA宏条形码检测出大型底栖动物12门19纲43目88科110属223个特征序列(Amplicon Sequence Variants,ASVs),环节动物门、扁形动物门和软体动物门为优势类群;基于形态学分类检测出7大门类68个属,主要类群为环节动物和软体动物。上述两种方法所得大型底栖动物种类组成和多样性存在显著差异,环境DNA在门和属水平上能鉴定出更多的种类,Margalef丰富度指数较高,但未能注释出节肢动物甲壳纲。底层水盐度和沉积物粒度参数(中值粒径和偏度)、TOC含量是影响庙岛群岛海域大型底栖动物群落组成的主要环境因子。研究结果表明,环境DNA宏条形码技术作为一种生物多样性监测新方法在大型底栖动物快速监/检测中具有较高的应用潜力,与传统形态学分类相结合能够全面了解区域内海洋底栖动物的种类和生物多样性。 展开更多
关键词 环境dna 生物多样性 环境因子 底栖动物 庙岛群岛 渤海海峡
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基于环境DNA技术的西江珍稀鱼类省级自然保护区鱼类多样性研究
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作者 钟占友 邓洪 +7 位作者 寇春妮 陈蔚涛 武智 李跃飞 夏雨果 李慧峰 李捷 朱书礼 《南方水产科学》 北大核心 2025年第2期47-58,共12页
为更好地保护西江珍稀鱼类省级自然保护区的鱼类资源,利用基于COI和12S rRNA 2个基因标记的环境DNA技术(Environmental DNA,eDNA),对保护区江段的左岸、中间和右岸共计18个采样站位开展了鱼类种类组成及河段不同横向断面的鱼类多样性分... 为更好地保护西江珍稀鱼类省级自然保护区的鱼类资源,利用基于COI和12S rRNA 2个基因标记的环境DNA技术(Environmental DNA,eDNA),对保护区江段的左岸、中间和右岸共计18个采样站位开展了鱼类种类组成及河段不同横向断面的鱼类多样性分析。结果发现,COI和12S rRNA 2个基因共检测出53种鱼类,隶属于4目12科48属;12S rRNA基因检测出47种鱼类,COI基因检测出19种鱼类,2个基因同时检测出的鱼类有13种。基于序列丰度的Alpha多样性分析结果显示,2个基因的结果一致支持保护区江段左岸的鱼类物种数和Chao1丰富度最高,说明左岸具有较高的鱼类多样性。基于12S rRNA基因的Beta多样性结果发现,保护区的左岸、中间和右岸的鱼类组成存在显著性差异。研究结果可为保护区鱼类生物多样性的保护和动态监测提供基础资料与技术支持。 展开更多
关键词 环境dna 鱼类多样性 自然保护区 西江珍稀鱼类
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基于环境DNA与影像技术的卡罗琳海山八放珊瑚多样性研究
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作者 郑小宇 徐雨 +2 位作者 徐奎栋 类彦立 詹子锋 《海洋科学》 北大核心 2025年第8期63-70,共8页
八放珊瑚作为深海海山生态系统中的关键类群,对维持深海生物多样性具有重要意义。然而,由于传统深海调查技术的限制,目前对深海海山八放珊瑚多样性的研究仍不充分。本研究利用环境DNA宏条形码技术结合影像分析对卡罗琳海山的八放珊瑚多... 八放珊瑚作为深海海山生态系统中的关键类群,对维持深海生物多样性具有重要意义。然而,由于传统深海调查技术的限制,目前对深海海山八放珊瑚多样性的研究仍不充分。本研究利用环境DNA宏条形码技术结合影像分析对卡罗琳海山的八放珊瑚多样性进行综合分析,旨在分析环境DNA技术在海山调查中的可行性。通过环境DNA技术,共检测到65个分子种,涵盖2目、11科、19属;而影像技术则识别出29个形态种,涉及2目、6科、9属。两种方法均成功检测到热带西太平洋深海常见的八放珊瑚类群,如金柳珊瑚科、角柳珊瑚科、丑柳珊瑚科和棘柳珊瑚科,但在群落结构和物种组成上存在差异。环境DNA技术在检测隐匿物种和稀有类群方面表现出更高的灵敏度,而影像技术则在物种定量和形态特征分析上更具优势。本研究表明,环境DNA与影像技术的结合应用能够显著提升深海八放珊瑚多样性评估的全面性和可靠性,为深海生物多样性研究提供新的技术途径。 展开更多
关键词 环境dna 八放珊瑚 卡罗琳海山 宏条形码技术 影像技术
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基于环境DNA的千岛湖鱼类空间分布格局及驱动因素研究
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作者 李栩 汪敬业 +3 位作者 吴铭杰 许海 杨江华 张效伟 《生态毒理学报》 北大核心 2025年第6期49-59,共11页
鱼类作为湖泊生态系统中的顶级消费者,可通过下行效应影响整个生态系统的结构和功能。厘清鱼类群落的空间分布及其主要驱动因素,对维护湖泊生态系统健康具有重要作用。本研究利用环境DNA技术分析了千岛湖主要湖区及水层中鱼类组成与多... 鱼类作为湖泊生态系统中的顶级消费者,可通过下行效应影响整个生态系统的结构和功能。厘清鱼类群落的空间分布及其主要驱动因素,对维护湖泊生态系统健康具有重要作用。本研究利用环境DNA技术分析了千岛湖主要湖区及水层中鱼类组成与多样性的空间分布特征,结合环境因子与浮游生物数据探讨其关键驱动机制。共检出6目16科43属51种鱼类,其中鲤形目与鲈形目物种占比分别为60.38%和20.75%。西北湖区的鱼类α多样性显著低于其他湖区,鱼类群落结构与其他湖区存在显著差异。不同水层之间的物种多样性指数(Chao1、Shannon、Simpson)无显著差异,鱼类群落组成较为一致。结合鱼类生态习性,发现环境DNA检出的鱼类中有约60%的鱼种的相对丰度与其偏好栖息水层呈现一致性。DistLM分析结果显示,表层水体中的鱼类分布主要受藻类群落结构驱动,而底层鱼类分布则更受悬浮颗粒物和溶解氧等理化因子的影响。本研究展示了环境DNA技术在湖库鱼类空间生态格局研究中的应用,为鱼类资源调查及环境胁迫因子的识别提供了科学依据与方法参考。 展开更多
关键词 环境dna 群落结构 垂直分布 千岛湖 驱动因子
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基于环境DNA的永定河和北运河本土与入侵鱼类群落特征
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作者 张芮青 林豪杰 +4 位作者 祝燕 蔺晓茹 杜津柘 王书平 闫振广 《环境科学研究》 北大核心 2025年第8期1772-1782,共11页
永定河和北运河是京津冀地区的重要河流,为解析这两条河流的本土及入侵鱼类群落特征及其影响因素等,该研究于2023年10月在两条河流分别布设8个调查点位,使用环境DNA技术获取了鱼类基础数据,并对其分布特征、生物多样性及生态位等进行了... 永定河和北运河是京津冀地区的重要河流,为解析这两条河流的本土及入侵鱼类群落特征及其影响因素等,该研究于2023年10月在两条河流分别布设8个调查点位,使用环境DNA技术获取了鱼类基础数据,并对其分布特征、生物多样性及生态位等进行了研究。结果表明:①研究期间在永定河和北运河共检出46种鱼类,隶属于7目18科39属,以鲤形目和鲈形目为主。其中,永定河检出39种鱼类,涵盖7目17科34属;北运河检出44种鱼类,涵盖7目17科37属。②永定河和北运河各调查点位Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数和Margalef丰富度指数的范围分别为1.23~2.52、0.44~0.82和1.79~3.84,且北运河鱼类生物多样性略优于永定河(p<0.05)。③RDA分析发现,氨氮浓度、总氮浓度和氧化还原电位均与河流鱼类群落组成呈显著相关(p<0.05)。④研究期间共发现5种具有入侵风险的鱼类,分别为齐氏罗非鱼、白斑狗鱼、西太公鱼、太湖新银鱼和斑点叉尾鮰。其中,齐氏罗非鱼在调查点位分布广泛,其生态位宽度最大,且属于首次在永定河和北运河中被检出,后续值得关注。研究显示,在研究区域北运河鱼类多样性优于永定河,并且该研究的5种具有入侵风险的鱼类中,齐氏罗非鱼扩散能力可能是最强的。 展开更多
关键词 环境dna 环境因子 生态位 鱼类群落 入侵物种 生物多样性
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