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云南某农村猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查 被引量:8
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作者 黄芬 禹文海 +2 位作者 马天武 井申荣 曾韦锟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期274-277,共4页
目的了解云南农村散养猪群HEV感染情况,为HEV防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对所采集云南猪群78份粪便样品进行HEV ORF2基因部分片段扩增,经琼脂糖凝胶电泳后对目的条带进行回收纯化及克隆测序... 目的了解云南农村散养猪群HEV感染情况,为HEV防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对所采集云南猪群78份粪便样品进行HEV ORF2基因部分片段扩增,经琼脂糖凝胶电泳后对目的条带进行回收纯化及克隆测序。序列利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和系统进化树构建。结果 RT-nested PCR方法扩增出了350bp目的基因序列,该序列与GenBank中HEV各型的同源性在77.4%~97.4%之间,与基因4型同源性最高(97.4%),与3型同源性最低(77.4%)。系统进化树显示测定的序列与基因4型聚为一支,表明该序列属于基因4型。本次实验共检测了78份猪粪便样品,其中8份为阳性,阳性率为10.26%。结论云南农村人群存在感染HEV的风险,应该加以防控以免HEV暴发流行。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 逆转录巢式PCR 分子流行病学 调查
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猪戊型肝炎病毒大庆株DQ1全基因序列分析 被引量:6
2
作者 于敏 曲娟娟 +2 位作者 郭巍 赵立平 相文华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期507-510,共4页
本试验采用RT-PCR的方法对戊型肝炎病毒大庆株(DQ1HEV株)的全基因进行分片段扩增,并对其两个末端采用末端快速扩增法(RACE)进行扩增、克隆,测序。与已报道的人的14株HEV的4个基因型的核苷酸和氨基酸进行比较,与IV型HEV的同源性最高。ORF... 本试验采用RT-PCR的方法对戊型肝炎病毒大庆株(DQ1HEV株)的全基因进行分片段扩增,并对其两个末端采用末端快速扩增法(RACE)进行扩增、克隆,测序。与已报道的人的14株HEV的4个基因型的核苷酸和氨基酸进行比较,与IV型HEV的同源性最高。ORF1区与IV型HEV核苷酸的同源性为82.6%~83.6%,氨基酸同源性为93.5%。ORF2区与IV型HEV核苷酸的同源性为87.0%~88.4%,氨基酸同源性为95.8%~97.4%。ORF3区与IV型HEV核苷酸的同源性为94.4%~96.5%,氨基酸同源性为90.3%~96.5%。其结果表明DQ1HEV株为IV型HEV。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 克隆 序列分析
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猪戊型肝炎病毒的流行病学调查 被引量:7
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作者 张亮权 梁焕斌 +4 位作者 王衡 高李泽 王德刚 尤佳 张桂红 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第8期215-219,共5页
利用双抗原夹心ELISA对2009—2011年间采自广东省各地区的若干猪场的484份血清样品,进行血清流行病学调查;对69份病猪胆汁样品进行分子流行病学调查,分离得到猪源戊型肝炎病毒(swine hepatitis E virus,swHEV),并基于ORF2部分基因序列... 利用双抗原夹心ELISA对2009—2011年间采自广东省各地区的若干猪场的484份血清样品,进行血清流行病学调查;对69份病猪胆汁样品进行分子流行病学调查,分离得到猪源戊型肝炎病毒(swine hepatitis E virus,swHEV),并基于ORF2部分基因序列进行核苷酸序列比对、相似性分析和遗传进化树分析,以期初步了解广东各地猪群戊型肝炎(hepatitis E,HE)的感染情况和流行特点。试验结果显示,全部被检查猪的swHEV抗体平均阳性率为71.9%(348/484),分离的猪源HEV毒株均属于基因Ⅳ型,阳性率为71.0%(49/69)。调查结果表明基因Ⅳ型swHEV在广东地区普遍流行。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 双抗原夹心ELISA 流行病学调查
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猪戊型肝炎病毒ORF2主要抗原表位区间接ELISA方法的初步建立 被引量:4
4
作者 闻晓波 王密 +4 位作者 冉旭华 周恩民 李晓娟 侯喜林 朴范泽 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第5期99-102,共4页
应用原核表达系统表达猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白C端和N端的主要抗原表位区,重组蛋白命名为ORF2-C和ORF2-N,初步建立间接ELISA诊断方法。用重组蛋白ORF2-C和ORF2-N作为诊断抗原,对反应条件进行优化,初步建立ELISA诊断方法。抗原最适包被浓... 应用原核表达系统表达猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白C端和N端的主要抗原表位区,重组蛋白命名为ORF2-C和ORF2-N,初步建立间接ELISA诊断方法。用重组蛋白ORF2-C和ORF2-N作为诊断抗原,对反应条件进行优化,初步建立ELISA诊断方法。抗原最适包被浓度ORF2-C为8μg/mL、ORF2-N为12μg/mL;血清最适稀释度均为1∶50,ORF2-C作用时间为50min、ORF2-N作用时间为90min;酶标抗体最适稀释度为1∶5000;ORF2-C判定标准:D450nm值≥0.348为阳性,D450nm值<0.348为阴性;ORF2-N判定标准:D450nm值≥0.397为阳性,D450nm值<0.397为阴性。与戊型肝炎病毒诊断试剂盒检测结果相比,阳性符合率分别为93.3%、86.7%。利用重组蛋白建立的ELISA方法特异性、敏感性和重复性均较好,且ORF2-C的检测效率明显高于ORF2-N,该方法的初步建立为进一步完善猪戊型肝炎病毒诊断方法奠定基础。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2 主要抗原表位区 ELISA
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昆明地区猪戊型肝炎病毒感染的血清学调查 被引量:3
5
作者 严玉霖 高洪 +3 位作者 李文贵 陈玲 高利波 赵汝 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第6期89-91,共3页
为了解昆明地区猪戊型肝炎病毒(HEV)感染的情况,从昆明地区12个规模化养猪场和部分散养户采集了270份猪血清,采用间接ELISA方法对血清样本进行抗HEV抗体检测。检测结果显示,235份规模化养猪场猪血清抗HEV抗体阳性率为59.15%,35份散养户... 为了解昆明地区猪戊型肝炎病毒(HEV)感染的情况,从昆明地区12个规模化养猪场和部分散养户采集了270份猪血清,采用间接ELISA方法对血清样本进行抗HEV抗体检测。检测结果显示,235份规模化养猪场猪血清抗HEV抗体阳性率为59.15%,35份散养户猪群血清中抗HEV抗体阳性率为74.29%,其中3月龄以上的育肥猪HEV抗体阳性率较高,为75%。结果表明,昆明地区猪群普遍存在HEV感染,尤其是仔猪和生长育肥猪HEV的感染较为严重。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 感染 间接ELISA 血清学调查
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检测猪戊型肝炎病毒的荧光定量PCR方法的建立 被引量:4
6
作者 张亮权 欧阳昀 +5 位作者 刘志刚 曹宗喜 闫明菲 王文华 郭泗虎 张桂红 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2011年第10期16-18,共3页
根据GenBank中猪戊型肝炎病毒的ORF2核苷酸序列的保守区域设计合成一对特异性引物,建立了一套SYBRGreenⅠ荧光定量PCR检测猪源戊型肝炎病毒(swHEV)的方法,并评价了该方法的灵敏度、稳定性和特异性,同时与常规的RT-nPCR进行对比分析。结... 根据GenBank中猪戊型肝炎病毒的ORF2核苷酸序列的保守区域设计合成一对特异性引物,建立了一套SYBRGreenⅠ荧光定量PCR检测猪源戊型肝炎病毒(swHEV)的方法,并评价了该方法的灵敏度、稳定性和特异性,同时与常规的RT-nPCR进行对比分析。结果表明,建立标准曲线的相关系数为0.998,斜率为-3.039,Ct值变异系数(CV)在0.17%~1.41%之间,有良好的稳定性。同时在检测猪群常见病中显示出很好的特异性,并且比RT-nPCR更灵敏,适合于swHEV的检测。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 荧光定量PCR RT-nPCR
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猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白N端主要抗原表位区的原核表达 被引量:2
7
作者 冉旭华 闻晓波 +2 位作者 王密 李冬野 侯喜林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第1期51-54,共4页
用原核表达系统表达猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白N端的主要抗原表位区。通过对GenBank公布的猪戊型肝炎病毒DQ1株ORF2的氨基酸序列进行分析,确定了其N端抗原性较高的区域,针对此区域设计并合成了1对特异性引物,RT-PCR扩增该区段,并将此片段... 用原核表达系统表达猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白N端的主要抗原表位区。通过对GenBank公布的猪戊型肝炎病毒DQ1株ORF2的氨基酸序列进行分析,确定了其N端抗原性较高的区域,针对此区域设计并合成了1对特异性引物,RT-PCR扩增该区段,并将此片段克隆到原核表达载体pET30a(+)上,命名为pET30a-ORF2N,转化大肠杆菌BL21感受态细胞,1.0 mmol/LIPTG37℃诱导表达。RT-PCR扩增得到424 bp的片段,重组蛋白大小约为21.8 ku,与预期大小相符。West-ern blotting分析结果表明,该蛋白能与阳性血清发生特异性反应,证明该蛋白具有生物学活性。猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白N端主要抗原表位区在大肠杆菌中成功表达,具有一定的反应原性,为进一步用其建立诊断方法奠定基础。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2 主要抗原表位区 表达
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猪戊型肝炎病毒RT-nPCR检测方法的建立及应用 被引量:3
8
作者 张序 罗火亮 +1 位作者 张文波 邓舜洲 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期107-111,共5页
建立猪戊型肝炎病毒(Swine Hepatitis E Virus,SHEV)RT-PCR检测方法,为SHEV的流行病学调查、临床诊断提供可靠的技术手段。根据SHEV的基因组序列,设计并合成2对引物,以SHEV江西分离株SHEV-JX-1为模板,对反应条件进行了优化,建立了诊断S... 建立猪戊型肝炎病毒(Swine Hepatitis E Virus,SHEV)RT-PCR检测方法,为SHEV的流行病学调查、临床诊断提供可靠的技术手段。根据SHEV的基因组序列,设计并合成2对引物,以SHEV江西分离株SHEV-JX-1为模板,对反应条件进行了优化,建立了诊断SHEV的RT-PCR方法。该方法可从SHEV-JX-1中扩增出230 bp的片段,测序结果表明为SHEVⅣ型基因片段;对猪的其它病毒进行检测结果均为阴性;能检测出2.5×10-8μg的SHEV RNA;对江西部分猪场采集的胆汁及肠容物进行检测,结果胆汁中的阳性率为10%,肠容物的阳性率为4%。实验建立的RT-PCR方法具有敏感、特异、重复性好的特点,可用于SHEV的分子流行病学调查和临床快速诊断。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 RT-PCR
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猪戊型肝炎病毒ORF2基因的分段原核表达及抗原表位的初步鉴定 被引量:2
9
作者 古洪浪 梁焕斌 +5 位作者 纪方晓 周沛 邓胜朝 曹振鹏 王衡 张桂红 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2015年第9期25-27,共3页
为了初步鉴定猪戊型肝炎病毒(sw HEV)ORF2蛋白的抗原表位,通过设计两对引物,PCR扩增ORF2-1和ORF2-2两段基因片段,使用p MD18-T载体克隆,双酶切后构建重组质粒p ET32a-0RF2-(1,2),转化大肠杆菌BL21后进行IPTG诱导和SDS-PAGE凝胶电泳... 为了初步鉴定猪戊型肝炎病毒(sw HEV)ORF2蛋白的抗原表位,通过设计两对引物,PCR扩增ORF2-1和ORF2-2两段基因片段,使用p MD18-T载体克隆,双酶切后构建重组质粒p ET32a-0RF2-(1,2),转化大肠杆菌BL21后进行IPTG诱导和SDS-PAGE凝胶电泳,最后用4株ORF2单抗对其进行Western Blot来初步鉴定其抗原表位。结果表明,分别获得约为36 ku和35 ku的两个目的蛋白,均以不可溶形式存在,抗原表位初步定位于ORF2-1这段蛋白中的414~523 aa。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2基因 原核表达 抗原表位
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基因3型猪戊型肝炎病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立 被引量:2
10
作者 陈小金 董志珍 +7 位作者 赵祥平 王建华 刘洋 王玉玲 陈本龙 肖妍 王乃福 张俊哲 《中国动物检疫》 CAS 2016年第7期72-77,共6页
对GenBank中基因3型猪戊型肝炎病毒(HEV)代表毒株基因进行序列分析,最终选定ORF3基因的部分序列为目的基因,运用生物信息学软件设计特异性引物和探针,扩增获得目的片段,并构建重组载体p UC-19-ORF3。梯度稀释重组质粒制备标准品,初步... 对GenBank中基因3型猪戊型肝炎病毒(HEV)代表毒株基因进行序列分析,最终选定ORF3基因的部分序列为目的基因,运用生物信息学软件设计特异性引物和探针,扩增获得目的片段,并构建重组载体p UC-19-ORF3。梯度稀释重组质粒制备标准品,初步建立检测基因3型HEV的实时荧光定量PCR方法。对建立的检测方法进行特异性、敏感性和重复性验证。结果表明,标准品浓度在108~102 copies/μL范围内线性关系良好,相关系数为0.996。特异性试验结果显示,其它几种常见猪病病原体(猪流行性腹泻病毒、猪轮状病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒)未见典型扩增曲线。敏感性试验证实本方法的最低检测下限为101 copies/μL。重复性试验表明该方法对3个标准品检测结果的批内和批间变异系数低于2%。用该方法抽检59份进境猪肉样品,同时用普通RT-PCR方法对这些样品进行符合性试验,结果均为阴性。本研究所建立的检测方法不仅适用于进境猪肉样品中基因3型HEV的监控检测,而且还可用于基因3型HEV的早期临床诊断及分子流行病学调查。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 TAQMAN探针 荧光定量RT-PCR
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猪戊型肝炎病毒ORF2蛋白C端主要抗原表位区的原核表达 被引量:1
11
作者 冉旭华 闻晓波 +2 位作者 王密 李冬野 侯喜林 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第1期24-27,共4页
利用分子生物学软件分析GenBank公布的猪戊型肝炎病毒DQ1株ORF2的氨基酸序列,确定了其C端抗原性较高的区域,针对此区域设计并合成了一对特异性引物,RT-PCR扩增该区域,并将此片段克隆到原核表达载体pET30a(+)上,命名为pET30a-ORF2C,然后... 利用分子生物学软件分析GenBank公布的猪戊型肝炎病毒DQ1株ORF2的氨基酸序列,确定了其C端抗原性较高的区域,针对此区域设计并合成了一对特异性引物,RT-PCR扩增该区域,并将此片段克隆到原核表达载体pET30a(+)上,命名为pET30a-ORF2C,然后转化大肠埃希菌BL21感受态细胞,1.0 mmol/L IPTG 37℃诱导表达。结果表明,RT-PCR扩增得到301 bp的片段,重组蛋白大小约为18 ku,与预期大小相符。Western blot分析表明,该蛋白与阳性血清发生特异性反应,为进一步利用其建立诊断方法奠定了基础。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2 主要抗原表位区 表达
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猪戊型肝炎病毒单克隆抗体的抗原识别位点分析 被引量:2
12
作者 李丹丹 张馨心 +1 位作者 赵立平 相文华 《动物医学进展》 CSCD 2008年第4期42-44,共3页
采用ELISA叠加试验,对6株具有ELISA反应特性的猪戊型肝炎病毒(SHEV)单克隆抗体(McAb-αC11、αC12、γH1、γF8、BC4和CH8)的抗原识别位点进行检测。抗体反应增值结果表明,6株单抗分别针对4个不同抗原位点,McAb-γH1,BC4,CH8识别的位点... 采用ELISA叠加试验,对6株具有ELISA反应特性的猪戊型肝炎病毒(SHEV)单克隆抗体(McAb-αC11、αC12、γH1、γF8、BC4和CH8)的抗原识别位点进行检测。抗体反应增值结果表明,6株单抗分别针对4个不同抗原位点,McAb-γH1,BC4,CH8识别的位点各不相同,其中McAb-γH1、BC4识别的位点有部分重叠,McAb-αC11、αC12,γF8识别同一位点,位于γH1,BC4识别位点的重叠区内。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 单克隆抗体 抗原位点
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猪戊型肝炎病毒swCH189株衣壳蛋白基因CP239片段原核表达条件的优化
13
作者 郝宝成 梁剑平 +5 位作者 兰喜 刑小勇 项海涛 温峰琴 胡永浩 柳纪省 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第15期3116-3119,共4页
为了提高猪戊型肝炎病毒swCH189株衣壳蛋白基因CP239片段在大肠杆菌中的表达量,研究了载体、温度、转速、诱导时间以及诱导剂IPTG浓度等不同条件对衣壳蛋白基因CP239片段融合蛋白表达量的影响。结果表明,用LB培养基于37℃培养3.5 h后,... 为了提高猪戊型肝炎病毒swCH189株衣壳蛋白基因CP239片段在大肠杆菌中的表达量,研究了载体、温度、转速、诱导时间以及诱导剂IPTG浓度等不同条件对衣壳蛋白基因CP239片段融合蛋白表达量的影响。结果表明,用LB培养基于37℃培养3.5 h后,采用终浓度为0.3 mmol/L的IPTG在37℃、200r/min诱导培养4 h,pET32a-CP239融合蛋白表达量最大;SDS-PAGE检测结果表明pET32a-CP239融合蛋白的分子质量与预期大小一致,约为45.3 ku;Western blotting结果表明,pET32a-CP239融合蛋白可以与抗-HEV阳性血清发生特异性反应,并具有良好的反应原性,说明衣壳蛋白基因CP239片段蛋白得到正确表达。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 衣壳蛋白 CP239片段 原核表达
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猪戊型肝炎病毒ORF3基因的克隆与原核表达
14
作者 何美琳 张焕容 王栋 《动物医学进展》 北大核心 2015年第7期33-37,共5页
为了表达猪源戊型肝炎病毒衣壳蛋白,并对其反应原性进行研究,采用RT-PCR方法扩增猪戊型肝炎病毒(SHEV)ORF3完整基因,将扩增产物插入pMD19-T载体,再亚克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建了pET-32a(+)-ORF3表达载体,转入E.coli BL21(DE3),... 为了表达猪源戊型肝炎病毒衣壳蛋白,并对其反应原性进行研究,采用RT-PCR方法扩增猪戊型肝炎病毒(SHEV)ORF3完整基因,将扩增产物插入pMD19-T载体,再亚克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建了pET-32a(+)-ORF3表达载体,转入E.coli BL21(DE3),IPTG诱导表达,同时对诱导表达条件进行筛选,并用SDS-PAGE和免疫印迹等方法分析鉴定表达产物。结果表明,成功扩增到345bp的目的基因片段,表达载体pET-32a(+)-ORF3转入E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导,成功表达了ORF3基因编码的蛋白,当IPTG浓度为1mmol/L,诱导时间为6h时,该基因在E.coli BL21(DE3)中表达量最高。表达产物的分子质量约为29.6ku,与预期目的蛋白分子质量相符。表达的蛋白既有包涵体形式,也有可溶性形式。经Western blot检测,表达的目的蛋白能与SHEV阳性血清发生特异性反应。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF3基因 表达
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猪戊型肝炎病毒血清抗体间接ELISA检测方法的建立与应用 被引量:6
15
作者 丁军 赵晓静 +8 位作者 虞楷锐 周天明 李慧霞 盛亚敏 陈宜阳 刘宝元 孙亚妮 周恩民 赵钦 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2240-2248,共9页
由于猪戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)可跨种属感染人,因此,猪群中猪HEV感染的监测对于该病的防控和公共卫生都具有重要的意义。本试验旨在建立一种检测猪HEV抗体的间接ELISA方法,以原核表达纯化截短的猪HEV衣壳蛋白为包被抗原,... 由于猪戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)可跨种属感染人,因此,猪群中猪HEV感染的监测对于该病的防控和公共卫生都具有重要的意义。本试验旨在建立一种检测猪HEV抗体的间接ELISA方法,以原核表达纯化截短的猪HEV衣壳蛋白为包被抗原,优化条件,确定最佳试验条件,并分析该方法的敏感性、特异性、重复性,以及与商品化试剂盒的符合率,评价其临床应用价值。SDS-PAGE和Western blot结果证明抗原蛋白获得正确表达与纯化,并且具有良好的反应原性,可以作为后续建立ELISA方法的包被抗原。通过优化ELISA条件,最终确定抗原最佳包被量为200ng·孔-1,血清最佳稀释度为1∶200,包被缓冲液为碳酸盐缓冲液(pH 9.6),封闭液为2.5%的脱脂奶粉,阴阳性判定的临界值为OD450nm≥0.296。该间接ELISA方法的特异性和敏感性良好,板内和板间变异系数均小于10%,与北京万泰商品化试剂盒符合率为91.2%。临床应用表明,该方法可应用于猪HEV感染猪后抗体消长以及临床猪血清抗体的检测。因此,本研究建立的猪HEV抗体间接ELISA检测方法具有较好的敏感性和特异性,准确率较高,该方法适用于临床猪血清样品的检测和猪HEV感染血清流行病学的调查。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 间接ELISA 抗体 ORF2蛋白
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猪戊型肝炎病毒SYBR Green Ⅱ荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:7
16
作者 李幽幽 龚双燕 +4 位作者 李小璟 毛汐语 邓益超 朱玲 徐志文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1002-1006,1017,共6页
目的建立一种快速检测猪戊型肝炎病毒(HEV)的方法。方法针对HEVORF2基因保守序列设计1对引物,基于SYBR GreenⅡ染料,建立了检测HEV的实时荧光定量RT-PCR方法。结果该方法只能对猪戊型肝炎病毒检测到荧光,对猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪... 目的建立一种快速检测猪戊型肝炎病毒(HEV)的方法。方法针对HEVORF2基因保守序列设计1对引物,基于SYBR GreenⅡ染料,建立了检测HEV的实时荧光定量RT-PCR方法。结果该方法只能对猪戊型肝炎病毒检测到荧光,对猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、猪流行性腹泻病毒、猪嵴病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒均不能检测到荧光信号,特异性好;检测HEV时,在4.10×10~2~4.10×10~8拷贝/μL内具有良好的线性关系,灵敏度可以达到1.00×10~2拷贝/μL,扩增相关系数为0.996,扩增产物的熔解温度为84.0℃±0.1℃,该检测方法组内变异系数为0.83%~0.94%,组间变异系数为0.83%~0.94%,重复性较好。利用该方法对临床61份来自四川各地的猪肠内容物进行检测,检出9份阳性,且与常规PCR检测方法的阳性符合率为100%。结论建立的针对HEV的荧光定量RT-PCR有效可行,对HEV的临床检测和进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 SYBR GreenⅡ 荧光定量RT-PCR
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猪戊型肝炎病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
17
作者 闫蕾 涂亚斌 +5 位作者 李海 张交儿 王刚 刘永刚 陈志宝 蔡雪辉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期322-325,共4页
为建立猪戊型肝炎病毒(SHEV)的TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据SHEV基因ORF2保守区设计引物及探针,并对PCR反应条件进行优化。结果表明,该方法扩增的相关系数可达0.999,在102拷贝/μL^109拷贝/μL内具有良好的线性关系。对猪圆环... 为建立猪戊型肝炎病毒(SHEV)的TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据SHEV基因ORF2保守区设计引物及探针,并对PCR反应条件进行优化。结果表明,该方法扩增的相关系数可达0.999,在102拷贝/μL^109拷贝/μL内具有良好的线性关系。对猪圆环病毒2型、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和伪狂犬病毒的RNA或DNA进行检测,结果均为阴性。该方法可以检出最低拷贝数为10拷贝/μL。重复性试验结果表明该方法的批内和批间变异系数均小于3.0%。本研究使用该荧光定量PCR检测方法对黑龙江省临床收集的131份样品(肝脏45份、粪便86份)进行检测,总阳性率为11.45%,其中肝脏阳性率为22.22%,粪便阳性率为5.81%。该方法的建立为SHEV的快速检出及绝对定量奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 荧光定量PCR TAQMAN探针 应用
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山东泰安市猪戊型肝炎病毒的检测及序列分析 被引量:6
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作者 宋腾飞 赵钦 +2 位作者 姚永红 肖一红 周恩民 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第3期23-27,共5页
为了解山东泰安市猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)感染情况及其对职业人群的危害,从山东省某屠宰场共收集来自泰安市的106份猪胆汁样品,利用逆转录套式聚合酶链式反应(reverse transcription nested polymerase chain reaction,R... 为了解山东泰安市猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)感染情况及其对职业人群的危害,从山东省某屠宰场共收集来自泰安市的106份猪胆汁样品,利用逆转录套式聚合酶链式反应(reverse transcription nested polymerase chain reaction,RT-nPCR)检测HEV开放阅读框(open reading frame 2,ORF2)保守区基因,其中32份为阳性,阳性率为30.2%。同时随机挑选20个阳性样品克隆测序,并与GenBank上的参考序列进行同源性比较,发现所获得的序列与9株HEV基因Ⅳ型参考序列之间的核苷酸同源性最高,为83.6%~92.8%。其中3株与中国猪源HEV swGX32株(EU366959)亲缘关系近(90.8%),属于4a亚型,另外17株与新疆猪源HEVswCH25株(AY594199)和人源HEVT1株(AJ272108)亲缘关系近(87.9%~92.8%),属于4d亚型。调查结果表明该地区猪戊型肝炎病毒的阳性率很高,而且进一步证实猪源HEV和人源HEV有较高的同源性,对人类的身体健康具有潜在威胁。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2基因 序列分析
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上海郊区猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查 被引量:3
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作者 周佳明 陈冈 +5 位作者 司伏生 于瑞嵩 陈冰清 谢春芳 李震 董世娟 《上海农业学报》 2022年第3期93-97,共5页
为了解上海郊区猪场戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,从3个猪场随机采集180份新鲜粪便样本,用逆转录巢式聚合酶链反应对HEV ORF2部分基因片段进行扩增、克隆及测序。结果表明:HEV RNA的PCR检测总阳性率为15.6%,个别猪场HEV RNA检出率达30%... 为了解上海郊区猪场戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,从3个猪场随机采集180份新鲜粪便样本,用逆转录巢式聚合酶链反应对HEV ORF2部分基因片段进行扩增、克隆及测序。结果表明:HEV RNA的PCR检测总阳性率为15.6%,个别猪场HEV RNA检出率达30%,且存在基因3型和4型同时检出的情况。经NCBI数据库BLAST比对分析,23份样本为基因4型,5份样本为基因3型。遗传进化分析显示,基因3型和4型毒株与来源于上海地区的参考毒株遗传关系最近,核苷酸同源性分别为97.9%和96.3%。研究表明,上海郊区某些猪场HEV感染率仍较高,且存在基因3型与4型共感染的现象,应注意加强防控。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 ORF2基因 分子流行病学 遗传进化分析
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猪戊型肝炎病毒Ⅳ型衣壳蛋白单克隆抗体的制备与鉴定 被引量:1
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作者 赵菲菲 赵钦 +3 位作者 胡守彬 陈福勇 肖一红 周恩民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期950-955,共6页
为获得猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)Ⅳ型衣壳蛋白单克隆抗体,将猪HEV衣壳蛋白的C端267(408—675)个氨基酸基因序列克隆入原核表达载体pET-28a(+),构建重组质粒pET-28a-ORF2-C,转化E.coli Rosetta(BL21)感受态细胞进行诱导表达... 为获得猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)Ⅳ型衣壳蛋白单克隆抗体,将猪HEV衣壳蛋白的C端267(408—675)个氨基酸基因序列克隆入原核表达载体pET-28a(+),构建重组质粒pET-28a-ORF2-C,转化E.coli Rosetta(BL21)感受态细胞进行诱导表达,SDS-PAGE和Western blot鉴定,纯化后免疫小鼠。取免疫小鼠的脾脏与鼠骨髓瘤细胞SP2/0融合制备单克隆抗体。通过间接ELISA和竞争ELISA方法筛选并鉴定单抗。结果表明蛋白得到正确、高效表达,获得3株识别不同的抗原表位区的单克隆抗体,分别命名为Mab-1E4(IgG1)、Mab-2C7(IgG1)和Mab-2G9(IgG2b),其中1E4和2G9能阻断临床阳性猪血清,提示该2株单克隆抗体识别的抗原表位是猪HEVⅣ型衣壳蛋白上重要的抗原表位区,而单抗Mab-2C7不能阻断。本研究为猪HEVⅣ型的诊断及研究提供重要工具。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 衣壳蛋白 单克隆抗体 鉴定
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