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猪细小病毒1型VP2基因的原核表达及反应原性分析
被引量:
1
1
作者
欧云文
马小元
+3 位作者
张杰
丁耀忠
张永光
贾宁
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期169-174,共6页
旨在研究猪细小病毒1型(PPV1)VP2蛋白(第155-439位氨基酸)的抗原性,为开发PPV1的检测方法奠定基础。以PPV1型AV31株的DNA为模板,扩增获得849 bp的目的片段,扩增产物克隆入p ET30a(+)原核表达载体,构建p ET30aPPV1-VP2(155-439 aa)重组质...
旨在研究猪细小病毒1型(PPV1)VP2蛋白(第155-439位氨基酸)的抗原性,为开发PPV1的检测方法奠定基础。以PPV1型AV31株的DNA为模板,扩增获得849 bp的目的片段,扩增产物克隆入p ET30a(+)原核表达载体,构建p ET30aPPV1-VP2(155-439 aa)重组质粒,转入大肠杆菌BL21(DE3);在37℃,以1 mmol/L IPTG诱导表达6 h;采用Ni-NTA树脂亲和层析纯化重组蛋白,并用不同浓度的尿素对纯化蛋白进行复性。SDS-PAGE分析表明,该VP2编码基因在大肠杆菌中得到表达,蛋白大小约为39 k D;Western blot检测结果表明,该重组蛋白与PPV1阳性血清发生特异性反应,与NA-PRRSV和PCV2阳性血清不发生交叉反应。该实验成功构建了PPV1-VP2(155-439 aa)原核表达载体,实现了在大肠杆菌中的表达,纯化后的复性蛋白具有较好的反应原性。
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关键词
猪细小病毒1型
VP2基因
原核表达
反应原性
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职称材料
猪细小病毒1型河南流行毒株的遗传进化分析
被引量:
4
2
作者
许夕雅
丁晨梦
+7 位作者
孙亚威
韩紫薇
齐江坤
吕晨哲
石蒙蒙
郭子仪
邓梦梦
陈陆
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2023年第2期288-297,351,共11页
【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2...
【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2021。通过分析同源性和构建遗传进化树分析PPV1全基因组、NS1基因、VP2基因的变异情况,并且比对分析NS1蛋白和VP2蛋白的氨基酸变异情况及非编码区基因缺失情况。【结果】2条序列的核苷酸相似性为99.9%;与46株国内外PPV1流行毒株全基因组的核苷酸同源性为93.5%~99.9%;NS1基因核苷酸同源性为98.6%~99.9%,NS1蛋白氨基酸同源性为98.2%~99.9%;VP2基因核苷酸同源性为98.4%~99.9%,VP2蛋白氨基酸同源性为98.3%~99.9%,说明本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性。本研究鉴定株与湖南及吉林毒株亲缘关系最近,而与河南原有毒株亲缘关系较远。在对NS1蛋白与VP2蛋白的氨基酸变异分析中发现,NS1蛋白发生6处突变,VP2蛋白发生7处突变,均在经典突变位点范围内,符合PPV1遗传变异的保守性。鉴定株VP2基因后部非编码区基因与NADL-2株相比缺失127 nt。【结论】本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性,河南省存在新旧PPV1毒株同时流行的情况。
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关键词
猪细小病毒1型
全基因组测序
遗传变异分析
NS
1
基因
VP2基因
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职称材料
猪细小病毒1型突变株分离鉴定及全基因组进化分析
被引量:
1
3
作者
于永乐
姚延珠
+4 位作者
张瑞华
陈超
赵婷
单虎
韩先杰
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期232-238,共7页
旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析。对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对...
旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析。对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对,利用DNAMAN V6对基因组末端5′UTR和3′UTR二级结构进行展示和比较,应用MEGA V7进行遗传进化分析,最后利用多步生长曲线绘制对分离株在易感细胞内的增殖能力进行比较。共分离得到3株病毒,均鉴定为PPV1型毒株,分别命名为SDPV1、SDPV2和SDPV3,GenBank登录号分别为ON924737、ON924738和ON924739;3个分离株全基因序列长度基本一致,其中5′-UTR序列高度保守,呈Y型结构;而3′-UTR呈U型结构,个别碱基有所差异;VP2氨基酸序列中有5个非同义突变位点,分别为T20A、R82K、Q226E、D366N和K407N,为国内毒株首次发现。生长曲线显示,突变株生长趋势相对较快,与PPV-QN株相比,最高滴度相差10倍。报道了包含新型变异位点的PPV毒株的基因组特征。
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关键词
猪细小病毒1型
突变株
全基因组
遗传变异
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职称材料
2021-2022年河南省猪细小病毒1~7型检测与分析
被引量:
2
4
作者
郭全海
许夕雅
+4 位作者
石蒙蒙
杨寒
高冬生
王永生
陈陆
《动物医学进展》
北大核心
2024年第6期123-129,共7页
旨在了解猪细小病毒1~7型(PPV1~PPV7)在河南省的流行情况。利用PCR检测了2021-2022年河南省猪场送检的748份样品,并对检测数据进行了分析。结果表明,PPV1/2/3/5/6/7在河南省各地区一年四季广泛流行,而秋、冬季节是感染高峰期,PPV2(16.0...
旨在了解猪细小病毒1~7型(PPV1~PPV7)在河南省的流行情况。利用PCR检测了2021-2022年河南省猪场送检的748份样品,并对检测数据进行了分析。结果表明,PPV1/2/3/5/6/7在河南省各地区一年四季广泛流行,而秋、冬季节是感染高峰期,PPV2(16.04%)的感染率最高,PPV7(15.11%)次之。产房仔猪未检出PPV1/3/5,PPV2/6/7在各生长阶段猪群中均有检出,患呼吸系统疾病的保育和育肥猪中PPV各型检出率均较高,尤以PPV2常见。PPV2和PPV7在口腔液、血样、肺脾淋巴结中检出率均较高,血样中较低,PPV3常存在于血清和组织中,PPV5多见于口腔液,PPV6多见于血样。研究证实,除PPV4未检出外,其他6种PPV在河南均存在,并且多与其他病原混合感染,PPV2、PPV7可与多种病原混合感染,PPV7与PCV2混合感染最常见。
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关键词
猪
细小
病毒
1~7
型
检测
分析
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职称材料
题名
猪细小病毒1型VP2基因的原核表达及反应原性分析
被引量:
1
1
作者
欧云文
马小元
张杰
丁耀忠
张永光
贾宁
机构
甘肃农业大学动物医学院
中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期169-174,共6页
基金
国家国际合作项目(2012DFG31890)
国家自然科学基金项目(31072143)
文摘
旨在研究猪细小病毒1型(PPV1)VP2蛋白(第155-439位氨基酸)的抗原性,为开发PPV1的检测方法奠定基础。以PPV1型AV31株的DNA为模板,扩增获得849 bp的目的片段,扩增产物克隆入p ET30a(+)原核表达载体,构建p ET30aPPV1-VP2(155-439 aa)重组质粒,转入大肠杆菌BL21(DE3);在37℃,以1 mmol/L IPTG诱导表达6 h;采用Ni-NTA树脂亲和层析纯化重组蛋白,并用不同浓度的尿素对纯化蛋白进行复性。SDS-PAGE分析表明,该VP2编码基因在大肠杆菌中得到表达,蛋白大小约为39 k D;Western blot检测结果表明,该重组蛋白与PPV1阳性血清发生特异性反应,与NA-PRRSV和PCV2阳性血清不发生交叉反应。该实验成功构建了PPV1-VP2(155-439 aa)原核表达载体,实现了在大肠杆菌中的表达,纯化后的复性蛋白具有较好的反应原性。
关键词
猪细小病毒1型
VP2基因
原核表达
反应原性
Keywords
porcine parvovirus type
1
( PPV
1
)
VP2 gene
prokaryotic expression
reactinogenieity
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪细小病毒1型河南流行毒株的遗传进化分析
被引量:
4
2
作者
许夕雅
丁晨梦
孙亚威
韩紫薇
齐江坤
吕晨哲
石蒙蒙
郭子仪
邓梦梦
陈陆
机构
河南农业大学动物医学院
出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2023年第2期288-297,351,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31772781)。
文摘
【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2021。通过分析同源性和构建遗传进化树分析PPV1全基因组、NS1基因、VP2基因的变异情况,并且比对分析NS1蛋白和VP2蛋白的氨基酸变异情况及非编码区基因缺失情况。【结果】2条序列的核苷酸相似性为99.9%;与46株国内外PPV1流行毒株全基因组的核苷酸同源性为93.5%~99.9%;NS1基因核苷酸同源性为98.6%~99.9%,NS1蛋白氨基酸同源性为98.2%~99.9%;VP2基因核苷酸同源性为98.4%~99.9%,VP2蛋白氨基酸同源性为98.3%~99.9%,说明本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性。本研究鉴定株与湖南及吉林毒株亲缘关系最近,而与河南原有毒株亲缘关系较远。在对NS1蛋白与VP2蛋白的氨基酸变异分析中发现,NS1蛋白发生6处突变,VP2蛋白发生7处突变,均在经典突变位点范围内,符合PPV1遗传变异的保守性。鉴定株VP2基因后部非编码区基因与NADL-2株相比缺失127 nt。【结论】本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性,河南省存在新旧PPV1毒株同时流行的情况。
关键词
猪细小病毒1型
全基因组测序
遗传变异分析
NS
1
基因
VP2基因
Keywords
porcine parvovirus
1
complete genome sequencing
genetic evolution analysis
NS
1
gene
VP2 gene
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪细小病毒1型突变株分离鉴定及全基因组进化分析
被引量:
1
3
作者
于永乐
姚延珠
张瑞华
陈超
赵婷
单虎
韩先杰
机构
青岛农业大学动物医学院
青岛农业大学植物医学学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期232-238,共7页
基金
山东省生猪产业技术体系(SDAIT-08-09)
青岛农业大学高层次人才科研基金(1120015/663)
青岛农业大学博士启动基金项目。
文摘
旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析。对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对,利用DNAMAN V6对基因组末端5′UTR和3′UTR二级结构进行展示和比较,应用MEGA V7进行遗传进化分析,最后利用多步生长曲线绘制对分离株在易感细胞内的增殖能力进行比较。共分离得到3株病毒,均鉴定为PPV1型毒株,分别命名为SDPV1、SDPV2和SDPV3,GenBank登录号分别为ON924737、ON924738和ON924739;3个分离株全基因序列长度基本一致,其中5′-UTR序列高度保守,呈Y型结构;而3′-UTR呈U型结构,个别碱基有所差异;VP2氨基酸序列中有5个非同义突变位点,分别为T20A、R82K、Q226E、D366N和K407N,为国内毒株首次发现。生长曲线显示,突变株生长趋势相对较快,与PPV-QN株相比,最高滴度相差10倍。报道了包含新型变异位点的PPV毒株的基因组特征。
关键词
猪细小病毒1型
突变株
全基因组
遗传变异
Keywords
Porcine parvovirus type
1
Mutant strain
Whole genome
Genetic variation
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
2021-2022年河南省猪细小病毒1~7型检测与分析
被引量:
2
4
作者
郭全海
许夕雅
石蒙蒙
杨寒
高冬生
王永生
陈陆
机构
商丘职业技术学院牧医学院
河南农业大学动物医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第6期123-129,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31772781)
河南省软科学研究计划项目(232400411047)。
文摘
旨在了解猪细小病毒1~7型(PPV1~PPV7)在河南省的流行情况。利用PCR检测了2021-2022年河南省猪场送检的748份样品,并对检测数据进行了分析。结果表明,PPV1/2/3/5/6/7在河南省各地区一年四季广泛流行,而秋、冬季节是感染高峰期,PPV2(16.04%)的感染率最高,PPV7(15.11%)次之。产房仔猪未检出PPV1/3/5,PPV2/6/7在各生长阶段猪群中均有检出,患呼吸系统疾病的保育和育肥猪中PPV各型检出率均较高,尤以PPV2常见。PPV2和PPV7在口腔液、血样、肺脾淋巴结中检出率均较高,血样中较低,PPV3常存在于血清和组织中,PPV5多见于口腔液,PPV6多见于血样。研究证实,除PPV4未检出外,其他6种PPV在河南均存在,并且多与其他病原混合感染,PPV2、PPV7可与多种病原混合感染,PPV7与PCV2混合感染最常见。
关键词
猪
细小
病毒
1~7
型
检测
分析
Keywords
Porcine parvovirus
1
-7
detection
analysis
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪细小病毒1型VP2基因的原核表达及反应原性分析
欧云文
马小元
张杰
丁耀忠
张永光
贾宁
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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职称材料
2
猪细小病毒1型河南流行毒株的遗传进化分析
许夕雅
丁晨梦
孙亚威
韩紫薇
齐江坤
吕晨哲
石蒙蒙
郭子仪
邓梦梦
陈陆
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2023
4
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职称材料
3
猪细小病毒1型突变株分离鉴定及全基因组进化分析
于永乐
姚延珠
张瑞华
陈超
赵婷
单虎
韩先杰
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023
1
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职称材料
4
2021-2022年河南省猪细小病毒1~7型检测与分析
郭全海
许夕雅
石蒙蒙
杨寒
高冬生
王永生
陈陆
《动物医学进展》
北大核心
2024
2
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