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猪细环病毒2型环介导等温扩增检测方法的建立 被引量:2
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作者 张黎 李凯 +3 位作者 田光玲 李德峰 王伟松 何后军 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第5期1098-1103,共6页
为了能快速、特异的检测猪细环病毒2型(TTSuV2),本研究针对TTSuV2全基因序列的非编码区域和第1个开放性阅读框前端设计了2对引物,建立了TTSuV2的环介导等温扩增(LAMP)检测方法并对反应成分和条件进行了梯度摸索。试验结果显示,该LAMP检... 为了能快速、特异的检测猪细环病毒2型(TTSuV2),本研究针对TTSuV2全基因序列的非编码区域和第1个开放性阅读框前端设计了2对引物,建立了TTSuV2的环介导等温扩增(LAMP)检测方法并对反应成分和条件进行了梯度摸索。试验结果显示,该LAMP检测方法最佳反应条件为64℃恒温90 min,可特异性检测TTSuV2,与猪细环病毒1型、猪圆环病毒2型、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪博卡病毒无交叉反应,病毒最低检出限为100拷贝/μL。结果表明,建立的LAMP方法具有快速、特异且灵敏的特点,可在TTSuV2快速检测方面提供一定的技术支持。 展开更多
关键词 猪细环病毒2型(TTSuV2) 介导等温扩增 检测
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猪细环病毒2型荧光定量PCR检测方法的优化 被引量:2
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作者 王园 杨倩 +2 位作者 滕飞 于红欣 周双海 《北京农学院学报》 2016年第2期69-72,共4页
【目的】优化1种猪细环病毒2型(TTSu V2)的荧光定量PCR检测方法。【方法】对原有引物进行调整设计,以原有重组质粒为模板来重新进行检测TTSu V2 DNA的SYBR Green I real-time PCR扩增。【结果】新的TTSu V2 SYBR Green I荧光定量PCR的... 【目的】优化1种猪细环病毒2型(TTSu V2)的荧光定量PCR检测方法。【方法】对原有引物进行调整设计,以原有重组质粒为模板来重新进行检测TTSu V2 DNA的SYBR Green I real-time PCR扩增。【结果】新的TTSu V2 SYBR Green I荧光定量PCR的扩增效率为99.3%,标准曲线的决定系数为0.998,可准确检测的最低核酸模板浓度为50 copies/μL。与原方法相比较,新方法在熔解曲线、特异性、重复性方面都非常接近,但在扩增曲线方面得到明显改善,其可准确定量检测的灵敏度提高了至少10倍以上,临床检测数据也更加准确可靠。【结论】建立了一种新的准确灵敏度更高的定量检测TTSu V2的荧光定量PCR方法。 展开更多
关键词 猪细环病毒2型 SYBR Green I 荧光定量PCR 灵敏度 优化
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猪细环病毒2型感染与断奶后多系统衰竭综合征的相关性分析
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作者 王园 胡胜云 +3 位作者 杨倩 刘鑫宇 张贺 周双海 《北京农学院学报》 2018年第3期57-60,共4页
【目的】分析猪细环病毒2型(TTSuV2)感染与猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的发生是否存在临床相关性。【方法】采集35头临床疑似PMWS病猪和35头同群健康猪的血清,用综合诊断方法来确认PMWS病猪与猪圆环病毒2型(PCV2)亚临床感染猪,用荧... 【目的】分析猪细环病毒2型(TTSuV2)感染与猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的发生是否存在临床相关性。【方法】采集35头临床疑似PMWS病猪和35头同群健康猪的血清,用综合诊断方法来确认PMWS病猪与猪圆环病毒2型(PCV2)亚临床感染猪,用荧光定量PCR方法检测PCV2与TTSuV2载量,对2种病毒载量分别进行差异分析,并对二者进行相关性分析。【结果】经综合诊断确认,有24头PMWS病猪和27头PCV2亚临床感染猪,前者血清中PCV2载量与TTSuV2载量都极显著(P<0.01)高于后者,且TTSuV2载量与PCV2载量之间存在极显著(P<0.01)相关。【结论】PMWS与TTSuV2感染在临床上存在一定相关。 展开更多
关键词 断奶后多系统衰竭综合征 猪细环病毒2型 病毒载量 相关性
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猪细环病毒2型衣壳蛋白的原核表达及纯化
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作者 刘伟 朱怡平 +4 位作者 张戴婷 关敏慧 何飞龙 杨谦 郭霄峰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第5期23-28,共6页
本试验通过在大肠杆菌中表达衣壳蛋白,确定最优表达条件并对其进行纯化。用PCR法扩增猪细环病毒2型(TTV2)ORF1抗原基因,定向克隆至质粒pGEX-4T-1中,获得重组质粒pGEX-4T-1-ORF1。经双酶切鉴定及测序正确后转化到BL21(DE3)工程菌中,获得... 本试验通过在大肠杆菌中表达衣壳蛋白,确定最优表达条件并对其进行纯化。用PCR法扩增猪细环病毒2型(TTV2)ORF1抗原基因,定向克隆至质粒pGEX-4T-1中,获得重组质粒pGEX-4T-1-ORF1。经双酶切鉴定及测序正确后转化到BL21(DE3)工程菌中,获得衣壳蛋白大肠杆菌表达株。IPTG诱导表达,表达的重组融合蛋白经SDS-PAGE及Western blotting鉴定,并对影响重组蛋白表达的3个因素,即诱导时间、诱导温度和IPTG浓度进行优化,确定最优表达条件。重组表达质粒PCR及双酶切鉴定结果显示衣壳蛋白原核表达载体构建正确。重组融合蛋白分子质量约80ku,主要以包涵体形式存在。37℃诱导5h表达量最多,IPTG浓度对表达量无明显影响。蛋白质串联肽谱分析检测氨基酸序列与GenBank中公布的TTV2 ORF1基因序列翻译的氨基酸序列相对应,且可被鼠抗GST单克隆抗体特异性识别。该融合蛋白首次用KCl染色切胶回收法对表达的融合蛋白进行纯化,纯化效果较好,性价比高。结果表明,成功构建了pGEX-4T-1-ORF1重组质粒,衣壳蛋白得到了高效表达及纯化,为间接ELISA的建立及单克隆抗体的研制提供了抗原。 展开更多
关键词 猪细环病毒2型 衣壳蛋白 原核表达 纯化
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猪细环病毒k2型SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:2
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作者 陈如敬 黄秋宇 +4 位作者 修金生 吴学敏 严山 车勇良 周伦江 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2016年第5期10-15,共6页
为建立检测猪细环病毒k2型(Porcine Torque teno sus virus k2,PTTSu Vk2)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,本研究根据PTTSu Vk2 ORF2基因序列特征设计引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PTTSu Vk2的实时荧光定量PCR方法,该方法在PTTSu V... 为建立检测猪细环病毒k2型(Porcine Torque teno sus virus k2,PTTSu Vk2)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,本研究根据PTTSu Vk2 ORF2基因序列特征设计引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PTTSu Vk2的实时荧光定量PCR方法,该方法在PTTSu Vk2 ORF2基因含量为1.92×102~1.92×107 copies/μL反应范围内有很好的线性关系。扩增产物溶解曲线分析仅出现单一特异峰,无引物二聚体,Tm值为(83.83±0.08)℃,对猪圆环病毒(Porcine circovirus type 1 and type 2,PCV1和PCV2)、猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)、猪博卡病毒5型(Porcine bovavirus type 5,Pbo V5)、猪细环病毒1a型(PTTSu V 1a)和1b型(PTTSu V 1b)核酸均无阳性信号扩增,可重复性好,组内变异系数为0.39%~1.69%,组间变异系数0.69%~2.19%。本方法的建立可用于定量分析PTTSu Vk2感染噬性组织器官和感染程度,为PTTSu Vk2的流行病学研究及临床诊断等提供了一种可靠的方法。 展开更多
关键词 病毒k2 ORF2基因 SYBR Green 实时荧光定量PCR方法
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2016-2017年中国部分地区TTSuV2流行情况调查与遗传进化分析 被引量:1
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作者 王德海 陈文文 +3 位作者 朱金海 李春秋 李鹏 孙东波 《黑龙江八一农垦大学学报》 2022年第6期45-55,76,共12页
为了解2016-2017年中国地区TTSuV2的流行情况以及流行毒株的遗传演化情况,对中国东北、华中、华东、华北、华南、西南、西北7个地区采集的325份仔猪腹泻样品进行PCR检测,并对其中阳性样品的基因组高变区进行克隆与遗传演化分析。结果显... 为了解2016-2017年中国地区TTSuV2的流行情况以及流行毒株的遗传演化情况,对中国东北、华中、华东、华北、华南、西南、西北7个地区采集的325份仔猪腹泻样品进行PCR检测,并对其中阳性样品的基因组高变区进行克隆与遗传演化分析。结果显示:TTSuV2阳性样品总数为92份,总阳性率为28.31%;成功克隆出目的基因31条,均属于Kappatorquevirus属的TTSuV k2a基因型,且分布于Group1和Group2。基于全长目的基因同源性分析结果显示,31株TTSuV2型鉴定毒株之间的核苷酸同源性为87.5%~99.7%。UTR核苷酸序列比对结果显示,所有鉴定毒株的核苷酸突变位点主要集中在第51~230 nt。ORF2蛋白序列比对结果显示,所有鉴定毒株的氨基酸突变位点主要集中在第39~49 aa;ORF1蛋白序列比对结果显示,氨基酸突变位点主要集中在第19~50 aa。重组分析结果显示,共存在1株潜在重组毒株TTSuV/515。ORF2基因选择压力分析结果显示,3个密码子位点受到正选择压力,4个密码子位点受到负选择压力。 展开更多
关键词 猪细环病毒2型 流行情况 遗传演化分析
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