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猪圆环病毒Ⅰ型全基因组的克隆及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
徐弘
魏永伟
+3 位作者
谢荣辉
吕冬梅
章晓栋
于涟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期338-344,共7页
猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)是引起临床断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的主要病原之一,而与之遗传相关的猪圆环病毒Ⅰ型(PCV1)无致病性。本研究从病猪的脾脏通过PCR扩增并成功克隆了PCV1的全基因组,在此基础上,对GenBank中发表的所有31株PCV...
猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)是引起临床断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的主要病原之一,而与之遗传相关的猪圆环病毒Ⅰ型(PCV1)无致病性。本研究从病猪的脾脏通过PCR扩增并成功克隆了PCV1的全基因组,在此基础上,对GenBank中发表的所有31株PCV1以及部分PCV2(60株)进行了生物信息学分析。PCV1株间遗传与分子进化分析结果表明:PCV1可分为基因Ⅰ型与基因Ⅱ型两种基因型。PCV1与PCV2之间基因组结构和功能区分析结果表明:PCV1和PCV2基因组之间在复制起始区等功能区高度保守,在主要的编码区,尤其是编码Cap蛋白的ORF2,存在着许多差异。
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关键词
猪圆环病毒ⅰ型
猪
圆
环
病毒
Ⅱ
型
断奶仔
猪
多系统衰竭综合症
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职称材料
猪圆环病毒I型荧光定量PCR检测方法的建立
被引量：
9
2
作者
张福良
朱道中
宋长绪
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2008年第1期8-10,共3页
以定量的10倍系列稀释的质量pMD-ORF2为标准品进行荧光定量PCR扩增，建立了PCV1检测的荧光定量PCR方法。结果表明该方法检测灵敏度可达1．0×10^4拷贝／μL，线性范围为10^10～10^1；对起始浓度为1．0×10^2、1．0×10^6、1...
以定量的10倍系列稀释的质量pMD-ORF2为标准品进行荧光定量PCR扩增，建立了PCV1检测的荧光定量PCR方法。结果表明该方法检测灵敏度可达1．0×10^4拷贝／μL，线性范围为10^10～10^1；对起始浓度为1．0×10^2、1．0×10^6、1．0×10^6拷贝／μL的标准品的最终实际测得值分别为1．001×10^7、0．869×10^6和0．988×10^5拷贝／μL，变异系数分别为4．758％、1．865％和3．836％，说明此方法具有良好的准确性和重现性。对阳性组织病料的检测表明该方法的检测灵敏度高出常规PCR，与套式PCR（nPCR）具有相近的灵敏度。
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关键词
猪圆环病毒ⅰ型
荧光定量PCR
TAQMAN探针
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职称材料
猪圆环病毒I型ORF2蛋白序列与其核定位功能的相关性
被引量：
2
3
作者
陈美玲
陈焕春
+1 位作者
宋云峰
黄红亮
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期459-461,共3页
软件分析PCV1-ORF2的核苷酸序列发现其N端的氨基酸序列中包含一段核定位序列,将具有核定位序列特征的区域删除,构建缺失核定位序列的PCV1-ORF2基因与绿色荧光蛋白的真核融合表达载体,同时构建PCV1-ORF2全基因与绿色荧光蛋白的真核融合...
软件分析PCV1-ORF2的核苷酸序列发现其N端的氨基酸序列中包含一段核定位序列,将具有核定位序列特征的区域删除,构建缺失核定位序列的PCV1-ORF2基因与绿色荧光蛋白的真核融合表达载体,同时构建PCV1-ORF2全基因与绿色荧光蛋白的真核融合表达载体,分别转染Hela细胞,可观察到后者绿色荧光聚集在细胞核区域;而前者转染Hela细胞结果显示核定位现象消失,从而可以推断这一区域是CPV1-ORF2蛋白核定位的功能区。
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关键词
猪圆环病毒ⅰ型
ORF2蛋白
HELA细胞
绿荧光蛋白
核定位序列
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职称材料
题名
猪圆环病毒Ⅰ型全基因组的克隆及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
徐弘
魏永伟
谢荣辉
吕冬梅
章晓栋
于涟
机构
浙江大学动物预防医学研究所浙江省重点实验室
浙江省疾病预防控制中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期338-344,共7页
文摘
猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)是引起临床断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的主要病原之一,而与之遗传相关的猪圆环病毒Ⅰ型(PCV1)无致病性。本研究从病猪的脾脏通过PCR扩增并成功克隆了PCV1的全基因组,在此基础上,对GenBank中发表的所有31株PCV1以及部分PCV2(60株)进行了生物信息学分析。PCV1株间遗传与分子进化分析结果表明:PCV1可分为基因Ⅰ型与基因Ⅱ型两种基因型。PCV1与PCV2之间基因组结构和功能区分析结果表明:PCV1和PCV2基因组之间在复制起始区等功能区高度保守,在主要的编码区,尤其是编码Cap蛋白的ORF2,存在着许多差异。
关键词
猪圆环病毒ⅰ型
猪
圆
环
病毒
Ⅱ
型
断奶仔
猪
多系统衰竭综合症
Keywords
porcine circovirus type 1
porcine circovirus type 2
postweaning multisystemic wasting syndrome
分类号
S852.659 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪圆环病毒I型荧光定量PCR检测方法的建立
被引量：
9
2
作者
张福良
朱道中
宋长绪
机构
安阳工学院生物与食品工程学院
广州出入境检验检疫局
广东省农业科学院兽医研究所
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2008年第1期8-10,共3页
基金
国家“863”科技攻关项目(2003AA241110)
文摘
以定量的10倍系列稀释的质量pMD-ORF2为标准品进行荧光定量PCR扩增，建立了PCV1检测的荧光定量PCR方法。结果表明该方法检测灵敏度可达1．0×10^4拷贝／μL，线性范围为10^10～10^1；对起始浓度为1．0×10^2、1．0×10^6、1．0×10^6拷贝／μL的标准品的最终实际测得值分别为1．001×10^7、0．869×10^6和0．988×10^5拷贝／μL，变异系数分别为4．758％、1．865％和3．836％，说明此方法具有良好的准确性和重现性。对阳性组织病料的检测表明该方法的检测灵敏度高出常规PCR，与套式PCR（nPCR）具有相近的灵敏度。
关键词
猪圆环病毒ⅰ型
荧光定量PCR
TAQMAN探针
Keywords
PCV1
fluorescent quantitative PCR
TaqMan probe
分类号
S858.285.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
猪圆环病毒I型ORF2蛋白序列与其核定位功能的相关性
被引量：
2
3
作者
陈美玲
陈焕春
宋云峰
黄红亮
机构
华中农业大学动物医学院动物病毒室
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期459-461,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目(30170701)
文摘
软件分析PCV1-ORF2的核苷酸序列发现其N端的氨基酸序列中包含一段核定位序列,将具有核定位序列特征的区域删除,构建缺失核定位序列的PCV1-ORF2基因与绿色荧光蛋白的真核融合表达载体,同时构建PCV1-ORF2全基因与绿色荧光蛋白的真核融合表达载体,分别转染Hela细胞,可观察到后者绿色荧光聚集在细胞核区域;而前者转染Hela细胞结果显示核定位现象消失,从而可以推断这一区域是CPV1-ORF2蛋白核定位的功能区。
关键词
猪圆环病毒ⅰ型
ORF2蛋白
HELA细胞
绿荧光蛋白
核定位序列
Keywords
porcine circovirus
ⅰ
ORF2 fusion protein
hela cell
green fluorescence protein
nuclear localization sequence
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
Q753 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪圆环病毒Ⅰ型全基因组的克隆及生物信息学分析
徐弘
魏永伟
谢荣辉
吕冬梅
章晓栋
于涟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪圆环病毒I型荧光定量PCR检测方法的建立
张福良
朱道中
宋长绪
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2008
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
猪圆环病毒I型ORF2蛋白序列与其核定位功能的相关性
陈美玲
陈焕春
宋云峰
黄红亮
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
2
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职称材料
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