-
题名猪细环病毒1a型ORF1基因的克隆与序列分析
被引量:1
- 1
-
-
作者
陈鹏强
胡崇伟
林群群
陈秋勇
修金生
-
机构
福建农林大学动物科学学院
-
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2015年第7期1668-1673,共6页
-
基金
福建省农业科学技术项目(2014-01)
福建省自然科学基金项目(2013J05042)
-
文摘
为明确猪细环病毒(porcine Torque teno sus virus,PTTSuV)1a型福建株ORF1基因的特征,本研究采用分段扩增的办法从PTTSuV 1a型感染阳性粪便中扩增PTTSuV 1a型福建株ORF1基因,对PCR扩增产物胶回收克隆测序后利用SeqMan软件拼接出完整的PTTSuV 1a型福建株ORF1基因,通过分子生物学软件对其编码蛋白进行生物信息学分析。结果表明,PTTSuV 1a型福建株ORF1基因全长为1 947bp,编码648个氨基酸,其理论等电点为10.06。核苷酸同源性比对结果表明,本试验PTTSuV 1a型福建株ORF1基因和PTTSuV 1a型TTV1Bj2-1株(GenBank登录号:HM633243)同源性最高,达99.7%。利用Mega 6.06绘制其遗传进化树,可见PTTSuV1a型ORF1基因在遗传进化上呈两个大的遗传进化分支(分支Ⅰ和分支Ⅱ),分支Ⅰ又可分为两个小的分支(Ⅰa和Ⅰb),本研究为丰富福建源PTTSuV 1a型分子流行病学数据库奠定基础。
-
关键词
猪细环病毒1a型
ORF1基因
克隆
序列分析
-
Keywords
porcine Torque teno sus virus type la
ORF1 gene
clone
sequence analysis
-
分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
-