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猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析
被引量：
7
1
作者
赵婷
张家龙
+5 位作者
盖新娜
郭鑫
周磊
陈艳红
查振林
杨汉春
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期873-878,共6页
为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒（EMCV）基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒（GX0601和GX0602）进行了全基因组序列测定和比较分析。结果显示,2个分离毒株的基因组全长（包含poly A）分别为7 729和7 725 nt...
为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒（EMCV）基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒（GX0601和GX0602）进行了全基因组序列测定和比较分析。结果显示,2个分离毒株的基因组全长（包含poly A）分别为7 729和7 725 nt,核苷酸和氨基酸同源性均在99.8%以上。与国外毒株及国内已报道的分离株的序列比较结果表明,2个毒株与BJC3和HB1的核苷酸同源性为98.18%~99.41%,推导的氨基酸序列同源性为99.5%~99.7%,与国外分离株的核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别介于80.53%~99.57%和93.1%~99.5%。基于基因组开放阅读框推导的氨基酸序列的系统进化分析表明,我国分离毒株与国外毒株PEC9、CBNU、BEL-2887A/91和EMCV-R的同源性较高,位于同一个亚群。研究结果提示,猪源与鼠源毒株的基因组具有很高的同源性,鼠是猪场EMCV感染的传染来源。
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关键词
脑心肌炎病
毒
猪源和鼠源毒株
基因组
序列测定
进化分析
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题名
猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析
被引量：
7
1
作者
赵婷
张家龙
盖新娜
郭鑫
周磊
陈艳红
查振林
杨汉春
机构
中国农业大学动物医学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期873-878,共6页
基金
国家自然科学基金重点项目(30530550)
教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0866)
文摘
为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒（EMCV）基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒（GX0601和GX0602）进行了全基因组序列测定和比较分析。结果显示,2个分离毒株的基因组全长（包含poly A）分别为7 729和7 725 nt,核苷酸和氨基酸同源性均在99.8%以上。与国外毒株及国内已报道的分离株的序列比较结果表明,2个毒株与BJC3和HB1的核苷酸同源性为98.18%~99.41%,推导的氨基酸序列同源性为99.5%~99.7%,与国外分离株的核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别介于80.53%~99.57%和93.1%~99.5%。基于基因组开放阅读框推导的氨基酸序列的系统进化分析表明,我国分离毒株与国外毒株PEC9、CBNU、BEL-2887A/91和EMCV-R的同源性较高,位于同一个亚群。研究结果提示,猪源与鼠源毒株的基因组具有很高的同源性,鼠是猪场EMCV感染的传染来源。
关键词
脑心肌炎病
毒
猪源和鼠源毒株
基因组
序列测定
进化分析
Keywords
encephalomyocarditis virus （EMCV）
strains from pig and mouse origin
genome
sequencing
phylogenetic analysis
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析
赵婷
张家龙
盖新娜
郭鑫
周磊
陈艳红
查振林
杨汉春
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
7
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